FuNGI

A0A1V6SDD2

Protein Details

Accession

A0A1V6SDD2

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
110-136	SPDTPDPVSRKRQKKRKSHVDISSYQS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
119-126	RKRQKKRK

Subcellular Location(s)

nucl 16, extr 5, cyto 3, plas 2, cyto_mito 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043519 NT_sf IPR045862 Trf4-like
Gene Ontology	GO:0016020 C:membrane GO:0031499 C:TRAMP complex GO:0043631 P:RNA polyadenylation

Amino Acid Sequences

MVTSTPVSSFALFKCPDTVMQLSSLPLRIRPSHLFRPFHSSVAAAKTPDVFANSLRKTLEAHRSTNRSRLIRKIYPIEDPPGLWRPEIPPESRAGYQPPAEPALPDSEYSPDTPDPVSRKRQKKRKSHVDISSYQSLNNQYGEDAIQPAGTGRPAQSPWLRNLELPRANAEITLDAEIRALDQYLTPRAQEQARIEKLRMEVASLLKAVVPHAPRVIGSHCTGLVLAHSDLDFILPYEDLPRSLERDRRPSPTRPQIQDAHIRLLRQVQRALQHTDTFSNHVKLSDKRNPSLSARHRPTGLLLQFYCGEGIPAITEYLQDYQAEYPALRPLYAVTRTLLEARGLFGSPQASIGPDALAMLIVAFLKMNHGRFPGPNNLGEQFLALLQFYGTQVDLQFVGVAVDPPGLFSADMLPVASNADEPAHQRGQRSLINAKRTAAAKRNSLVAQRLCIQDPTHYMNDLGRSCTRTSELQSAFAAAYQQLCHSCDEWANDGNIKTSSVLATTLQANFDTLEKVRNQLAYL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.26
2	0.26
3	0.26
4	0.28
5	0.29
6	0.22
7	0.24
8	0.24
9	0.23
10	0.24
11	0.27
12	0.22
13	0.23
14	0.27
15	0.28
16	0.33
17	0.4
18	0.45
19	0.52
20	0.6
21	0.61
22	0.58
23	0.64
24	0.6
25	0.53
26	0.46
27	0.37
28	0.32
29	0.34
30	0.34
31	0.26
32	0.25
33	0.25
34	0.25
35	0.25
36	0.23
37	0.17
38	0.19
39	0.28
40	0.28
41	0.3
42	0.29
43	0.28
44	0.29
45	0.35
46	0.42
47	0.37
48	0.42
49	0.47
50	0.55
51	0.58
52	0.62
53	0.63
54	0.6
55	0.6
56	0.64
57	0.65
58	0.63
59	0.67
60	0.67
61	0.62
62	0.61
63	0.6
64	0.55
65	0.47
66	0.41
67	0.4
68	0.38
69	0.36
70	0.3
71	0.28
72	0.26
73	0.33
74	0.37
75	0.34
76	0.29
77	0.31
78	0.35
79	0.35
80	0.34
81	0.29
82	0.29
83	0.29
84	0.3
85	0.29
86	0.28
87	0.27
88	0.25
89	0.22
90	0.23
91	0.21
92	0.19
93	0.17
94	0.16
95	0.18
96	0.18
97	0.2
98	0.15
99	0.16
100	0.17
101	0.2
102	0.24
103	0.3
104	0.4
105	0.46
106	0.56
107	0.65
108	0.75
109	0.8
110	0.85
111	0.89
112	0.9
113	0.91
114	0.9
115	0.88
116	0.86
117	0.81
118	0.76
119	0.72
120	0.61
121	0.51
122	0.44
123	0.38
124	0.32
125	0.27
126	0.21
127	0.13
128	0.14
129	0.14
130	0.12
131	0.1
132	0.09
133	0.08
134	0.07
135	0.08
136	0.08
137	0.08
138	0.08
139	0.08
140	0.11
141	0.12
142	0.17
143	0.23
144	0.25
145	0.29
146	0.35
147	0.34
148	0.33
149	0.37
150	0.4
151	0.38
152	0.36
153	0.35
154	0.29
155	0.29
156	0.27
157	0.23
158	0.15
159	0.12
160	0.13
161	0.1
162	0.09
163	0.09
164	0.08
165	0.08
166	0.07
167	0.06
168	0.05
169	0.06
170	0.08
171	0.11
172	0.12
173	0.12
174	0.13
175	0.15
176	0.16
177	0.2
178	0.22
179	0.28
180	0.34
181	0.35
182	0.35
183	0.35
184	0.35
185	0.34
186	0.29
187	0.21
188	0.17
189	0.17
190	0.18
191	0.14
192	0.14
193	0.1
194	0.11
195	0.1
196	0.12
197	0.12
198	0.12
199	0.12
200	0.12
201	0.12
202	0.14
203	0.15
204	0.14
205	0.14
206	0.14
207	0.13
208	0.13
209	0.13
210	0.11
211	0.09
212	0.08
213	0.07
214	0.06
215	0.06
216	0.06
217	0.06
218	0.06
219	0.06
220	0.04
221	0.04
222	0.04
223	0.04
224	0.06
225	0.06
226	0.06
227	0.08
228	0.09
229	0.12
230	0.16
231	0.22
232	0.24
233	0.33
234	0.36
235	0.42
236	0.46
237	0.49
238	0.55
239	0.59
240	0.63
241	0.57
242	0.59
243	0.55
244	0.54
245	0.56
246	0.48
247	0.44
248	0.37
249	0.34
250	0.29
251	0.33
252	0.33
253	0.27
254	0.27
255	0.23
256	0.27
257	0.3
258	0.34
259	0.28
260	0.25
261	0.24
262	0.25
263	0.23
264	0.23
265	0.21
266	0.19
267	0.18
268	0.17
269	0.2
270	0.21
271	0.28
272	0.33
273	0.35
274	0.35
275	0.38
276	0.4
277	0.4
278	0.46
279	0.46
280	0.48
281	0.48
282	0.48
283	0.46
284	0.43
285	0.42
286	0.4
287	0.33
288	0.27
289	0.22
290	0.22
291	0.22
292	0.22
293	0.2
294	0.12
295	0.1
296	0.06
297	0.06
298	0.05
299	0.04
300	0.05
301	0.04
302	0.05
303	0.05
304	0.07
305	0.08
306	0.07
307	0.08
308	0.08
309	0.09
310	0.1
311	0.09
312	0.08
313	0.11
314	0.11
315	0.1
316	0.1
317	0.1
318	0.15
319	0.16
320	0.16
321	0.13
322	0.14
323	0.15
324	0.17
325	0.16
326	0.12
327	0.11
328	0.11
329	0.11
330	0.1
331	0.1
332	0.09
333	0.09
334	0.08
335	0.09
336	0.08
337	0.07
338	0.08
339	0.08
340	0.07
341	0.06
342	0.06
343	0.05
344	0.05
345	0.04
346	0.03
347	0.03
348	0.03
349	0.03
350	0.03
351	0.03
352	0.07
353	0.1
354	0.12
355	0.13
356	0.15
357	0.17
358	0.19
359	0.24
360	0.29
361	0.29
362	0.3
363	0.31
364	0.3
365	0.29
366	0.27
367	0.22
368	0.14
369	0.11
370	0.1
371	0.07
372	0.06
373	0.05
374	0.05
375	0.05
376	0.06
377	0.06
378	0.06
379	0.06
380	0.07
381	0.08
382	0.07
383	0.07
384	0.06
385	0.06
386	0.06
387	0.06
388	0.06
389	0.06
390	0.06
391	0.06
392	0.07
393	0.07
394	0.07
395	0.06
396	0.08
397	0.08
398	0.08
399	0.08
400	0.08
401	0.07
402	0.08
403	0.08
404	0.06
405	0.06
406	0.07
407	0.08
408	0.1
409	0.16
410	0.22
411	0.23
412	0.25
413	0.27
414	0.32
415	0.34
416	0.37
417	0.4
418	0.4
419	0.46
420	0.47
421	0.45
422	0.44
423	0.44
424	0.46
425	0.46
426	0.45
427	0.43
428	0.43
429	0.47
430	0.45
431	0.46
432	0.47
433	0.41
434	0.39
435	0.38
436	0.4
437	0.36
438	0.36
439	0.32
440	0.28
441	0.31
442	0.34
443	0.31
444	0.29
445	0.28
446	0.28
447	0.33
448	0.31
449	0.3
450	0.28
451	0.29
452	0.29
453	0.31
454	0.31
455	0.29
456	0.32
457	0.37
458	0.35
459	0.35
460	0.35
461	0.33
462	0.3
463	0.26
464	0.23
465	0.14
466	0.14
467	0.12
468	0.14
469	0.15
470	0.16
471	0.18
472	0.18
473	0.2
474	0.22
475	0.25
476	0.26
477	0.26
478	0.27
479	0.29
480	0.29
481	0.29
482	0.25
483	0.23
484	0.2
485	0.18
486	0.16
487	0.13
488	0.14
489	0.12
490	0.14
491	0.16
492	0.17
493	0.17
494	0.17
495	0.16
496	0.16
497	0.16
498	0.17
499	0.15
500	0.19
501	0.19
502	0.22
503	0.25

A0A1V6SDD2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer