Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V6SQJ0

Protein Details
Accession A0A1V6SQJ0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
4-37KITNSRKSNISTKIKRSKRSERKSERSVTRDIREHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
16-27KIKRSKRSERKS
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 10.5, mito 6, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000195  Rab-GAP-TBC_dom  
IPR035969  Rab-GAP_TBC_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF00566  RabGAP-TBC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50086  TBC_RABGAP  
Amino Acid Sequences MYSKITNSRKSNISTKIKRSKRSERKSERSVTRDIRENQPIRILSGNYVVSNFQPSNLPTSNSKGWNFQLHSPSVMASVKYTPPPTPSPPASCYAMSDDEEDEYNTITQAASSRGVKLLFSKSKVYVHPTSSSKDNIPGFIALVQQKPLPASHAPASHSRNTDTPSYLLAWVPESSLGEAYDTYVKVDLSEGDSPPRQKYLVPPLPTTTTYKDPIGLYSFAIPLSEIYSLLVRPPSLGWWFGSLVINTRAGDGFPALFFHDDECQSTILQKRKRVKENFDPFGNEGGLFWGGDEVLRWLRRYAEVQRSAVDSNVYLINPSDEDQLSFGRPVSHGDKSILAKAQPEAAAAGSRAEPPDASMDPFMKTLKETRWKVLEQLSKITTFTRRTANEIADNPRVPPQVRRLMKNPEIQTLQDEFDSARVYLARWAMSVAEQSDKERNQRIWTAQDMLEMENSSVGDFEILELETGNLALQERRRVLKLEEWQGFFDPTSGRLQVTTEEVKERIFHGGLDPNDGVRKEAWLFLLGVYSWDSSSEERQAMMNSKRDEYIRLKAGWWERMVEGNSTIEQFDHWREQKNRIEKDVHRTDRSIPLFAGEDIPHPDPDSPFAETGTNVHLEQMKDMLLTYNEFNPDLGYVQGMSDLLAPIYAVMQDDAVAFWAFVGFMDRMEYNFLRDQSGMRGQLLALDNLVQLMDPQLYLHLQSADSTNFFFFFRMLLVWYKREFDWGDVLRLWETLWTDYFSSSFHLFIALAILEKHRDVIMDHLKHFDEVLKYINELSNTMDLVPILTRAESLFHRFERSVQAIDKKDSPPAAPTAHQRRPGATGQDSPSGSKGKSPQRTVASSSGVNAGSSALQKAIDADKPKVISPELRQLLRKDIPWKRQQT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.7
2 0.75
3 0.79
4 0.81
5 0.85
6 0.86
7 0.88
8 0.88
9 0.89
10 0.9
11 0.9
12 0.92
13 0.92
14 0.92
15 0.9
16 0.84
17 0.83
18 0.8
19 0.76
20 0.75
21 0.7
22 0.69
23 0.7
24 0.67
25 0.6
26 0.6
27 0.54
28 0.47
29 0.46
30 0.39
31 0.31
32 0.33
33 0.32
34 0.25
35 0.25
36 0.24
37 0.2
38 0.25
39 0.23
40 0.18
41 0.2
42 0.21
43 0.27
44 0.28
45 0.3
46 0.27
47 0.34
48 0.4
49 0.42
50 0.43
51 0.41
52 0.43
53 0.49
54 0.5
55 0.5
56 0.49
57 0.45
58 0.45
59 0.4
60 0.36
61 0.3
62 0.29
63 0.22
64 0.18
65 0.2
66 0.22
67 0.26
68 0.28
69 0.27
70 0.3
71 0.36
72 0.4
73 0.44
74 0.46
75 0.47
76 0.48
77 0.5
78 0.49
79 0.43
80 0.39
81 0.36
82 0.33
83 0.28
84 0.27
85 0.24
86 0.21
87 0.21
88 0.2
89 0.15
90 0.13
91 0.12
92 0.1
93 0.1
94 0.08
95 0.08
96 0.09
97 0.11
98 0.14
99 0.15
100 0.16
101 0.19
102 0.19
103 0.2
104 0.23
105 0.3
106 0.32
107 0.34
108 0.37
109 0.38
110 0.43
111 0.45
112 0.48
113 0.44
114 0.42
115 0.46
116 0.45
117 0.45
118 0.44
119 0.44
120 0.39
121 0.4
122 0.37
123 0.31
124 0.3
125 0.27
126 0.23
127 0.21
128 0.24
129 0.2
130 0.2
131 0.2
132 0.19
133 0.19
134 0.2
135 0.19
136 0.18
137 0.17
138 0.2
139 0.23
140 0.26
141 0.27
142 0.34
143 0.39
144 0.4
145 0.41
146 0.39
147 0.38
148 0.37
149 0.38
150 0.33
151 0.29
152 0.25
153 0.24
154 0.23
155 0.2
156 0.18
157 0.16
158 0.14
159 0.14
160 0.12
161 0.11
162 0.11
163 0.11
164 0.1
165 0.09
166 0.09
167 0.1
168 0.12
169 0.11
170 0.11
171 0.12
172 0.11
173 0.11
174 0.12
175 0.11
176 0.12
177 0.15
178 0.15
179 0.19
180 0.23
181 0.25
182 0.26
183 0.27
184 0.23
185 0.22
186 0.28
187 0.35
188 0.4
189 0.41
190 0.42
191 0.43
192 0.46
193 0.47
194 0.44
195 0.37
196 0.33
197 0.32
198 0.31
199 0.31
200 0.27
201 0.27
202 0.26
203 0.23
204 0.19
205 0.17
206 0.17
207 0.14
208 0.14
209 0.11
210 0.08
211 0.09
212 0.08
213 0.07
214 0.07
215 0.08
216 0.08
217 0.1
218 0.1
219 0.09
220 0.09
221 0.09
222 0.12
223 0.13
224 0.14
225 0.13
226 0.14
227 0.15
228 0.16
229 0.17
230 0.14
231 0.16
232 0.17
233 0.18
234 0.15
235 0.16
236 0.14
237 0.12
238 0.12
239 0.1
240 0.08
241 0.07
242 0.07
243 0.07
244 0.08
245 0.08
246 0.09
247 0.11
248 0.11
249 0.13
250 0.14
251 0.14
252 0.13
253 0.17
254 0.22
255 0.27
256 0.32
257 0.38
258 0.46
259 0.55
260 0.65
261 0.69
262 0.71
263 0.74
264 0.79
265 0.77
266 0.7
267 0.64
268 0.56
269 0.5
270 0.42
271 0.3
272 0.2
273 0.16
274 0.13
275 0.09
276 0.08
277 0.06
278 0.05
279 0.05
280 0.05
281 0.06
282 0.1
283 0.11
284 0.12
285 0.13
286 0.14
287 0.17
288 0.21
289 0.27
290 0.32
291 0.36
292 0.36
293 0.37
294 0.38
295 0.36
296 0.32
297 0.25
298 0.15
299 0.12
300 0.12
301 0.11
302 0.08
303 0.08
304 0.08
305 0.08
306 0.09
307 0.1
308 0.09
309 0.09
310 0.1
311 0.11
312 0.11
313 0.11
314 0.11
315 0.09
316 0.1
317 0.13
318 0.16
319 0.17
320 0.18
321 0.18
322 0.22
323 0.22
324 0.25
325 0.23
326 0.19
327 0.18
328 0.17
329 0.19
330 0.15
331 0.14
332 0.11
333 0.1
334 0.1
335 0.09
336 0.09
337 0.07
338 0.08
339 0.08
340 0.08
341 0.07
342 0.07
343 0.11
344 0.1
345 0.11
346 0.11
347 0.12
348 0.13
349 0.14
350 0.13
351 0.1
352 0.11
353 0.13
354 0.19
355 0.27
356 0.29
357 0.32
358 0.37
359 0.37
360 0.39
361 0.43
362 0.41
363 0.34
364 0.36
365 0.33
366 0.29
367 0.29
368 0.27
369 0.25
370 0.22
371 0.23
372 0.25
373 0.25
374 0.29
375 0.32
376 0.32
377 0.32
378 0.32
379 0.35
380 0.32
381 0.31
382 0.27
383 0.28
384 0.27
385 0.24
386 0.24
387 0.26
388 0.32
389 0.35
390 0.38
391 0.39
392 0.46
393 0.51
394 0.55
395 0.49
396 0.44
397 0.42
398 0.39
399 0.37
400 0.3
401 0.25
402 0.17
403 0.16
404 0.11
405 0.11
406 0.11
407 0.08
408 0.07
409 0.06
410 0.06
411 0.09
412 0.1
413 0.09
414 0.08
415 0.08
416 0.08
417 0.08
418 0.09
419 0.07
420 0.08
421 0.08
422 0.1
423 0.15
424 0.16
425 0.19
426 0.22
427 0.23
428 0.24
429 0.27
430 0.27
431 0.26
432 0.26
433 0.26
434 0.21
435 0.22
436 0.19
437 0.16
438 0.15
439 0.12
440 0.1
441 0.07
442 0.07
443 0.05
444 0.05
445 0.04
446 0.03
447 0.03
448 0.03
449 0.04
450 0.04
451 0.04
452 0.04
453 0.04
454 0.03
455 0.04
456 0.03
457 0.03
458 0.03
459 0.05
460 0.07
461 0.1
462 0.12
463 0.14
464 0.15
465 0.17
466 0.19
467 0.24
468 0.29
469 0.34
470 0.36
471 0.36
472 0.36
473 0.35
474 0.33
475 0.26
476 0.21
477 0.13
478 0.1
479 0.11
480 0.11
481 0.1
482 0.1
483 0.1
484 0.1
485 0.13
486 0.13
487 0.12
488 0.13
489 0.14
490 0.14
491 0.14
492 0.14
493 0.13
494 0.11
495 0.1
496 0.11
497 0.16
498 0.16
499 0.18
500 0.17
501 0.16
502 0.17
503 0.17
504 0.16
505 0.11
506 0.13
507 0.1
508 0.11
509 0.11
510 0.1
511 0.1
512 0.1
513 0.1
514 0.08
515 0.08
516 0.08
517 0.07
518 0.06
519 0.06
520 0.07
521 0.08
522 0.1
523 0.12
524 0.12
525 0.12
526 0.13
527 0.14
528 0.19
529 0.22
530 0.26
531 0.25
532 0.26
533 0.27
534 0.27
535 0.31
536 0.29
537 0.31
538 0.29
539 0.28
540 0.28
541 0.32
542 0.35
543 0.34
544 0.3
545 0.26
546 0.22
547 0.25
548 0.26
549 0.21
550 0.18
551 0.15
552 0.15
553 0.14
554 0.13
555 0.09
556 0.08
557 0.1
558 0.12
559 0.18
560 0.2
561 0.28
562 0.31
563 0.39
564 0.46
565 0.54
566 0.54
567 0.52
568 0.57
569 0.53
570 0.6
571 0.62
572 0.6
573 0.54
574 0.52
575 0.5
576 0.52
577 0.5
578 0.41
579 0.31
580 0.26
581 0.25
582 0.23
583 0.22
584 0.14
585 0.13
586 0.15
587 0.17
588 0.15
589 0.15
590 0.16
591 0.14
592 0.17
593 0.17
594 0.16
595 0.15
596 0.15
597 0.15
598 0.14
599 0.15
600 0.13
601 0.13
602 0.11
603 0.12
604 0.14
605 0.14
606 0.14
607 0.14
608 0.12
609 0.1
610 0.11
611 0.11
612 0.08
613 0.09
614 0.1
615 0.12
616 0.13
617 0.13
618 0.13
619 0.12
620 0.11
621 0.11
622 0.09
623 0.07
624 0.06
625 0.06
626 0.06
627 0.06
628 0.06
629 0.06
630 0.06
631 0.05
632 0.05
633 0.05
634 0.04
635 0.05
636 0.04
637 0.04
638 0.04
639 0.04
640 0.05
641 0.05
642 0.05
643 0.06
644 0.06
645 0.05
646 0.05
647 0.05
648 0.05
649 0.04
650 0.07
651 0.06
652 0.06
653 0.08
654 0.09
655 0.09
656 0.14
657 0.14
658 0.15
659 0.19
660 0.2
661 0.2
662 0.2
663 0.21
664 0.21
665 0.27
666 0.24
667 0.21
668 0.21
669 0.19
670 0.24
671 0.24
672 0.19
673 0.13
674 0.12
675 0.12
676 0.11
677 0.12
678 0.06
679 0.05
680 0.06
681 0.06
682 0.05
683 0.05
684 0.06
685 0.07
686 0.08
687 0.09
688 0.09
689 0.09
690 0.1
691 0.12
692 0.12
693 0.13
694 0.13
695 0.12
696 0.12
697 0.12
698 0.12
699 0.1
700 0.09
701 0.09
702 0.08
703 0.1
704 0.15
705 0.18
706 0.21
707 0.23
708 0.25
709 0.24
710 0.29
711 0.28
712 0.24
713 0.3
714 0.28
715 0.3
716 0.29
717 0.3
718 0.25
719 0.24
720 0.22
721 0.15
722 0.14
723 0.13
724 0.13
725 0.14
726 0.14
727 0.14
728 0.15
729 0.13
730 0.15
731 0.14
732 0.13
733 0.11
734 0.11
735 0.11
736 0.11
737 0.12
738 0.08
739 0.08
740 0.08
741 0.1
742 0.1
743 0.1
744 0.11
745 0.1
746 0.1
747 0.1
748 0.19
749 0.27
750 0.31
751 0.32
752 0.34
753 0.35
754 0.34
755 0.34
756 0.3
757 0.22
758 0.19
759 0.22
760 0.19
761 0.19
762 0.21
763 0.23
764 0.19
765 0.18
766 0.19
767 0.17
768 0.16
769 0.16
770 0.14
771 0.11
772 0.12
773 0.11
774 0.1
775 0.08
776 0.08
777 0.08
778 0.08
779 0.11
780 0.13
781 0.18
782 0.23
783 0.24
784 0.29
785 0.29
786 0.31
787 0.37
788 0.38
789 0.37
790 0.37
791 0.44
792 0.44
793 0.47
794 0.5
795 0.43
796 0.45
797 0.43
798 0.39
799 0.34
800 0.34
801 0.34
802 0.32
803 0.41
804 0.46
805 0.51
806 0.57
807 0.55
808 0.53
809 0.55
810 0.57
811 0.54
812 0.48
813 0.48
814 0.44
815 0.49
816 0.47
817 0.44
818 0.41
819 0.38
820 0.33
821 0.32
822 0.37
823 0.4
824 0.49
825 0.53
826 0.57
827 0.61
828 0.65
829 0.64
830 0.61
831 0.56
832 0.47
833 0.43
834 0.39
835 0.32
836 0.28
837 0.22
838 0.17
839 0.15
840 0.16
841 0.15
842 0.11
843 0.11
844 0.11
845 0.14
846 0.17
847 0.21
848 0.24
849 0.27
850 0.31
851 0.33
852 0.35
853 0.35
854 0.35
855 0.36
856 0.37
857 0.45
858 0.47
859 0.5
860 0.53
861 0.52
862 0.58
863 0.56
864 0.56
865 0.55
866 0.58
867 0.63