FuNGI

A0A1V6SMC1

Protein Details

Accession

A0A1V6SMC1

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
588-610	LIGRQENRSKRRRKDTRLEQLAI	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
149-178	SRRRRRGGGRFSGRWGARGGKGIKRGPRKP
597-600	KRRR

Subcellular Location(s)

nucl 11.5, cyto_nucl 11, cyto 7.5, pero 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039340 Tfc4/TFIIIC-102/Sfc4 IPR011990 TPR-like_helical_dom_sf IPR019734 TPR_repeat
Gene Ontology	GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF13432 TPR_16 PF14559 TPR_19

Amino Acid Sequences

MSSQHYPDGVPLDEEMQEEESAYPDIDETVHYPWQNDQSFDVGDMLASVIDPRLFGDQNAQTQPQSINQYPQDPNEVQGEVEVEEEQEAEGFYPDEYDSQGYPPVSYPPVPGEGAVSDEDFALSEDESESESDEDEPAEDDDDDHSGASRRRRRGGGRFSGRWGARGGKGIKRGPRKPLEPSPEFKHLHSGATSAFIDGDYERAIDLVMQAIQINPEMFAAHSLLSEIFLAQGEKDKALAALFNGAHTRPKDPGVWVKVARLILDRAGENRQSALHDVAYCYSRILEVSPDNTNIRFQRAAIYRELGHNGRAAAEYERLLKDCPHSARALRHLAETYIDLNDVQKAVDHYANSIDHYLSLDPEASDFTWSDLNIYVELFGYLNEHEEGLISLKILARWLLGRGEDSVWDGHEDDDREWDADDSPRRIKTDGFIPNQWPRESYGLGLPLELRIKMGVFRLKLGDKHHNEALHHFEWLNPEDDSEGARIFDYGDLFREVADALKQVGLFEEALRYYTPIQQTAEHADISFFMAMADCCMHLGKMEDAESCYLLIAEHDASHMESRVLLAKLYESLGMSEQAMKYVGEAVLIGRQENRSKRRRKDTRLEQLAIEFKMAESKPLRSIAPKTTQATTLMAAPLAPGKGRAQPGEGTRTDDIQFLYAKLLELNPQVKDGVSVAIEDWLDIADALLRDFRNNRAFYPMDRSIAFRGYSTGVKHKNQTKNGTMMDEMQQMAGRLQETLGDVAEEPLQGAIPTDYHGIPFDEWLDIFLQYALLVAEQGEPEEAYETLDSAAVASIWLHSKPKSRLIHVCWFTCALRARDEETLANEARWFIKEYQFVTDTYRLFSMLGHLCGDPHRSLFHSSGNMKFMLRQIKAIDFTMPQDTPRPIRHSVWKERATLSTRDEAGEPITAKELDIALLVLYGHMLYSGNSFYPALNYFFRAYALDDQNPAVLLSIALSFIHHSLKRQSENRHYLIMQGLSFMHEYRLVREKPGTLLAEKQEMEFNFARVWHSLGLAHLAVEGYDRVLKIGEQIQQQAKQKSVQEPTSAKDCADVVMGDDDQPQKTLSPTGQPFVEDFSREAAYALQCIHVLSGNADTAKALTEKWLVV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.19
2	0.18
3	0.16
4	0.15
5	0.14
6	0.14
7	0.13
8	0.13
9	0.12
10	0.11
11	0.09
12	0.09
13	0.09
14	0.1
15	0.11
16	0.14
17	0.18
18	0.19
19	0.2
20	0.24
21	0.33
22	0.34
23	0.33
24	0.31
25	0.3
26	0.3
27	0.3
28	0.26
29	0.17
30	0.14
31	0.13
32	0.11
33	0.07
34	0.06
35	0.06
36	0.06
37	0.07
38	0.07
39	0.08
40	0.12
41	0.13
42	0.14
43	0.21
44	0.25
45	0.31
46	0.35
47	0.36
48	0.32
49	0.34
50	0.35
51	0.33
52	0.36
53	0.32
54	0.36
55	0.37
56	0.45
57	0.45
58	0.46
59	0.47
60	0.4
61	0.4
62	0.36
63	0.33
64	0.25
65	0.23
66	0.21
67	0.14
68	0.14
69	0.12
70	0.09
71	0.08
72	0.08
73	0.08
74	0.07
75	0.06
76	0.06
77	0.06
78	0.06
79	0.06
80	0.08
81	0.08
82	0.08
83	0.1
84	0.11
85	0.12
86	0.13
87	0.17
88	0.16
89	0.17
90	0.17
91	0.2
92	0.21
93	0.21
94	0.22
95	0.21
96	0.24
97	0.24
98	0.22
99	0.2
100	0.17
101	0.18
102	0.17
103	0.14
104	0.11
105	0.11
106	0.11
107	0.09
108	0.09
109	0.08
110	0.07
111	0.07
112	0.07
113	0.07
114	0.08
115	0.08
116	0.09
117	0.08
118	0.09
119	0.09
120	0.09
121	0.09
122	0.09
123	0.1
124	0.09
125	0.1
126	0.09
127	0.09
128	0.1
129	0.11
130	0.11
131	0.09
132	0.1
133	0.13
134	0.18
135	0.27
136	0.34
137	0.4
138	0.47
139	0.55
140	0.63
141	0.69
142	0.75
143	0.76
144	0.78
145	0.74
146	0.73
147	0.74
148	0.65
149	0.56
150	0.49
151	0.43
152	0.36
153	0.4
154	0.4
155	0.37
156	0.45
157	0.49
158	0.55
159	0.6
160	0.64
161	0.66
162	0.7
163	0.69
164	0.69
165	0.73
166	0.74
167	0.69
168	0.7
169	0.67
170	0.67
171	0.64
172	0.55
173	0.54
174	0.46
175	0.43
176	0.36
177	0.31
178	0.22
179	0.24
180	0.24
181	0.15
182	0.14
183	0.11
184	0.12
185	0.1
186	0.11
187	0.07
188	0.07
189	0.07
190	0.07
191	0.07
192	0.06
193	0.06
194	0.06
195	0.06
196	0.06
197	0.07
198	0.07
199	0.08
200	0.08
201	0.08
202	0.07
203	0.07
204	0.07
205	0.07
206	0.08
207	0.08
208	0.07
209	0.07
210	0.08
211	0.07
212	0.08
213	0.08
214	0.06
215	0.06
216	0.06
217	0.07
218	0.06
219	0.12
220	0.13
221	0.13
222	0.13
223	0.13
224	0.13
225	0.13
226	0.13
227	0.08
228	0.12
229	0.12
230	0.13
231	0.14
232	0.14
233	0.19
234	0.2
235	0.22
236	0.19
237	0.21
238	0.22
239	0.26
240	0.34
241	0.34
242	0.39
243	0.38
244	0.38
245	0.39
246	0.37
247	0.34
248	0.27
249	0.23
250	0.19
251	0.2
252	0.19
253	0.17
254	0.21
255	0.21
256	0.19
257	0.19
258	0.18
259	0.17
260	0.18
261	0.18
262	0.15
263	0.15
264	0.15
265	0.16
266	0.17
267	0.15
268	0.13
269	0.11
270	0.1
271	0.09
272	0.09
273	0.11
274	0.12
275	0.15
276	0.17
277	0.2
278	0.21
279	0.21
280	0.25
281	0.23
282	0.24
283	0.22
284	0.2
285	0.26
286	0.3
287	0.32
288	0.29
289	0.31
290	0.28
291	0.3
292	0.34
293	0.26
294	0.22
295	0.21
296	0.19
297	0.17
298	0.16
299	0.15
300	0.13
301	0.13
302	0.13
303	0.16
304	0.16
305	0.16
306	0.17
307	0.17
308	0.18
309	0.23
310	0.25
311	0.24
312	0.26
313	0.3
314	0.34
315	0.38
316	0.42
317	0.36
318	0.35
319	0.33
320	0.3
321	0.27
322	0.23
323	0.18
324	0.12
325	0.11
326	0.1
327	0.09
328	0.1
329	0.09
330	0.07
331	0.07
332	0.08
333	0.1
334	0.12
335	0.12
336	0.12
337	0.15
338	0.15
339	0.15
340	0.15
341	0.12
342	0.1
343	0.12
344	0.11
345	0.08
346	0.09
347	0.08
348	0.07
349	0.07
350	0.08
351	0.07
352	0.08
353	0.08
354	0.08
355	0.09
356	0.09
357	0.1
358	0.1
359	0.1
360	0.09
361	0.09
362	0.08
363	0.07
364	0.08
365	0.06
366	0.05
367	0.06
368	0.05
369	0.07
370	0.07
371	0.07
372	0.06
373	0.06
374	0.07
375	0.07
376	0.07
377	0.06
378	0.06
379	0.07
380	0.08
381	0.08
382	0.08
383	0.07
384	0.07
385	0.09
386	0.09
387	0.09
388	0.1
389	0.11
390	0.11
391	0.1
392	0.11
393	0.1
394	0.09
395	0.09
396	0.09
397	0.08
398	0.1
399	0.11
400	0.1
401	0.12
402	0.13
403	0.12
404	0.12
405	0.12
406	0.11
407	0.14
408	0.17
409	0.19
410	0.22
411	0.24
412	0.25
413	0.25
414	0.24
415	0.22
416	0.27
417	0.32
418	0.32
419	0.33
420	0.37
421	0.42
422	0.45
423	0.43
424	0.35
425	0.29
426	0.28
427	0.26
428	0.21
429	0.18
430	0.17
431	0.17
432	0.16
433	0.14
434	0.13
435	0.13
436	0.12
437	0.1
438	0.07
439	0.07
440	0.08
441	0.11
442	0.13
443	0.13
444	0.14
445	0.17
446	0.19
447	0.22
448	0.26
449	0.32
450	0.31
451	0.35
452	0.37
453	0.36
454	0.35
455	0.34
456	0.36
457	0.26
458	0.24
459	0.2
460	0.18
461	0.19
462	0.2
463	0.19
464	0.12
465	0.12
466	0.11
467	0.11
468	0.11
469	0.09
470	0.07
471	0.06
472	0.06
473	0.06
474	0.06
475	0.06
476	0.07
477	0.06
478	0.07
479	0.08
480	0.08
481	0.08
482	0.08
483	0.07
484	0.06
485	0.07
486	0.06
487	0.05
488	0.06
489	0.06
490	0.06
491	0.06
492	0.06
493	0.06
494	0.06
495	0.06
496	0.06
497	0.06
498	0.07
499	0.07
500	0.08
501	0.11
502	0.12
503	0.13
504	0.14
505	0.14
506	0.16
507	0.18
508	0.18
509	0.15
510	0.14
511	0.12
512	0.11
513	0.11
514	0.09
515	0.06
516	0.04
517	0.05
518	0.04
519	0.05
520	0.05
521	0.04
522	0.04
523	0.04
524	0.04
525	0.04
526	0.06
527	0.05
528	0.06
529	0.07
530	0.07
531	0.08
532	0.08
533	0.08
534	0.07
535	0.06
536	0.05
537	0.05
538	0.04
539	0.04
540	0.04
541	0.04
542	0.04
543	0.05
544	0.05
545	0.06
546	0.06
547	0.05
548	0.05
549	0.05
550	0.08
551	0.08
552	0.08
553	0.07
554	0.07
555	0.08
556	0.09
557	0.08
558	0.05
559	0.06
560	0.06
561	0.06
562	0.06
563	0.08
564	0.07
565	0.07
566	0.08
567	0.07
568	0.06
569	0.07
570	0.07
571	0.05
572	0.05
573	0.05
574	0.07
575	0.07
576	0.07
577	0.07
578	0.09
579	0.14
580	0.22
581	0.3
582	0.37
583	0.47
584	0.55
585	0.65
586	0.73
587	0.77
588	0.81
589	0.84
590	0.86
591	0.84
592	0.77
593	0.66
594	0.59
595	0.53
596	0.42
597	0.31
598	0.2
599	0.12
600	0.16
601	0.15
602	0.16
603	0.15
604	0.16
605	0.18
606	0.2
607	0.21
608	0.19
609	0.23
610	0.25
611	0.3
612	0.33
613	0.32
614	0.32
615	0.32
616	0.31
617	0.28
618	0.23
619	0.17
620	0.13
621	0.1
622	0.09
623	0.08
624	0.08
625	0.07
626	0.06
627	0.06
628	0.08
629	0.12
630	0.14
631	0.14
632	0.15
633	0.18
634	0.21
635	0.25
636	0.24
637	0.24
638	0.23
639	0.24
640	0.23
641	0.21
642	0.19
643	0.15
644	0.15
645	0.11
646	0.11
647	0.09
648	0.09
649	0.08
650	0.08
651	0.09
652	0.12
653	0.14
654	0.13
655	0.14
656	0.14
657	0.13
658	0.14
659	0.12
660	0.09
661	0.07
662	0.07
663	0.06
664	0.07
665	0.07
666	0.07
667	0.06
668	0.05
669	0.05
670	0.04
671	0.04
672	0.04
673	0.04
674	0.04
675	0.07
676	0.07
677	0.09
678	0.1
679	0.16
680	0.22
681	0.23
682	0.23
683	0.27
684	0.28
685	0.28
686	0.35
687	0.32
688	0.27
689	0.27
690	0.28
691	0.24
692	0.26
693	0.24
694	0.16
695	0.15
696	0.15
697	0.17
698	0.17
699	0.24
700	0.27
701	0.29
702	0.36
703	0.43
704	0.5
705	0.55
706	0.59
707	0.55
708	0.55
709	0.54
710	0.49
711	0.41
712	0.34
713	0.29
714	0.25
715	0.21
716	0.15
717	0.14
718	0.12
719	0.12
720	0.11
721	0.08
722	0.06
723	0.06
724	0.07
725	0.07
726	0.08
727	0.07
728	0.07
729	0.07
730	0.07
731	0.08
732	0.07
733	0.06
734	0.05
735	0.05
736	0.05
737	0.05
738	0.05
739	0.04
740	0.06
741	0.08
742	0.08
743	0.08
744	0.09
745	0.1
746	0.1
747	0.1
748	0.1
749	0.08
750	0.08
751	0.09
752	0.09
753	0.08
754	0.08
755	0.07
756	0.06
757	0.05
758	0.06
759	0.05
760	0.04
761	0.04
762	0.04
763	0.05
764	0.05
765	0.05
766	0.05
767	0.05
768	0.05
769	0.06
770	0.06
771	0.06
772	0.06
773	0.06
774	0.06
775	0.07
776	0.06
777	0.05
778	0.05
779	0.04
780	0.04
781	0.04
782	0.05
783	0.06
784	0.08
785	0.1
786	0.12
787	0.2
788	0.24
789	0.33
790	0.37
791	0.41
792	0.49
793	0.53
794	0.61
795	0.58
796	0.55
797	0.48
798	0.46
799	0.4
800	0.37
801	0.36
802	0.27
803	0.27
804	0.27
805	0.29
806	0.28
807	0.3
808	0.26
809	0.23
810	0.26
811	0.22
812	0.2
813	0.18
814	0.17
815	0.16
816	0.16
817	0.17
818	0.15
819	0.2
820	0.24
821	0.25
822	0.29
823	0.29
824	0.28
825	0.3
826	0.32
827	0.27
828	0.25
829	0.24
830	0.19
831	0.18
832	0.17
833	0.18
834	0.17
835	0.17
836	0.17
837	0.16
838	0.17
839	0.19
840	0.22
841	0.17
842	0.15
843	0.15
844	0.16
845	0.2
846	0.21
847	0.23
848	0.26
849	0.29
850	0.32
851	0.32
852	0.31
853	0.28
854	0.28
855	0.29
856	0.31
857	0.28
858	0.27
859	0.28
860	0.31
861	0.33
862	0.31
863	0.28
864	0.21
865	0.22
866	0.24
867	0.22
868	0.19
869	0.22
870	0.24
871	0.27
872	0.32
873	0.36
874	0.35
875	0.4
876	0.49
877	0.54
878	0.61
879	0.66
880	0.65
881	0.63
882	0.61
883	0.63
884	0.57
885	0.52
886	0.46
887	0.41
888	0.37
889	0.35
890	0.33
891	0.27
892	0.24
893	0.23
894	0.2
895	0.15
896	0.16
897	0.15
898	0.14
899	0.14
900	0.13
901	0.1
902	0.09
903	0.08
904	0.06
905	0.06
906	0.06
907	0.05
908	0.04
909	0.04
910	0.03
911	0.04
912	0.04
913	0.04
914	0.06
915	0.07
916	0.08
917	0.09
918	0.1
919	0.1
920	0.12
921	0.14
922	0.16
923	0.16
924	0.19
925	0.19
926	0.19
927	0.2
928	0.18
929	0.19
930	0.24
931	0.27
932	0.26
933	0.26
934	0.26
935	0.26
936	0.25
937	0.22
938	0.14
939	0.09
940	0.07
941	0.06
942	0.06
943	0.06
944	0.06
945	0.06
946	0.07
947	0.08
948	0.15
949	0.15
950	0.18
951	0.25
952	0.32
953	0.41
954	0.47
955	0.55
956	0.6
957	0.67
958	0.67
959	0.65
960	0.58
961	0.52
962	0.49
963	0.42
964	0.32
965	0.24
966	0.21
967	0.18
968	0.19
969	0.16
970	0.13
971	0.15
972	0.15
973	0.19
974	0.28
975	0.27
976	0.3
977	0.33
978	0.34
979	0.33
980	0.39
981	0.37
982	0.3
983	0.35
984	0.34
985	0.37
986	0.35
987	0.33
988	0.32
989	0.29
990	0.33
991	0.29
992	0.27
993	0.22
994	0.23
995	0.24
996	0.19
997	0.21
998	0.16
999	0.16
1000	0.15
1001	0.14
1002	0.17
1003	0.15
1004	0.13
1005	0.12
1006	0.11
1007	0.09
1008	0.1
1009	0.09
1010	0.07
1011	0.1
1012	0.1
1013	0.1
1014	0.1
1015	0.11
1016	0.14
1017	0.19
1018	0.23
1019	0.24
1020	0.31
1021	0.37
1022	0.43
1023	0.51
1024	0.51
1025	0.48
1026	0.49
1027	0.51
1028	0.53
1029	0.55
1030	0.52
1031	0.53
1032	0.52
1033	0.53
1034	0.54
1035	0.49
1036	0.4
1037	0.34
1038	0.3
1039	0.23
1040	0.21
1041	0.17
1042	0.13
1043	0.15
1044	0.15
1045	0.14
1046	0.18
1047	0.2
1048	0.19
1049	0.2
1050	0.19
1051	0.17
1052	0.18
1053	0.22
1054	0.2
1055	0.27
1056	0.29
1057	0.32
1058	0.32
1059	0.33
1060	0.32
1061	0.33
1062	0.33
1063	0.25
1064	0.23
1065	0.23
1066	0.23
1067	0.22
1068	0.22
1069	0.2
1070	0.18
1071	0.18
1072	0.18
1073	0.15
1074	0.14
1075	0.15
1076	0.15
1077	0.13
1078	0.13
1079	0.12
1080	0.14
1081	0.15
1082	0.15
1083	0.15
1084	0.15
1085	0.13
1086	0.14
1087	0.14
1088	0.12
1089	0.13

A0A1V6SMC1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer