FuNGI

A0A1V6TC67

Protein Details

Accession

A0A1V6TC67

Localization Confidence

Low

Confidence Score

6.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
515-536	QQEKVLRQARKQEHETKKREAW	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

mito 12.5, cyto_mito 10.833, cyto 8, cyto_nucl 7.833, nucl 6.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR001680 WD40_repeat IPR036322 WD40_repeat_dom_sf IPR045227 WDR18/Ipi3/RID3
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0097344 C:Rix1 complex GO:0006364 P:rRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF00400 WD40
PROSITE	View protein in PROSITE PS50082 WD_REPEATS_2 PS50294 WD_REPEATS_REGION

Amino Acid Sequences

MLSESFVASTLSSAKSPTASLRDVGVCVHELQPSSILRLTFKKSSTLTNCLAVSPSHIFTAQADKAVLHVYNREKGNQEGVVPFPERIRSIAVAGGKYGDVLVLGTEGGRLILWETCTGRQVATTASHLQPVASLVVDPTSNFILSGSADASVHVWSLPGILSFSKPALSATRQPTNSPIRTFSNHRAAITSLAVGHSNGRHNIVVSTAKDNTAIAWDYHTGRALRTFLLPLSATSVALDPVDRAFYVGYEDGSVQSVDFYRSQSAQHLLHDPSVQSTPAQVSMEDRWLPPSAETGSAKAISLTYDGTTLLSGHANGKVLSWNVARRKYTSSVADYTHPITNLVMLPPGGIPHPSSDLKRKAHTIVKPRHDSGLSAPNHAPGAVPAEYMFHTQIIAPSDSRKPTEFSQALTHSSFPTSMIEDGLAELAAFRQPGSAEVTRVASNAAPARETPVDTAARDSQVTELENEVAVLKKKVAVNETARHNADDEVVQLRSDLANLQDYINELHEKQEAAQQEKVLRQARKQEHETKKREAWLAAEKKGRNGDAVIQKMDIDGAVTSDSDDPSDE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.14
2	0.15
3	0.17
4	0.22
5	0.24
6	0.24
7	0.25
8	0.28
9	0.28
10	0.28
11	0.27
12	0.23
13	0.19
14	0.19
15	0.2
16	0.19
17	0.18
18	0.18
19	0.22
20	0.21
21	0.23
22	0.23
23	0.22
24	0.24
25	0.29
26	0.34
27	0.35
28	0.35
29	0.38
30	0.37
31	0.46
32	0.49
33	0.5
34	0.47
35	0.46
36	0.45
37	0.39
38	0.39
39	0.29
40	0.27
41	0.24
42	0.23
43	0.19
44	0.18
45	0.18
46	0.18
47	0.26
48	0.22
49	0.21
50	0.2
51	0.18
52	0.19
53	0.21
54	0.21
55	0.14
56	0.2
57	0.23
58	0.29
59	0.31
60	0.34
61	0.34
62	0.35
63	0.39
64	0.34
65	0.31
66	0.27
67	0.27
68	0.28
69	0.27
70	0.25
71	0.22
72	0.23
73	0.21
74	0.2
75	0.22
76	0.19
77	0.19
78	0.21
79	0.23
80	0.2
81	0.19
82	0.19
83	0.15
84	0.14
85	0.12
86	0.08
87	0.05
88	0.05
89	0.05
90	0.04
91	0.04
92	0.04
93	0.04
94	0.04
95	0.04
96	0.04
97	0.04
98	0.05
99	0.07
100	0.08
101	0.11
102	0.13
103	0.14
104	0.16
105	0.17
106	0.16
107	0.14
108	0.14
109	0.14
110	0.14
111	0.16
112	0.19
113	0.19
114	0.21
115	0.21
116	0.2
117	0.18
118	0.17
119	0.14
120	0.09
121	0.08
122	0.06
123	0.08
124	0.08
125	0.07
126	0.08
127	0.08
128	0.08
129	0.08
130	0.08
131	0.08
132	0.08
133	0.09
134	0.07
135	0.07
136	0.07
137	0.07
138	0.08
139	0.07
140	0.07
141	0.06
142	0.05
143	0.05
144	0.05
145	0.05
146	0.05
147	0.06
148	0.06
149	0.07
150	0.08
151	0.09
152	0.09
153	0.09
154	0.1
155	0.13
156	0.16
157	0.23
158	0.28
159	0.35
160	0.36
161	0.36
162	0.42
163	0.47
164	0.47
165	0.42
166	0.4
167	0.36
168	0.4
169	0.45
170	0.45
171	0.47
172	0.44
173	0.42
174	0.4
175	0.36
176	0.34
177	0.28
178	0.21
179	0.12
180	0.11
181	0.11
182	0.09
183	0.1
184	0.11
185	0.13
186	0.14
187	0.15
188	0.15
189	0.15
190	0.15
191	0.16
192	0.17
193	0.16
194	0.18
195	0.17
196	0.17
197	0.17
198	0.17
199	0.14
200	0.13
201	0.12
202	0.09
203	0.09
204	0.11
205	0.12
206	0.13
207	0.15
208	0.13
209	0.13
210	0.15
211	0.15
212	0.14
213	0.13
214	0.13
215	0.11
216	0.12
217	0.12
218	0.1
219	0.12
220	0.12
221	0.1
222	0.1
223	0.1
224	0.09
225	0.08
226	0.08
227	0.05
228	0.05
229	0.06
230	0.05
231	0.05
232	0.05
233	0.05
234	0.07
235	0.07
236	0.06
237	0.06
238	0.07
239	0.07
240	0.07
241	0.07
242	0.05
243	0.05
244	0.06
245	0.07
246	0.08
247	0.08
248	0.09
249	0.1
250	0.11
251	0.12
252	0.15
253	0.15
254	0.16
255	0.19
256	0.18
257	0.18
258	0.19
259	0.17
260	0.14
261	0.14
262	0.13
263	0.09
264	0.09
265	0.08
266	0.09
267	0.09
268	0.07
269	0.09
270	0.1
271	0.13
272	0.13
273	0.12
274	0.13
275	0.13
276	0.14
277	0.12
278	0.13
279	0.11
280	0.13
281	0.13
282	0.12
283	0.13
284	0.13
285	0.13
286	0.11
287	0.1
288	0.07
289	0.07
290	0.07
291	0.06
292	0.06
293	0.06
294	0.06
295	0.06
296	0.06
297	0.06
298	0.05
299	0.06
300	0.06
301	0.07
302	0.08
303	0.08
304	0.08
305	0.09
306	0.09
307	0.11
308	0.12
309	0.17
310	0.22
311	0.27
312	0.28
313	0.29
314	0.33
315	0.33
316	0.36
317	0.34
318	0.32
319	0.3
320	0.31
321	0.3
322	0.28
323	0.27
324	0.24
325	0.2
326	0.16
327	0.14
328	0.13
329	0.12
330	0.11
331	0.09
332	0.07
333	0.07
334	0.07
335	0.07
336	0.06
337	0.06
338	0.06
339	0.07
340	0.12
341	0.13
342	0.16
343	0.24
344	0.31
345	0.34
346	0.36
347	0.38
348	0.39
349	0.45
350	0.48
351	0.51
352	0.53
353	0.59
354	0.62
355	0.6
356	0.58
357	0.51
358	0.45
359	0.4
360	0.39
361	0.31
362	0.29
363	0.28
364	0.26
365	0.25
366	0.24
367	0.19
368	0.11
369	0.14
370	0.11
371	0.1
372	0.09
373	0.1
374	0.11
375	0.13
376	0.13
377	0.08
378	0.09
379	0.09
380	0.11
381	0.13
382	0.13
383	0.12
384	0.15
385	0.2
386	0.22
387	0.24
388	0.23
389	0.24
390	0.25
391	0.34
392	0.32
393	0.29
394	0.33
395	0.33
396	0.35
397	0.33
398	0.32
399	0.23
400	0.22
401	0.2
402	0.15
403	0.14
404	0.12
405	0.11
406	0.11
407	0.1
408	0.09
409	0.09
410	0.08
411	0.07
412	0.05
413	0.04
414	0.04
415	0.05
416	0.05
417	0.05
418	0.06
419	0.06
420	0.08
421	0.14
422	0.15
423	0.15
424	0.17
425	0.19
426	0.18
427	0.18
428	0.18
429	0.12
430	0.14
431	0.17
432	0.16
433	0.15
434	0.15
435	0.2
436	0.2
437	0.21
438	0.19
439	0.2
440	0.21
441	0.21
442	0.25
443	0.22
444	0.23
445	0.22
446	0.21
447	0.17
448	0.18
449	0.18
450	0.15
451	0.14
452	0.13
453	0.13
454	0.12
455	0.12
456	0.12
457	0.13
458	0.13
459	0.12
460	0.16
461	0.18
462	0.22
463	0.24
464	0.29
465	0.34
466	0.4
467	0.46
468	0.49
469	0.48
470	0.45
471	0.43
472	0.36
473	0.31
474	0.25
475	0.2
476	0.16
477	0.15
478	0.14
479	0.13
480	0.13
481	0.12
482	0.11
483	0.11
484	0.09
485	0.13
486	0.14
487	0.14
488	0.14
489	0.15
490	0.16
491	0.17
492	0.18
493	0.15
494	0.16
495	0.18
496	0.18
497	0.18
498	0.21
499	0.24
500	0.26
501	0.29
502	0.3
503	0.33
504	0.35
505	0.42
506	0.45
507	0.44
508	0.45
509	0.53
510	0.59
511	0.63
512	0.69
513	0.72
514	0.75
515	0.81
516	0.82
517	0.81
518	0.78
519	0.76
520	0.72
521	0.63
522	0.58
523	0.58
524	0.59
525	0.58
526	0.59
527	0.54
528	0.55
529	0.59
530	0.54
531	0.45
532	0.4
533	0.41
534	0.42
535	0.46
536	0.41
537	0.36
538	0.35
539	0.32
540	0.3
541	0.21
542	0.13
543	0.08
544	0.07
545	0.08
546	0.08
547	0.09
548	0.11
549	0.11

A0A1V6TC67

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer