Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V6TW56

Protein Details
Accession A0A1V6TW56    Localization Confidence Low Confidence Score 9.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-22MDHQKNNKDKRGRGQGQSRDVQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
336-342GNPKGRR
Subcellular Location(s) cyto_nucl 11.666, nucl 10, cyto 10, cyto_mito 9.332, mito_nucl 9.332, mito 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002745  Ptrans_KptA/Tpt1  
IPR042081  RNA_2'-PTrans_C  
IPR042080  RNA_2'-PTrans_N  
Gene Ontology GO:0000215  F:tRNA 2'-phosphotransferase activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF01885  PTS_2-RNA  
Amino Acid Sequences MDHQKNNKDKRGRGQGQSRDVQVSKALSLLLRHAAEKEGLKMNAQGYASVSDVLNWRKLKSLKVAFPEILHAVDSSDKKRFALLHIPSAQPTKSTTQATTTPATPPDAEHEAAYIVGEEQPETSVLESAPTTSEAQQSATDQALSVKDTDPSNFLIRATQGHSIKTVDAASFLEPLSLSDESKLPDTVVHGTFHATWPAILQSGGLRCMGRNHVHFATGPSLESVLAVHADGSAQSKSKPDDSRVISGMRRDAQVLIYIDVRKALKAGVPFWRSENGVILSEGIPVTKGGAGKGEAQKFVTLDFFDVVVERKVGLGKIWEHGEVLQELPETLTKKGNPKGRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.83
2 0.82
3 0.82
4 0.79
5 0.72
6 0.67
7 0.59
8 0.51
9 0.45
10 0.37
11 0.29
12 0.24
13 0.22
14 0.16
15 0.17
16 0.18
17 0.2
18 0.19
19 0.2
20 0.2
21 0.21
22 0.23
23 0.24
24 0.25
25 0.26
26 0.25
27 0.26
28 0.28
29 0.27
30 0.27
31 0.26
32 0.22
33 0.17
34 0.18
35 0.17
36 0.15
37 0.15
38 0.12
39 0.17
40 0.19
41 0.24
42 0.24
43 0.24
44 0.3
45 0.33
46 0.36
47 0.41
48 0.47
49 0.46
50 0.51
51 0.55
52 0.49
53 0.47
54 0.45
55 0.37
56 0.28
57 0.23
58 0.17
59 0.12
60 0.16
61 0.19
62 0.19
63 0.23
64 0.23
65 0.23
66 0.25
67 0.26
68 0.26
69 0.32
70 0.32
71 0.35
72 0.38
73 0.39
74 0.38
75 0.4
76 0.35
77 0.26
78 0.26
79 0.21
80 0.22
81 0.24
82 0.23
83 0.24
84 0.28
85 0.3
86 0.29
87 0.27
88 0.24
89 0.23
90 0.24
91 0.2
92 0.18
93 0.19
94 0.2
95 0.19
96 0.17
97 0.16
98 0.14
99 0.14
100 0.13
101 0.08
102 0.05
103 0.06
104 0.06
105 0.05
106 0.05
107 0.06
108 0.06
109 0.06
110 0.06
111 0.06
112 0.06
113 0.07
114 0.06
115 0.06
116 0.07
117 0.08
118 0.09
119 0.1
120 0.12
121 0.11
122 0.12
123 0.12
124 0.13
125 0.13
126 0.12
127 0.1
128 0.08
129 0.09
130 0.09
131 0.09
132 0.09
133 0.08
134 0.1
135 0.11
136 0.11
137 0.11
138 0.13
139 0.14
140 0.13
141 0.13
142 0.12
143 0.12
144 0.13
145 0.14
146 0.17
147 0.16
148 0.17
149 0.18
150 0.17
151 0.17
152 0.16
153 0.14
154 0.08
155 0.08
156 0.08
157 0.08
158 0.08
159 0.08
160 0.07
161 0.06
162 0.06
163 0.08
164 0.08
165 0.08
166 0.08
167 0.09
168 0.1
169 0.11
170 0.11
171 0.08
172 0.08
173 0.09
174 0.12
175 0.12
176 0.12
177 0.11
178 0.13
179 0.13
180 0.13
181 0.13
182 0.09
183 0.07
184 0.07
185 0.08
186 0.07
187 0.06
188 0.06
189 0.07
190 0.08
191 0.09
192 0.09
193 0.09
194 0.09
195 0.12
196 0.16
197 0.18
198 0.19
199 0.24
200 0.23
201 0.24
202 0.24
203 0.24
204 0.23
205 0.19
206 0.17
207 0.12
208 0.12
209 0.11
210 0.1
211 0.08
212 0.05
213 0.05
214 0.05
215 0.04
216 0.04
217 0.04
218 0.04
219 0.06
220 0.07
221 0.07
222 0.08
223 0.11
224 0.13
225 0.21
226 0.24
227 0.26
228 0.33
229 0.37
230 0.4
231 0.4
232 0.41
233 0.36
234 0.35
235 0.36
236 0.3
237 0.27
238 0.23
239 0.22
240 0.19
241 0.22
242 0.21
243 0.17
244 0.18
245 0.18
246 0.17
247 0.2
248 0.2
249 0.15
250 0.14
251 0.13
252 0.13
253 0.15
254 0.19
255 0.24
256 0.26
257 0.27
258 0.29
259 0.31
260 0.3
261 0.28
262 0.29
263 0.22
264 0.21
265 0.2
266 0.19
267 0.16
268 0.16
269 0.15
270 0.11
271 0.09
272 0.08
273 0.09
274 0.09
275 0.09
276 0.08
277 0.11
278 0.13
279 0.2
280 0.27
281 0.29
282 0.29
283 0.3
284 0.31
285 0.29
286 0.28
287 0.23
288 0.16
289 0.15
290 0.14
291 0.13
292 0.11
293 0.12
294 0.13
295 0.12
296 0.12
297 0.1
298 0.11
299 0.12
300 0.13
301 0.13
302 0.16
303 0.17
304 0.22
305 0.24
306 0.23
307 0.22
308 0.23
309 0.24
310 0.2
311 0.19
312 0.16
313 0.14
314 0.13
315 0.14
316 0.17
317 0.16
318 0.17
319 0.22
320 0.25
321 0.34
322 0.41