Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V6TSW9

Protein Details
Accession A0A1V6TSW9    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
3-22YALESKKRKFHRVLDSISKPHydrophilic
427-446AKIRRVRQVLTAKSPKRKAVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
419-444KKADREWWAKIRRVRQVLTAKSPKRK
Subcellular Location(s) mito 12, nucl 10, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013909  NIPA/Rsm1_C  
IPR012935  Znf_C3HC-like  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF08600  Rsm1  
PF07967  zf-C3HC  
Amino Acid Sequences MSYALESKKRKFHRVLDSISKPLTSDNAPKPAPAAPTTAQDRLSANLSIKKVRLASADPSELTAVRNSIHKISRPAHRIASANSNKRPTFVPWDRERFLERLETFRRVDRWTSKPSPINEVQWAKRGWICTDVMRVTCVSECGGAVVVKLPDEIDELDGFDIDKVEERKEVRARLVDEYAKMLSSAHGENCPWRNKSCDATIQHLPLTNYDAALSGLHERYTNVSKMGDKLPADDIIQTPEGLEFDVLIKGLPDEWFKEAEKAAASTNGETQPANADNQDSTETPKTVNRVALALALLGWDTASDGAAELVGCGACFRRLGLWMYKPKENGDVTVYTSLDVAGEHMEYCPWIDKVAQSGTGRPNENLAELRAGWQVVAEAVKVKHRRRVRSMASTDTMRTDVGTPTETAAEEENADAKKKADREWWAKIRRVRQVLTAKSPKRKAVLPQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.78
2 0.8
3 0.8
4 0.78
5 0.74
6 0.67
7 0.58
8 0.47
9 0.39
10 0.34
11 0.29
12 0.33
13 0.34
14 0.41
15 0.41
16 0.41
17 0.41
18 0.41
19 0.41
20 0.33
21 0.32
22 0.25
23 0.32
24 0.37
25 0.39
26 0.36
27 0.33
28 0.33
29 0.29
30 0.3
31 0.26
32 0.25
33 0.27
34 0.29
35 0.32
36 0.32
37 0.34
38 0.32
39 0.32
40 0.32
41 0.3
42 0.33
43 0.35
44 0.37
45 0.33
46 0.33
47 0.31
48 0.28
49 0.25
50 0.2
51 0.15
52 0.13
53 0.16
54 0.18
55 0.23
56 0.27
57 0.3
58 0.36
59 0.41
60 0.49
61 0.51
62 0.53
63 0.51
64 0.5
65 0.49
66 0.45
67 0.5
68 0.5
69 0.53
70 0.55
71 0.58
72 0.54
73 0.52
74 0.52
75 0.46
76 0.47
77 0.47
78 0.5
79 0.51
80 0.59
81 0.59
82 0.59
83 0.58
84 0.49
85 0.43
86 0.42
87 0.35
88 0.35
89 0.38
90 0.4
91 0.38
92 0.41
93 0.42
94 0.37
95 0.43
96 0.42
97 0.44
98 0.49
99 0.53
100 0.56
101 0.58
102 0.57
103 0.58
104 0.54
105 0.51
106 0.5
107 0.51
108 0.46
109 0.46
110 0.44
111 0.38
112 0.36
113 0.34
114 0.27
115 0.24
116 0.24
117 0.2
118 0.25
119 0.25
120 0.23
121 0.22
122 0.21
123 0.18
124 0.17
125 0.15
126 0.11
127 0.09
128 0.08
129 0.07
130 0.08
131 0.07
132 0.07
133 0.09
134 0.08
135 0.08
136 0.08
137 0.07
138 0.07
139 0.08
140 0.08
141 0.07
142 0.07
143 0.08
144 0.07
145 0.07
146 0.07
147 0.06
148 0.06
149 0.05
150 0.08
151 0.09
152 0.1
153 0.13
154 0.14
155 0.21
156 0.25
157 0.28
158 0.28
159 0.31
160 0.32
161 0.32
162 0.35
163 0.3
164 0.26
165 0.25
166 0.22
167 0.18
168 0.15
169 0.12
170 0.09
171 0.1
172 0.1
173 0.1
174 0.11
175 0.11
176 0.16
177 0.21
178 0.26
179 0.25
180 0.25
181 0.28
182 0.3
183 0.33
184 0.32
185 0.34
186 0.31
187 0.34
188 0.36
189 0.34
190 0.32
191 0.31
192 0.27
193 0.2
194 0.21
195 0.16
196 0.13
197 0.11
198 0.11
199 0.09
200 0.08
201 0.08
202 0.07
203 0.07
204 0.08
205 0.08
206 0.08
207 0.1
208 0.13
209 0.13
210 0.12
211 0.13
212 0.13
213 0.15
214 0.17
215 0.18
216 0.15
217 0.16
218 0.16
219 0.16
220 0.16
221 0.14
222 0.13
223 0.11
224 0.12
225 0.1
226 0.09
227 0.08
228 0.08
229 0.07
230 0.06
231 0.04
232 0.04
233 0.05
234 0.05
235 0.04
236 0.04
237 0.04
238 0.05
239 0.06
240 0.06
241 0.07
242 0.09
243 0.11
244 0.12
245 0.13
246 0.13
247 0.13
248 0.12
249 0.12
250 0.11
251 0.12
252 0.12
253 0.11
254 0.14
255 0.14
256 0.14
257 0.13
258 0.13
259 0.13
260 0.13
261 0.13
262 0.11
263 0.11
264 0.1
265 0.11
266 0.13
267 0.1
268 0.14
269 0.15
270 0.15
271 0.16
272 0.18
273 0.19
274 0.2
275 0.21
276 0.18
277 0.16
278 0.16
279 0.16
280 0.13
281 0.11
282 0.08
283 0.06
284 0.05
285 0.04
286 0.04
287 0.03
288 0.03
289 0.03
290 0.03
291 0.03
292 0.03
293 0.03
294 0.04
295 0.04
296 0.03
297 0.04
298 0.03
299 0.03
300 0.04
301 0.04
302 0.05
303 0.05
304 0.06
305 0.07
306 0.1
307 0.14
308 0.2
309 0.27
310 0.35
311 0.39
312 0.43
313 0.43
314 0.42
315 0.45
316 0.4
317 0.34
318 0.29
319 0.26
320 0.25
321 0.26
322 0.25
323 0.18
324 0.17
325 0.15
326 0.11
327 0.1
328 0.07
329 0.05
330 0.06
331 0.06
332 0.06
333 0.06
334 0.06
335 0.07
336 0.09
337 0.09
338 0.09
339 0.1
340 0.11
341 0.15
342 0.17
343 0.22
344 0.2
345 0.26
346 0.31
347 0.36
348 0.37
349 0.33
350 0.34
351 0.29
352 0.31
353 0.27
354 0.22
355 0.19
356 0.17
357 0.2
358 0.18
359 0.17
360 0.14
361 0.12
362 0.11
363 0.09
364 0.1
365 0.08
366 0.11
367 0.12
368 0.21
369 0.29
370 0.33
371 0.41
372 0.49
373 0.58
374 0.62
375 0.72
376 0.73
377 0.75
378 0.77
379 0.75
380 0.71
381 0.65
382 0.58
383 0.5
384 0.41
385 0.31
386 0.26
387 0.21
388 0.18
389 0.17
390 0.18
391 0.16
392 0.16
393 0.17
394 0.16
395 0.15
396 0.15
397 0.14
398 0.13
399 0.13
400 0.16
401 0.16
402 0.18
403 0.17
404 0.17
405 0.22
406 0.25
407 0.3
408 0.34
409 0.43
410 0.49
411 0.59
412 0.68
413 0.7
414 0.74
415 0.77
416 0.77
417 0.78
418 0.77
419 0.69
420 0.69
421 0.71
422 0.71
423 0.73
424 0.75
425 0.74
426 0.76
427 0.8
428 0.77
429 0.71