FuNGI

A0A1V6SQD5

Protein Details

Accession

A0A1V6SQD5

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
23-46	SLSRSTPFSKPKGRNPRLYPLPSI	Hydrophilic
94-116	SRDPTYRPPTRRKGPLYTRTHKV	Hydrophilic
621-652	NMSDEQRREYNKERRKKKRRRLAIEQNMREEG	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
627-641	RREYNKERRKKKRRR

Subcellular Location(s)

mito 15.5, cyto_mito 10, nucl 5, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR002885 Pentatricopeptide_repeat IPR011990 TPR-like_helical_dom_sf
Pfam	View protein in Pfam PF13812 PPR_3
PROSITE	View protein in PROSITE PS51375 PPR

Amino Acid Sequences

MSRRALVLDGLWYSLCPSFTTLSLSRSTPFSKPKGRNPRLYPLPSISSPSSGSRRCYNTSGGDSYKFPYNAAYHNDRSEAREPRENEYRDAHLSRDPTYRPPTRRKGPLYTRTHKVQDDLLGKTNEGLESRLQYAMDNKPNIRHITQILRLLIRDRHVQPNARHYKALILANTDNERGSPQLVRGLLEEMENNGITADSGTLHGALQVLAVHPDYLLRQEILNKLRDRWLTLSPAGWHFVAAGLLRENQIELALEHVALMERKDIFVENWLHSIIVYTLCDHGELDEVYNVMRARVDQGHDMTHRLWMHVLTEAGKQGHYPMAHYVWRRMVELGYMHPLVEVCDDVLKMAANAGDTEMASSVFRYLRDSGIPLERTQYERLVETHVAAGDLPAAFEALCTMHEAQIPLADSSTERILAHMIQSKVDRREAWQILKRLKNAKRTIPIDSVRAIADLCEHDAHDDPSVVDDGVGFYKELYTLCPEGADVRVYNALIRMCRTARNRESGMFLVKEMASLGVVPNGVTFESIILMCLDAGNFRSGFMYFQDLMKRDARLSPETQVEIREICAGSVDEFAMRLQYHPFIRDDVRKLDEELQQKQKEKEANEKAGRHPVPPAVRRLNMSDEQRREYNKERRKKKRRRLAIEQNMREEGWDEWEAGGTGSGSAKSE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.16
2	0.15
3	0.12
4	0.14
5	0.15
6	0.16
7	0.23
8	0.23
9	0.24
10	0.26
11	0.27
12	0.26
13	0.29
14	0.32
15	0.32
16	0.39
17	0.44
18	0.52
19	0.59
20	0.68
21	0.75
22	0.8
23	0.83
24	0.82
25	0.84
26	0.84
27	0.8
28	0.75
29	0.69
30	0.66
31	0.57
32	0.56
33	0.47
34	0.39
35	0.37
36	0.37
37	0.4
38	0.38
39	0.41
40	0.43
41	0.47
42	0.49
43	0.5
44	0.49
45	0.47
46	0.49
47	0.51
48	0.47
49	0.44
50	0.4
51	0.4
52	0.42
53	0.35
54	0.3
55	0.29
56	0.28
57	0.31
58	0.36
59	0.4
60	0.37
61	0.39
62	0.42
63	0.39
64	0.42
65	0.45
66	0.46
67	0.44
68	0.49
69	0.49
70	0.53
71	0.61
72	0.57
73	0.53
74	0.49
75	0.48
76	0.46
77	0.45
78	0.4
79	0.35
80	0.35
81	0.35
82	0.37
83	0.35
84	0.36
85	0.44
86	0.5
87	0.54
88	0.62
89	0.68
90	0.71
91	0.79
92	0.78
93	0.8
94	0.82
95	0.84
96	0.84
97	0.81
98	0.78
99	0.75
100	0.74
101	0.65
102	0.56
103	0.5
104	0.47
105	0.45
106	0.42
107	0.41
108	0.36
109	0.34
110	0.32
111	0.3
112	0.23
113	0.19
114	0.17
115	0.13
116	0.15
117	0.17
118	0.17
119	0.16
120	0.16
121	0.21
122	0.27
123	0.32
124	0.34
125	0.33
126	0.37
127	0.42
128	0.45
129	0.41
130	0.36
131	0.34
132	0.37
133	0.4
134	0.41
135	0.39
136	0.36
137	0.35
138	0.36
139	0.34
140	0.3
141	0.32
142	0.31
143	0.37
144	0.41
145	0.48
146	0.49
147	0.56
148	0.62
149	0.57
150	0.54
151	0.45
152	0.45
153	0.43
154	0.43
155	0.33
156	0.29
157	0.28
158	0.31
159	0.32
160	0.28
161	0.22
162	0.18
163	0.18
164	0.14
165	0.15
166	0.12
167	0.11
168	0.15
169	0.16
170	0.16
171	0.16
172	0.17
173	0.15
174	0.15
175	0.14
176	0.1
177	0.11
178	0.11
179	0.09
180	0.08
181	0.07
182	0.06
183	0.06
184	0.05
185	0.04
186	0.05
187	0.05
188	0.06
189	0.06
190	0.06
191	0.06
192	0.06
193	0.05
194	0.05
195	0.05
196	0.06
197	0.06
198	0.06
199	0.05
200	0.06
201	0.06
202	0.07
203	0.08
204	0.08
205	0.08
206	0.12
207	0.18
208	0.22
209	0.28
210	0.28
211	0.29
212	0.34
213	0.34
214	0.34
215	0.32
216	0.31
217	0.29
218	0.28
219	0.28
220	0.25
221	0.25
222	0.23
223	0.2
224	0.16
225	0.12
226	0.11
227	0.1
228	0.08
229	0.08
230	0.07
231	0.08
232	0.08
233	0.08
234	0.08
235	0.07
236	0.07
237	0.06
238	0.05
239	0.06
240	0.06
241	0.06
242	0.05
243	0.05
244	0.06
245	0.06
246	0.06
247	0.07
248	0.07
249	0.07
250	0.08
251	0.08
252	0.08
253	0.13
254	0.16
255	0.15
256	0.16
257	0.16
258	0.15
259	0.14
260	0.14
261	0.1
262	0.07
263	0.07
264	0.07
265	0.07
266	0.07
267	0.08
268	0.07
269	0.07
270	0.07
271	0.07
272	0.07
273	0.06
274	0.06
275	0.06
276	0.08
277	0.08
278	0.07
279	0.07
280	0.06
281	0.09
282	0.11
283	0.13
284	0.13
285	0.14
286	0.17
287	0.18
288	0.19
289	0.16
290	0.19
291	0.17
292	0.15
293	0.15
294	0.12
295	0.12
296	0.12
297	0.12
298	0.09
299	0.1
300	0.11
301	0.11
302	0.11
303	0.1
304	0.09
305	0.12
306	0.1
307	0.1
308	0.1
309	0.13
310	0.16
311	0.17
312	0.19
313	0.19
314	0.2
315	0.2
316	0.19
317	0.16
318	0.14
319	0.14
320	0.13
321	0.12
322	0.11
323	0.1
324	0.1
325	0.1
326	0.09
327	0.08
328	0.07
329	0.04
330	0.05
331	0.05
332	0.04
333	0.05
334	0.04
335	0.04
336	0.04
337	0.04
338	0.04
339	0.04
340	0.04
341	0.05
342	0.04
343	0.05
344	0.05
345	0.05
346	0.04
347	0.04
348	0.06
349	0.06
350	0.07
351	0.09
352	0.1
353	0.11
354	0.12
355	0.13
356	0.13
357	0.18
358	0.19
359	0.16
360	0.18
361	0.18
362	0.2
363	0.21
364	0.21
365	0.16
366	0.16
367	0.17
368	0.18
369	0.17
370	0.15
371	0.14
372	0.12
373	0.11
374	0.1
375	0.09
376	0.06
377	0.06
378	0.05
379	0.04
380	0.04
381	0.04
382	0.04
383	0.04
384	0.03
385	0.04
386	0.06
387	0.06
388	0.08
389	0.09
390	0.1
391	0.09
392	0.11
393	0.11
394	0.1
395	0.09
396	0.08
397	0.07
398	0.08
399	0.09
400	0.08
401	0.07
402	0.07
403	0.08
404	0.09
405	0.11
406	0.15
407	0.15
408	0.16
409	0.19
410	0.23
411	0.25
412	0.27
413	0.25
414	0.23
415	0.32
416	0.34
417	0.39
418	0.4
419	0.44
420	0.5
421	0.54
422	0.56
423	0.56
424	0.58
425	0.6
426	0.6
427	0.62
428	0.63
429	0.61
430	0.61
431	0.59
432	0.55
433	0.48
434	0.43
435	0.36
436	0.27
437	0.25
438	0.19
439	0.11
440	0.11
441	0.09
442	0.1
443	0.09
444	0.09
445	0.1
446	0.11
447	0.12
448	0.11
449	0.11
450	0.09
451	0.1
452	0.11
453	0.09
454	0.08
455	0.07
456	0.07
457	0.07
458	0.08
459	0.06
460	0.05
461	0.06
462	0.07
463	0.07
464	0.07
465	0.11
466	0.11
467	0.11
468	0.11
469	0.11
470	0.11
471	0.13
472	0.13
473	0.09
474	0.1
475	0.11
476	0.11
477	0.12
478	0.13
479	0.14
480	0.13
481	0.15
482	0.17
483	0.17
484	0.25
485	0.29
486	0.37
487	0.4
488	0.46
489	0.47
490	0.45
491	0.48
492	0.43
493	0.43
494	0.33
495	0.28
496	0.24
497	0.21
498	0.19
499	0.15
500	0.12
501	0.08
502	0.08
503	0.08
504	0.06
505	0.06
506	0.06
507	0.06
508	0.07
509	0.07
510	0.06
511	0.06
512	0.05
513	0.06
514	0.06
515	0.07
516	0.06
517	0.06
518	0.06
519	0.06
520	0.06
521	0.05
522	0.07
523	0.09
524	0.09
525	0.09
526	0.1
527	0.1
528	0.11
529	0.11
530	0.16
531	0.14
532	0.17
533	0.23
534	0.23
535	0.27
536	0.29
537	0.29
538	0.25
539	0.28
540	0.3
541	0.3
542	0.31
543	0.32
544	0.33
545	0.34
546	0.33
547	0.31
548	0.28
549	0.23
550	0.22
551	0.21
552	0.17
553	0.14
554	0.14
555	0.14
556	0.13
557	0.13
558	0.12
559	0.09
560	0.09
561	0.09
562	0.11
563	0.1
564	0.1
565	0.12
566	0.17
567	0.19
568	0.21
569	0.23
570	0.24
571	0.3
572	0.36
573	0.39
574	0.4
575	0.41
576	0.4
577	0.42
578	0.45
579	0.45
580	0.45
581	0.48
582	0.52
583	0.55
584	0.59
585	0.58
586	0.58
587	0.58
588	0.56
589	0.59
590	0.58
591	0.62
592	0.64
593	0.67
594	0.65
595	0.69
596	0.66
597	0.57
598	0.51
599	0.48
600	0.5
601	0.5
602	0.55
603	0.52
604	0.54
605	0.55
606	0.55
607	0.55
608	0.52
609	0.56
610	0.56
611	0.54
612	0.57
613	0.59
614	0.6
615	0.6
616	0.63
617	0.65
618	0.65
619	0.7
620	0.76
621	0.81
622	0.88
623	0.92
624	0.93
625	0.94
626	0.95
627	0.95
628	0.95
629	0.95
630	0.95
631	0.95
632	0.91
633	0.85
634	0.77
635	0.66
636	0.55
637	0.45
638	0.35
639	0.3
640	0.24
641	0.18
642	0.16
643	0.17
644	0.17
645	0.15
646	0.15
647	0.09
648	0.09
649	0.09

A0A1V6SQD5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer