Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V6TDB8

Protein Details
Accession A0A1V6TDB8    Localization Confidence Low Confidence Score 6.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
61-80EWSCKRCETRHTGHRPGYRLHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) plas 12, cyto 5, nucl 4, mito 4, mito_nucl 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003150  DNA-bd_RFX  
IPR039779  RFX-like  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF02257  RFX_DNA_binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51526  RFX_DBD  
Amino Acid Sequences MGKTTLSEERALFCLSSLDSHNAASLSEPKAHDKSFLVNVLASFWIPHFVCLVCLPNFGFEWSCKRCETRHTGHRPGYRLLHLLTQTKQSKMPPELARAHSQGSVVSQTTQIAPQSRPGTADPVRARSEALSRASRRPRSRGSTASIHSSTTQQTQDQHLDGFPQFMPSQVGTGQHMFNNPEDMLMRFGHQLSHHNGAPLDQSMQDTHAGMSRTEDFPNHPMQGHPLSHHPIQPEIANGLSGVSVPQYQPMYDSGVENHLPDHIVEDQEVSEPGTKKKRGASSTVANDNELRKLLRQYEGWSLKQMAAEVMKNEGGGGKAEKVKQVFAMIWLRENCRKSSGSVRRDRVYCCYAENCGTERVSVLNPASFGKLVRIIFPNVQTRRLGVRGESKYHYVDLSVIEEKQQKLAPLNPQIAHHSNGPASMPSRAASAMRSRSASVQQPTADTAVFPSPTTSFAPRFPNNASPADCNCQGHTPSGPDATITRENVAQQAGKMIHQMLQFPTDENTLVDNDTLQLPDIRAYLPANTDLKVAAALAALYRSHCISVIDSFRYCKERNLMKYFSAFHGTLTVPVQKLLTHPNLAPWIKECDWMMYQKMIAFVAPLTTQVVPKPVLDAFNSISQRLCGHIAETFKTQPTHVSIARLIPAHIFCNLLKHMLDVNQAANAAAAWLCHPDNRNQMWTDFKTMVNPRDMMTKANIPTCAELATEQILKHDIRALLTPLSDADPSASLLFFTQPDTPDSVEAHKFPVESAPGDEYNFPDKWVQFILNIPAAFANHRTQCVIEKVDALWDSVLHRLTLAGAPSFSAWWMTKVFFHEMMVWQAEKGGFMRNTPGSLQSATFGPESLGHFQMKPASVPETSSFDASNDSQAKSNPSPPVAHNGPQSHPPSQHPEFKHPPTEKRLSLQDPGFQGHNNDDSAIDLEDDTMLLAVGKYGDMMVSDPADAEGDVVVI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.16
3 0.18
4 0.18
5 0.2
6 0.19
7 0.2
8 0.21
9 0.19
10 0.18
11 0.18
12 0.2
13 0.19
14 0.24
15 0.26
16 0.3
17 0.35
18 0.36
19 0.37
20 0.33
21 0.36
22 0.36
23 0.38
24 0.33
25 0.29
26 0.28
27 0.27
28 0.26
29 0.2
30 0.15
31 0.11
32 0.17
33 0.15
34 0.16
35 0.16
36 0.15
37 0.17
38 0.18
39 0.23
40 0.18
41 0.2
42 0.2
43 0.2
44 0.21
45 0.21
46 0.21
47 0.19
48 0.27
49 0.29
50 0.32
51 0.33
52 0.36
53 0.37
54 0.45
55 0.51
56 0.52
57 0.59
58 0.65
59 0.72
60 0.77
61 0.8
62 0.76
63 0.73
64 0.68
65 0.61
66 0.55
67 0.47
68 0.45
69 0.42
70 0.43
71 0.39
72 0.43
73 0.43
74 0.41
75 0.44
76 0.41
77 0.46
78 0.45
79 0.51
80 0.47
81 0.51
82 0.56
83 0.57
84 0.58
85 0.52
86 0.5
87 0.43
88 0.38
89 0.31
90 0.25
91 0.24
92 0.19
93 0.17
94 0.16
95 0.16
96 0.17
97 0.18
98 0.19
99 0.2
100 0.2
101 0.26
102 0.28
103 0.28
104 0.29
105 0.29
106 0.33
107 0.32
108 0.41
109 0.38
110 0.41
111 0.43
112 0.41
113 0.4
114 0.35
115 0.37
116 0.33
117 0.34
118 0.37
119 0.38
120 0.47
121 0.56
122 0.63
123 0.65
124 0.67
125 0.71
126 0.7
127 0.74
128 0.71
129 0.67
130 0.66
131 0.62
132 0.62
133 0.53
134 0.47
135 0.4
136 0.37
137 0.33
138 0.29
139 0.29
140 0.24
141 0.26
142 0.3
143 0.33
144 0.31
145 0.3
146 0.25
147 0.27
148 0.24
149 0.24
150 0.18
151 0.18
152 0.16
153 0.16
154 0.19
155 0.15
156 0.16
157 0.15
158 0.16
159 0.16
160 0.18
161 0.19
162 0.18
163 0.21
164 0.21
165 0.2
166 0.22
167 0.19
168 0.18
169 0.17
170 0.16
171 0.16
172 0.15
173 0.16
174 0.14
175 0.14
176 0.16
177 0.16
178 0.21
179 0.23
180 0.28
181 0.27
182 0.27
183 0.27
184 0.25
185 0.26
186 0.21
187 0.18
188 0.13
189 0.14
190 0.13
191 0.14
192 0.14
193 0.13
194 0.12
195 0.14
196 0.14
197 0.13
198 0.15
199 0.17
200 0.18
201 0.19
202 0.2
203 0.19
204 0.22
205 0.27
206 0.25
207 0.22
208 0.21
209 0.25
210 0.29
211 0.27
212 0.26
213 0.26
214 0.3
215 0.32
216 0.34
217 0.3
218 0.26
219 0.26
220 0.25
221 0.21
222 0.17
223 0.15
224 0.12
225 0.11
226 0.09
227 0.08
228 0.07
229 0.06
230 0.05
231 0.06
232 0.06
233 0.1
234 0.1
235 0.1
236 0.11
237 0.12
238 0.15
239 0.15
240 0.16
241 0.13
242 0.17
243 0.17
244 0.16
245 0.15
246 0.12
247 0.12
248 0.11
249 0.12
250 0.1
251 0.1
252 0.1
253 0.1
254 0.1
255 0.1
256 0.11
257 0.09
258 0.13
259 0.14
260 0.2
261 0.27
262 0.29
263 0.31
264 0.38
265 0.44
266 0.43
267 0.47
268 0.48
269 0.48
270 0.53
271 0.57
272 0.51
273 0.44
274 0.43
275 0.39
276 0.34
277 0.26
278 0.21
279 0.16
280 0.19
281 0.21
282 0.22
283 0.22
284 0.24
285 0.32
286 0.37
287 0.35
288 0.34
289 0.33
290 0.31
291 0.3
292 0.27
293 0.18
294 0.15
295 0.16
296 0.13
297 0.14
298 0.12
299 0.12
300 0.11
301 0.1
302 0.08
303 0.08
304 0.09
305 0.1
306 0.14
307 0.16
308 0.19
309 0.19
310 0.19
311 0.19
312 0.19
313 0.16
314 0.17
315 0.21
316 0.19
317 0.23
318 0.24
319 0.27
320 0.31
321 0.33
322 0.3
323 0.28
324 0.29
325 0.27
326 0.36
327 0.42
328 0.46
329 0.53
330 0.57
331 0.58
332 0.6
333 0.6
334 0.55
335 0.48
336 0.39
337 0.33
338 0.29
339 0.26
340 0.26
341 0.26
342 0.21
343 0.21
344 0.2
345 0.17
346 0.16
347 0.15
348 0.13
349 0.13
350 0.12
351 0.1
352 0.11
353 0.11
354 0.12
355 0.1
356 0.1
357 0.09
358 0.13
359 0.13
360 0.15
361 0.16
362 0.18
363 0.19
364 0.23
365 0.31
366 0.28
367 0.3
368 0.27
369 0.27
370 0.28
371 0.28
372 0.25
373 0.19
374 0.27
375 0.27
376 0.31
377 0.31
378 0.31
379 0.29
380 0.29
381 0.26
382 0.17
383 0.15
384 0.12
385 0.13
386 0.12
387 0.11
388 0.13
389 0.17
390 0.17
391 0.18
392 0.18
393 0.16
394 0.17
395 0.21
396 0.24
397 0.26
398 0.3
399 0.29
400 0.29
401 0.33
402 0.33
403 0.31
404 0.26
405 0.21
406 0.17
407 0.17
408 0.16
409 0.12
410 0.11
411 0.1
412 0.1
413 0.08
414 0.09
415 0.09
416 0.09
417 0.1
418 0.14
419 0.16
420 0.17
421 0.18
422 0.18
423 0.2
424 0.23
425 0.26
426 0.23
427 0.23
428 0.21
429 0.21
430 0.21
431 0.2
432 0.16
433 0.11
434 0.1
435 0.09
436 0.09
437 0.08
438 0.08
439 0.08
440 0.1
441 0.12
442 0.13
443 0.13
444 0.17
445 0.24
446 0.24
447 0.27
448 0.27
449 0.3
450 0.31
451 0.32
452 0.3
453 0.26
454 0.27
455 0.27
456 0.27
457 0.22
458 0.2
459 0.2
460 0.19
461 0.17
462 0.16
463 0.14
464 0.14
465 0.14
466 0.13
467 0.1
468 0.1
469 0.13
470 0.15
471 0.14
472 0.13
473 0.13
474 0.14
475 0.14
476 0.15
477 0.11
478 0.08
479 0.11
480 0.11
481 0.1
482 0.11
483 0.1
484 0.13
485 0.13
486 0.15
487 0.12
488 0.13
489 0.13
490 0.13
491 0.13
492 0.1
493 0.1
494 0.09
495 0.09
496 0.08
497 0.08
498 0.07
499 0.06
500 0.06
501 0.06
502 0.06
503 0.05
504 0.05
505 0.05
506 0.06
507 0.07
508 0.06
509 0.07
510 0.07
511 0.08
512 0.08
513 0.11
514 0.12
515 0.11
516 0.12
517 0.1
518 0.1
519 0.09
520 0.08
521 0.05
522 0.04
523 0.04
524 0.03
525 0.04
526 0.04
527 0.04
528 0.05
529 0.05
530 0.05
531 0.06
532 0.06
533 0.07
534 0.11
535 0.13
536 0.15
537 0.15
538 0.16
539 0.18
540 0.23
541 0.22
542 0.22
543 0.26
544 0.31
545 0.38
546 0.44
547 0.44
548 0.41
549 0.43
550 0.42
551 0.36
552 0.33
553 0.25
554 0.19
555 0.19
556 0.18
557 0.16
558 0.16
559 0.17
560 0.13
561 0.13
562 0.13
563 0.11
564 0.12
565 0.16
566 0.17
567 0.17
568 0.17
569 0.19
570 0.25
571 0.25
572 0.24
573 0.2
574 0.24
575 0.23
576 0.25
577 0.23
578 0.19
579 0.21
580 0.22
581 0.22
582 0.16
583 0.16
584 0.15
585 0.16
586 0.12
587 0.1
588 0.09
589 0.07
590 0.07
591 0.07
592 0.06
593 0.07
594 0.08
595 0.09
596 0.09
597 0.12
598 0.11
599 0.11
600 0.13
601 0.12
602 0.13
603 0.13
604 0.15
605 0.15
606 0.2
607 0.21
608 0.19
609 0.18
610 0.17
611 0.17
612 0.16
613 0.16
614 0.1
615 0.1
616 0.12
617 0.14
618 0.15
619 0.18
620 0.18
621 0.18
622 0.19
623 0.18
624 0.18
625 0.2
626 0.23
627 0.21
628 0.22
629 0.21
630 0.22
631 0.24
632 0.22
633 0.19
634 0.16
635 0.16
636 0.15
637 0.14
638 0.14
639 0.12
640 0.16
641 0.16
642 0.16
643 0.15
644 0.15
645 0.16
646 0.16
647 0.18
648 0.15
649 0.15
650 0.13
651 0.14
652 0.12
653 0.1
654 0.08
655 0.06
656 0.05
657 0.05
658 0.04
659 0.07
660 0.07
661 0.1
662 0.12
663 0.16
664 0.25
665 0.27
666 0.31
667 0.3
668 0.32
669 0.36
670 0.37
671 0.37
672 0.31
673 0.28
674 0.31
675 0.35
676 0.37
677 0.33
678 0.32
679 0.28
680 0.32
681 0.32
682 0.27
683 0.25
684 0.27
685 0.26
686 0.28
687 0.29
688 0.24
689 0.25
690 0.23
691 0.2
692 0.15
693 0.13
694 0.11
695 0.12
696 0.13
697 0.12
698 0.12
699 0.14
700 0.14
701 0.14
702 0.17
703 0.16
704 0.15
705 0.17
706 0.18
707 0.17
708 0.17
709 0.16
710 0.13
711 0.13
712 0.12
713 0.1
714 0.09
715 0.09
716 0.1
717 0.1
718 0.09
719 0.07
720 0.08
721 0.09
722 0.08
723 0.1
724 0.12
725 0.12
726 0.14
727 0.16
728 0.17
729 0.17
730 0.18
731 0.21
732 0.2
733 0.2
734 0.21
735 0.2
736 0.19
737 0.18
738 0.2
739 0.18
740 0.16
741 0.18
742 0.19
743 0.19
744 0.2
745 0.21
746 0.2
747 0.22
748 0.21
749 0.2
750 0.21
751 0.2
752 0.21
753 0.22
754 0.2
755 0.16
756 0.19
757 0.22
758 0.22
759 0.22
760 0.2
761 0.19
762 0.18
763 0.18
764 0.19
765 0.21
766 0.19
767 0.21
768 0.21
769 0.22
770 0.25
771 0.29
772 0.28
773 0.23
774 0.22
775 0.21
776 0.25
777 0.24
778 0.21
779 0.16
780 0.14
781 0.14
782 0.16
783 0.17
784 0.12
785 0.11
786 0.11
787 0.12
788 0.13
789 0.14
790 0.11
791 0.1
792 0.11
793 0.11
794 0.12
795 0.1
796 0.11
797 0.1
798 0.12
799 0.14
800 0.14
801 0.16
802 0.2
803 0.24
804 0.22
805 0.22
806 0.23
807 0.23
808 0.25
809 0.25
810 0.22
811 0.17
812 0.19
813 0.17
814 0.16
815 0.14
816 0.19
817 0.17
818 0.18
819 0.24
820 0.23
821 0.25
822 0.25
823 0.27
824 0.22
825 0.23
826 0.23
827 0.18
828 0.17
829 0.18
830 0.17
831 0.14
832 0.12
833 0.14
834 0.17
835 0.19
836 0.21
837 0.21
838 0.21
839 0.22
840 0.27
841 0.25
842 0.23
843 0.21
844 0.22
845 0.21
846 0.24
847 0.25
848 0.26
849 0.26
850 0.26
851 0.24
852 0.21
853 0.24
854 0.22
855 0.27
856 0.24
857 0.24
858 0.25
859 0.27
860 0.34
861 0.34
862 0.4
863 0.37
864 0.37
865 0.39
866 0.39
867 0.46
868 0.43
869 0.44
870 0.45
871 0.45
872 0.44
873 0.49
874 0.52
875 0.48
876 0.47
877 0.47
878 0.48
879 0.5
880 0.56
881 0.54
882 0.59
883 0.62
884 0.65
885 0.71
886 0.69
887 0.71
888 0.71
889 0.74
890 0.68
891 0.65
892 0.67
893 0.62
894 0.63
895 0.58
896 0.54
897 0.49
898 0.48
899 0.44
900 0.36
901 0.34
902 0.3
903 0.3
904 0.25
905 0.22
906 0.19
907 0.19
908 0.19
909 0.17
910 0.13
911 0.1
912 0.1
913 0.1
914 0.09
915 0.08
916 0.06
917 0.05
918 0.05
919 0.05
920 0.05
921 0.05
922 0.05
923 0.05
924 0.05
925 0.06
926 0.06
927 0.07
928 0.09
929 0.09
930 0.09
931 0.09
932 0.1
933 0.1
934 0.1
935 0.09