Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V6SHU5

Protein Details
Accession A0A1V6SHU5    Localization Confidence Low Confidence Score 7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-21MSSPVERKPHIEKDKRKDSDIBasic
845-867DEERRSRTSSRHRRPSNLSAPSNHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) plas 26
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011992  EF-hand-dom_pair  
IPR018247  EF_Hand_1_Ca_BS  
IPR002048  EF_hand_dom  
IPR010920  LSM_dom_sf  
IPR016688  MscS-like_plants/fungi  
IPR023408  MscS_beta-dom_sf  
IPR006685  MscS_channel  
Gene Ontology GO:0005789  C:endoplasmic reticulum membrane  
GO:0005509  F:calcium ion binding  
GO:0055085  P:transmembrane transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF00924  MS_channel  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00018  EF_HAND_1  
PS50222  EF_HAND_2  
Amino Acid Sequences MSSPVERKPHIEKDKRKDSDISPTSDDGTCVTEPDIDRTASHLKVDTTRYAHDDDEDPPLRTPSARREQATRMDDDLLLLQAERMTSHSTGAPDDEHDRNSINRARSRRSEMVDEFDEATNPLHEKAAIYKPPEKPNTQIAVFVKKLHQSSFLVRYLTYISPIVLLLLIPLLVGALKYPNASVGGVELMWFSIWLEIVWLTLWAGRLVAKCMPPIVGLLASVFTNNAKKWRDMAKQLELHAALFFWWLGVEISFLPTMKNHHVDGNTATRGWEGTLNKIIIVVFVWTILNFIEKILIQLIAISFHTRTYADRIEINKFQIGSLTKLYDWSRSTLGEKDDAFEEKNEESTPSGVKTPLHYAGMAQRKAKGALNKVGNRVGDVAGAVMADVTGRAATRSTDAYQVILALLRTTGGSQVLARRLYRTFVRDGFETVFGGDLKAAFDDGEEAEAAFAMFDRDMNGDISMEELEAVCVDIGRERKSITASLKDLDSVVSKLDNVFMFFVFVIVLIVFLTLISTSAAGVLTSAGSAILALSWLFSATAQEFLQSVIFVFVKHPFDVGDRVTIYGNSGDSGLGDDYFVKEITLLYTEFKKMQGHVVQAPNSYLNTLFVLNQRRSGALAEAVPIIIKYGTTIEQLDSLRQRLLEFVRSEKRDFQNNILTEMRAVTENFSLTLNIVFFYKSNWQNEGLRLQRRNKFICMLMIALQEIGIEGPRMNLQGAKFDIPFHVNYGNTRSSEGPAPTDAEEVPISNESHDLPENTGSGSGSAIRHPSILRKGMHTANARARGASVSQRKHVDFSLGMSNMASNDIMGDVFEDRGVVVDDIVRTANRDAAERRIQEENEDDEERRSRTSSRHRRPSNLSAPSNNDAGRGSTDAHSFRSGRSSLSRNRFFHHRSSVGHDRDDLMEQGRFDEPTLPPPATVPAAKEHPN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.85
2 0.84
3 0.8
4 0.75
5 0.69
6 0.69
7 0.65
8 0.6
9 0.53
10 0.5
11 0.49
12 0.43
13 0.39
14 0.29
15 0.27
16 0.21
17 0.17
18 0.17
19 0.18
20 0.19
21 0.23
22 0.25
23 0.21
24 0.22
25 0.26
26 0.3
27 0.27
28 0.28
29 0.26
30 0.26
31 0.31
32 0.35
33 0.37
34 0.35
35 0.36
36 0.38
37 0.38
38 0.36
39 0.33
40 0.31
41 0.27
42 0.33
43 0.32
44 0.31
45 0.29
46 0.3
47 0.28
48 0.29
49 0.31
50 0.32
51 0.4
52 0.45
53 0.47
54 0.51
55 0.57
56 0.64
57 0.64
58 0.57
59 0.49
60 0.44
61 0.41
62 0.36
63 0.3
64 0.21
65 0.17
66 0.13
67 0.11
68 0.09
69 0.09
70 0.08
71 0.09
72 0.13
73 0.13
74 0.15
75 0.17
76 0.17
77 0.18
78 0.2
79 0.19
80 0.18
81 0.23
82 0.24
83 0.23
84 0.23
85 0.24
86 0.24
87 0.3
88 0.33
89 0.35
90 0.4
91 0.45
92 0.51
93 0.57
94 0.65
95 0.65
96 0.63
97 0.64
98 0.6
99 0.6
100 0.54
101 0.49
102 0.43
103 0.36
104 0.31
105 0.23
106 0.21
107 0.16
108 0.15
109 0.14
110 0.12
111 0.12
112 0.12
113 0.18
114 0.26
115 0.28
116 0.33
117 0.4
118 0.47
119 0.56
120 0.61
121 0.58
122 0.54
123 0.58
124 0.59
125 0.51
126 0.51
127 0.45
128 0.47
129 0.45
130 0.43
131 0.38
132 0.37
133 0.39
134 0.34
135 0.35
136 0.3
137 0.35
138 0.39
139 0.39
140 0.34
141 0.32
142 0.32
143 0.31
144 0.29
145 0.24
146 0.18
147 0.14
148 0.14
149 0.14
150 0.13
151 0.08
152 0.08
153 0.05
154 0.05
155 0.05
156 0.04
157 0.03
158 0.03
159 0.03
160 0.03
161 0.03
162 0.05
163 0.06
164 0.07
165 0.07
166 0.08
167 0.09
168 0.09
169 0.09
170 0.08
171 0.08
172 0.08
173 0.08
174 0.07
175 0.06
176 0.06
177 0.06
178 0.05
179 0.04
180 0.05
181 0.04
182 0.05
183 0.05
184 0.05
185 0.06
186 0.06
187 0.05
188 0.06
189 0.07
190 0.07
191 0.07
192 0.1
193 0.1
194 0.13
195 0.17
196 0.17
197 0.17
198 0.18
199 0.18
200 0.15
201 0.15
202 0.14
203 0.1
204 0.09
205 0.09
206 0.08
207 0.08
208 0.07
209 0.07
210 0.08
211 0.11
212 0.12
213 0.19
214 0.21
215 0.22
216 0.27
217 0.36
218 0.41
219 0.46
220 0.52
221 0.54
222 0.55
223 0.55
224 0.55
225 0.46
226 0.39
227 0.31
228 0.24
229 0.15
230 0.12
231 0.1
232 0.05
233 0.05
234 0.05
235 0.05
236 0.05
237 0.06
238 0.05
239 0.07
240 0.08
241 0.08
242 0.08
243 0.08
244 0.13
245 0.16
246 0.19
247 0.19
248 0.23
249 0.23
250 0.25
251 0.28
252 0.3
253 0.26
254 0.23
255 0.22
256 0.18
257 0.18
258 0.17
259 0.18
260 0.13
261 0.16
262 0.21
263 0.2
264 0.2
265 0.21
266 0.19
267 0.14
268 0.13
269 0.1
270 0.05
271 0.06
272 0.06
273 0.05
274 0.06
275 0.05
276 0.06
277 0.05
278 0.05
279 0.06
280 0.06
281 0.07
282 0.07
283 0.07
284 0.06
285 0.07
286 0.07
287 0.07
288 0.07
289 0.08
290 0.07
291 0.07
292 0.09
293 0.08
294 0.1
295 0.14
296 0.16
297 0.16
298 0.2
299 0.23
300 0.27
301 0.29
302 0.3
303 0.27
304 0.24
305 0.23
306 0.22
307 0.21
308 0.18
309 0.18
310 0.17
311 0.15
312 0.19
313 0.2
314 0.2
315 0.2
316 0.2
317 0.19
318 0.19
319 0.21
320 0.21
321 0.22
322 0.21
323 0.2
324 0.19
325 0.19
326 0.19
327 0.18
328 0.15
329 0.16
330 0.12
331 0.13
332 0.12
333 0.12
334 0.11
335 0.11
336 0.12
337 0.11
338 0.11
339 0.12
340 0.12
341 0.13
342 0.17
343 0.18
344 0.17
345 0.16
346 0.16
347 0.22
348 0.3
349 0.3
350 0.27
351 0.27
352 0.28
353 0.3
354 0.32
355 0.3
356 0.27
357 0.31
358 0.39
359 0.4
360 0.42
361 0.43
362 0.4
363 0.35
364 0.31
365 0.24
366 0.16
367 0.12
368 0.09
369 0.06
370 0.06
371 0.05
372 0.03
373 0.03
374 0.02
375 0.02
376 0.02
377 0.02
378 0.02
379 0.03
380 0.04
381 0.04
382 0.06
383 0.08
384 0.09
385 0.12
386 0.12
387 0.12
388 0.12
389 0.11
390 0.1
391 0.08
392 0.07
393 0.04
394 0.04
395 0.04
396 0.04
397 0.04
398 0.05
399 0.04
400 0.05
401 0.06
402 0.09
403 0.12
404 0.14
405 0.14
406 0.16
407 0.16
408 0.18
409 0.2
410 0.2
411 0.2
412 0.21
413 0.23
414 0.22
415 0.23
416 0.22
417 0.2
418 0.17
419 0.13
420 0.11
421 0.09
422 0.08
423 0.07
424 0.05
425 0.04
426 0.04
427 0.04
428 0.03
429 0.03
430 0.04
431 0.04
432 0.04
433 0.04
434 0.04
435 0.04
436 0.04
437 0.04
438 0.03
439 0.03
440 0.03
441 0.03
442 0.03
443 0.04
444 0.04
445 0.05
446 0.06
447 0.06
448 0.06
449 0.06
450 0.06
451 0.06
452 0.05
453 0.04
454 0.04
455 0.03
456 0.03
457 0.03
458 0.03
459 0.02
460 0.03
461 0.05
462 0.07
463 0.09
464 0.1
465 0.1
466 0.12
467 0.13
468 0.17
469 0.18
470 0.2
471 0.19
472 0.2
473 0.19
474 0.18
475 0.17
476 0.14
477 0.12
478 0.08
479 0.07
480 0.06
481 0.06
482 0.06
483 0.08
484 0.08
485 0.07
486 0.08
487 0.07
488 0.08
489 0.07
490 0.07
491 0.05
492 0.05
493 0.04
494 0.03
495 0.03
496 0.03
497 0.03
498 0.02
499 0.02
500 0.02
501 0.02
502 0.03
503 0.03
504 0.03
505 0.03
506 0.03
507 0.03
508 0.03
509 0.03
510 0.03
511 0.03
512 0.03
513 0.03
514 0.02
515 0.02
516 0.02
517 0.02
518 0.02
519 0.02
520 0.02
521 0.02
522 0.02
523 0.03
524 0.03
525 0.03
526 0.04
527 0.04
528 0.07
529 0.06
530 0.07
531 0.07
532 0.08
533 0.08
534 0.07
535 0.06
536 0.06
537 0.06
538 0.06
539 0.07
540 0.11
541 0.12
542 0.12
543 0.12
544 0.11
545 0.13
546 0.15
547 0.15
548 0.13
549 0.12
550 0.13
551 0.13
552 0.12
553 0.12
554 0.1
555 0.09
556 0.07
557 0.07
558 0.06
559 0.06
560 0.07
561 0.06
562 0.05
563 0.05
564 0.05
565 0.06
566 0.07
567 0.07
568 0.05
569 0.05
570 0.05
571 0.06
572 0.07
573 0.07
574 0.08
575 0.1
576 0.11
577 0.12
578 0.14
579 0.14
580 0.14
581 0.2
582 0.21
583 0.23
584 0.28
585 0.32
586 0.31
587 0.31
588 0.31
589 0.25
590 0.22
591 0.19
592 0.13
593 0.1
594 0.09
595 0.09
596 0.1
597 0.14
598 0.21
599 0.21
600 0.24
601 0.24
602 0.23
603 0.23
604 0.23
605 0.19
606 0.13
607 0.13
608 0.11
609 0.1
610 0.1
611 0.09
612 0.08
613 0.07
614 0.05
615 0.04
616 0.04
617 0.06
618 0.07
619 0.08
620 0.09
621 0.09
622 0.13
623 0.13
624 0.17
625 0.18
626 0.18
627 0.17
628 0.17
629 0.17
630 0.17
631 0.19
632 0.21
633 0.2
634 0.26
635 0.33
636 0.36
637 0.38
638 0.42
639 0.44
640 0.47
641 0.48
642 0.47
643 0.47
644 0.45
645 0.47
646 0.4
647 0.36
648 0.28
649 0.26
650 0.21
651 0.14
652 0.13
653 0.1
654 0.1
655 0.1
656 0.11
657 0.1
658 0.1
659 0.09
660 0.1
661 0.08
662 0.07
663 0.07
664 0.07
665 0.07
666 0.09
667 0.17
668 0.21
669 0.24
670 0.26
671 0.29
672 0.31
673 0.34
674 0.4
675 0.39
676 0.42
677 0.46
678 0.53
679 0.56
680 0.6
681 0.61
682 0.56
683 0.53
684 0.47
685 0.43
686 0.36
687 0.31
688 0.26
689 0.23
690 0.2
691 0.16
692 0.14
693 0.1
694 0.08
695 0.07
696 0.04
697 0.04
698 0.04
699 0.05
700 0.06
701 0.07
702 0.08
703 0.1
704 0.1
705 0.15
706 0.17
707 0.19
708 0.18
709 0.19
710 0.21
711 0.21
712 0.21
713 0.19
714 0.19
715 0.18
716 0.19
717 0.24
718 0.25
719 0.23
720 0.24
721 0.23
722 0.22
723 0.26
724 0.26
725 0.23
726 0.21
727 0.22
728 0.21
729 0.21
730 0.18
731 0.16
732 0.15
733 0.13
734 0.14
735 0.14
736 0.13
737 0.12
738 0.13
739 0.11
740 0.14
741 0.15
742 0.15
743 0.14
744 0.16
745 0.16
746 0.15
747 0.15
748 0.12
749 0.11
750 0.1
751 0.11
752 0.1
753 0.12
754 0.14
755 0.13
756 0.15
757 0.16
758 0.22
759 0.26
760 0.32
761 0.32
762 0.34
763 0.39
764 0.41
765 0.48
766 0.45
767 0.46
768 0.48
769 0.53
770 0.5
771 0.45
772 0.42
773 0.36
774 0.34
775 0.36
776 0.37
777 0.34
778 0.4
779 0.45
780 0.46
781 0.46
782 0.44
783 0.39
784 0.31
785 0.3
786 0.32
787 0.26
788 0.25
789 0.23
790 0.22
791 0.18
792 0.18
793 0.15
794 0.06
795 0.06
796 0.06
797 0.06
798 0.06
799 0.06
800 0.06
801 0.06
802 0.07
803 0.06
804 0.06
805 0.07
806 0.08
807 0.07
808 0.07
809 0.09
810 0.09
811 0.1
812 0.12
813 0.11
814 0.12
815 0.13
816 0.16
817 0.14
818 0.19
819 0.2
820 0.27
821 0.36
822 0.35
823 0.38
824 0.41
825 0.4
826 0.39
827 0.41
828 0.38
829 0.36
830 0.36
831 0.34
832 0.32
833 0.36
834 0.34
835 0.31
836 0.29
837 0.27
838 0.34
839 0.44
840 0.51
841 0.58
842 0.68
843 0.73
844 0.8
845 0.85
846 0.86
847 0.85
848 0.83
849 0.78
850 0.73
851 0.72
852 0.67
853 0.62
854 0.52
855 0.43
856 0.34
857 0.29
858 0.26
859 0.21
860 0.21
861 0.19
862 0.24
863 0.24
864 0.26
865 0.3
866 0.28
867 0.28
868 0.31
869 0.29
870 0.28
871 0.34
872 0.39
873 0.44
874 0.53
875 0.61
876 0.57
877 0.62
878 0.67
879 0.65
880 0.66
881 0.65
882 0.61
883 0.55
884 0.61
885 0.67
886 0.62
887 0.59
888 0.52
889 0.45
890 0.42
891 0.41
892 0.34
893 0.27
894 0.25
895 0.22
896 0.24
897 0.23
898 0.21
899 0.19
900 0.23
901 0.21
902 0.25
903 0.3
904 0.27
905 0.26
906 0.26
907 0.29
908 0.27
909 0.28
910 0.24
911 0.25