FuNGI

A0A1V6TH67

Protein Details

Accession

A0A1V6TH67

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
23-43	TFTPPAQPSNHKRPRLNPTES	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 20.5, cyto_nucl 14, cyto 6.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027417 P-loop_NTPase IPR003395 RecF/RecN/SMC_N IPR027131 SMC5
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0030915 C:Smc5-Smc6 complex GO:0005524 F:ATP binding GO:0016887 F:ATP hydrolysis activity GO:0000724 P:double-strand break repair via homologous recombination
Pfam	View protein in Pfam PF02463 SMC_N

Amino Acid Sequences

MASPSIPRRRPHSEDEEEDGDPTFTPPAQPSNHKRPRLNPTESDDDSEPGDESEGGGEGESDGDSAGSETPEAASQAPRAIAHDGLGPGGYKPGAIVRIKVTNFVTYTSAVFYPGPKLNMVIGPNGTGKSTLVCAICLGLGWGPQHLGRAKDLGEFVKHGAREATIEIELCGPPKIGRNPVIQRTIKRDGNKSSFTVNGANASKNDVLKLAQSFAIQVDNLCQFLPQDKVAEFAALTPIELLHSTQRAAAGPEMTQWHDALKRLRAEQKKLEMDNSGDKELLENMENRQEMQRADVERMRQRAVIKRKIEILERCRPIVEYKEHHNAVEALKVTKAEVEREYHRIQAENEPILRAVNAKEAYIAQLNSVKDDRKDSVGEASRVATERGQKIDEFENKIKDLNDRIEAERKSGQRHKSEAALAQQAINRLRRQQEEEAVEFDPEFYNETLREKRREKRELEIKAREIQDRRQPLQDQQQQVQRNIQQAERQLSSLDSASGQQELKLQKLSHDTLKAYRWLLENQSKFEKEVFGPPIVTCSVTDPKYADAVESLFQKTDFTSFTVQTRNDFRTLQLAINQTLKLHDISIRTCSLSLDTMRAPMSNDQLAQLGFDGWARDFLAGPNPVIAMLCSEKNLHSTPIGLREISNEVFARLEEGLMSSWVSGKRSYQVTRRREYGPGATSTRVREIKPAQVWTEQPVDVSLKREHQQNIMLWNEQLQDIKEKLESERAAVLKIREEHEQAEREMNDIEKEKSAKQTAHTQYRAIPEKISQQEAKFRNITSMFDGVRERVRGFRNQQDEIAIQKAEAAVEYADAVELFRQAHEELMKVEVLFLEATSDLQTLRHRNIDSTKLLEAKRREAQEATVKLRESKVKARAVLQKAQRISRELHDEPDAQAILEGLDDHDMDKLEADIDSEKARLELTHGGSSHMIKEFEDRERSIEKLRSKLADFLNKLTELGNAIADIRKDWEPKLEALIEKISDAFSDSFRRIGCAGQVTLGKAEGEPGPNGEPGASEFGEWSIVIHVQFREGAGLSVLDSHRQSGGERAVSTIFYLMALQSLSASPFRVVDEINQGMDPRNERMVHGRLVDIACASSETEETDENGNPIGGGGGGQYFLITPKLLEQLSYKPGMRVLCIYSGEHMPEDYDKTNFKKAIRSMRAVAASAITSGPSEPMQSNGQVDVYA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.67
2	0.69
3	0.66
4	0.57
5	0.51
6	0.43
7	0.33
8	0.25
9	0.2
10	0.15
11	0.11
12	0.13
13	0.15
14	0.21
15	0.26
16	0.35
17	0.44
18	0.54
19	0.63
20	0.69
21	0.73
22	0.76
23	0.81
24	0.81
25	0.8
26	0.76
27	0.73
28	0.73
29	0.69
30	0.65
31	0.56
32	0.47
33	0.4
34	0.34
35	0.27
36	0.18
37	0.17
38	0.12
39	0.1
40	0.1
41	0.09
42	0.08
43	0.07
44	0.07
45	0.06
46	0.07
47	0.06
48	0.06
49	0.05
50	0.05
51	0.05
52	0.06
53	0.07
54	0.06
55	0.07
56	0.07
57	0.08
58	0.09
59	0.1
60	0.1
61	0.11
62	0.13
63	0.15
64	0.17
65	0.16
66	0.18
67	0.19
68	0.18
69	0.17
70	0.19
71	0.17
72	0.16
73	0.16
74	0.14
75	0.11
76	0.13
77	0.12
78	0.08
79	0.08
80	0.11
81	0.18
82	0.18
83	0.21
84	0.24
85	0.32
86	0.32
87	0.36
88	0.35
89	0.33
90	0.32
91	0.32
92	0.29
93	0.23
94	0.23
95	0.21
96	0.19
97	0.17
98	0.17
99	0.16
100	0.2
101	0.23
102	0.23
103	0.21
104	0.22
105	0.23
106	0.26
107	0.26
108	0.24
109	0.2
110	0.21
111	0.23
112	0.22
113	0.2
114	0.16
115	0.15
116	0.13
117	0.14
118	0.15
119	0.14
120	0.14
121	0.13
122	0.13
123	0.13
124	0.11
125	0.11
126	0.07
127	0.09
128	0.09
129	0.1
130	0.11
131	0.11
132	0.16
133	0.19
134	0.2
135	0.19
136	0.21
137	0.22
138	0.24
139	0.26
140	0.24
141	0.23
142	0.23
143	0.23
144	0.26
145	0.25
146	0.23
147	0.21
148	0.19
149	0.18
150	0.18
151	0.18
152	0.14
153	0.14
154	0.13
155	0.15
156	0.14
157	0.14
158	0.13
159	0.11
160	0.12
161	0.19
162	0.24
163	0.28
164	0.33
165	0.41
166	0.49
167	0.56
168	0.64
169	0.62
170	0.62
171	0.63
172	0.67
173	0.64
174	0.62
175	0.62
176	0.62
177	0.64
178	0.63
179	0.56
180	0.51
181	0.47
182	0.43
183	0.39
184	0.3
185	0.29
186	0.27
187	0.27
188	0.24
189	0.27
190	0.27
191	0.24
192	0.24
193	0.19
194	0.17
195	0.19
196	0.2
197	0.17
198	0.16
199	0.15
200	0.15
201	0.15
202	0.16
203	0.12
204	0.11
205	0.13
206	0.12
207	0.13
208	0.12
209	0.11
210	0.1
211	0.13
212	0.16
213	0.13
214	0.15
215	0.15
216	0.17
217	0.17
218	0.17
219	0.14
220	0.11
221	0.14
222	0.11
223	0.11
224	0.09
225	0.09
226	0.09
227	0.09
228	0.1
229	0.1
230	0.11
231	0.12
232	0.12
233	0.14
234	0.14
235	0.15
236	0.16
237	0.13
238	0.12
239	0.15
240	0.16
241	0.17
242	0.17
243	0.16
244	0.17
245	0.18
246	0.22
247	0.24
248	0.28
249	0.3
250	0.35
251	0.44
252	0.48
253	0.54
254	0.57
255	0.61
256	0.63
257	0.61
258	0.57
259	0.51
260	0.47
261	0.48
262	0.43
263	0.35
264	0.28
265	0.26
266	0.24
267	0.23
268	0.21
269	0.14
270	0.13
271	0.13
272	0.19
273	0.19
274	0.19
275	0.2
276	0.21
277	0.2
278	0.21
279	0.24
280	0.2
281	0.25
282	0.27
283	0.31
284	0.34
285	0.38
286	0.36
287	0.34
288	0.37
289	0.42
290	0.49
291	0.52
292	0.49
293	0.49
294	0.53
295	0.53
296	0.56
297	0.55
298	0.53
299	0.54
300	0.54
301	0.52
302	0.46
303	0.44
304	0.4
305	0.38
306	0.37
307	0.32
308	0.36
309	0.44
310	0.44
311	0.43
312	0.41
313	0.36
314	0.3
315	0.3
316	0.24
317	0.16
318	0.16
319	0.16
320	0.14
321	0.16
322	0.16
323	0.15
324	0.16
325	0.19
326	0.22
327	0.28
328	0.29
329	0.29
330	0.29
331	0.28
332	0.28
333	0.31
334	0.33
335	0.31
336	0.3
337	0.27
338	0.26
339	0.24
340	0.22
341	0.16
342	0.12
343	0.14
344	0.14
345	0.14
346	0.14
347	0.14
348	0.16
349	0.17
350	0.16
351	0.12
352	0.16
353	0.16
354	0.18
355	0.2
356	0.2
357	0.18
358	0.22
359	0.23
360	0.21
361	0.22
362	0.2
363	0.26
364	0.29
365	0.29
366	0.25
367	0.24
368	0.23
369	0.23
370	0.23
371	0.17
372	0.18
373	0.2
374	0.22
375	0.22
376	0.21
377	0.23
378	0.29
379	0.32
380	0.33
381	0.34
382	0.35
383	0.34
384	0.36
385	0.34
386	0.3
387	0.28
388	0.25
389	0.26
390	0.25
391	0.27
392	0.33
393	0.32
394	0.33
395	0.35
396	0.33
397	0.37
398	0.42
399	0.46
400	0.44
401	0.48
402	0.46
403	0.44
404	0.45
405	0.4
406	0.37
407	0.33
408	0.28
409	0.26
410	0.25
411	0.25
412	0.26
413	0.26
414	0.24
415	0.25
416	0.3
417	0.31
418	0.35
419	0.36
420	0.39
421	0.39
422	0.39
423	0.37
424	0.33
425	0.3
426	0.24
427	0.2
428	0.14
429	0.09
430	0.1
431	0.07
432	0.08
433	0.09
434	0.13
435	0.19
436	0.24
437	0.31
438	0.36
439	0.44
440	0.53
441	0.6
442	0.59
443	0.62
444	0.67
445	0.69
446	0.71
447	0.7
448	0.63
449	0.61
450	0.6
451	0.55
452	0.48
453	0.45
454	0.44
455	0.45
456	0.44
457	0.43
458	0.43
459	0.43
460	0.51
461	0.52
462	0.48
463	0.45
464	0.5
465	0.48
466	0.47
467	0.47
468	0.4
469	0.39
470	0.36
471	0.33
472	0.3
473	0.3
474	0.33
475	0.28
476	0.25
477	0.2
478	0.19
479	0.18
480	0.15
481	0.11
482	0.07
483	0.07
484	0.08
485	0.09
486	0.09
487	0.08
488	0.12
489	0.13
490	0.14
491	0.17
492	0.16
493	0.17
494	0.22
495	0.24
496	0.23
497	0.25
498	0.25
499	0.25
500	0.27
501	0.27
502	0.23
503	0.23
504	0.21
505	0.21
506	0.26
507	0.3
508	0.29
509	0.3
510	0.34
511	0.32
512	0.3
513	0.29
514	0.25
515	0.19
516	0.23
517	0.22
518	0.18
519	0.18
520	0.17
521	0.19
522	0.17
523	0.16
524	0.1
525	0.12
526	0.16
527	0.16
528	0.17
529	0.15
530	0.16
531	0.17
532	0.16
533	0.12
534	0.08
535	0.08
536	0.09
537	0.11
538	0.1
539	0.09
540	0.09
541	0.09
542	0.09
543	0.09
544	0.09
545	0.09
546	0.11
547	0.11
548	0.13
549	0.18
550	0.18
551	0.19
552	0.22
553	0.22
554	0.22
555	0.22
556	0.2
557	0.2
558	0.21
559	0.19
560	0.19
561	0.19
562	0.18
563	0.2
564	0.19
565	0.15
566	0.14
567	0.14
568	0.11
569	0.09
570	0.1
571	0.1
572	0.11
573	0.14
574	0.14
575	0.13
576	0.13
577	0.13
578	0.11
579	0.11
580	0.11
581	0.1
582	0.09
583	0.11
584	0.11
585	0.11
586	0.11
587	0.11
588	0.13
589	0.11
590	0.11
591	0.1
592	0.11
593	0.11
594	0.09
595	0.08
596	0.06
597	0.05
598	0.05
599	0.05
600	0.04
601	0.05
602	0.05
603	0.06
604	0.06
605	0.06
606	0.1
607	0.1
608	0.1
609	0.1
610	0.09
611	0.09
612	0.09
613	0.08
614	0.05
615	0.06
616	0.06
617	0.07
618	0.08
619	0.08
620	0.11
621	0.12
622	0.11
623	0.1
624	0.12
625	0.12
626	0.17
627	0.17
628	0.15
629	0.14
630	0.15
631	0.17
632	0.16
633	0.17
634	0.11
635	0.11
636	0.11
637	0.11
638	0.1
639	0.07
640	0.07
641	0.05
642	0.06
643	0.05
644	0.05
645	0.06
646	0.04
647	0.07
648	0.08
649	0.09
650	0.09
651	0.09
652	0.13
653	0.18
654	0.22
655	0.28
656	0.37
657	0.43
658	0.46
659	0.5
660	0.48
661	0.46
662	0.45
663	0.42
664	0.36
665	0.33
666	0.31
667	0.29
668	0.28
669	0.27
670	0.3
671	0.27
672	0.24
673	0.26
674	0.27
675	0.33
676	0.34
677	0.35
678	0.31
679	0.32
680	0.32
681	0.29
682	0.29
683	0.22
684	0.18
685	0.17
686	0.17
687	0.15
688	0.18
689	0.17
690	0.18
691	0.2
692	0.26
693	0.26
694	0.27
695	0.31
696	0.29
697	0.32
698	0.29
699	0.28
700	0.22
701	0.22
702	0.2
703	0.16
704	0.15
705	0.11
706	0.12
707	0.12
708	0.13
709	0.13
710	0.13
711	0.13
712	0.19
713	0.18
714	0.16
715	0.2
716	0.19
717	0.19
718	0.2
719	0.2
720	0.18
721	0.2
722	0.21
723	0.19
724	0.2
725	0.21
726	0.24
727	0.25
728	0.22
729	0.24
730	0.22
731	0.21
732	0.2
733	0.18
734	0.15
735	0.16
736	0.16
737	0.14
738	0.16
739	0.17
740	0.21
741	0.24
742	0.24
743	0.24
744	0.33
745	0.39
746	0.46
747	0.45
748	0.42
749	0.43
750	0.49
751	0.52
752	0.42
753	0.35
754	0.28
755	0.35
756	0.37
757	0.37
758	0.32
759	0.28
760	0.36
761	0.38
762	0.41
763	0.34
764	0.32
765	0.33
766	0.31
767	0.31
768	0.25
769	0.27
770	0.22
771	0.22
772	0.23
773	0.19
774	0.21
775	0.21
776	0.18
777	0.2
778	0.23
779	0.28
780	0.33
781	0.39
782	0.42
783	0.42
784	0.42
785	0.39
786	0.37
787	0.32
788	0.29
789	0.21
790	0.14
791	0.13
792	0.13
793	0.1
794	0.09
795	0.07
796	0.05
797	0.05
798	0.05
799	0.04
800	0.04
801	0.04
802	0.04
803	0.04
804	0.05
805	0.05
806	0.05
807	0.07
808	0.07
809	0.09
810	0.1
811	0.1
812	0.1
813	0.11
814	0.12
815	0.1
816	0.1
817	0.08
818	0.08
819	0.07
820	0.06
821	0.06
822	0.05
823	0.06
824	0.06
825	0.07
826	0.06
827	0.08
828	0.12
829	0.15
830	0.18
831	0.22
832	0.22
833	0.25
834	0.3
835	0.34
836	0.33
837	0.32
838	0.32
839	0.33
840	0.34
841	0.37
842	0.36
843	0.37
844	0.4
845	0.4
846	0.4
847	0.35
848	0.38
849	0.41
850	0.44
851	0.42
852	0.39
853	0.38
854	0.37
855	0.4
856	0.4
857	0.37
858	0.39
859	0.42
860	0.44
861	0.45
862	0.5
863	0.56
864	0.56
865	0.58
866	0.56
867	0.55
868	0.53
869	0.56
870	0.51
871	0.45
872	0.42
873	0.4
874	0.42
875	0.36
876	0.35
877	0.34
878	0.33
879	0.31
880	0.31
881	0.26
882	0.17
883	0.16
884	0.13
885	0.09
886	0.08
887	0.07
888	0.04
889	0.05
890	0.05
891	0.05
892	0.06
893	0.07
894	0.07
895	0.07
896	0.07
897	0.06
898	0.06
899	0.07
900	0.07
901	0.08
902	0.09
903	0.09
904	0.09
905	0.09
906	0.09
907	0.08
908	0.11
909	0.15
910	0.18
911	0.22
912	0.22
913	0.24
914	0.25
915	0.26
916	0.25
917	0.22
918	0.19
919	0.15
920	0.2
921	0.22
922	0.26
923	0.3
924	0.28
925	0.29
926	0.31
927	0.33
928	0.35
929	0.38
930	0.37
931	0.38
932	0.42
933	0.42
934	0.41
935	0.46
936	0.46
937	0.49
938	0.46
939	0.43
940	0.43
941	0.39
942	0.38
943	0.31
944	0.25
945	0.18
946	0.16
947	0.13
948	0.09
949	0.1
950	0.11
951	0.11
952	0.11
953	0.12
954	0.15
955	0.17
956	0.18
957	0.24
958	0.25
959	0.26
960	0.29
961	0.3
962	0.27
963	0.27
964	0.29
965	0.22
966	0.2
967	0.19
968	0.15
969	0.11
970	0.13
971	0.12
972	0.12
973	0.16
974	0.17
975	0.19
976	0.19
977	0.21
978	0.19
979	0.19
980	0.21
981	0.2
982	0.2
983	0.2
984	0.22
985	0.21
986	0.21
987	0.2
988	0.17
989	0.12
990	0.14
991	0.13
992	0.14
993	0.13
994	0.15
995	0.16
996	0.16
997	0.16
998	0.14
999	0.12
1000	0.12
1001	0.16
1002	0.14
1003	0.12
1004	0.12
1005	0.12
1006	0.13
1007	0.12
1008	0.11
1009	0.08
1010	0.09
1011	0.09
1012	0.12
1013	0.12
1014	0.13
1015	0.13
1016	0.13
1017	0.13
1018	0.12
1019	0.12
1020	0.09
1021	0.09
1022	0.08
1023	0.12
1024	0.13
1025	0.14
1026	0.14
1027	0.15
1028	0.16
1029	0.17
1030	0.17
1031	0.19
1032	0.24
1033	0.24
1034	0.24
1035	0.25
1036	0.25
1037	0.24
1038	0.24
1039	0.18
1040	0.13
1041	0.09
1042	0.09
1043	0.07
1044	0.07
1045	0.07
1046	0.06
1047	0.07
1048	0.07
1049	0.09
1050	0.09
1051	0.1
1052	0.1
1053	0.11
1054	0.12
1055	0.13
1056	0.13
1057	0.15
1058	0.21
1059	0.22
1060	0.22
1061	0.22
1062	0.22
1063	0.23
1064	0.26
1065	0.26
1066	0.22
1067	0.27
1068	0.26
1069	0.28
1070	0.34
1071	0.36
1072	0.36
1073	0.35
1074	0.32
1075	0.31
1076	0.3
1077	0.29
1078	0.22
1079	0.18
1080	0.14
1081	0.13
1082	0.13
1083	0.09
1084	0.09
1085	0.1
1086	0.11
1087	0.11
1088	0.13
1089	0.15
1090	0.15
1091	0.15
1092	0.15
1093	0.14
1094	0.12
1095	0.11
1096	0.09
1097	0.06
1098	0.05
1099	0.05
1100	0.05
1101	0.05
1102	0.05
1103	0.05
1104	0.05
1105	0.07
1106	0.08
1107	0.08
1108	0.08
1109	0.1
1110	0.15
1111	0.15
1112	0.17
1113	0.19
1114	0.24
1115	0.29
1116	0.34
1117	0.32
1118	0.28
1119	0.32
1120	0.32
1121	0.31
1122	0.29
1123	0.27
1124	0.27
1125	0.28
1126	0.28
1127	0.27
1128	0.28
1129	0.28
1130	0.25
1131	0.22
1132	0.19
1133	0.19
1134	0.23
1135	0.22
1136	0.23
1137	0.27
1138	0.31
1139	0.39
1140	0.41
1141	0.41
1142	0.45
1143	0.51
1144	0.59
1145	0.61
1146	0.63
1147	0.59
1148	0.62
1149	0.62
1150	0.54
1151	0.47
1152	0.37
1153	0.29
1154	0.24
1155	0.2
1156	0.13
1157	0.11
1158	0.1
1159	0.11
1160	0.1
1161	0.13
1162	0.12
1163	0.16
1164	0.19
1165	0.21
1166	0.22
1167	0.22

A0A1V6TH67

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer