Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V6SWZ7

Protein Details
Accession A0A1V6SWZ7    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
238-266FSTQSHKTFRTKQKLAKAQRQNRPIPQWIHydrophilic
268-290LRTNNTIRYNAKRRHWRKSTLKVHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 10, mito 4, cyto 2.5, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002575  Aminoglycoside_PTrfase  
IPR011009  Kinase-like_dom_sf  
IPR000077  Ribosomal_L39  
IPR023626  Ribosomal_L39e_dom_sf  
Gene Ontology GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0005840  C:ribosome  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0006412  P:translation  
Pfam View protein in Pfam  
PF01636  APH  
PF00832  Ribosomal_L39  
Amino Acid Sequences MDFIPGQPLDKCWTNLPYDNQRQIAIQIADMIKEMQSVVISQPGPLGGGPFRGRFITDYSAGPFKDSAEVQGWFNNKLDICKHMSQCPKDIPPFKFSTFVLTHQDISPRNLILDDNGEVWLIDWANASAYPPAFESAALLAQQFFTGFNEEPPKAQIPHHLTQPKRSQALPHTNHPHSKVDNFIRPSNKLAVAINPSRCRYVSTLFPPFSKNTFAIVAVSLPSQTSEKIEKQNLNPSFSTQSHKTFRTKQKLAKAQRQNRPIPQWIRLRTNNTIRYNAKRRHWRKSTLKV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.4
3 0.46
4 0.51
5 0.56
6 0.61
7 0.58
8 0.55
9 0.5
10 0.45
11 0.44
12 0.34
13 0.24
14 0.23
15 0.21
16 0.21
17 0.2
18 0.2
19 0.12
20 0.12
21 0.12
22 0.07
23 0.07
24 0.08
25 0.08
26 0.13
27 0.13
28 0.13
29 0.13
30 0.13
31 0.13
32 0.12
33 0.13
34 0.08
35 0.14
36 0.16
37 0.17
38 0.18
39 0.18
40 0.19
41 0.19
42 0.22
43 0.21
44 0.21
45 0.21
46 0.23
47 0.26
48 0.25
49 0.25
50 0.21
51 0.17
52 0.18
53 0.17
54 0.17
55 0.16
56 0.17
57 0.17
58 0.21
59 0.21
60 0.2
61 0.2
62 0.2
63 0.17
64 0.19
65 0.19
66 0.19
67 0.24
68 0.28
69 0.31
70 0.35
71 0.42
72 0.43
73 0.47
74 0.49
75 0.48
76 0.49
77 0.55
78 0.5
79 0.48
80 0.5
81 0.46
82 0.43
83 0.37
84 0.36
85 0.3
86 0.3
87 0.3
88 0.27
89 0.27
90 0.25
91 0.3
92 0.24
93 0.25
94 0.24
95 0.18
96 0.17
97 0.16
98 0.15
99 0.12
100 0.12
101 0.1
102 0.09
103 0.09
104 0.09
105 0.08
106 0.08
107 0.08
108 0.06
109 0.05
110 0.05
111 0.04
112 0.05
113 0.05
114 0.05
115 0.05
116 0.05
117 0.06
118 0.06
119 0.07
120 0.06
121 0.06
122 0.06
123 0.06
124 0.06
125 0.06
126 0.06
127 0.05
128 0.05
129 0.05
130 0.05
131 0.04
132 0.04
133 0.07
134 0.07
135 0.09
136 0.13
137 0.13
138 0.13
139 0.15
140 0.17
141 0.15
142 0.16
143 0.21
144 0.25
145 0.27
146 0.34
147 0.38
148 0.37
149 0.43
150 0.51
151 0.48
152 0.43
153 0.41
154 0.38
155 0.41
156 0.5
157 0.46
158 0.47
159 0.5
160 0.51
161 0.54
162 0.53
163 0.49
164 0.4
165 0.38
166 0.37
167 0.35
168 0.38
169 0.39
170 0.4
171 0.4
172 0.4
173 0.41
174 0.37
175 0.33
176 0.27
177 0.24
178 0.22
179 0.25
180 0.28
181 0.32
182 0.32
183 0.33
184 0.33
185 0.33
186 0.32
187 0.29
188 0.27
189 0.29
190 0.31
191 0.38
192 0.38
193 0.39
194 0.39
195 0.38
196 0.37
197 0.33
198 0.26
199 0.21
200 0.21
201 0.2
202 0.18
203 0.16
204 0.14
205 0.11
206 0.11
207 0.08
208 0.07
209 0.08
210 0.08
211 0.08
212 0.11
213 0.16
214 0.21
215 0.28
216 0.35
217 0.4
218 0.43
219 0.52
220 0.53
221 0.52
222 0.47
223 0.44
224 0.43
225 0.39
226 0.42
227 0.36
228 0.4
229 0.42
230 0.47
231 0.5
232 0.54
233 0.63
234 0.67
235 0.71
236 0.72
237 0.76
238 0.82
239 0.84
240 0.84
241 0.85
242 0.84
243 0.85
244 0.87
245 0.84
246 0.83
247 0.81
248 0.8
249 0.75
250 0.73
251 0.73
252 0.71
253 0.72
254 0.7
255 0.7
256 0.69
257 0.73
258 0.74
259 0.69
260 0.71
261 0.68
262 0.71
263 0.74
264 0.74
265 0.74
266 0.76
267 0.79
268 0.82
269 0.85
270 0.85