Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A1V6SGJ0

Protein Details
Accession A0A1V6SGJ0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
112-137YQEVDEKMDKRRRARREAREKAEQEEBasic
170-191VGDLTGKHRRDKQNARQRHYAVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
121-131KRRRARREARE
Subcellular Location(s) cyto_nucl 8.666, nucl 8.5, cyto 8.5, cyto_mito 7.333, mito_nucl 7.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR010491  PRP1_N  
IPR045075  Syf1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF06424  PRP1_N  
PF13432  TPR_16  
PF14559  TPR_19  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
Amino Acid Sequences MASGRKDFLSQAAPENYVAGLGRGATGFTTRSDLGPAREGPTPEQIQAALTKRAQLLGAAAPTAYGATTREKGGKEEDQGEEDERFQDPENEAGLFAYGQFDQEDDEADRIYQEVDEKMDKRRRARREAREKAEQEEYERNNPKIQHQFADLKRTLASVSEEDWANLPEVGDLTGKHRRDKQNARQRHYAVPDSVIAGARDSAQYRTTIAEDGTETSIGEGESADSAMMNFADIGAARDKVLKVRLDQAALGSSTETSGTATNVDPKGYLTSLTQSEAKAGEVEVGDIKRVRTLLESVTKTNPKHAPGWIALARLEELAGRIVAARTLIAKGCELCPKSEDAWLENIRLNEGHNAKVIAANAIKNNDRSTRLWTEAMRLETDTRAKKNVLRQAILHIPQSVQIWKEAVNLEDDPADARLLLAKAVEIIPLSVELWLALARLETPENAQKVLNAARKAVPTSYEVWIAAARLQEQMGTFAKVNVMKRAIQSLARENAMLKREEWITEAEKCEAEGAVLTCGSIIQETLGWGLDEDDDRKDIWMDDAKASIARGNYETARAIYAYALRVFVNRRSIWLAAADLERNHGTKEALWQVLEKAVEACPQSEELWLLLAKEKWQSGDIDDARRVLGRAFNQNPNNEDIWLAAVKLEADAKKTDQARELLATARREAGTDRVWTKSVAFERQLGNIDDALDLVNQGLQLFPKADKLWMMKGQIYEAQNKLPQAREAYGTGTRACPKSVALWLLASRLEEKAGAVVRARSVLDRARLAVPKSPELWTESVRVERRANNIAQAKVIMARAIQEVPTSGLLWSESIWYLEPRAQRKARSLEAIKKVENDPILFITVARIFWGERRLEKAMTWFEKAIVLDSDYGDGWAWYYKFLMQHGTEEKRSDVVSKCISMEPKHGEVWQSIAKDPVNAYKTTEEILKLVASTIN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.31
3 0.26
4 0.21
5 0.19
6 0.12
7 0.09
8 0.08
9 0.09
10 0.08
11 0.08
12 0.08
13 0.09
14 0.1
15 0.11
16 0.15
17 0.15
18 0.16
19 0.2
20 0.23
21 0.25
22 0.29
23 0.3
24 0.29
25 0.32
26 0.34
27 0.32
28 0.38
29 0.37
30 0.32
31 0.31
32 0.28
33 0.26
34 0.3
35 0.31
36 0.28
37 0.26
38 0.3
39 0.29
40 0.3
41 0.29
42 0.23
43 0.22
44 0.19
45 0.2
46 0.16
47 0.15
48 0.13
49 0.13
50 0.12
51 0.09
52 0.06
53 0.07
54 0.12
55 0.14
56 0.18
57 0.23
58 0.24
59 0.27
60 0.33
61 0.37
62 0.37
63 0.41
64 0.4
65 0.38
66 0.39
67 0.38
68 0.33
69 0.28
70 0.24
71 0.2
72 0.19
73 0.17
74 0.2
75 0.19
76 0.2
77 0.21
78 0.19
79 0.18
80 0.17
81 0.16
82 0.11
83 0.1
84 0.09
85 0.07
86 0.08
87 0.08
88 0.08
89 0.09
90 0.09
91 0.11
92 0.11
93 0.12
94 0.11
95 0.11
96 0.12
97 0.1
98 0.11
99 0.09
100 0.1
101 0.1
102 0.13
103 0.19
104 0.21
105 0.31
106 0.39
107 0.44
108 0.52
109 0.6
110 0.66
111 0.72
112 0.8
113 0.82
114 0.85
115 0.89
116 0.87
117 0.88
118 0.81
119 0.75
120 0.73
121 0.63
122 0.57
123 0.55
124 0.52
125 0.51
126 0.55
127 0.51
128 0.48
129 0.48
130 0.51
131 0.52
132 0.51
133 0.45
134 0.45
135 0.52
136 0.51
137 0.59
138 0.51
139 0.43
140 0.4
141 0.37
142 0.31
143 0.24
144 0.23
145 0.15
146 0.16
147 0.18
148 0.18
149 0.18
150 0.18
151 0.17
152 0.15
153 0.13
154 0.11
155 0.08
156 0.09
157 0.09
158 0.09
159 0.09
160 0.13
161 0.21
162 0.23
163 0.29
164 0.37
165 0.45
166 0.55
167 0.66
168 0.71
169 0.74
170 0.82
171 0.84
172 0.84
173 0.79
174 0.76
175 0.71
176 0.65
177 0.56
178 0.48
179 0.42
180 0.34
181 0.32
182 0.25
183 0.19
184 0.14
185 0.13
186 0.11
187 0.12
188 0.12
189 0.13
190 0.12
191 0.13
192 0.13
193 0.15
194 0.15
195 0.14
196 0.13
197 0.13
198 0.12
199 0.14
200 0.14
201 0.12
202 0.11
203 0.1
204 0.1
205 0.09
206 0.08
207 0.06
208 0.05
209 0.05
210 0.05
211 0.05
212 0.04
213 0.04
214 0.05
215 0.05
216 0.04
217 0.04
218 0.03
219 0.04
220 0.04
221 0.06
222 0.07
223 0.08
224 0.08
225 0.11
226 0.12
227 0.15
228 0.2
229 0.2
230 0.21
231 0.27
232 0.29
233 0.28
234 0.28
235 0.25
236 0.23
237 0.2
238 0.19
239 0.12
240 0.09
241 0.08
242 0.08
243 0.07
244 0.06
245 0.06
246 0.07
247 0.08
248 0.08
249 0.14
250 0.15
251 0.15
252 0.14
253 0.15
254 0.17
255 0.15
256 0.16
257 0.1
258 0.13
259 0.14
260 0.16
261 0.17
262 0.15
263 0.16
264 0.15
265 0.15
266 0.11
267 0.1
268 0.1
269 0.08
270 0.09
271 0.1
272 0.1
273 0.11
274 0.12
275 0.12
276 0.12
277 0.12
278 0.12
279 0.11
280 0.13
281 0.17
282 0.23
283 0.26
284 0.27
285 0.33
286 0.38
287 0.36
288 0.42
289 0.41
290 0.36
291 0.36
292 0.36
293 0.34
294 0.29
295 0.35
296 0.3
297 0.27
298 0.24
299 0.22
300 0.2
301 0.15
302 0.14
303 0.08
304 0.07
305 0.06
306 0.06
307 0.05
308 0.05
309 0.05
310 0.05
311 0.05
312 0.05
313 0.05
314 0.07
315 0.08
316 0.08
317 0.09
318 0.09
319 0.12
320 0.18
321 0.18
322 0.17
323 0.18
324 0.2
325 0.2
326 0.23
327 0.22
328 0.17
329 0.23
330 0.23
331 0.24
332 0.23
333 0.22
334 0.19
335 0.18
336 0.18
337 0.17
338 0.17
339 0.17
340 0.16
341 0.16
342 0.15
343 0.17
344 0.16
345 0.12
346 0.12
347 0.13
348 0.13
349 0.16
350 0.17
351 0.17
352 0.19
353 0.2
354 0.22
355 0.22
356 0.27
357 0.28
358 0.3
359 0.31
360 0.29
361 0.3
362 0.3
363 0.3
364 0.24
365 0.21
366 0.19
367 0.19
368 0.24
369 0.24
370 0.22
371 0.23
372 0.24
373 0.27
374 0.34
375 0.39
376 0.37
377 0.34
378 0.33
379 0.36
380 0.4
381 0.38
382 0.32
383 0.25
384 0.2
385 0.21
386 0.21
387 0.18
388 0.12
389 0.11
390 0.1
391 0.1
392 0.13
393 0.12
394 0.11
395 0.12
396 0.11
397 0.11
398 0.11
399 0.1
400 0.08
401 0.08
402 0.07
403 0.05
404 0.05
405 0.06
406 0.06
407 0.06
408 0.05
409 0.05
410 0.05
411 0.06
412 0.06
413 0.04
414 0.04
415 0.04
416 0.04
417 0.05
418 0.04
419 0.04
420 0.03
421 0.04
422 0.04
423 0.04
424 0.03
425 0.03
426 0.03
427 0.04
428 0.05
429 0.05
430 0.07
431 0.11
432 0.11
433 0.12
434 0.12
435 0.11
436 0.13
437 0.19
438 0.22
439 0.19
440 0.19
441 0.21
442 0.22
443 0.22
444 0.2
445 0.16
446 0.13
447 0.15
448 0.15
449 0.14
450 0.13
451 0.13
452 0.12
453 0.11
454 0.11
455 0.08
456 0.08
457 0.07
458 0.07
459 0.07
460 0.07
461 0.1
462 0.09
463 0.1
464 0.09
465 0.09
466 0.11
467 0.14
468 0.14
469 0.15
470 0.16
471 0.16
472 0.16
473 0.19
474 0.18
475 0.17
476 0.19
477 0.21
478 0.21
479 0.2
480 0.2
481 0.18
482 0.21
483 0.21
484 0.19
485 0.14
486 0.14
487 0.15
488 0.15
489 0.15
490 0.14
491 0.14
492 0.16
493 0.17
494 0.16
495 0.15
496 0.14
497 0.14
498 0.11
499 0.08
500 0.07
501 0.06
502 0.05
503 0.05
504 0.05
505 0.04
506 0.04
507 0.04
508 0.04
509 0.03
510 0.03
511 0.03
512 0.03
513 0.04
514 0.04
515 0.04
516 0.04
517 0.05
518 0.05
519 0.06
520 0.06
521 0.07
522 0.07
523 0.08
524 0.08
525 0.08
526 0.08
527 0.09
528 0.12
529 0.13
530 0.13
531 0.14
532 0.14
533 0.14
534 0.14
535 0.13
536 0.09
537 0.09
538 0.09
539 0.11
540 0.11
541 0.12
542 0.13
543 0.11
544 0.11
545 0.1
546 0.09
547 0.08
548 0.09
549 0.09
550 0.09
551 0.1
552 0.09
553 0.11
554 0.13
555 0.16
556 0.21
557 0.19
558 0.21
559 0.23
560 0.23
561 0.22
562 0.2
563 0.17
564 0.13
565 0.14
566 0.13
567 0.1
568 0.12
569 0.12
570 0.12
571 0.12
572 0.11
573 0.1
574 0.1
575 0.15
576 0.17
577 0.17
578 0.17
579 0.17
580 0.17
581 0.19
582 0.18
583 0.13
584 0.1
585 0.09
586 0.12
587 0.12
588 0.12
589 0.1
590 0.11
591 0.12
592 0.11
593 0.11
594 0.08
595 0.09
596 0.09
597 0.09
598 0.1
599 0.1
600 0.11
601 0.13
602 0.13
603 0.13
604 0.14
605 0.15
606 0.13
607 0.22
608 0.23
609 0.24
610 0.24
611 0.24
612 0.23
613 0.23
614 0.22
615 0.14
616 0.15
617 0.15
618 0.24
619 0.28
620 0.36
621 0.4
622 0.42
623 0.43
624 0.42
625 0.39
626 0.31
627 0.26
628 0.18
629 0.16
630 0.13
631 0.11
632 0.07
633 0.07
634 0.06
635 0.07
636 0.1
637 0.09
638 0.11
639 0.12
640 0.14
641 0.19
642 0.22
643 0.23
644 0.24
645 0.25
646 0.24
647 0.24
648 0.24
649 0.23
650 0.26
651 0.25
652 0.22
653 0.23
654 0.21
655 0.2
656 0.2
657 0.2
658 0.19
659 0.22
660 0.23
661 0.23
662 0.24
663 0.24
664 0.23
665 0.25
666 0.26
667 0.26
668 0.26
669 0.28
670 0.28
671 0.31
672 0.33
673 0.28
674 0.25
675 0.2
676 0.19
677 0.15
678 0.14
679 0.11
680 0.08
681 0.07
682 0.05
683 0.05
684 0.05
685 0.05
686 0.05
687 0.05
688 0.06
689 0.08
690 0.08
691 0.12
692 0.12
693 0.13
694 0.17
695 0.2
696 0.25
697 0.28
698 0.3
699 0.29
700 0.29
701 0.3
702 0.31
703 0.3
704 0.3
705 0.27
706 0.28
707 0.27
708 0.29
709 0.3
710 0.27
711 0.27
712 0.26
713 0.26
714 0.25
715 0.24
716 0.26
717 0.26
718 0.25
719 0.24
720 0.23
721 0.27
722 0.25
723 0.25
724 0.22
725 0.2
726 0.22
727 0.25
728 0.23
729 0.19
730 0.2
731 0.2
732 0.21
733 0.2
734 0.18
735 0.15
736 0.13
737 0.13
738 0.11
739 0.1
740 0.13
741 0.13
742 0.14
743 0.14
744 0.15
745 0.15
746 0.17
747 0.18
748 0.15
749 0.17
750 0.2
751 0.23
752 0.23
753 0.25
754 0.29
755 0.32
756 0.33
757 0.35
758 0.34
759 0.34
760 0.35
761 0.34
762 0.3
763 0.3
764 0.31
765 0.28
766 0.27
767 0.26
768 0.32
769 0.33
770 0.36
771 0.37
772 0.38
773 0.42
774 0.44
775 0.43
776 0.44
777 0.46
778 0.43
779 0.39
780 0.35
781 0.3
782 0.26
783 0.25
784 0.17
785 0.11
786 0.12
787 0.13
788 0.14
789 0.13
790 0.11
791 0.12
792 0.13
793 0.14
794 0.13
795 0.1
796 0.1
797 0.1
798 0.1
799 0.1
800 0.1
801 0.09
802 0.09
803 0.11
804 0.11
805 0.13
806 0.17
807 0.23
808 0.26
809 0.35
810 0.39
811 0.43
812 0.5
813 0.56
814 0.57
815 0.6
816 0.63
817 0.63
818 0.67
819 0.69
820 0.62
821 0.59
822 0.55
823 0.51
824 0.46
825 0.38
826 0.31
827 0.26
828 0.26
829 0.22
830 0.2
831 0.19
832 0.17
833 0.16
834 0.14
835 0.13
836 0.12
837 0.16
838 0.22
839 0.23
840 0.24
841 0.3
842 0.33
843 0.34
844 0.35
845 0.38
846 0.42
847 0.42
848 0.42
849 0.37
850 0.34
851 0.36
852 0.35
853 0.3
854 0.22
855 0.19
856 0.17
857 0.17
858 0.17
859 0.14
860 0.14
861 0.12
862 0.1
863 0.09
864 0.12
865 0.12
866 0.11
867 0.12
868 0.15
869 0.17
870 0.19
871 0.25
872 0.22
873 0.29
874 0.36
875 0.42
876 0.42
877 0.43
878 0.42
879 0.38
880 0.37
881 0.36
882 0.31
883 0.32
884 0.34
885 0.33
886 0.35
887 0.37
888 0.42
889 0.39
890 0.43
891 0.42
892 0.41
893 0.41
894 0.41
895 0.39
896 0.34
897 0.37
898 0.34
899 0.3
900 0.28
901 0.3
902 0.28
903 0.29
904 0.3
905 0.33
906 0.31
907 0.29
908 0.32
909 0.3
910 0.31
911 0.3
912 0.31
913 0.24
914 0.21
915 0.22
916 0.19
917 0.16