Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V6TSE5

Protein Details
Accession A0A1V6TSE5    Localization Confidence Low Confidence Score 9.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
335-362CKCASCGVRTCRKCKKRAHPGDCVYKLDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 12, cyto 5.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR031127  E3_UB_ligase_RBR  
IPR002867  IBR_dom  
IPR044066  TRIAD_supradom  
IPR017907  Znf_RING_CS  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0004842  F:ubiquitin-protein transferase activity  
GO:0016567  P:protein ubiquitination  
Pfam View protein in Pfam  
PF01485  IBR  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51873  TRIAD  
PS00518  ZF_RING_1  
CDD cd20335  BRcat_RBR  
Amino Acid Sequences MDQDTHQDTVSLVLELLLEDVDTNIDWFETQQQLLKASNQPANRLEELEPDELVAFRLWKSEFERLRVFLSDMQMATALSLEVKRTFTKRISAAIEKLLLSFCDVYLELLLEDLNTKIDGLKTQLQLMKATDQSVNLLEELEPDRGIALHIWKSEIEKQRVISSGSQTVTASSPQETNTFANRISTAIQKLLLPLKNIMRSIKASVLAHSKPEQLGDSIENAINLVDSAKSEIWRECVSCREDHIQDDMIKTKCSHFYCKCCLVRLFKNALRDESLFPPQCCHKPIAASEKMIGPVLVQKHKEKAIELKDPDRTYCSDSKCAQYLPRKATPTRVCKCASCGVRTCRKCKKRAHPGDCVYKLDALLEELADRKEWQRCSNCRRLIELSTGCNHIT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.09
3 0.1
4 0.06
5 0.05
6 0.05
7 0.05
8 0.05
9 0.05
10 0.06
11 0.05
12 0.06
13 0.06
14 0.07
15 0.12
16 0.14
17 0.15
18 0.19
19 0.2
20 0.23
21 0.25
22 0.29
23 0.3
24 0.34
25 0.39
26 0.37
27 0.41
28 0.42
29 0.46
30 0.42
31 0.39
32 0.33
33 0.34
34 0.37
35 0.33
36 0.29
37 0.23
38 0.22
39 0.19
40 0.19
41 0.13
42 0.1
43 0.08
44 0.13
45 0.13
46 0.16
47 0.22
48 0.3
49 0.33
50 0.37
51 0.42
52 0.4
53 0.42
54 0.39
55 0.37
56 0.31
57 0.3
58 0.28
59 0.23
60 0.21
61 0.19
62 0.17
63 0.14
64 0.11
65 0.08
66 0.06
67 0.07
68 0.08
69 0.1
70 0.12
71 0.16
72 0.18
73 0.24
74 0.25
75 0.31
76 0.32
77 0.36
78 0.4
79 0.41
80 0.41
81 0.39
82 0.38
83 0.32
84 0.3
85 0.24
86 0.18
87 0.15
88 0.13
89 0.1
90 0.09
91 0.09
92 0.09
93 0.09
94 0.09
95 0.07
96 0.06
97 0.06
98 0.05
99 0.05
100 0.05
101 0.05
102 0.05
103 0.05
104 0.06
105 0.07
106 0.08
107 0.11
108 0.17
109 0.18
110 0.22
111 0.25
112 0.25
113 0.26
114 0.26
115 0.26
116 0.21
117 0.22
118 0.18
119 0.16
120 0.16
121 0.16
122 0.15
123 0.11
124 0.11
125 0.08
126 0.1
127 0.11
128 0.11
129 0.09
130 0.09
131 0.09
132 0.08
133 0.09
134 0.07
135 0.09
136 0.11
137 0.11
138 0.12
139 0.12
140 0.15
141 0.23
142 0.3
143 0.3
144 0.3
145 0.31
146 0.33
147 0.34
148 0.33
149 0.28
150 0.23
151 0.24
152 0.22
153 0.21
154 0.19
155 0.18
156 0.17
157 0.15
158 0.13
159 0.09
160 0.1
161 0.1
162 0.11
163 0.12
164 0.13
165 0.15
166 0.15
167 0.14
168 0.14
169 0.13
170 0.13
171 0.13
172 0.14
173 0.12
174 0.12
175 0.12
176 0.11
177 0.13
178 0.17
179 0.18
180 0.16
181 0.17
182 0.2
183 0.22
184 0.23
185 0.22
186 0.19
187 0.18
188 0.19
189 0.18
190 0.18
191 0.16
192 0.17
193 0.21
194 0.2
195 0.21
196 0.2
197 0.2
198 0.17
199 0.18
200 0.16
201 0.11
202 0.12
203 0.11
204 0.11
205 0.11
206 0.1
207 0.1
208 0.09
209 0.08
210 0.07
211 0.06
212 0.05
213 0.03
214 0.03
215 0.06
216 0.06
217 0.07
218 0.09
219 0.1
220 0.13
221 0.14
222 0.15
223 0.14
224 0.19
225 0.21
226 0.2
227 0.23
228 0.25
229 0.25
230 0.26
231 0.27
232 0.25
233 0.23
234 0.24
235 0.27
236 0.22
237 0.22
238 0.22
239 0.22
240 0.26
241 0.27
242 0.35
243 0.36
244 0.42
245 0.47
246 0.56
247 0.55
248 0.53
249 0.55
250 0.53
251 0.53
252 0.54
253 0.55
254 0.48
255 0.54
256 0.51
257 0.49
258 0.45
259 0.4
260 0.36
261 0.32
262 0.38
263 0.34
264 0.32
265 0.33
266 0.35
267 0.36
268 0.35
269 0.34
270 0.28
271 0.28
272 0.33
273 0.4
274 0.38
275 0.36
276 0.35
277 0.34
278 0.33
279 0.29
280 0.23
281 0.14
282 0.15
283 0.19
284 0.24
285 0.25
286 0.27
287 0.32
288 0.36
289 0.37
290 0.35
291 0.38
292 0.4
293 0.46
294 0.47
295 0.48
296 0.52
297 0.52
298 0.51
299 0.45
300 0.4
301 0.38
302 0.4
303 0.39
304 0.39
305 0.4
306 0.43
307 0.43
308 0.43
309 0.45
310 0.47
311 0.51
312 0.52
313 0.56
314 0.57
315 0.56
316 0.64
317 0.65
318 0.67
319 0.63
320 0.62
321 0.58
322 0.54
323 0.58
324 0.56
325 0.52
326 0.48
327 0.52
328 0.54
329 0.61
330 0.66
331 0.71
332 0.73
333 0.77
334 0.79
335 0.81
336 0.84
337 0.85
338 0.89
339 0.88
340 0.88
341 0.88
342 0.9
343 0.83
344 0.76
345 0.67
346 0.57
347 0.48
348 0.39
349 0.3
350 0.21
351 0.17
352 0.13
353 0.12
354 0.12
355 0.13
356 0.13
357 0.15
358 0.18
359 0.25
360 0.29
361 0.37
362 0.45
363 0.55
364 0.63
365 0.72
366 0.75
367 0.71
368 0.73
369 0.7
370 0.64
371 0.63
372 0.58
373 0.53
374 0.48