FuNGI

A0A1V6S9U4

Protein Details

Accession

A0A1V6S9U4

Localization Confidence

Low

Confidence Score

7.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
33-61	QCPACMPGKQYQKRNSRARQPRLHSTRTF	Hydrophilic
835-857	LSRNPEFHKRTKHFNVKFHYQRA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

mito 17.5, cyto_mito 11, cyto 3.5, nucl 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR001584 Integrase_cat-core IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR013103 RVT_2
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003887 F:DNA-directed DNA polymerase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0003964 F:RNA-directed DNA polymerase activity GO:0015074 P:DNA integration GO:0032196 P:transposition
Pfam	View protein in Pfam PF00665 rve PF07727 RVT_2
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE
CDD	cd09272 RNase_HI_RT_Ty1

Amino Acid Sequences

MGHLNWGDLRVVLRRTGTPYRPLTQTQLLATPQCPACMPGKQYQKRNSRARQPRLHSTRTFEMIHSDIMEMPIAKDGSRYVITFTDDYSRGSWAYAMRWKHEALQKFRQFEAWVHRQFGAQIKRFLTDNGREYLPIGTHHESQGVEFDTSPPFCKGQNGLAERTNRTIRGRINTLLSDARLPPSWWTELLETVVYLKLRAPASILQKKTPFEILYGKPPSLLHLRRIGSRAWVLIPKEHRANLGPRSSECRLLGYCEPNQYKLYEVHSRKTVFSRDVEFDERTPVAPLIEGETGNDLPDNAPPSPVFPSMPRSGGLPTPPASPLPPSNEREETPSDREEETPPLANPSQQETDLTSDLGYSIYGRRRRPSRRLLESLGKVYSAGTLNTGPARQVDPATFHEAVSGPDQLEWWAAIQKEYASLLEHGTWEKIRREDVPARDHVIGCKWVFKTKANGTRKARLVIKGYRQKHGIDYHETFAAVSRMDSVRCIVASTVLRGWKLQQFDAVTAFLHGDVDSSIYMELPQGFEEPGYVCRLRRSLYGLKQAPRIWYQCVHRVLASPGFTMAQSDNCVFYKPDCVVCVYVDDFLVAAANTHEIEQVQRVLQAEFRLNDLGTPRSFLGIQFDYHIDGSVSIHQHQYIQKVLSDFGMESCQPKSTPMNTKQSLNHRPDEELPDEEAKARFATAIGSLMYLMVGTRPDIAFALGLLSRFTSQPQSHHQVALQRLLRYIKATQSHRITYRNGQFIGYTDADFGGSVVTDGAYSTSGYVFQLAGAPVSWSSKRQGEVATSTTHAEYIGQYNAILHLQWLRTFLAETQLYRSPVTNIMADNQSAIALSRNPEFHKRTKHFNVKFHYQRAVLIAGEIGFQYIPTEKQAADGLTKPLGPTAFAKF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.25
2	0.32
3	0.4
4	0.43
5	0.47
6	0.51
7	0.53
8	0.55
9	0.56
10	0.55
11	0.52
12	0.51
13	0.44
14	0.43
15	0.41
16	0.39
17	0.36
18	0.36
19	0.3
20	0.28
21	0.26
22	0.23
23	0.25
24	0.28
25	0.33
26	0.35
27	0.45
28	0.52
29	0.62
30	0.69
31	0.75
32	0.78
33	0.84
34	0.85
35	0.85
36	0.88
37	0.89
38	0.9
39	0.87
40	0.88
41	0.86
42	0.85
43	0.79
44	0.75
45	0.71
46	0.66
47	0.6
48	0.49
49	0.46
50	0.39
51	0.35
52	0.29
53	0.23
54	0.19
55	0.17
56	0.18
57	0.13
58	0.12
59	0.15
60	0.14
61	0.13
62	0.13
63	0.13
64	0.17
65	0.19
66	0.18
67	0.17
68	0.19
69	0.23
70	0.22
71	0.23
72	0.24
73	0.23
74	0.24
75	0.23
76	0.22
77	0.19
78	0.19
79	0.2
80	0.15
81	0.21
82	0.25
83	0.27
84	0.29
85	0.32
86	0.33
87	0.38
88	0.43
89	0.46
90	0.47
91	0.55
92	0.59
93	0.6
94	0.59
95	0.55
96	0.5
97	0.47
98	0.48
99	0.47
100	0.44
101	0.43
102	0.43
103	0.41
104	0.42
105	0.45
106	0.45
107	0.41
108	0.42
109	0.41
110	0.42
111	0.42
112	0.42
113	0.4
114	0.38
115	0.36
116	0.34
117	0.34
118	0.32
119	0.32
120	0.31
121	0.25
122	0.2
123	0.23
124	0.23
125	0.24
126	0.25
127	0.26
128	0.24
129	0.23
130	0.25
131	0.21
132	0.17
133	0.16
134	0.17
135	0.18
136	0.19
137	0.21
138	0.19
139	0.18
140	0.18
141	0.22
142	0.23
143	0.25
144	0.33
145	0.35
146	0.36
147	0.41
148	0.45
149	0.43
150	0.46
151	0.43
152	0.38
153	0.37
154	0.4
155	0.4
156	0.43
157	0.45
158	0.42
159	0.43
160	0.4
161	0.4
162	0.36
163	0.31
164	0.27
165	0.23
166	0.23
167	0.2
168	0.2
169	0.19
170	0.21
171	0.22
172	0.19
173	0.21
174	0.19
175	0.19
176	0.2
177	0.17
178	0.13
179	0.13
180	0.14
181	0.12
182	0.11
183	0.11
184	0.15
185	0.15
186	0.15
187	0.16
188	0.2
189	0.3
190	0.37
191	0.39
192	0.39
193	0.43
194	0.44
195	0.44
196	0.43
197	0.33
198	0.28
199	0.34
200	0.31
201	0.36
202	0.38
203	0.35
204	0.32
205	0.31
206	0.32
207	0.34
208	0.34
209	0.29
210	0.34
211	0.36
212	0.38
213	0.4
214	0.38
215	0.32
216	0.31
217	0.28
218	0.23
219	0.26
220	0.23
221	0.28
222	0.31
223	0.31
224	0.34
225	0.33
226	0.32
227	0.32
228	0.36
229	0.37
230	0.39
231	0.36
232	0.34
233	0.4
234	0.4
235	0.4
236	0.35
237	0.31
238	0.26
239	0.29
240	0.32
241	0.29
242	0.3
243	0.34
244	0.35
245	0.34
246	0.35
247	0.31
248	0.29
249	0.26
250	0.29
251	0.31
252	0.32
253	0.34
254	0.39
255	0.4
256	0.4
257	0.42
258	0.4
259	0.34
260	0.34
261	0.34
262	0.31
263	0.34
264	0.35
265	0.32
266	0.28
267	0.29
268	0.26
269	0.22
270	0.2
271	0.16
272	0.12
273	0.11
274	0.11
275	0.1
276	0.11
277	0.1
278	0.09
279	0.12
280	0.11
281	0.11
282	0.11
283	0.08
284	0.07
285	0.09
286	0.12
287	0.1
288	0.11
289	0.11
290	0.13
291	0.15
292	0.16
293	0.15
294	0.14
295	0.19
296	0.21
297	0.22
298	0.2
299	0.18
300	0.19
301	0.2
302	0.2
303	0.17
304	0.16
305	0.16
306	0.17
307	0.16
308	0.16
309	0.16
310	0.18
311	0.22
312	0.27
313	0.28
314	0.32
315	0.34
316	0.34
317	0.35
318	0.38
319	0.35
320	0.33
321	0.32
322	0.29
323	0.27
324	0.29
325	0.26
326	0.24
327	0.22
328	0.2
329	0.18
330	0.2
331	0.19
332	0.19
333	0.18
334	0.19
335	0.19
336	0.17
337	0.18
338	0.16
339	0.18
340	0.17
341	0.16
342	0.11
343	0.1
344	0.1
345	0.09
346	0.07
347	0.05
348	0.08
349	0.15
350	0.21
351	0.23
352	0.3
353	0.39
354	0.47
355	0.55
356	0.62
357	0.65
358	0.68
359	0.72
360	0.7
361	0.69
362	0.64
363	0.57
364	0.47
365	0.37
366	0.29
367	0.23
368	0.2
369	0.13
370	0.1
371	0.08
372	0.08
373	0.09
374	0.1
375	0.1
376	0.08
377	0.08
378	0.09
379	0.09
380	0.1
381	0.09
382	0.12
383	0.15
384	0.2
385	0.19
386	0.18
387	0.18
388	0.18
389	0.18
390	0.16
391	0.15
392	0.09
393	0.08
394	0.09
395	0.08
396	0.08
397	0.06
398	0.05
399	0.07
400	0.07
401	0.07
402	0.07
403	0.07
404	0.08
405	0.08
406	0.08
407	0.06
408	0.07
409	0.07
410	0.08
411	0.08
412	0.08
413	0.09
414	0.1
415	0.12
416	0.14
417	0.14
418	0.15
419	0.16
420	0.22
421	0.27
422	0.32
423	0.33
424	0.32
425	0.35
426	0.34
427	0.33
428	0.27
429	0.23
430	0.21
431	0.16
432	0.19
433	0.16
434	0.18
435	0.2
436	0.21
437	0.27
438	0.31
439	0.41
440	0.42
441	0.5
442	0.52
443	0.57
444	0.58
445	0.55
446	0.5
447	0.44
448	0.45
449	0.41
450	0.46
451	0.48
452	0.48
453	0.47
454	0.46
455	0.43
456	0.42
457	0.41
458	0.35
459	0.33
460	0.32
461	0.3
462	0.28
463	0.27
464	0.22
465	0.18
466	0.15
467	0.09
468	0.06
469	0.07
470	0.08
471	0.08
472	0.08
473	0.08
474	0.08
475	0.08
476	0.08
477	0.06
478	0.09
479	0.1
480	0.11
481	0.12
482	0.13
483	0.14
484	0.13
485	0.16
486	0.16
487	0.17
488	0.16
489	0.17
490	0.16
491	0.17
492	0.18
493	0.16
494	0.12
495	0.1
496	0.1
497	0.07
498	0.06
499	0.05
500	0.04
501	0.04
502	0.05
503	0.04
504	0.05
505	0.05
506	0.04
507	0.05
508	0.05
509	0.05
510	0.05
511	0.06
512	0.06
513	0.06
514	0.06
515	0.06
516	0.07
517	0.08
518	0.11
519	0.11
520	0.11
521	0.14
522	0.16
523	0.16
524	0.17
525	0.23
526	0.27
527	0.33
528	0.42
529	0.45
530	0.47
531	0.51
532	0.51
533	0.47
534	0.44
535	0.39
536	0.32
537	0.32
538	0.33
539	0.36
540	0.37
541	0.34
542	0.3
543	0.3
544	0.29
545	0.28
546	0.25
547	0.17
548	0.15
549	0.14
550	0.14
551	0.13
552	0.11
553	0.09
554	0.1
555	0.1
556	0.12
557	0.12
558	0.13
559	0.12
560	0.12
561	0.15
562	0.15
563	0.16
564	0.15
565	0.16
566	0.16
567	0.16
568	0.17
569	0.14
570	0.13
571	0.11
572	0.1
573	0.08
574	0.07
575	0.07
576	0.04
577	0.04
578	0.04
579	0.05
580	0.05
581	0.05
582	0.06
583	0.06
584	0.07
585	0.08
586	0.09
587	0.09
588	0.1
589	0.11
590	0.11
591	0.12
592	0.14
593	0.16
594	0.15
595	0.16
596	0.16
597	0.15
598	0.16
599	0.16
600	0.17
601	0.14
602	0.15
603	0.14
604	0.14
605	0.14
606	0.13
607	0.17
608	0.15
609	0.15
610	0.15
611	0.15
612	0.16
613	0.15
614	0.16
615	0.1
616	0.09
617	0.09
618	0.12
619	0.13
620	0.13
621	0.14
622	0.14
623	0.18
624	0.19
625	0.21
626	0.21
627	0.2
628	0.21
629	0.21
630	0.22
631	0.18
632	0.17
633	0.14
634	0.11
635	0.13
636	0.11
637	0.12
638	0.12
639	0.13
640	0.13
641	0.15
642	0.19
643	0.24
644	0.33
645	0.4
646	0.49
647	0.49
648	0.54
649	0.58
650	0.63
651	0.66
652	0.61
653	0.59
654	0.51
655	0.52
656	0.51
657	0.5
658	0.43
659	0.35
660	0.33
661	0.29
662	0.28
663	0.27
664	0.24
665	0.19
666	0.16
667	0.14
668	0.11
669	0.09
670	0.1
671	0.08
672	0.09
673	0.08
674	0.08
675	0.08
676	0.08
677	0.07
678	0.06
679	0.05
680	0.04
681	0.05
682	0.05
683	0.07
684	0.07
685	0.08
686	0.08
687	0.09
688	0.08
689	0.08
690	0.09
691	0.08
692	0.08
693	0.08
694	0.08
695	0.09
696	0.09
697	0.11
698	0.17
699	0.18
700	0.22
701	0.3
702	0.36
703	0.37
704	0.39
705	0.39
706	0.38
707	0.4
708	0.43
709	0.4
710	0.33
711	0.35
712	0.35
713	0.34
714	0.31
715	0.31
716	0.29
717	0.33
718	0.36
719	0.41
720	0.45
721	0.51
722	0.52
723	0.53
724	0.51
725	0.53
726	0.57
727	0.55
728	0.49
729	0.44
730	0.4
731	0.37
732	0.39
733	0.3
734	0.22
735	0.16
736	0.16
737	0.15
738	0.14
739	0.13
740	0.06
741	0.05
742	0.05
743	0.04
744	0.04
745	0.04
746	0.04
747	0.05
748	0.05
749	0.05
750	0.06
751	0.06
752	0.07
753	0.07
754	0.08
755	0.07
756	0.07
757	0.1
758	0.09
759	0.09
760	0.09
761	0.1
762	0.1
763	0.14
764	0.15
765	0.14
766	0.19
767	0.22
768	0.24
769	0.26
770	0.28
771	0.28
772	0.32
773	0.32
774	0.3
775	0.27
776	0.28
777	0.25
778	0.22
779	0.18
780	0.14
781	0.14
782	0.14
783	0.15
784	0.13
785	0.13
786	0.13
787	0.14
788	0.14
789	0.12
790	0.1
791	0.13
792	0.14
793	0.15
794	0.17
795	0.17
796	0.17
797	0.18
798	0.18
799	0.21
800	0.22
801	0.22
802	0.25
803	0.29
804	0.3
805	0.3
806	0.3
807	0.25
808	0.27
809	0.28
810	0.26
811	0.22
812	0.25
813	0.26
814	0.25
815	0.23
816	0.18
817	0.16
818	0.13
819	0.13
820	0.11
821	0.11
822	0.13
823	0.16
824	0.2
825	0.25
826	0.34
827	0.39
828	0.46
829	0.54
830	0.57
831	0.64
832	0.71
833	0.78
834	0.77
835	0.8
836	0.8
837	0.8
838	0.84
839	0.79
840	0.75
841	0.65
842	0.59
843	0.53
844	0.47
845	0.36
846	0.28
847	0.22
848	0.16
849	0.15
850	0.13
851	0.1
852	0.07
853	0.07
854	0.08
855	0.09
856	0.1
857	0.13
858	0.15
859	0.14
860	0.17
861	0.2
862	0.21
863	0.23
864	0.25
865	0.25
866	0.25
867	0.26
868	0.24
869	0.24
870	0.22
871	0.21

A0A1V6S9U4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer