Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C4EJN2

Protein Details
Accession A0A0C4EJN2    Localization Confidence High Confidence Score 23.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
20-42ASNKSKSTSTKHAKKRANDVEPTHydrophilic
729-756IKRDRFDGLSRKQKRRKMGQEEDAKERVBasic
781-816SEQDSHLLKNQKQKRKKSKENKSKKPRSTFSVDLKTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
725-746KKTAIKRDRFDGLSRKQKRRKM
791-845QKQKRKKSKENKSKKPRSTFSVDLKTPKSSSKPVSKALKKADTLKSKSGGKRKSK
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR000629  RNA-helicase_DEAD-box_CS  
Gene Ontology GO:0030687  C:preribosome, large subunit precursor  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0004386  F:helicase activity  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0000027  P:ribosomal large subunit assembly  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF00271  Helicase_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00039  DEAD_ATP_HELICASE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
CDD cd17947  DEADc_DDX27  
cd18787  SF2_C_DEAD  
Amino Acid Sequences MSDFIFTIDSEDEGNGQTAASNKSKSTSTKHAKKRANDVEPTLELNPTFFLDGLGLDPDLNSEPKSNRSRLLNEFEDPLERFKKKNALPRVSIDEIVARHKKSGDHQDALVDELEDWKDEDSAEEEEAGTDGASEEGSSVESEDLDLEGESGNEEEGGCSNEDDDADYSKEDGDETAEDDFDSDAGASDLAEDGPEDEKTDKAGETDGKSQDVSLNAYFDQSVVPFGPATKEELVKDSHDQPFSSLPGAASLSRPVLMGLSSMSITSPTPIQRQAIPLGLLGKDLVCSSVTGSGKTLGYMVPIVERLIWRDKKGGGRTRVMILTPTRELAVQVFQVGKLLARFTDLTFSLCVGGMDLRTQEAELRERPEIVIGTPGRVIDHIRNTRGFSLETLEILVIDEADRILEEGFQDELEEIIRNCPRSRQTMLFSATVNESVADLAKLSLDKPIRIKIDPPKSTAAGLTQEFLKVKDSSSNKKAASLTDYTRQAILVTLCKASAFSKGRTIIFFRSKVGAHRMKIIFSLFSLKAEELHGNLTQQQRLAALQKFKDGETSFLLATDLASRGLDIKGVERVINYEPPTQYDVYLHRIGRTARAGAKGSALTLVGESDRKLIKEARKNCLATQGAIKNRRLDPNLVKDVKEELEKLSSTISEIIEEEKEEKELRNSEMQLKKGQNLMEHEEEIKSRPARTWFQSELDKKKSKKIGTSAHTANFAKTESSVLPKKTAIKRDRFDGLSRKQKRRKMGQEEDAKERVLPAINSSIRAAKKSQRPIKITASQSEQDSHLLKNQKQKRKKSKENKSKKPRSTFSVDLKTPKSSSKPVSKALKKADTLKSKSGGKRKSK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.1
3 0.09
4 0.1
5 0.13
6 0.18
7 0.21
8 0.22
9 0.22
10 0.25
11 0.3
12 0.34
13 0.38
14 0.44
15 0.5
16 0.58
17 0.68
18 0.76
19 0.8
20 0.83
21 0.86
22 0.86
23 0.83
24 0.8
25 0.74
26 0.71
27 0.65
28 0.61
29 0.5
30 0.42
31 0.33
32 0.27
33 0.23
34 0.17
35 0.15
36 0.11
37 0.11
38 0.09
39 0.1
40 0.1
41 0.1
42 0.09
43 0.08
44 0.08
45 0.09
46 0.11
47 0.12
48 0.13
49 0.16
50 0.19
51 0.28
52 0.35
53 0.37
54 0.41
55 0.46
56 0.52
57 0.55
58 0.6
59 0.56
60 0.51
61 0.5
62 0.45
63 0.43
64 0.37
65 0.36
66 0.35
67 0.33
68 0.33
69 0.36
70 0.44
71 0.46
72 0.55
73 0.6
74 0.61
75 0.63
76 0.68
77 0.7
78 0.63
79 0.58
80 0.49
81 0.42
82 0.35
83 0.39
84 0.38
85 0.31
86 0.3
87 0.31
88 0.34
89 0.38
90 0.48
91 0.47
92 0.45
93 0.45
94 0.46
95 0.44
96 0.42
97 0.34
98 0.23
99 0.15
100 0.14
101 0.14
102 0.11
103 0.11
104 0.1
105 0.1
106 0.09
107 0.1
108 0.1
109 0.12
110 0.12
111 0.11
112 0.11
113 0.11
114 0.11
115 0.1
116 0.07
117 0.05
118 0.05
119 0.05
120 0.04
121 0.04
122 0.04
123 0.04
124 0.05
125 0.05
126 0.06
127 0.06
128 0.06
129 0.06
130 0.06
131 0.06
132 0.06
133 0.06
134 0.05
135 0.05
136 0.05
137 0.06
138 0.05
139 0.05
140 0.05
141 0.05
142 0.05
143 0.06
144 0.08
145 0.08
146 0.08
147 0.08
148 0.08
149 0.09
150 0.1
151 0.1
152 0.11
153 0.11
154 0.12
155 0.12
156 0.12
157 0.12
158 0.1
159 0.09
160 0.09
161 0.08
162 0.09
163 0.1
164 0.09
165 0.09
166 0.09
167 0.09
168 0.07
169 0.06
170 0.05
171 0.04
172 0.05
173 0.05
174 0.04
175 0.04
176 0.05
177 0.04
178 0.04
179 0.04
180 0.05
181 0.07
182 0.07
183 0.08
184 0.09
185 0.09
186 0.11
187 0.12
188 0.11
189 0.1
190 0.14
191 0.16
192 0.19
193 0.25
194 0.25
195 0.25
196 0.25
197 0.25
198 0.24
199 0.21
200 0.21
201 0.15
202 0.15
203 0.14
204 0.14
205 0.14
206 0.12
207 0.11
208 0.08
209 0.09
210 0.07
211 0.08
212 0.08
213 0.08
214 0.1
215 0.1
216 0.14
217 0.14
218 0.16
219 0.16
220 0.18
221 0.2
222 0.21
223 0.24
224 0.26
225 0.29
226 0.28
227 0.28
228 0.27
229 0.28
230 0.26
231 0.24
232 0.18
233 0.13
234 0.13
235 0.14
236 0.13
237 0.11
238 0.11
239 0.11
240 0.1
241 0.1
242 0.09
243 0.08
244 0.07
245 0.07
246 0.06
247 0.06
248 0.06
249 0.06
250 0.06
251 0.06
252 0.06
253 0.07
254 0.09
255 0.11
256 0.14
257 0.16
258 0.17
259 0.18
260 0.21
261 0.22
262 0.22
263 0.2
264 0.18
265 0.18
266 0.16
267 0.14
268 0.12
269 0.1
270 0.08
271 0.07
272 0.07
273 0.05
274 0.05
275 0.06
276 0.12
277 0.13
278 0.13
279 0.13
280 0.15
281 0.14
282 0.14
283 0.14
284 0.08
285 0.08
286 0.08
287 0.08
288 0.06
289 0.07
290 0.07
291 0.08
292 0.08
293 0.1
294 0.19
295 0.21
296 0.22
297 0.24
298 0.28
299 0.34
300 0.42
301 0.48
302 0.44
303 0.46
304 0.46
305 0.46
306 0.44
307 0.37
308 0.31
309 0.24
310 0.23
311 0.19
312 0.18
313 0.15
314 0.14
315 0.14
316 0.12
317 0.12
318 0.09
319 0.09
320 0.09
321 0.08
322 0.09
323 0.09
324 0.08
325 0.07
326 0.07
327 0.06
328 0.07
329 0.08
330 0.08
331 0.11
332 0.1
333 0.11
334 0.11
335 0.11
336 0.1
337 0.09
338 0.09
339 0.06
340 0.06
341 0.05
342 0.06
343 0.06
344 0.05
345 0.05
346 0.06
347 0.07
348 0.09
349 0.12
350 0.13
351 0.16
352 0.16
353 0.17
354 0.16
355 0.16
356 0.14
357 0.11
358 0.15
359 0.12
360 0.13
361 0.13
362 0.13
363 0.12
364 0.12
365 0.14
366 0.11
367 0.2
368 0.22
369 0.24
370 0.26
371 0.27
372 0.27
373 0.27
374 0.24
375 0.16
376 0.16
377 0.13
378 0.12
379 0.11
380 0.1
381 0.08
382 0.08
383 0.07
384 0.04
385 0.03
386 0.03
387 0.03
388 0.03
389 0.03
390 0.03
391 0.03
392 0.03
393 0.03
394 0.04
395 0.04
396 0.04
397 0.05
398 0.04
399 0.04
400 0.05
401 0.05
402 0.04
403 0.08
404 0.09
405 0.11
406 0.11
407 0.15
408 0.17
409 0.22
410 0.25
411 0.26
412 0.28
413 0.32
414 0.35
415 0.32
416 0.3
417 0.26
418 0.23
419 0.19
420 0.16
421 0.1
422 0.07
423 0.06
424 0.06
425 0.04
426 0.04
427 0.04
428 0.04
429 0.04
430 0.04
431 0.09
432 0.1
433 0.12
434 0.14
435 0.19
436 0.21
437 0.21
438 0.27
439 0.31
440 0.4
441 0.41
442 0.42
443 0.4
444 0.38
445 0.38
446 0.33
447 0.25
448 0.18
449 0.16
450 0.14
451 0.11
452 0.12
453 0.12
454 0.12
455 0.13
456 0.1
457 0.1
458 0.17
459 0.21
460 0.26
461 0.3
462 0.36
463 0.33
464 0.37
465 0.37
466 0.32
467 0.32
468 0.28
469 0.27
470 0.27
471 0.29
472 0.25
473 0.24
474 0.23
475 0.19
476 0.17
477 0.15
478 0.12
479 0.11
480 0.11
481 0.11
482 0.11
483 0.11
484 0.1
485 0.17
486 0.18
487 0.18
488 0.23
489 0.26
490 0.27
491 0.28
492 0.31
493 0.29
494 0.31
495 0.31
496 0.27
497 0.27
498 0.27
499 0.28
500 0.34
501 0.34
502 0.29
503 0.36
504 0.35
505 0.33
506 0.33
507 0.31
508 0.22
509 0.17
510 0.22
511 0.14
512 0.14
513 0.15
514 0.13
515 0.13
516 0.15
517 0.15
518 0.1
519 0.12
520 0.11
521 0.1
522 0.15
523 0.17
524 0.16
525 0.16
526 0.15
527 0.14
528 0.15
529 0.19
530 0.19
531 0.22
532 0.21
533 0.25
534 0.26
535 0.25
536 0.29
537 0.25
538 0.23
539 0.21
540 0.22
541 0.18
542 0.17
543 0.17
544 0.11
545 0.11
546 0.1
547 0.08
548 0.06
549 0.06
550 0.06
551 0.07
552 0.07
553 0.08
554 0.07
555 0.08
556 0.11
557 0.12
558 0.12
559 0.11
560 0.13
561 0.15
562 0.19
563 0.2
564 0.22
565 0.21
566 0.24
567 0.27
568 0.24
569 0.22
570 0.21
571 0.21
572 0.22
573 0.27
574 0.25
575 0.23
576 0.26
577 0.26
578 0.28
579 0.28
580 0.26
581 0.24
582 0.28
583 0.28
584 0.25
585 0.27
586 0.22
587 0.2
588 0.17
589 0.14
590 0.1
591 0.08
592 0.08
593 0.07
594 0.07
595 0.07
596 0.11
597 0.12
598 0.12
599 0.15
600 0.21
601 0.29
602 0.38
603 0.45
604 0.48
605 0.55
606 0.56
607 0.55
608 0.57
609 0.5
610 0.42
611 0.42
612 0.42
613 0.43
614 0.47
615 0.49
616 0.46
617 0.49
618 0.54
619 0.49
620 0.49
621 0.49
622 0.52
623 0.59
624 0.55
625 0.51
626 0.45
627 0.46
628 0.4
629 0.35
630 0.26
631 0.19
632 0.2
633 0.2
634 0.19
635 0.17
636 0.15
637 0.14
638 0.15
639 0.13
640 0.1
641 0.11
642 0.12
643 0.12
644 0.12
645 0.13
646 0.11
647 0.13
648 0.13
649 0.14
650 0.18
651 0.2
652 0.23
653 0.27
654 0.29
655 0.37
656 0.41
657 0.42
658 0.45
659 0.44
660 0.44
661 0.42
662 0.41
663 0.36
664 0.36
665 0.39
666 0.35
667 0.34
668 0.32
669 0.29
670 0.29
671 0.27
672 0.28
673 0.24
674 0.22
675 0.25
676 0.3
677 0.35
678 0.39
679 0.44
680 0.41
681 0.44
682 0.53
683 0.57
684 0.59
685 0.62
686 0.65
687 0.6
688 0.65
689 0.69
690 0.65
691 0.65
692 0.66
693 0.66
694 0.63
695 0.69
696 0.66
697 0.6
698 0.61
699 0.54
700 0.45
701 0.37
702 0.32
703 0.25
704 0.19
705 0.19
706 0.15
707 0.21
708 0.26
709 0.27
710 0.29
711 0.32
712 0.4
713 0.45
714 0.54
715 0.56
716 0.6
717 0.62
718 0.65
719 0.68
720 0.62
721 0.62
722 0.62
723 0.62
724 0.63
725 0.69
726 0.74
727 0.76
728 0.8
729 0.83
730 0.84
731 0.85
732 0.85
733 0.85
734 0.84
735 0.86
736 0.84
737 0.82
738 0.73
739 0.62
740 0.51
741 0.42
742 0.34
743 0.27
744 0.22
745 0.18
746 0.25
747 0.26
748 0.28
749 0.28
750 0.33
751 0.31
752 0.33
753 0.35
754 0.35
755 0.43
756 0.52
757 0.6
758 0.62
759 0.66
760 0.69
761 0.74
762 0.73
763 0.69
764 0.64
765 0.62
766 0.55
767 0.52
768 0.48
769 0.41
770 0.36
771 0.33
772 0.29
773 0.29
774 0.34
775 0.37
776 0.45
777 0.53
778 0.6
779 0.68
780 0.77
781 0.82
782 0.85
783 0.92
784 0.93
785 0.94
786 0.95
787 0.97
788 0.97
789 0.97
790 0.96
791 0.95
792 0.95
793 0.9
794 0.87
795 0.84
796 0.82
797 0.8
798 0.79
799 0.74
800 0.71
801 0.67
802 0.65
803 0.58
804 0.56
805 0.52
806 0.5
807 0.54
808 0.57
809 0.6
810 0.64
811 0.73
812 0.74
813 0.77
814 0.78
815 0.78
816 0.72
817 0.75
818 0.76
819 0.75
820 0.74
821 0.72
822 0.69
823 0.7
824 0.73
825 0.74