FuNGI

A0A1V6TC56

Protein Details

Accession

A0A1V6TC56

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
63-82	ASGHPDCKGRIRFKPPPTEE	Hydrophilic
1266-1293	PPDQKLIARRRIDKTKPNHKSEDRDTGL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 11.5, cyto_nucl 9, cyto 5.5, mito 5, pero 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR035979 RBD_domain_sf IPR007855 RNA-dep_RNA_pol_euk-typ
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding GO:0003968 F:RNA-dependent RNA polymerase activity GO:0031047 P:RNA-mediated gene silencing
Pfam	View protein in Pfam PF05183 RdRP
CDD	cd00590 RRM_SF

Amino Acid Sequences

MAPPNAPAPARRNSPVRDWITWRSWRTCAVDLLNLPREMNTHDIYDAFHRYGNLISIDLWEDASGHPDCKGRIRFKPPPTEEFWRTGSFGVKLRSGRVAVISLSVCCGDSNGTIQSPVRPDVQLPGEVLKELKTVQVDIGVLLGLSTFHSMQSFTNLAYPRCVVDVMRKCLFLYFRVGIRGSDTADVNQHDYRVKVTFLQLTQIYQQYDKATREHSFLIVLDSAAIWHRKAKDIQSTLTEPLSWREEDSWYRQTSVTHNPNSLKTLPTNLKKTGHIIDLGRWNVFKISFAPDVDPNMRRVEDTSHYLMCVEDIFKDYNITIQDGSHFVEKADRPVPVWHWIDFSESKSNKASALLQDLGNQNYLHLPFKVRYQLEVCLSQGYLSEFTMTREFVEKLKGLGDDQATRLLEFVATEKKQYLAPMEIFDLIFFKGVTDSKIPNYCCFMRTARVTPTTIYYNTPTVDISNRVVREWSTKGAPGRFLRVRFTDEKTEGRINASQRDCNDEIYTRVKRTLANGITIGDHRYEFLAFGNSQFREHGAYFVAPDAGISAGTIRAWMGQFNHIRNVAKYAARLGQCFSTTRAFTGSSVQTIPCGDIIRNGFTFSDGVGKISKFLAQMVTSQHDIKTLTGEPPSAFQFRLGGAKGMLVVSPDPLPQEVHVRPSQQKFETSQAGLEIIRWSQYSLATLNRQIILVLSALGIPDEVFHSKLNTMLGSFHRAMLNDSKAINLLQKYIDPNQTTLTLAQMVSDGFRRNEEPFVNTMLELWKSWHLKHLKEKAKIAIDQGANVLGVMDETGVLKGYFKKELPRRRASYAEKLAALPEIFVQICRLDGDGEYEVIEGLCILARNPSLHPGDIRVVRAVNRPELHALRNVVVLPQTGDQDIASMCSGGDLDGDDYLVIWDPDLIPANWFVECMDYKGSKAPDLDHDVTVDEITSFFVTYMKNDCLPRIAHAHLAWADRLPKGVWEDKCIRLAQLHSDAVDYNKSGAHARMARSLDPKFWPHFMEKRFKRPSSIYKSTKILGQLYDAVITPNFVPKLEKPFDSRILESPLAPASEAYMEYARELKVEFDMNMRQIMAQYEVNTEFEVWSTFVLRHGFVIKDYKMQEDLGRIVGTLRRGFRHQCYDKVGRDGGNIPALVIAMYRVTQEQVAAALEARRNEALQREDFSIVEVNSTELPLISFPWIFPDVLGDVATGRARQAIISEGQESGNSAKPIGEGLVFTHKQILNIVEDMDGEVKPNAENMKLKDKENMKPKAEAGSNSAPPDQKLIARRRIDKTKPNHKSEDRDTGLYIEENDEKEGGVAIGPAKTEEKIDKKEAVTEDIVEMEGDVKPSALDDLIKMISG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.57
2	0.61
3	0.62
4	0.6
5	0.61
6	0.63
7	0.64
8	0.68
9	0.66
10	0.61
11	0.58
12	0.58
13	0.57
14	0.53
15	0.51
16	0.46
17	0.46
18	0.44
19	0.49
20	0.49
21	0.44
22	0.4
23	0.34
24	0.32
25	0.29
26	0.3
27	0.24
28	0.2
29	0.2
30	0.21
31	0.22
32	0.25
33	0.27
34	0.22
35	0.22
36	0.21
37	0.21
38	0.22
39	0.23
40	0.19
41	0.16
42	0.15
43	0.15
44	0.17
45	0.16
46	0.15
47	0.11
48	0.11
49	0.11
50	0.15
51	0.14
52	0.13
53	0.15
54	0.18
55	0.2
56	0.29
57	0.38
58	0.41
59	0.49
60	0.59
61	0.66
62	0.72
63	0.81
64	0.78
65	0.76
66	0.75
67	0.75
68	0.69
69	0.64
70	0.6
71	0.51
72	0.46
73	0.42
74	0.38
75	0.32
76	0.33
77	0.32
78	0.33
79	0.32
80	0.33
81	0.36
82	0.33
83	0.31
84	0.28
85	0.27
86	0.21
87	0.24
88	0.21
89	0.17
90	0.17
91	0.16
92	0.14
93	0.12
94	0.12
95	0.1
96	0.1
97	0.13
98	0.14
99	0.14
100	0.16
101	0.17
102	0.21
103	0.23
104	0.24
105	0.24
106	0.22
107	0.23
108	0.27
109	0.3
110	0.27
111	0.25
112	0.26
113	0.23
114	0.23
115	0.23
116	0.17
117	0.16
118	0.14
119	0.16
120	0.14
121	0.14
122	0.14
123	0.16
124	0.15
125	0.14
126	0.13
127	0.1
128	0.08
129	0.07
130	0.07
131	0.04
132	0.05
133	0.07
134	0.07
135	0.07
136	0.08
137	0.09
138	0.1
139	0.15
140	0.15
141	0.14
142	0.19
143	0.23
144	0.23
145	0.25
146	0.25
147	0.21
148	0.21
149	0.21
150	0.17
151	0.24
152	0.32
153	0.36
154	0.38
155	0.38
156	0.37
157	0.4
158	0.41
159	0.32
160	0.3
161	0.27
162	0.27
163	0.3
164	0.31
165	0.27
166	0.29
167	0.28
168	0.23
169	0.22
170	0.21
171	0.18
172	0.21
173	0.22
174	0.23
175	0.22
176	0.22
177	0.22
178	0.21
179	0.22
180	0.21
181	0.2
182	0.19
183	0.22
184	0.25
185	0.24
186	0.28
187	0.27
188	0.26
189	0.29
190	0.3
191	0.28
192	0.24
193	0.26
194	0.25
195	0.3
196	0.3
197	0.29
198	0.31
199	0.31
200	0.33
201	0.32
202	0.28
203	0.24
204	0.22
205	0.22
206	0.17
207	0.15
208	0.12
209	0.1
210	0.1
211	0.11
212	0.12
213	0.1
214	0.15
215	0.17
216	0.22
217	0.27
218	0.32
219	0.39
220	0.42
221	0.45
222	0.45
223	0.47
224	0.44
225	0.4
226	0.35
227	0.26
228	0.26
229	0.26
230	0.2
231	0.19
232	0.18
233	0.22
234	0.25
235	0.31
236	0.35
237	0.33
238	0.34
239	0.33
240	0.34
241	0.34
242	0.41
243	0.43
244	0.4
245	0.44
246	0.45
247	0.46
248	0.49
249	0.45
250	0.38
251	0.3
252	0.35
253	0.38
254	0.43
255	0.46
256	0.47
257	0.48
258	0.47
259	0.5
260	0.46
261	0.4
262	0.36
263	0.32
264	0.32
265	0.36
266	0.35
267	0.32
268	0.28
269	0.26
270	0.24
271	0.23
272	0.19
273	0.14
274	0.17
275	0.19
276	0.2
277	0.22
278	0.22
279	0.26
280	0.3
281	0.3
282	0.26
283	0.26
284	0.26
285	0.24
286	0.23
287	0.24
288	0.23
289	0.26
290	0.28
291	0.26
292	0.25
293	0.25
294	0.23
295	0.18
296	0.16
297	0.11
298	0.08
299	0.1
300	0.11
301	0.11
302	0.12
303	0.12
304	0.14
305	0.14
306	0.15
307	0.13
308	0.12
309	0.13
310	0.13
311	0.15
312	0.14
313	0.13
314	0.11
315	0.18
316	0.18
317	0.22
318	0.23
319	0.22
320	0.22
321	0.25
322	0.28
323	0.29
324	0.31
325	0.26
326	0.25
327	0.25
328	0.29
329	0.27
330	0.28
331	0.3
332	0.28
333	0.3
334	0.3
335	0.31
336	0.26
337	0.26
338	0.26
339	0.19
340	0.24
341	0.23
342	0.21
343	0.25
344	0.27
345	0.26
346	0.24
347	0.21
348	0.16
349	0.17
350	0.18
351	0.15
352	0.14
353	0.16
354	0.15
355	0.2
356	0.27
357	0.24
358	0.26
359	0.27
360	0.31
361	0.31
362	0.32
363	0.28
364	0.22
365	0.21
366	0.18
367	0.16
368	0.14
369	0.11
370	0.1
371	0.11
372	0.1
373	0.12
374	0.14
375	0.13
376	0.12
377	0.14
378	0.15
379	0.14
380	0.18
381	0.17
382	0.16
383	0.17
384	0.17
385	0.15
386	0.17
387	0.18
388	0.16
389	0.16
390	0.2
391	0.18
392	0.18
393	0.17
394	0.14
395	0.11
396	0.1
397	0.11
398	0.14
399	0.14
400	0.15
401	0.16
402	0.17
403	0.18
404	0.18
405	0.19
406	0.16
407	0.17
408	0.17
409	0.18
410	0.18
411	0.17
412	0.15
413	0.14
414	0.1
415	0.09
416	0.07
417	0.06
418	0.07
419	0.08
420	0.1
421	0.12
422	0.14
423	0.18
424	0.23
425	0.25
426	0.25
427	0.29
428	0.28
429	0.26
430	0.28
431	0.26
432	0.25
433	0.29
434	0.31
435	0.31
436	0.33
437	0.33
438	0.31
439	0.32
440	0.3
441	0.26
442	0.24
443	0.22
444	0.2
445	0.2
446	0.19
447	0.17
448	0.14
449	0.15
450	0.15
451	0.16
452	0.18
453	0.18
454	0.18
455	0.19
456	0.18
457	0.21
458	0.21
459	0.21
460	0.18
461	0.21
462	0.25
463	0.26
464	0.31
465	0.28
466	0.33
467	0.35
468	0.35
469	0.35
470	0.34
471	0.38
472	0.35
473	0.38
474	0.37
475	0.36
476	0.36
477	0.37
478	0.37
479	0.32
480	0.31
481	0.3
482	0.26
483	0.31
484	0.31
485	0.3
486	0.28
487	0.34
488	0.32
489	0.3
490	0.3
491	0.23
492	0.23
493	0.28
494	0.3
495	0.24
496	0.25
497	0.25
498	0.24
499	0.26
500	0.32
501	0.26
502	0.25
503	0.24
504	0.23
505	0.23
506	0.22
507	0.2
508	0.12
509	0.11
510	0.09
511	0.09
512	0.08
513	0.07
514	0.08
515	0.09
516	0.09
517	0.1
518	0.15
519	0.14
520	0.15
521	0.15
522	0.15
523	0.15
524	0.15
525	0.15
526	0.11
527	0.11
528	0.1
529	0.11
530	0.1
531	0.07
532	0.06
533	0.06
534	0.04
535	0.04
536	0.04
537	0.04
538	0.04
539	0.04
540	0.04
541	0.03
542	0.05
543	0.05
544	0.07
545	0.08
546	0.14
547	0.18
548	0.19
549	0.23
550	0.24
551	0.25
552	0.24
553	0.26
554	0.22
555	0.2
556	0.19
557	0.18
558	0.21
559	0.21
560	0.21
561	0.19
562	0.17
563	0.17
564	0.18
565	0.18
566	0.16
567	0.15
568	0.15
569	0.16
570	0.15
571	0.14
572	0.18
573	0.16
574	0.14
575	0.14
576	0.14
577	0.13
578	0.12
579	0.12
580	0.09
581	0.09
582	0.07
583	0.1
584	0.12
585	0.14
586	0.14
587	0.14
588	0.13
589	0.13
590	0.13
591	0.09
592	0.12
593	0.09
594	0.1
595	0.11
596	0.11
597	0.11
598	0.11
599	0.13
600	0.09
601	0.09
602	0.1
603	0.09
604	0.11
605	0.12
606	0.14
607	0.14
608	0.14
609	0.14
610	0.14
611	0.14
612	0.12
613	0.12
614	0.11
615	0.12
616	0.12
617	0.12
618	0.11
619	0.12
620	0.15
621	0.13
622	0.12
623	0.11
624	0.11
625	0.11
626	0.13
627	0.12
628	0.1
629	0.09
630	0.09
631	0.09
632	0.08
633	0.07
634	0.05
635	0.05
636	0.05
637	0.06
638	0.06
639	0.06
640	0.06
641	0.07
642	0.07
643	0.13
644	0.12
645	0.16
646	0.18
647	0.21
648	0.25
649	0.29
650	0.33
651	0.28
652	0.29
653	0.28
654	0.3
655	0.29
656	0.25
657	0.21
658	0.17
659	0.17
660	0.14
661	0.12
662	0.09
663	0.06
664	0.07
665	0.06
666	0.06
667	0.06
668	0.07
669	0.07
670	0.08
671	0.1
672	0.11
673	0.12
674	0.13
675	0.13
676	0.13
677	0.11
678	0.1
679	0.08
680	0.07
681	0.06
682	0.05
683	0.04
684	0.04
685	0.04
686	0.04
687	0.03
688	0.03
689	0.04
690	0.05
691	0.06
692	0.06
693	0.07
694	0.07
695	0.09
696	0.09
697	0.08
698	0.07
699	0.09
700	0.1
701	0.14
702	0.14
703	0.14
704	0.14
705	0.15
706	0.16
707	0.18
708	0.18
709	0.16
710	0.15
711	0.14
712	0.14
713	0.14
714	0.15
715	0.11
716	0.11
717	0.09
718	0.11
719	0.13
720	0.16
721	0.21
722	0.19
723	0.19
724	0.19
725	0.2
726	0.19
727	0.16
728	0.14
729	0.1
730	0.09
731	0.08
732	0.07
733	0.06
734	0.06
735	0.08
736	0.09
737	0.08
738	0.1
739	0.11
740	0.12
741	0.16
742	0.16
743	0.17
744	0.16
745	0.18
746	0.18
747	0.16
748	0.15
749	0.13
750	0.13
751	0.1
752	0.11
753	0.14
754	0.15
755	0.15
756	0.22
757	0.24
758	0.29
759	0.38
760	0.46
761	0.5
762	0.53
763	0.56
764	0.54
765	0.54
766	0.51
767	0.43
768	0.39
769	0.31
770	0.27
771	0.24
772	0.18
773	0.14
774	0.13
775	0.11
776	0.04
777	0.04
778	0.03
779	0.03
780	0.02
781	0.03
782	0.03
783	0.04
784	0.04
785	0.05
786	0.08
787	0.1
788	0.12
789	0.13
790	0.22
791	0.3
792	0.4
793	0.48
794	0.55
795	0.57
796	0.59
797	0.66
798	0.63
799	0.64
800	0.61
801	0.55
802	0.46
803	0.42
804	0.38
805	0.31
806	0.25
807	0.15
808	0.09
809	0.08
810	0.07
811	0.07
812	0.08
813	0.07
814	0.07
815	0.07
816	0.07
817	0.06
818	0.06
819	0.09
820	0.09
821	0.09
822	0.09
823	0.08
824	0.08
825	0.07
826	0.07
827	0.03
828	0.03
829	0.03
830	0.03
831	0.03
832	0.05
833	0.06
834	0.08
835	0.08
836	0.14
837	0.15
838	0.15
839	0.16
840	0.17
841	0.21
842	0.21
843	0.22
844	0.18
845	0.18
846	0.19
847	0.25
848	0.24
849	0.25
850	0.24
851	0.24
852	0.28
853	0.29
854	0.28
855	0.26
856	0.25
857	0.2
858	0.21
859	0.19
860	0.15
861	0.14
862	0.13
863	0.1
864	0.1
865	0.1
866	0.09
867	0.09
868	0.08
869	0.08
870	0.08
871	0.08
872	0.06
873	0.06
874	0.05
875	0.05
876	0.05
877	0.04
878	0.05
879	0.04
880	0.04
881	0.04
882	0.04
883	0.04
884	0.04
885	0.04
886	0.05
887	0.04
888	0.04
889	0.04
890	0.04
891	0.06
892	0.08
893	0.07
894	0.08
895	0.09
896	0.1
897	0.09
898	0.09
899	0.08
900	0.09
901	0.09
902	0.1
903	0.13
904	0.12
905	0.13
906	0.18
907	0.19
908	0.18
909	0.19
910	0.19
911	0.21
912	0.29
913	0.3
914	0.26
915	0.25
916	0.23
917	0.23
918	0.21
919	0.16
920	0.08
921	0.05
922	0.06
923	0.06
924	0.05
925	0.05
926	0.07
927	0.07
928	0.09
929	0.13
930	0.14
931	0.18
932	0.18
933	0.19
934	0.21
935	0.21
936	0.22
937	0.23
938	0.22
939	0.22
940	0.21
941	0.24
942	0.24
943	0.24
944	0.22
945	0.19
946	0.2
947	0.17
948	0.18
949	0.14
950	0.14
951	0.17
952	0.24
953	0.23
954	0.27
955	0.32
956	0.34
957	0.38
958	0.36
959	0.32
960	0.27
961	0.28
962	0.27
963	0.27
964	0.25
965	0.21
966	0.22
967	0.21
968	0.2
969	0.2
970	0.15
971	0.1
972	0.1
973	0.11
974	0.12
975	0.12
976	0.17
977	0.2
978	0.21
979	0.27
980	0.29
981	0.31
982	0.35
983	0.35
984	0.33
985	0.33
986	0.36
987	0.32
988	0.33
989	0.32
990	0.33
991	0.4
992	0.42
993	0.49
994	0.5
995	0.58
996	0.65
997	0.63
998	0.63
999	0.63
1000	0.67
1001	0.66
1002	0.71
1003	0.66
1004	0.62
1005	0.64
1006	0.59
1007	0.54
1008	0.47
1009	0.39
1010	0.3
1011	0.27
1012	0.24
1013	0.21
1014	0.21
1015	0.18
1016	0.15
1017	0.12
1018	0.12
1019	0.1
1020	0.12
1021	0.12
1022	0.12
1023	0.15
1024	0.17
1025	0.26
1026	0.29
1027	0.31
1028	0.32
1029	0.38
1030	0.45
1031	0.45
1032	0.44
1033	0.39
1034	0.42
1035	0.4
1036	0.35
1037	0.31
1038	0.25
1039	0.21
1040	0.19
1041	0.15
1042	0.1
1043	0.1
1044	0.1
1045	0.1
1046	0.1
1047	0.1
1048	0.11
1049	0.13
1050	0.12
1051	0.11
1052	0.11
1053	0.1
1054	0.12
1055	0.13
1056	0.13
1057	0.15
1058	0.18
1059	0.18
1060	0.19
1061	0.18
1062	0.16
1063	0.15
1064	0.16
1065	0.15
1066	0.14
1067	0.13
1068	0.16
1069	0.17
1070	0.17
1071	0.17
1072	0.16
1073	0.13
1074	0.12
1075	0.12
1076	0.09
1077	0.08
1078	0.09
1079	0.09
1080	0.12
1081	0.13
1082	0.13
1083	0.14
1084	0.16
1085	0.16
1086	0.17
1087	0.24
1088	0.21
1089	0.26
1090	0.27
1091	0.28
1092	0.27
1093	0.28
1094	0.27
1095	0.24
1096	0.25
1097	0.21
1098	0.2
1099	0.17
1100	0.17
1101	0.18
1102	0.2
1103	0.22
1104	0.23
1105	0.24
1106	0.29
1107	0.34
1108	0.4
1109	0.48
1110	0.49
1111	0.5
1112	0.56
1113	0.6
1114	0.6
1115	0.6
1116	0.56
1117	0.46
1118	0.44
1119	0.41
1120	0.35
1121	0.31
1122	0.26
1123	0.2
1124	0.18
1125	0.16
1126	0.13
1127	0.11
1128	0.08
1129	0.05
1130	0.06
1131	0.07
1132	0.07
1133	0.08
1134	0.08
1135	0.08
1136	0.08
1137	0.09
1138	0.09
1139	0.08
1140	0.09
1141	0.12
1142	0.14
1143	0.14
1144	0.16
1145	0.16
1146	0.16
1147	0.18
1148	0.23
1149	0.25
1150	0.26
1151	0.28
1152	0.29
1153	0.3
1154	0.29
1155	0.28
1156	0.26
1157	0.2
1158	0.18
1159	0.15
1160	0.14
1161	0.13
1162	0.13
1163	0.11
1164	0.07
1165	0.08
1166	0.07
1167	0.08
1168	0.09
1169	0.09
1170	0.09
1171	0.14
1172	0.15
1173	0.15
1174	0.14
1175	0.15
1176	0.14
1177	0.14
1178	0.15
1179	0.1
1180	0.09
1181	0.11
1182	0.12
1183	0.1
1184	0.09
1185	0.1
1186	0.1
1187	0.1
1188	0.11
1189	0.12
1190	0.14
1191	0.17
1192	0.18
1193	0.17
1194	0.17
1195	0.17
1196	0.17
1197	0.17
1198	0.19
1199	0.17
1200	0.16
1201	0.16
1202	0.15
1203	0.16
1204	0.16
1205	0.14
1206	0.09
1207	0.11
1208	0.21
1209	0.2
1210	0.21
1211	0.27
1212	0.27
1213	0.27
1214	0.29
1215	0.29
1216	0.22
1217	0.23
1218	0.23
1219	0.16
1220	0.15
1221	0.16
1222	0.15
1223	0.12
1224	0.11
1225	0.1
1226	0.1
1227	0.1
1228	0.13
1229	0.14
1230	0.17
1231	0.23
1232	0.26
1233	0.37
1234	0.39
1235	0.41
1236	0.46
1237	0.51
1238	0.54
1239	0.59
1240	0.64
1241	0.57
1242	0.58
1243	0.58
1244	0.58
1245	0.55
1246	0.49
1247	0.47
1248	0.45
1249	0.46
1250	0.44
1251	0.46
1252	0.39
1253	0.36
1254	0.38
1255	0.33
1256	0.3
1257	0.35
1258	0.42
1259	0.47
1260	0.54
1261	0.61
1262	0.66
1263	0.74
1264	0.78
1265	0.78
1266	0.8
1267	0.82
1268	0.84
1269	0.84
1270	0.85
1271	0.82
1272	0.83
1273	0.81
1274	0.81
1275	0.75
1276	0.67
1277	0.6
1278	0.52
1279	0.46
1280	0.37
1281	0.3
1282	0.23
1283	0.22
1284	0.21
1285	0.21
1286	0.2
1287	0.17
1288	0.16
1289	0.16
1290	0.12
1291	0.08
1292	0.09
1293	0.09
1294	0.1
1295	0.1
1296	0.12
1297	0.13
1298	0.13
1299	0.17
1300	0.24
1301	0.31
1302	0.36
1303	0.41
1304	0.45
1305	0.45
1306	0.52
1307	0.5
1308	0.47
1309	0.41
1310	0.36
1311	0.32
1312	0.26
1313	0.25
1314	0.18
1315	0.16
1316	0.12
1317	0.11
1318	0.1
1319	0.09
1320	0.08
1321	0.08
1322	0.09
1323	0.1
1324	0.09
1325	0.1
1326	0.09
1327	0.13

A0A1V6TC56

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer