FuNGI

A0A1V6TF65

Protein Details

Accession

A0A1V6TF65

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
391-411	RAEQRRERRREDERQLRQSRM	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
227-241	KFKHKKIPRGPPSPP

Subcellular Location(s)

nucl 15, cyto 7, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR017862 SKI-int_prot_SKIP IPR004015 SKI-int_prot_SKIP_SNW-dom
Gene Ontology	GO:0005681 C:spliceosomal complex GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome
Pfam	View protein in Pfam PF02731 SKIP_SNW

Amino Acid Sequences

MSTSIASGLFKSLPKPKYTGEEEELPQHAQPRGPRVVGADQIDETQVVLRRTGPPPYGNRAGWRPRAPEDFGDGGAFPEILVAQYPLDMGRKGKSSKSNALALQVDAEGKVKYDAIARRGHADNRTVHASFKDLIPLRQRVDMGEISLDKPSEEEVQAQMEKTKAALATLVEGASSAQKPKNVKGGQRAEPTFVRYTPANQMGNNGRQNDRIMKIVERQLDPMEPPKFKHKKIPRGPPSPPPPVMHSPPRKLTAEDQEAWKIPPPVSNWKNPKGYTVPLDKRLAADGRGLQDVSINDKFAQFAEALFTADRHAREEVQLRAQMQQKLAEKEKAQKEEHLRMLAQKAREDRAGPSAHASRARSRSRSVSRSVSAYSSRSATPSEDEEAARERAEQRRERRREDERQLRQSRMGTERRIQAMAREQNRDISEKVALGLAKPTQSSESMWDSRLFNQTSGMQAGFNEDNPYDKPLFAAQDAINSIYRPRAQTDVDDEDAGEGEMSKLEKTKRFEVLGRAKEGFRGAAEAEERQGPVQFEKDTADPFGIDNMIADVTSGQKRYGIQEAEGDDRKSKRPRVDDE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.36
2	0.39
3	0.4
4	0.46
5	0.51
6	0.53
7	0.5
8	0.52
9	0.51
10	0.52
11	0.51
12	0.44
13	0.38
14	0.35
15	0.32
16	0.29
17	0.32
18	0.35
19	0.38
20	0.37
21	0.37
22	0.37
23	0.4
24	0.42
25	0.39
26	0.34
27	0.29
28	0.29
29	0.28
30	0.23
31	0.18
32	0.16
33	0.18
34	0.16
35	0.16
36	0.18
37	0.24
38	0.27
39	0.33
40	0.33
41	0.36
42	0.41
43	0.49
44	0.53
45	0.49
46	0.52
47	0.55
48	0.6
49	0.62
50	0.62
51	0.59
52	0.58
53	0.62
54	0.6
55	0.53
56	0.51
57	0.44
58	0.38
59	0.34
60	0.27
61	0.22
62	0.19
63	0.16
64	0.09
65	0.07
66	0.06
67	0.05
68	0.06
69	0.06
70	0.06
71	0.06
72	0.06
73	0.07
74	0.09
75	0.11
76	0.12
77	0.15
78	0.21
79	0.24
80	0.31
81	0.38
82	0.44
83	0.51
84	0.54
85	0.57
86	0.52
87	0.54
88	0.49
89	0.4
90	0.33
91	0.25
92	0.21
93	0.15
94	0.15
95	0.1
96	0.09
97	0.1
98	0.09
99	0.09
100	0.15
101	0.19
102	0.22
103	0.27
104	0.28
105	0.33
106	0.36
107	0.4
108	0.37
109	0.39
110	0.38
111	0.37
112	0.42
113	0.36
114	0.34
115	0.3
116	0.29
117	0.24
118	0.21
119	0.25
120	0.21
121	0.25
122	0.31
123	0.35
124	0.34
125	0.36
126	0.36
127	0.29
128	0.32
129	0.28
130	0.22
131	0.2
132	0.19
133	0.17
134	0.18
135	0.17
136	0.12
137	0.11
138	0.12
139	0.12
140	0.12
141	0.13
142	0.12
143	0.17
144	0.17
145	0.17
146	0.17
147	0.15
148	0.14
149	0.13
150	0.14
151	0.1
152	0.09
153	0.1
154	0.08
155	0.1
156	0.1
157	0.1
158	0.08
159	0.08
160	0.08
161	0.09
162	0.1
163	0.12
164	0.13
165	0.17
166	0.2
167	0.23
168	0.33
169	0.34
170	0.39
171	0.46
172	0.52
173	0.56
174	0.61
175	0.59
176	0.53
177	0.5
178	0.48
179	0.41
180	0.33
181	0.28
182	0.2
183	0.22
184	0.25
185	0.3
186	0.27
187	0.25
188	0.3
189	0.33
190	0.39
191	0.4
192	0.37
193	0.31
194	0.32
195	0.34
196	0.34
197	0.3
198	0.26
199	0.24
200	0.23
201	0.27
202	0.3
203	0.32
204	0.27
205	0.28
206	0.26
207	0.25
208	0.24
209	0.27
210	0.27
211	0.23
212	0.24
213	0.34
214	0.39
215	0.4
216	0.49
217	0.52
218	0.58
219	0.66
220	0.76
221	0.75
222	0.77
223	0.79
224	0.78
225	0.76
226	0.71
227	0.65
228	0.56
229	0.52
230	0.48
231	0.49
232	0.49
233	0.49
234	0.47
235	0.48
236	0.5
237	0.45
238	0.42
239	0.42
240	0.41
241	0.39
242	0.36
243	0.34
244	0.32
245	0.32
246	0.3
247	0.28
248	0.21
249	0.16
250	0.18
251	0.19
252	0.27
253	0.3
254	0.38
255	0.42
256	0.47
257	0.52
258	0.49
259	0.49
260	0.42
261	0.41
262	0.37
263	0.4
264	0.37
265	0.37
266	0.39
267	0.35
268	0.32
269	0.32
270	0.28
271	0.19
272	0.17
273	0.14
274	0.14
275	0.14
276	0.14
277	0.11
278	0.12
279	0.12
280	0.15
281	0.13
282	0.12
283	0.12
284	0.12
285	0.13
286	0.11
287	0.12
288	0.06
289	0.06
290	0.07
291	0.07
292	0.07
293	0.07
294	0.07
295	0.07
296	0.09
297	0.1
298	0.1
299	0.11
300	0.11
301	0.13
302	0.18
303	0.18
304	0.2
305	0.22
306	0.2
307	0.24
308	0.29
309	0.29
310	0.25
311	0.29
312	0.29
313	0.32
314	0.34
315	0.33
316	0.3
317	0.36
318	0.42
319	0.42
320	0.39
321	0.41
322	0.44
323	0.48
324	0.49
325	0.42
326	0.37
327	0.33
328	0.37
329	0.34
330	0.29
331	0.26
332	0.26
333	0.26
334	0.27
335	0.26
336	0.22
337	0.25
338	0.25
339	0.21
340	0.23
341	0.23
342	0.24
343	0.27
344	0.27
345	0.28
346	0.35
347	0.4
348	0.39
349	0.4
350	0.46
351	0.51
352	0.53
353	0.51
354	0.49
355	0.45
356	0.45
357	0.43
358	0.36
359	0.31
360	0.28
361	0.24
362	0.2
363	0.19
364	0.17
365	0.17
366	0.15
367	0.15
368	0.16
369	0.17
370	0.17
371	0.16
372	0.17
373	0.19
374	0.19
375	0.16
376	0.16
377	0.18
378	0.22
379	0.31
380	0.37
381	0.44
382	0.54
383	0.61
384	0.66
385	0.71
386	0.73
387	0.76
388	0.79
389	0.8
390	0.78
391	0.82
392	0.8
393	0.75
394	0.69
395	0.62
396	0.57
397	0.55
398	0.51
399	0.46
400	0.46
401	0.49
402	0.48
403	0.47
404	0.4
405	0.37
406	0.4
407	0.43
408	0.42
409	0.41
410	0.39
411	0.43
412	0.44
413	0.43
414	0.34
415	0.28
416	0.24
417	0.2
418	0.19
419	0.16
420	0.14
421	0.12
422	0.14
423	0.13
424	0.13
425	0.13
426	0.14
427	0.13
428	0.15
429	0.15
430	0.17
431	0.22
432	0.23
433	0.24
434	0.26
435	0.26
436	0.29
437	0.35
438	0.31
439	0.25
440	0.26
441	0.25
442	0.25
443	0.25
444	0.22
445	0.15
446	0.13
447	0.18
448	0.16
449	0.15
450	0.16
451	0.14
452	0.16
453	0.17
454	0.21
455	0.17
456	0.17
457	0.17
458	0.18
459	0.2
460	0.18
461	0.21
462	0.17
463	0.2
464	0.21
465	0.21
466	0.19
467	0.17
468	0.18
469	0.18
470	0.21
471	0.19
472	0.21
473	0.23
474	0.24
475	0.28
476	0.34
477	0.35
478	0.34
479	0.32
480	0.29
481	0.25
482	0.24
483	0.2
484	0.13
485	0.07
486	0.05
487	0.07
488	0.08
489	0.08
490	0.12
491	0.18
492	0.24
493	0.3
494	0.36
495	0.41
496	0.44
497	0.48
498	0.54
499	0.59
500	0.59
501	0.58
502	0.55
503	0.49
504	0.48
505	0.45
506	0.36
507	0.26
508	0.22
509	0.17
510	0.18
511	0.2
512	0.18
513	0.19
514	0.2
515	0.2
516	0.18
517	0.2
518	0.18
519	0.19
520	0.22
521	0.2
522	0.2
523	0.22
524	0.24
525	0.23
526	0.23
527	0.21
528	0.18
529	0.17
530	0.18
531	0.15
532	0.13
533	0.11
534	0.1
535	0.09
536	0.08
537	0.08
538	0.07
539	0.11
540	0.15
541	0.16
542	0.16
543	0.18
544	0.2
545	0.24
546	0.32
547	0.29
548	0.27
549	0.31
550	0.34
551	0.39
552	0.42
553	0.4
554	0.38
555	0.4
556	0.47
557	0.51
558	0.55
559	0.57

A0A1V6TF65

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer