Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V6SWR7

Protein Details
Accession A0A1V6SWR7    Localization Confidence High Confidence Score 22.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
92-115APVKADKKAEKKPAAKKSKKEEAEBasic
414-438PVPTDDTPKKAKKGKKTEAPKAAATHydrophilic
444-465KSPATKAKGKVTKKATKTKSKAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
5-77KRVSKRKAAPVAADSPAKKTKKVEAKPAEATKETAPKSILKKNEKGTKSKTEKAAAPAKTNGEPARQVKPRKR
95-135KADKKAEKKPAAKKSKKEEAEAAPAPKKAAAKKAAPKTKKP
201-214TKKAERKLAKQLRK
313-351RRFKVTPWNRIEKKRLAKGKTREQWSKSIESEQKKREAK
421-465PKKAKKGKKTEAPKAAATESPAAKSPATKAKGKVTKKATKTKSKA
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12307  RRM_NIFK_like  
Amino Acid Sequences MAPDKRVSKRKAAPVAADSPAKKTKKVEAKPAEATKETAPKSILKKNEKGTKSKTEKAAAPAKTNGEPARQVKPRKRAADFLTDEEADEPVAPVKADKKAEKKPAAKKSKKEEAEAAPAPKKAAAKKAAPKTKKPEPVVESEEEDAEEDVSPADESEAENEGDDDDQTEALIKGFESSGDEDESDGEGYKEGEPIPKAPDTKKAERKLAKQLRKNGPPEEPGTVYIGRIPHGFYEHQMKAYFSQFGEITKLRLSRNRLTGRSKHYAFIEFSSTTVAKIVADTMDNYLMYGHIVKCKFVPKEQLHPEIWKGANRRFKVTPWNRIEKKRLAKGKTREQWSKSIESEQKKREAKVNKLKALGYELDLPQLKSVDDVPVQEAPKAVEAAEATETTTEEPTKAIEAPAPTEAPAPVEAPVPTDDTPKKAKKGKKTEAPKAAATESPAAKSPATKAKGKVTKKATKTKSKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.69
2 0.69
3 0.63
4 0.6
5 0.51
6 0.48
7 0.51
8 0.47
9 0.45
10 0.44
11 0.49
12 0.54
13 0.6
14 0.65
15 0.65
16 0.71
17 0.76
18 0.78
19 0.74
20 0.65
21 0.6
22 0.55
23 0.54
24 0.48
25 0.42
26 0.37
27 0.38
28 0.43
29 0.48
30 0.52
31 0.52
32 0.58
33 0.65
34 0.72
35 0.71
36 0.73
37 0.73
38 0.75
39 0.74
40 0.74
41 0.72
42 0.68
43 0.67
44 0.66
45 0.67
46 0.6
47 0.56
48 0.53
49 0.5
50 0.46
51 0.47
52 0.41
53 0.37
54 0.4
55 0.39
56 0.44
57 0.48
58 0.56
59 0.59
60 0.67
61 0.72
62 0.73
63 0.74
64 0.72
65 0.7
66 0.7
67 0.65
68 0.6
69 0.55
70 0.46
71 0.42
72 0.34
73 0.29
74 0.19
75 0.15
76 0.11
77 0.08
78 0.08
79 0.07
80 0.08
81 0.12
82 0.18
83 0.24
84 0.3
85 0.38
86 0.46
87 0.57
88 0.65
89 0.7
90 0.74
91 0.79
92 0.84
93 0.84
94 0.83
95 0.83
96 0.84
97 0.79
98 0.73
99 0.7
100 0.64
101 0.64
102 0.59
103 0.55
104 0.48
105 0.45
106 0.41
107 0.36
108 0.35
109 0.3
110 0.34
111 0.34
112 0.39
113 0.47
114 0.57
115 0.64
116 0.66
117 0.71
118 0.71
119 0.74
120 0.75
121 0.7
122 0.69
123 0.63
124 0.64
125 0.61
126 0.55
127 0.48
128 0.39
129 0.35
130 0.26
131 0.23
132 0.16
133 0.11
134 0.09
135 0.06
136 0.05
137 0.06
138 0.05
139 0.05
140 0.05
141 0.05
142 0.05
143 0.06
144 0.08
145 0.08
146 0.08
147 0.08
148 0.08
149 0.08
150 0.08
151 0.07
152 0.05
153 0.05
154 0.05
155 0.06
156 0.06
157 0.06
158 0.06
159 0.05
160 0.05
161 0.05
162 0.06
163 0.07
164 0.08
165 0.09
166 0.09
167 0.1
168 0.09
169 0.1
170 0.1
171 0.08
172 0.07
173 0.06
174 0.06
175 0.07
176 0.07
177 0.07
178 0.07
179 0.1
180 0.1
181 0.12
182 0.15
183 0.16
184 0.19
185 0.19
186 0.28
187 0.33
188 0.41
189 0.49
190 0.51
191 0.57
192 0.61
193 0.65
194 0.67
195 0.7
196 0.69
197 0.67
198 0.72
199 0.72
200 0.74
201 0.73
202 0.65
203 0.59
204 0.54
205 0.49
206 0.41
207 0.33
208 0.26
209 0.25
210 0.21
211 0.17
212 0.15
213 0.14
214 0.12
215 0.11
216 0.1
217 0.08
218 0.1
219 0.11
220 0.1
221 0.17
222 0.17
223 0.19
224 0.19
225 0.19
226 0.18
227 0.2
228 0.2
229 0.12
230 0.13
231 0.11
232 0.12
233 0.15
234 0.13
235 0.13
236 0.14
237 0.17
238 0.16
239 0.21
240 0.27
241 0.29
242 0.38
243 0.43
244 0.46
245 0.5
246 0.55
247 0.58
248 0.59
249 0.55
250 0.48
251 0.44
252 0.42
253 0.36
254 0.31
255 0.28
256 0.2
257 0.19
258 0.19
259 0.17
260 0.14
261 0.13
262 0.11
263 0.07
264 0.07
265 0.08
266 0.05
267 0.06
268 0.06
269 0.07
270 0.08
271 0.07
272 0.07
273 0.07
274 0.06
275 0.06
276 0.08
277 0.08
278 0.12
279 0.13
280 0.13
281 0.16
282 0.22
283 0.24
284 0.25
285 0.34
286 0.33
287 0.43
288 0.49
289 0.53
290 0.48
291 0.49
292 0.47
293 0.43
294 0.4
295 0.35
296 0.33
297 0.34
298 0.41
299 0.4
300 0.44
301 0.4
302 0.41
303 0.48
304 0.52
305 0.55
306 0.54
307 0.63
308 0.65
309 0.7
310 0.75
311 0.73
312 0.73
313 0.72
314 0.73
315 0.69
316 0.72
317 0.73
318 0.77
319 0.76
320 0.75
321 0.75
322 0.7
323 0.72
324 0.68
325 0.64
326 0.55
327 0.55
328 0.54
329 0.54
330 0.59
331 0.56
332 0.61
333 0.6
334 0.6
335 0.6
336 0.61
337 0.63
338 0.65
339 0.7
340 0.66
341 0.65
342 0.64
343 0.57
344 0.52
345 0.43
346 0.34
347 0.29
348 0.24
349 0.25
350 0.26
351 0.25
352 0.21
353 0.21
354 0.18
355 0.14
356 0.15
357 0.14
358 0.14
359 0.15
360 0.16
361 0.21
362 0.21
363 0.21
364 0.21
365 0.18
366 0.18
367 0.18
368 0.14
369 0.11
370 0.11
371 0.12
372 0.13
373 0.12
374 0.1
375 0.11
376 0.11
377 0.1
378 0.12
379 0.11
380 0.1
381 0.1
382 0.11
383 0.12
384 0.13
385 0.12
386 0.14
387 0.15
388 0.17
389 0.19
390 0.19
391 0.18
392 0.18
393 0.17
394 0.16
395 0.15
396 0.14
397 0.12
398 0.13
399 0.13
400 0.14
401 0.15
402 0.17
403 0.17
404 0.23
405 0.25
406 0.28
407 0.37
408 0.42
409 0.49
410 0.54
411 0.62
412 0.65
413 0.75
414 0.8
415 0.81
416 0.85
417 0.87
418 0.89
419 0.86
420 0.78
421 0.72
422 0.64
423 0.55
424 0.48
425 0.44
426 0.36
427 0.33
428 0.31
429 0.29
430 0.26
431 0.27
432 0.3
433 0.33
434 0.36
435 0.4
436 0.42
437 0.51
438 0.6
439 0.64
440 0.67
441 0.68
442 0.73
443 0.77
444 0.82
445 0.82