Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C4EKD6

Protein Details
Accession A0A0C4EKD6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
442-464ANQLRVERRLLKKQNKLKIKILSHydrophilic
485-516NKLGHKDKNKSTKTSQKARSSKPKAGSNKAKSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
436-516RKRIKSANQLRVERRLLKKQNKLKIKILSSQKSKKQELQATLKPFKSALNKLGHKDKNKSTKTSQKARSSKPKAGSNKAKS
Subcellular Location(s) mito 14, nucl 12.5, cyto_nucl 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MRPKGCADAPMPVPCASFALRLNPSRQPTIFPSKKSETRKLSDMSVQSPHTSSTSSHPPETSEQKNTRTVFVGNVHIECVRNKSASRALSEHLLNPLKEETGLGTQARIESIRFRGIPLATPIRSEPPKSDHGTKRSKSWQEAQASSRPSFDDAMGGSAGRRGAKPLEPTETTAPPVKLLTDAQKRKIGYVTGNIHPEAKSCLAYVVIAPPPTSSQGSDDLSAIELAKLIATKSDGTTFMDRVLRCDIASQPPSKNSTKPGHSIDYKEQRRTLFIGGLDFAEEEDSIRKAVENRLLEEKKGSPDGATTWVERVRVVRDKATSLTKGFAYVLLRTQDAVEEMLALPEGSFTIGKRKVRLQKYLSSGQSSALKRTREPATANRSDKRGKANPTNQSTSSSGAKNSHNRPRIDLSKEIETSYKGPDQSQELANLDKDERKRIKSANQLRVERRLLKKQNKLKIKILSSQKSKKQELQATLKPFKSALNKLGHKDKNKSTKTSQKARSSKPKAGSNKAKS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.3
3 0.24
4 0.23
5 0.21
6 0.26
7 0.31
8 0.35
9 0.39
10 0.44
11 0.47
12 0.5
13 0.48
14 0.46
15 0.47
16 0.54
17 0.56
18 0.53
19 0.56
20 0.58
21 0.66
22 0.7
23 0.72
24 0.69
25 0.69
26 0.72
27 0.66
28 0.62
29 0.61
30 0.56
31 0.5
32 0.47
33 0.43
34 0.38
35 0.36
36 0.33
37 0.27
38 0.24
39 0.22
40 0.22
41 0.3
42 0.33
43 0.34
44 0.33
45 0.36
46 0.41
47 0.47
48 0.47
49 0.47
50 0.49
51 0.51
52 0.58
53 0.56
54 0.52
55 0.47
56 0.41
57 0.36
58 0.34
59 0.36
60 0.31
61 0.3
62 0.28
63 0.27
64 0.28
65 0.24
66 0.26
67 0.23
68 0.23
69 0.23
70 0.27
71 0.32
72 0.34
73 0.37
74 0.34
75 0.33
76 0.36
77 0.37
78 0.33
79 0.34
80 0.35
81 0.3
82 0.29
83 0.28
84 0.23
85 0.22
86 0.2
87 0.15
88 0.14
89 0.16
90 0.14
91 0.14
92 0.14
93 0.14
94 0.15
95 0.13
96 0.11
97 0.13
98 0.16
99 0.21
100 0.21
101 0.21
102 0.24
103 0.24
104 0.26
105 0.28
106 0.32
107 0.27
108 0.28
109 0.29
110 0.32
111 0.34
112 0.33
113 0.31
114 0.29
115 0.35
116 0.39
117 0.47
118 0.48
119 0.54
120 0.63
121 0.6
122 0.63
123 0.66
124 0.68
125 0.64
126 0.64
127 0.62
128 0.59
129 0.62
130 0.58
131 0.54
132 0.52
133 0.47
134 0.4
135 0.33
136 0.28
137 0.24
138 0.2
139 0.16
140 0.12
141 0.13
142 0.12
143 0.11
144 0.09
145 0.09
146 0.11
147 0.1
148 0.1
149 0.1
150 0.13
151 0.17
152 0.22
153 0.24
154 0.28
155 0.28
156 0.32
157 0.34
158 0.32
159 0.3
160 0.29
161 0.26
162 0.22
163 0.2
164 0.17
165 0.15
166 0.15
167 0.22
168 0.28
169 0.33
170 0.36
171 0.4
172 0.4
173 0.4
174 0.4
175 0.34
176 0.26
177 0.3
178 0.31
179 0.3
180 0.32
181 0.31
182 0.3
183 0.27
184 0.26
185 0.2
186 0.17
187 0.14
188 0.11
189 0.12
190 0.1
191 0.1
192 0.1
193 0.1
194 0.11
195 0.1
196 0.1
197 0.1
198 0.11
199 0.13
200 0.13
201 0.1
202 0.11
203 0.14
204 0.15
205 0.15
206 0.15
207 0.13
208 0.12
209 0.12
210 0.1
211 0.06
212 0.05
213 0.04
214 0.04
215 0.04
216 0.04
217 0.04
218 0.05
219 0.06
220 0.06
221 0.08
222 0.09
223 0.11
224 0.13
225 0.13
226 0.14
227 0.18
228 0.17
229 0.18
230 0.19
231 0.17
232 0.16
233 0.17
234 0.16
235 0.18
236 0.21
237 0.22
238 0.21
239 0.23
240 0.28
241 0.28
242 0.28
243 0.29
244 0.32
245 0.32
246 0.35
247 0.37
248 0.37
249 0.37
250 0.39
251 0.41
252 0.45
253 0.46
254 0.45
255 0.44
256 0.4
257 0.4
258 0.38
259 0.31
260 0.23
261 0.19
262 0.17
263 0.14
264 0.14
265 0.12
266 0.09
267 0.08
268 0.05
269 0.05
270 0.04
271 0.05
272 0.05
273 0.05
274 0.05
275 0.06
276 0.08
277 0.11
278 0.17
279 0.18
280 0.2
281 0.29
282 0.3
283 0.29
284 0.3
285 0.29
286 0.25
287 0.25
288 0.23
289 0.14
290 0.14
291 0.15
292 0.17
293 0.16
294 0.14
295 0.15
296 0.17
297 0.17
298 0.17
299 0.17
300 0.18
301 0.23
302 0.24
303 0.26
304 0.26
305 0.27
306 0.3
307 0.33
308 0.29
309 0.24
310 0.24
311 0.2
312 0.19
313 0.18
314 0.17
315 0.14
316 0.13
317 0.15
318 0.15
319 0.15
320 0.14
321 0.14
322 0.12
323 0.11
324 0.1
325 0.07
326 0.06
327 0.06
328 0.06
329 0.06
330 0.05
331 0.05
332 0.04
333 0.04
334 0.04
335 0.05
336 0.05
337 0.13
338 0.19
339 0.21
340 0.24
341 0.33
342 0.41
343 0.48
344 0.56
345 0.54
346 0.56
347 0.6
348 0.65
349 0.59
350 0.53
351 0.47
352 0.4
353 0.43
354 0.37
355 0.37
356 0.35
357 0.34
358 0.31
359 0.37
360 0.39
361 0.35
362 0.39
363 0.41
364 0.45
365 0.52
366 0.58
367 0.55
368 0.56
369 0.56
370 0.55
371 0.56
372 0.54
373 0.53
374 0.58
375 0.63
376 0.67
377 0.69
378 0.71
379 0.62
380 0.6
381 0.53
382 0.46
383 0.41
384 0.34
385 0.29
386 0.29
387 0.34
388 0.38
389 0.46
390 0.52
391 0.55
392 0.55
393 0.57
394 0.61
395 0.62
396 0.59
397 0.56
398 0.51
399 0.51
400 0.51
401 0.47
402 0.4
403 0.35
404 0.31
405 0.29
406 0.29
407 0.23
408 0.23
409 0.24
410 0.28
411 0.29
412 0.29
413 0.28
414 0.25
415 0.26
416 0.26
417 0.25
418 0.23
419 0.25
420 0.26
421 0.33
422 0.38
423 0.4
424 0.45
425 0.49
426 0.56
427 0.61
428 0.69
429 0.69
430 0.72
431 0.77
432 0.75
433 0.77
434 0.75
435 0.73
436 0.7
437 0.71
438 0.72
439 0.73
440 0.79
441 0.8
442 0.83
443 0.84
444 0.84
445 0.81
446 0.8
447 0.75
448 0.74
449 0.75
450 0.74
451 0.74
452 0.77
453 0.77
454 0.77
455 0.78
456 0.77
457 0.77
458 0.76
459 0.75
460 0.74
461 0.74
462 0.74
463 0.75
464 0.68
465 0.6
466 0.52
467 0.49
468 0.48
469 0.47
470 0.45
471 0.48
472 0.53
473 0.58
474 0.68
475 0.69
476 0.69
477 0.71
478 0.73
479 0.73
480 0.74
481 0.76
482 0.75
483 0.78
484 0.79
485 0.81
486 0.81
487 0.81
488 0.85
489 0.87
490 0.89
491 0.87
492 0.86
493 0.84
494 0.84
495 0.83
496 0.84