Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V6SH40

Protein Details
Accession A0A1V6SH40    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
132-152KDMERTRKLREQKKTEYEKGKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
52-63GRGRGRRGAAAP
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto_nucl 13.5, cyto 11
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00642  zf-CCCH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MSENDDLLAKIGQLAGQINRHKTQETQPANHQSQYVSRHVPSHPGWAPYYRGRGRGRRGAAAPHRHRTLVLNTAGTGSNTSGNSSPAPISANNSAVVPTPSSTGNGWVVKHDRHMQLINPAVYERKTQDRSKDMERTRKLREQKKTEYEKGKVLRYAQGSGASAMVSTTANPAAGHQILVNDVAFRVANGGSKLIRVSNDPSSANNTPKRVTVADVPFVRSKNGNLHRLGAVAMKKNHTVKKRDELCKRFTTTGTCYKGPTCPFVHDPSKVAMCKDFLQTGQCAAGSSCDLSHEPSPHRSPTCMHFLRGRCANPECRYAHVRVTPGAPVCRAFATLGYCEKGDACEEKHVHECPDYANTGACHKKRCQLPHVDRAGQIRKAAAAAASKADLGEDESDPSSEEENYDAIDSDDVDSDAFDDSPEELIEGVDSGEMSQQQDFIRF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.16
3 0.24
4 0.3
5 0.35
6 0.38
7 0.4
8 0.4
9 0.41
10 0.46
11 0.5
12 0.52
13 0.52
14 0.58
15 0.65
16 0.67
17 0.64
18 0.56
19 0.48
20 0.46
21 0.45
22 0.42
23 0.38
24 0.36
25 0.38
26 0.38
27 0.44
28 0.39
29 0.43
30 0.41
31 0.39
32 0.4
33 0.39
34 0.43
35 0.41
36 0.49
37 0.44
38 0.48
39 0.53
40 0.59
41 0.65
42 0.69
43 0.67
44 0.64
45 0.64
46 0.65
47 0.67
48 0.69
49 0.68
50 0.67
51 0.65
52 0.59
53 0.57
54 0.52
55 0.48
56 0.44
57 0.4
58 0.32
59 0.3
60 0.31
61 0.3
62 0.26
63 0.21
64 0.14
65 0.15
66 0.14
67 0.16
68 0.14
69 0.15
70 0.16
71 0.16
72 0.16
73 0.13
74 0.15
75 0.14
76 0.17
77 0.18
78 0.19
79 0.18
80 0.18
81 0.17
82 0.16
83 0.17
84 0.13
85 0.11
86 0.11
87 0.11
88 0.13
89 0.13
90 0.14
91 0.18
92 0.2
93 0.19
94 0.23
95 0.27
96 0.26
97 0.31
98 0.35
99 0.32
100 0.33
101 0.35
102 0.32
103 0.35
104 0.39
105 0.35
106 0.28
107 0.26
108 0.25
109 0.24
110 0.25
111 0.21
112 0.24
113 0.29
114 0.33
115 0.4
116 0.45
117 0.48
118 0.53
119 0.6
120 0.59
121 0.63
122 0.66
123 0.65
124 0.66
125 0.69
126 0.71
127 0.71
128 0.73
129 0.72
130 0.75
131 0.79
132 0.81
133 0.81
134 0.79
135 0.73
136 0.71
137 0.66
138 0.6
139 0.53
140 0.47
141 0.43
142 0.38
143 0.37
144 0.3
145 0.27
146 0.23
147 0.21
148 0.18
149 0.13
150 0.1
151 0.08
152 0.07
153 0.05
154 0.05
155 0.06
156 0.05
157 0.06
158 0.06
159 0.07
160 0.09
161 0.09
162 0.09
163 0.08
164 0.08
165 0.08
166 0.09
167 0.08
168 0.06
169 0.05
170 0.06
171 0.05
172 0.05
173 0.06
174 0.05
175 0.07
176 0.07
177 0.09
178 0.08
179 0.09
180 0.09
181 0.09
182 0.1
183 0.1
184 0.13
185 0.16
186 0.18
187 0.18
188 0.19
189 0.24
190 0.26
191 0.3
192 0.3
193 0.28
194 0.26
195 0.27
196 0.28
197 0.23
198 0.22
199 0.23
200 0.22
201 0.26
202 0.25
203 0.27
204 0.27
205 0.27
206 0.26
207 0.2
208 0.19
209 0.23
210 0.28
211 0.31
212 0.29
213 0.31
214 0.3
215 0.3
216 0.29
217 0.23
218 0.19
219 0.19
220 0.2
221 0.2
222 0.23
223 0.28
224 0.33
225 0.36
226 0.39
227 0.4
228 0.48
229 0.56
230 0.62
231 0.66
232 0.66
233 0.67
234 0.67
235 0.65
236 0.57
237 0.48
238 0.44
239 0.4
240 0.43
241 0.41
242 0.35
243 0.33
244 0.33
245 0.36
246 0.33
247 0.32
248 0.25
249 0.24
250 0.26
251 0.31
252 0.34
253 0.3
254 0.3
255 0.28
256 0.31
257 0.28
258 0.26
259 0.21
260 0.19
261 0.2
262 0.2
263 0.19
264 0.15
265 0.17
266 0.16
267 0.16
268 0.14
269 0.12
270 0.11
271 0.09
272 0.09
273 0.08
274 0.08
275 0.07
276 0.08
277 0.08
278 0.11
279 0.13
280 0.17
281 0.19
282 0.25
283 0.28
284 0.32
285 0.33
286 0.32
287 0.31
288 0.32
289 0.39
290 0.35
291 0.34
292 0.35
293 0.37
294 0.42
295 0.46
296 0.43
297 0.38
298 0.41
299 0.47
300 0.43
301 0.48
302 0.42
303 0.41
304 0.43
305 0.41
306 0.42
307 0.38
308 0.37
309 0.31
310 0.31
311 0.3
312 0.3
313 0.29
314 0.24
315 0.21
316 0.21
317 0.19
318 0.19
319 0.15
320 0.14
321 0.15
322 0.16
323 0.18
324 0.18
325 0.17
326 0.16
327 0.16
328 0.15
329 0.15
330 0.15
331 0.15
332 0.22
333 0.23
334 0.26
335 0.3
336 0.32
337 0.31
338 0.29
339 0.28
340 0.22
341 0.25
342 0.23
343 0.19
344 0.19
345 0.18
346 0.24
347 0.31
348 0.32
349 0.35
350 0.37
351 0.44
352 0.5
353 0.57
354 0.58
355 0.61
356 0.67
357 0.71
358 0.76
359 0.72
360 0.67
361 0.68
362 0.66
363 0.58
364 0.5
365 0.41
366 0.33
367 0.3
368 0.27
369 0.21
370 0.17
371 0.15
372 0.16
373 0.15
374 0.15
375 0.14
376 0.13
377 0.11
378 0.1
379 0.12
380 0.11
381 0.13
382 0.14
383 0.14
384 0.15
385 0.16
386 0.15
387 0.13
388 0.12
389 0.11
390 0.11
391 0.12
392 0.11
393 0.1
394 0.09
395 0.09
396 0.1
397 0.1
398 0.1
399 0.1
400 0.09
401 0.08
402 0.08
403 0.09
404 0.08
405 0.07
406 0.07
407 0.08
408 0.09
409 0.09
410 0.09
411 0.08
412 0.08
413 0.08
414 0.07
415 0.06
416 0.05
417 0.05
418 0.06
419 0.08
420 0.09
421 0.11
422 0.11
423 0.14