FuNGI

A0A1V6SKU8

Protein Details

Accession

A0A1V6SKU8

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
6-25	ISKPASHTQKMKRPPPPFGQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 13, mito 10.5, cyto_mito 7, cyto 2.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR021950 Spt20 IPR046468 Spt20-like_SEP
Gene Ontology	GO:0000124 C:SAGA complex GO:0003712 F:transcription coregulator activity
Pfam	View protein in Pfam PF12090 Spt20

Amino Acid Sequences

MMATAISKPASHTQKMKRPPPPFGQAAVNGVKGQHLSSSPTSAAKRPPTGASVNATSNFTNGVAHGATSTTKGPLNRTRNQSQRPMDHSSRSGRPVTRTAATDQAYRVGKKAPEPYVKTTSYILKKYSKCPPSLIVHLHPTHFRFEQQDGSFPYNSEMKVIIEHLRAGTVPHDLIEELLRGGVQFYEGCLIVRVIDHKSASAQARKASTTSSNENNTPFSLHNYNEHITPSAFVPYPKQNQLTSATQGTKADGTSTANQQTDDMAAGEQTDDKSNNTSQKNAPMKPRVFTTVLHPTARTLQAELTLLVTTPDPRANKAPAQQNSSGPSATPGGSQPDRGHVAKRQKMLVEPEDLLECESKMTQALAPPLFLDPVHSIEAAQELFKHLESPLHRDPLPLPKRRKRTVAELAADEALAAEEERFMLIMDERLEPTASGPGGAAKAAAVDDAGGVAPFEPRFSRFKTLETIRMQHEEKAKREHEMKLKQELAKRQQQEQERERRRAIEQRQAEEHAKEESRRQQVAAQQAQAQLAAQQQNRHIMAQPNGVSQGQQSSPVVRNQTPHATSSPLVGNIMPQAVPMTMTASGSGSPPRPPSALQHAHPNVMSHQMAPSRSQQGPSRHGTPQMTQGTPAMSHATPIMRNVTPTQRMGHGSPTHSMGQTPVMNQGMGATPQMNGGMSFTPQQQMMLQHRQQALLQAQQQGHIPHNQFTPQQLAQLQANAHAQQNIQSHQQQMLQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQAHQGVPKVPQQGQQAYQAQLMRAQYAQMQIVKQQQQGQHPQMQGQQAQPHQGNQQLTNQQQQQMLMAAAQANGGQMGQNGQPMNQAQRYTQLYQQRLLRMRHDMSTRYMAQYGPPNQYPSNIAQQYGPGLEKTAKAWVSEVMRRERDGGQQQRAALQAQQMQAQGSMHSMGGMNN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.61
2	0.71
3	0.77
4	0.78
5	0.78
6	0.81
7	0.8
8	0.78
9	0.72
10	0.66
11	0.62
12	0.55
13	0.55
14	0.49
15	0.42
16	0.34
17	0.3
18	0.28
19	0.22
20	0.2
21	0.17
22	0.15
23	0.19
24	0.21
25	0.25
26	0.25
27	0.3
28	0.32
29	0.34
30	0.41
31	0.43
32	0.46
33	0.45
34	0.47
35	0.46
36	0.46
37	0.45
38	0.42
39	0.39
40	0.38
41	0.36
42	0.36
43	0.31
44	0.28
45	0.25
46	0.2
47	0.16
48	0.12
49	0.13
50	0.11
51	0.11
52	0.1
53	0.1
54	0.11
55	0.12
56	0.13
57	0.13
58	0.16
59	0.18
60	0.26
61	0.35
62	0.42
63	0.49
64	0.56
65	0.63
66	0.7
67	0.75
68	0.78
69	0.76
70	0.76
71	0.74
72	0.75
73	0.71
74	0.67
75	0.65
76	0.62
77	0.6
78	0.56
79	0.56
80	0.52
81	0.52
82	0.52
83	0.51
84	0.48
85	0.44
86	0.43
87	0.44
88	0.42
89	0.39
90	0.34
91	0.36
92	0.36
93	0.34
94	0.33
95	0.31
96	0.32
97	0.35
98	0.42
99	0.44
100	0.5
101	0.55
102	0.6
103	0.61
104	0.6
105	0.56
106	0.51
107	0.5
108	0.48
109	0.47
110	0.45
111	0.47
112	0.5
113	0.55
114	0.62
115	0.6
116	0.55
117	0.55
118	0.56
119	0.53
120	0.57
121	0.56
122	0.51
123	0.52
124	0.52
125	0.5
126	0.48
127	0.43
128	0.41
129	0.36
130	0.33
131	0.29
132	0.3
133	0.36
134	0.33
135	0.37
136	0.36
137	0.4
138	0.37
139	0.34
140	0.33
141	0.28
142	0.27
143	0.22
144	0.19
145	0.15
146	0.15
147	0.18
148	0.19
149	0.17
150	0.18
151	0.16
152	0.16
153	0.15
154	0.15
155	0.14
156	0.12
157	0.11
158	0.1
159	0.11
160	0.1
161	0.11
162	0.11
163	0.1
164	0.08
165	0.08
166	0.07
167	0.06
168	0.07
169	0.06
170	0.06
171	0.05
172	0.06
173	0.08
174	0.08
175	0.08
176	0.09
177	0.09
178	0.08
179	0.09
180	0.11
181	0.12
182	0.15
183	0.15
184	0.15
185	0.16
186	0.21
187	0.26
188	0.29
189	0.29
190	0.3
191	0.33
192	0.33
193	0.32
194	0.3
195	0.3
196	0.3
197	0.33
198	0.35
199	0.37
200	0.38
201	0.39
202	0.38
203	0.33
204	0.3
205	0.25
206	0.24
207	0.24
208	0.22
209	0.25
210	0.28
211	0.28
212	0.27
213	0.27
214	0.23
215	0.2
216	0.2
217	0.16
218	0.15
219	0.15
220	0.14
221	0.18
222	0.24
223	0.3
224	0.34
225	0.36
226	0.33
227	0.35
228	0.4
229	0.39
230	0.35
231	0.34
232	0.31
233	0.29
234	0.29
235	0.27
236	0.23
237	0.19
238	0.16
239	0.12
240	0.14
241	0.16
242	0.2
243	0.23
244	0.22
245	0.23
246	0.22
247	0.21
248	0.18
249	0.15
250	0.11
251	0.07
252	0.06
253	0.06
254	0.06
255	0.07
256	0.07
257	0.09
258	0.09
259	0.1
260	0.13
261	0.17
262	0.24
263	0.25
264	0.29
265	0.29
266	0.38
267	0.45
268	0.46
269	0.51
270	0.53
271	0.53
272	0.51
273	0.51
274	0.46
275	0.4
276	0.36
277	0.35
278	0.36
279	0.37
280	0.36
281	0.33
282	0.3
283	0.32
284	0.34
285	0.28
286	0.19
287	0.15
288	0.16
289	0.17
290	0.15
291	0.12
292	0.1
293	0.09
294	0.08
295	0.08
296	0.08
297	0.09
298	0.13
299	0.13
300	0.15
301	0.19
302	0.22
303	0.26
304	0.32
305	0.39
306	0.39
307	0.44
308	0.44
309	0.43
310	0.43
311	0.41
312	0.34
313	0.25
314	0.22
315	0.18
316	0.15
317	0.13
318	0.11
319	0.15
320	0.15
321	0.18
322	0.17
323	0.2
324	0.23
325	0.23
326	0.25
327	0.27
328	0.36
329	0.39
330	0.42
331	0.41
332	0.38
333	0.4
334	0.43
335	0.39
336	0.32
337	0.27
338	0.25
339	0.23
340	0.21
341	0.19
342	0.13
343	0.1
344	0.07
345	0.07
346	0.06
347	0.06
348	0.07
349	0.07
350	0.08
351	0.13
352	0.13
353	0.13
354	0.13
355	0.13
356	0.13
357	0.12
358	0.12
359	0.09
360	0.11
361	0.12
362	0.11
363	0.11
364	0.11
365	0.12
366	0.1
367	0.09
368	0.06
369	0.07
370	0.08
371	0.08
372	0.08
373	0.07
374	0.11
375	0.13
376	0.2
377	0.22
378	0.25
379	0.25
380	0.26
381	0.28
382	0.34
383	0.41
384	0.42
385	0.48
386	0.53
387	0.62
388	0.65
389	0.71
390	0.64
391	0.65
392	0.66
393	0.65
394	0.59
395	0.51
396	0.47
397	0.4
398	0.35
399	0.26
400	0.16
401	0.08
402	0.05
403	0.04
404	0.03
405	0.03
406	0.03
407	0.03
408	0.03
409	0.03
410	0.03
411	0.04
412	0.05
413	0.07
414	0.07
415	0.08
416	0.08
417	0.08
418	0.08
419	0.08
420	0.09
421	0.07
422	0.06
423	0.06
424	0.06
425	0.06
426	0.06
427	0.06
428	0.04
429	0.04
430	0.04
431	0.04
432	0.03
433	0.02
434	0.02
435	0.03
436	0.03
437	0.02
438	0.02
439	0.03
440	0.04
441	0.04
442	0.04
443	0.05
444	0.08
445	0.11
446	0.14
447	0.2
448	0.2
449	0.22
450	0.27
451	0.3
452	0.35
453	0.35
454	0.35
455	0.31
456	0.34
457	0.33
458	0.3
459	0.36
460	0.33
461	0.34
462	0.38
463	0.37
464	0.36
465	0.39
466	0.41
467	0.42
468	0.45
469	0.46
470	0.45
471	0.49
472	0.49
473	0.5
474	0.51
475	0.49
476	0.49
477	0.47
478	0.46
479	0.47
480	0.5
481	0.55
482	0.56
483	0.6
484	0.6
485	0.62
486	0.58
487	0.55
488	0.52
489	0.53
490	0.5
491	0.48
492	0.46
493	0.44
494	0.45
495	0.46
496	0.44
497	0.36
498	0.31
499	0.25
500	0.22
501	0.19
502	0.22
503	0.26
504	0.3
505	0.3
506	0.29
507	0.3
508	0.32
509	0.4
510	0.38
511	0.32
512	0.28
513	0.29
514	0.28
515	0.25
516	0.2
517	0.13
518	0.13
519	0.17
520	0.16
521	0.17
522	0.18
523	0.23
524	0.24
525	0.23
526	0.22
527	0.22
528	0.22
529	0.25
530	0.25
531	0.21
532	0.22
533	0.21
534	0.18
535	0.14
536	0.15
537	0.1
538	0.11
539	0.11
540	0.13
541	0.15
542	0.18
543	0.22
544	0.2
545	0.22
546	0.23
547	0.29
548	0.27
549	0.27
550	0.25
551	0.24
552	0.23
553	0.23
554	0.21
555	0.15
556	0.14
557	0.12
558	0.11
559	0.1
560	0.1
561	0.07
562	0.06
563	0.06
564	0.06
565	0.06
566	0.06
567	0.07
568	0.06
569	0.06
570	0.07
571	0.07
572	0.07
573	0.07
574	0.1
575	0.1
576	0.12
577	0.14
578	0.15
579	0.16
580	0.17
581	0.2
582	0.28
583	0.33
584	0.31
585	0.39
586	0.39
587	0.4
588	0.39
589	0.35
590	0.26
591	0.26
592	0.25
593	0.15
594	0.16
595	0.17
596	0.18
597	0.19
598	0.23
599	0.24
600	0.24
601	0.27
602	0.31
603	0.35
604	0.4
605	0.43
606	0.43
607	0.39
608	0.43
609	0.42
610	0.37
611	0.39
612	0.38
613	0.34
614	0.3
615	0.29
616	0.25
617	0.23
618	0.22
619	0.16
620	0.11
621	0.11
622	0.12
623	0.13
624	0.13
625	0.14
626	0.17
627	0.14
628	0.16
629	0.19
630	0.24
631	0.26
632	0.27
633	0.27
634	0.26
635	0.29
636	0.28
637	0.32
638	0.29
639	0.28
640	0.28
641	0.29
642	0.28
643	0.25
644	0.24
645	0.18
646	0.19
647	0.18
648	0.17
649	0.18
650	0.17
651	0.16
652	0.16
653	0.16
654	0.12
655	0.11
656	0.11
657	0.08
658	0.07
659	0.08
660	0.08
661	0.07
662	0.06
663	0.07
664	0.07
665	0.08
666	0.09
667	0.1
668	0.11
669	0.11
670	0.12
671	0.13
672	0.18
673	0.24
674	0.32
675	0.33
676	0.38
677	0.39
678	0.4
679	0.38
680	0.37
681	0.33
682	0.29
683	0.31
684	0.3
685	0.29
686	0.29
687	0.31
688	0.27
689	0.27
690	0.28
691	0.26
692	0.24
693	0.26
694	0.28
695	0.26
696	0.26
697	0.3
698	0.24
699	0.26
700	0.24
701	0.24
702	0.22
703	0.24
704	0.22
705	0.19
706	0.21
707	0.19
708	0.19
709	0.18
710	0.17
711	0.2
712	0.23
713	0.23
714	0.25
715	0.26
716	0.27
717	0.28
718	0.31
719	0.29
720	0.32
721	0.39
722	0.39
723	0.41
724	0.47
725	0.52
726	0.55
727	0.57
728	0.58
729	0.57
730	0.6
731	0.64
732	0.64
733	0.65
734	0.66
735	0.69
736	0.7
737	0.7
738	0.69
739	0.69
740	0.65
741	0.6
742	0.6
743	0.55
744	0.5
745	0.45
746	0.41
747	0.37
748	0.37
749	0.38
750	0.35
751	0.34
752	0.37
753	0.41
754	0.43
755	0.42
756	0.46
757	0.45
758	0.41
759	0.43
760	0.38
761	0.32
762	0.31
763	0.29
764	0.23
765	0.18
766	0.17
767	0.16
768	0.17
769	0.2
770	0.19
771	0.19
772	0.22
773	0.3
774	0.34
775	0.35
776	0.39
777	0.4
778	0.46
779	0.54
780	0.56
781	0.54
782	0.51
783	0.51
784	0.5
785	0.5
786	0.46
787	0.41
788	0.42
789	0.37
790	0.43
791	0.41
792	0.39
793	0.37
794	0.39
795	0.38
796	0.33
797	0.39
798	0.4
799	0.41
800	0.46
801	0.47
802	0.45
803	0.44
804	0.42
805	0.35
806	0.29
807	0.26
808	0.18
809	0.16
810	0.12
811	0.1
812	0.1
813	0.09
814	0.07
815	0.07
816	0.07
817	0.06
818	0.05
819	0.08
820	0.09
821	0.13
822	0.13
823	0.13
824	0.17
825	0.19
826	0.26
827	0.27
828	0.28
829	0.25
830	0.32
831	0.37
832	0.36
833	0.4
834	0.43
835	0.42
836	0.46
837	0.51
838	0.53
839	0.55
840	0.55
841	0.54
842	0.54
843	0.54
844	0.54
845	0.54
846	0.48
847	0.46
848	0.5
849	0.47
850	0.42
851	0.4
852	0.34
853	0.33
854	0.39
855	0.4
856	0.4
857	0.4
858	0.42
859	0.41
860	0.43
861	0.42
862	0.38
863	0.42
864	0.36
865	0.34
866	0.3
867	0.31
868	0.31
869	0.3
870	0.27
871	0.17
872	0.18
873	0.19
874	0.2
875	0.2
876	0.25
877	0.23
878	0.23
879	0.24
880	0.26
881	0.31
882	0.35
883	0.4
884	0.42
885	0.44
886	0.45
887	0.47
888	0.45
889	0.48
890	0.53
891	0.56
892	0.55
893	0.55
894	0.55
895	0.54
896	0.53
897	0.45
898	0.37
899	0.33
900	0.31
901	0.29
902	0.31
903	0.29
904	0.28
905	0.27
906	0.25
907	0.2
908	0.16
909	0.16
910	0.12
911	0.12

A0A1V6SKU8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer