FuNGI

A0A1V6SNH0

Protein Details

Accession

A0A1V6SNH0

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
868-892	VSTHEEPKKKGKKKGGDNKSPTRTA	Basic
1151-1173	AKHAKDIQARRLRRNPLNPRVSS	Hydrophilic
1212-1238	GTDTSSSRSKQKKRAATSNPKLRGSKQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
874-886	PKKKGKKKGGDNK
1221-1237	KQKKRAATSNPKLRGSK

Subcellular Location(s)

nucl 11, cyto_nucl 10.333, cyto 8.5, mito_nucl 6.333, pero 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR033646 CLU-central IPR025697 CLU_dom IPR028275 CLU_N IPR027523 CLU_prot IPR023231 GSKIP_dom_sf IPR011990 TPR-like_helical_dom_sf IPR019734 TPR_repeat
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0003723 F:RNA binding GO:0007005 P:mitochondrion organization GO:0051640 P:organelle localization
Pfam	View protein in Pfam PF13236 CLU PF15044 CLU_N PF12807 eIF3_p135 PF13374 TPR_10 PF13424 TPR_12
PROSITE	View protein in PROSITE PS51823 CLU PS50005 TPR
CDD	cd15466 CLU-central

Amino Acid Sequences

MAQTNGELELSKEAPQASQEIANGTAPEGTEEDNAGGLFQISVKLPHAPHKIQVMVSSQEQVQDVRQSIVELPGTFQYTCFHLEFDGNRINDFVELSEVPGLQADSEIVLVEDPYTEKEARMHVVRIRELIGASGDRVDNLHGISAGLSLHDAITADAIKASESEKEHSLSKYDLTGVSPLQTILPTAEAPLPKTVKSISLSAWNPVPYNLRQKGHLLYLVVATNEGEQFQITAHVSGFFVNKCSSVRFDPFPKQTHPKKGSAHSLLTLISQLSPSFNASFEALQEYNNEKDLLTTFPFQNAIPNSPWLIAPSNSSLNAHQPDITRSQENYLISGVDNAETLRDWNEEFQTTRELPRETVQDRVFRERLTSKLFADYNEAAARGAVLVARGEVAPLNPTEARDAQIFVYNNIFYSFGADGVGTFTSEGGDEAARVAVGKDVLGIKAVNQLDIDGLFTPGTVVVDYLGKRIVGQSIVPGIFKQREPGEHQIDYGGVEGKEVVATHADFVPVFEKLSKALRVKQHPVWDKENQRHDLEGSVETKGLLGTDGRKYVLDLYRIAPLDAEWQEEEGSDVYPHRMSVLRLELVESYWRHKMSQYVKAEVENRKAASAEAAKEGKTEEESADQERVDISGFNLALNPDVFSGQVPQTEEEKEQWAKDEQEVRDACDHLRSKVIPDLLKDLHDGDVGFPMDGQSLTQLLHKRGINIRYLGKLAQQSAEKGPRLQALSILLVQEMVTRAFKHVANRYLNNVPAPFVASCLSHLLNCLLGSDVNATPKAEIDESLCAIFPEGDFSFEKVTPESLRAELEKQVTIRFRFSLEKDWVNSLKHLQLLRDISVKLGLQLGAREFAFTKDQVKEQVVVPVTNVSTHEEPKKKGKKKGGDNKSPTRTAPAPAQPAVTFTADDILNVVPLVRDAAPRSALAEEALEAGRISLMQNQKQLGQELILESLSLHEQIYGILHPEVAKLYHQLSMLYYQTDEKEAAVELARKAVIVTERTMGVDSADTILSYLNLSLFEHASGNTKTALVYIKHAMDVWKIIYGPNHPDSITTMNNAAVMLQHLKQYNDSRKWFEASLSICEELFGKDSINTATILFQLAQALALDQDSKAAVGKMREAYNIFLAQLGPEDRNTKEAENWLEQLTQNAVSIAKHAKDIQARRLRRNPLNPRVSSMGTRVQPQVGQTAPEISAPADPSGLDSRSIDELLKFIEGTDTSSSRSKQKKRAATSNPKLRGSKQSNKA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.18
2	0.19
3	0.2
4	0.18
5	0.19
6	0.19
7	0.18
8	0.19
9	0.2
10	0.19
11	0.17
12	0.16
13	0.13
14	0.14
15	0.13
16	0.13
17	0.13
18	0.13
19	0.13
20	0.12
21	0.12
22	0.1
23	0.09
24	0.08
25	0.07
26	0.06
27	0.08
28	0.08
29	0.1
30	0.12
31	0.17
32	0.19
33	0.28
34	0.36
35	0.36
36	0.4
37	0.45
38	0.47
39	0.43
40	0.45
41	0.4
42	0.36
43	0.35
44	0.33
45	0.27
46	0.26
47	0.26
48	0.23
49	0.21
50	0.23
51	0.23
52	0.22
53	0.22
54	0.21
55	0.21
56	0.24
57	0.24
58	0.18
59	0.19
60	0.2
61	0.23
62	0.21
63	0.2
64	0.18
65	0.18
66	0.21
67	0.2
68	0.17
69	0.16
70	0.2
71	0.21
72	0.26
73	0.31
74	0.27
75	0.27
76	0.27
77	0.26
78	0.22
79	0.21
80	0.15
81	0.12
82	0.12
83	0.13
84	0.14
85	0.14
86	0.13
87	0.13
88	0.13
89	0.09
90	0.09
91	0.07
92	0.06
93	0.06
94	0.06
95	0.05
96	0.05
97	0.05
98	0.05
99	0.06
100	0.06
101	0.08
102	0.13
103	0.13
104	0.14
105	0.17
106	0.2
107	0.24
108	0.27
109	0.3
110	0.3
111	0.36
112	0.37
113	0.37
114	0.35
115	0.31
116	0.28
117	0.24
118	0.23
119	0.17
120	0.15
121	0.16
122	0.14
123	0.13
124	0.13
125	0.13
126	0.12
127	0.11
128	0.11
129	0.09
130	0.09
131	0.09
132	0.09
133	0.08
134	0.07
135	0.07
136	0.06
137	0.06
138	0.06
139	0.06
140	0.05
141	0.07
142	0.07
143	0.07
144	0.08
145	0.08
146	0.08
147	0.08
148	0.09
149	0.13
150	0.14
151	0.18
152	0.19
153	0.21
154	0.25
155	0.25
156	0.27
157	0.23
158	0.23
159	0.21
160	0.21
161	0.19
162	0.18
163	0.19
164	0.17
165	0.17
166	0.16
167	0.14
168	0.13
169	0.12
170	0.11
171	0.09
172	0.1
173	0.09
174	0.1
175	0.14
176	0.14
177	0.16
178	0.22
179	0.23
180	0.22
181	0.24
182	0.23
183	0.24
184	0.25
185	0.26
186	0.21
187	0.28
188	0.29
189	0.3
190	0.32
191	0.29
192	0.27
193	0.27
194	0.3
195	0.26
196	0.35
197	0.4
198	0.38
199	0.39
200	0.42
201	0.43
202	0.42
203	0.4
204	0.31
205	0.24
206	0.25
207	0.24
208	0.2
209	0.17
210	0.13
211	0.12
212	0.11
213	0.1
214	0.08
215	0.07
216	0.07
217	0.07
218	0.09
219	0.09
220	0.09
221	0.09
222	0.1
223	0.1
224	0.12
225	0.14
226	0.12
227	0.13
228	0.13
229	0.14
230	0.15
231	0.17
232	0.2
233	0.22
234	0.27
235	0.3
236	0.36
237	0.43
238	0.49
239	0.51
240	0.54
241	0.59
242	0.63
243	0.69
244	0.68
245	0.67
246	0.67
247	0.68
248	0.71
249	0.66
250	0.6
251	0.51
252	0.46
253	0.39
254	0.33
255	0.27
256	0.18
257	0.12
258	0.1
259	0.09
260	0.09
261	0.09
262	0.11
263	0.11
264	0.11
265	0.12
266	0.12
267	0.12
268	0.12
269	0.16
270	0.13
271	0.13
272	0.16
273	0.18
274	0.18
275	0.19
276	0.19
277	0.14
278	0.15
279	0.16
280	0.16
281	0.16
282	0.18
283	0.17
284	0.18
285	0.19
286	0.18
287	0.23
288	0.22
289	0.23
290	0.21
291	0.22
292	0.22
293	0.22
294	0.22
295	0.18
296	0.18
297	0.15
298	0.16
299	0.18
300	0.19
301	0.19
302	0.2
303	0.19
304	0.22
305	0.24
306	0.22
307	0.21
308	0.21
309	0.23
310	0.26
311	0.29
312	0.25
313	0.24
314	0.26
315	0.27
316	0.26
317	0.24
318	0.2
319	0.17
320	0.14
321	0.15
322	0.12
323	0.09
324	0.08
325	0.07
326	0.07
327	0.07
328	0.07
329	0.07
330	0.08
331	0.09
332	0.11
333	0.13
334	0.14
335	0.15
336	0.16
337	0.2
338	0.2
339	0.22
340	0.24
341	0.23
342	0.23
343	0.26
344	0.31
345	0.27
346	0.33
347	0.34
348	0.36
349	0.38
350	0.44
351	0.42
352	0.35
353	0.39
354	0.34
355	0.35
356	0.35
357	0.35
358	0.28
359	0.32
360	0.33
361	0.29
362	0.31
363	0.28
364	0.24
365	0.22
366	0.21
367	0.15
368	0.14
369	0.14
370	0.08
371	0.07
372	0.05
373	0.04
374	0.04
375	0.04
376	0.05
377	0.05
378	0.05
379	0.05
380	0.05
381	0.06
382	0.06
383	0.09
384	0.09
385	0.1
386	0.13
387	0.13
388	0.15
389	0.14
390	0.15
391	0.13
392	0.18
393	0.18
394	0.16
395	0.17
396	0.16
397	0.15
398	0.15
399	0.14
400	0.09
401	0.11
402	0.1
403	0.08
404	0.08
405	0.08
406	0.07
407	0.08
408	0.08
409	0.05
410	0.05
411	0.05
412	0.05
413	0.05
414	0.05
415	0.04
416	0.04
417	0.04
418	0.05
419	0.05
420	0.04
421	0.04
422	0.04
423	0.05
424	0.05
425	0.05
426	0.06
427	0.06
428	0.07
429	0.08
430	0.07
431	0.07
432	0.13
433	0.13
434	0.12
435	0.12
436	0.12
437	0.11
438	0.11
439	0.12
440	0.05
441	0.06
442	0.05
443	0.05
444	0.05
445	0.05
446	0.05
447	0.04
448	0.04
449	0.04
450	0.07
451	0.07
452	0.08
453	0.08
454	0.08
455	0.08
456	0.09
457	0.1
458	0.08
459	0.07
460	0.08
461	0.11
462	0.11
463	0.11
464	0.11
465	0.13
466	0.14
467	0.14
468	0.17
469	0.15
470	0.18
471	0.24
472	0.31
473	0.34
474	0.32
475	0.32
476	0.28
477	0.27
478	0.24
479	0.19
480	0.13
481	0.08
482	0.07
483	0.07
484	0.07
485	0.07
486	0.06
487	0.06
488	0.05
489	0.05
490	0.06
491	0.07
492	0.07
493	0.06
494	0.07
495	0.08
496	0.07
497	0.07
498	0.07
499	0.07
500	0.08
501	0.11
502	0.16
503	0.17
504	0.23
505	0.3
506	0.36
507	0.41
508	0.44
509	0.5
510	0.52
511	0.54
512	0.54
513	0.55
514	0.56
515	0.58
516	0.61
517	0.56
518	0.5
519	0.46
520	0.41
521	0.34
522	0.28
523	0.23
524	0.17
525	0.13
526	0.12
527	0.11
528	0.11
529	0.09
530	0.07
531	0.05
532	0.05
533	0.07
534	0.09
535	0.1
536	0.1
537	0.11
538	0.11
539	0.15
540	0.18
541	0.17
542	0.16
543	0.17
544	0.2
545	0.21
546	0.2
547	0.15
548	0.12
549	0.16
550	0.14
551	0.14
552	0.1
553	0.11
554	0.11
555	0.11
556	0.11
557	0.06
558	0.06
559	0.06
560	0.06
561	0.07
562	0.07
563	0.07
564	0.07
565	0.08
566	0.08
567	0.11
568	0.14
569	0.13
570	0.13
571	0.14
572	0.13
573	0.12
574	0.16
575	0.13
576	0.13
577	0.15
578	0.16
579	0.15
580	0.16
581	0.23
582	0.25
583	0.33
584	0.33
585	0.34
586	0.34
587	0.36
588	0.41
589	0.38
590	0.36
591	0.3
592	0.27
593	0.24
594	0.23
595	0.21
596	0.18
597	0.16
598	0.13
599	0.14
600	0.15
601	0.15
602	0.14
603	0.15
604	0.12
605	0.11
606	0.11
607	0.07
608	0.09
609	0.1
610	0.12
611	0.12
612	0.12
613	0.11
614	0.1
615	0.09
616	0.07
617	0.06
618	0.05
619	0.06
620	0.07
621	0.06
622	0.07
623	0.07
624	0.07
625	0.07
626	0.07
627	0.05
628	0.05
629	0.05
630	0.05
631	0.07
632	0.07
633	0.08
634	0.09
635	0.1
636	0.11
637	0.13
638	0.13
639	0.12
640	0.16
641	0.16
642	0.15
643	0.16
644	0.16
645	0.16
646	0.19
647	0.24
648	0.2
649	0.27
650	0.27
651	0.27
652	0.26
653	0.26
654	0.23
655	0.23
656	0.24
657	0.17
658	0.2
659	0.18
660	0.18
661	0.21
662	0.25
663	0.19
664	0.19
665	0.23
666	0.2
667	0.21
668	0.2
669	0.17
670	0.14
671	0.13
672	0.12
673	0.08
674	0.1
675	0.09
676	0.08
677	0.07
678	0.07
679	0.07
680	0.07
681	0.06
682	0.04
683	0.04
684	0.05
685	0.09
686	0.11
687	0.12
688	0.18
689	0.18
690	0.21
691	0.26
692	0.28
693	0.28
694	0.28
695	0.29
696	0.25
697	0.26
698	0.23
699	0.21
700	0.2
701	0.18
702	0.18
703	0.17
704	0.17
705	0.21
706	0.25
707	0.23
708	0.21
709	0.22
710	0.23
711	0.23
712	0.21
713	0.18
714	0.14
715	0.15
716	0.15
717	0.13
718	0.1
719	0.08
720	0.08
721	0.08
722	0.07
723	0.06
724	0.06
725	0.07
726	0.08
727	0.11
728	0.12
729	0.17
730	0.23
731	0.29
732	0.34
733	0.35
734	0.38
735	0.39
736	0.38
737	0.34
738	0.28
739	0.22
740	0.17
741	0.18
742	0.13
743	0.11
744	0.11
745	0.09
746	0.1
747	0.11
748	0.11
749	0.09
750	0.1
751	0.09
752	0.09
753	0.09
754	0.08
755	0.06
756	0.06
757	0.06
758	0.09
759	0.09
760	0.1
761	0.1
762	0.1
763	0.1
764	0.11
765	0.12
766	0.09
767	0.09
768	0.09
769	0.1
770	0.1
771	0.11
772	0.1
773	0.08
774	0.08
775	0.08
776	0.06
777	0.08
778	0.08
779	0.1
780	0.11
781	0.12
782	0.14
783	0.15
784	0.16
785	0.12
786	0.14
787	0.12
788	0.14
789	0.15
790	0.13
791	0.14
792	0.14
793	0.16
794	0.17
795	0.18
796	0.18
797	0.17
798	0.2
799	0.24
800	0.24
801	0.24
802	0.21
803	0.22
804	0.25
805	0.26
806	0.3
807	0.3
808	0.32
809	0.32
810	0.36
811	0.36
812	0.33
813	0.32
814	0.27
815	0.25
816	0.25
817	0.25
818	0.2
819	0.23
820	0.24
821	0.24
822	0.24
823	0.22
824	0.19
825	0.2
826	0.19
827	0.14
828	0.13
829	0.12
830	0.09
831	0.1
832	0.11
833	0.11
834	0.1
835	0.11
836	0.1
837	0.11
838	0.13
839	0.13
840	0.16
841	0.17
842	0.18
843	0.21
844	0.22
845	0.22
846	0.2
847	0.25
848	0.22
849	0.2
850	0.19
851	0.18
852	0.16
853	0.15
854	0.15
855	0.14
856	0.15
857	0.18
858	0.26
859	0.29
860	0.32
861	0.42
862	0.52
863	0.56
864	0.63
865	0.69
866	0.71
867	0.77
868	0.85
869	0.85
870	0.85
871	0.86
872	0.87
873	0.83
874	0.76
875	0.66
876	0.61
877	0.52
878	0.44
879	0.43
880	0.39
881	0.37
882	0.36
883	0.37
884	0.31
885	0.3
886	0.3
887	0.23
888	0.17
889	0.12
890	0.14
891	0.12
892	0.12
893	0.11
894	0.09
895	0.08
896	0.08
897	0.08
898	0.04
899	0.05
900	0.07
901	0.06
902	0.08
903	0.1
904	0.13
905	0.14
906	0.14
907	0.16
908	0.14
909	0.13
910	0.12
911	0.1
912	0.08
913	0.09
914	0.09
915	0.07
916	0.07
917	0.06
918	0.06
919	0.06
920	0.06
921	0.1
922	0.16
923	0.19
924	0.23
925	0.24
926	0.27
927	0.29
928	0.29
929	0.24
930	0.19
931	0.17
932	0.14
933	0.14
934	0.11
935	0.09
936	0.08
937	0.08
938	0.08
939	0.08
940	0.07
941	0.06
942	0.06
943	0.06
944	0.08
945	0.07
946	0.08
947	0.08
948	0.08
949	0.08
950	0.09
951	0.1
952	0.09
953	0.1
954	0.11
955	0.12
956	0.14
957	0.15
958	0.14
959	0.15
960	0.18
961	0.18
962	0.16
963	0.15
964	0.14
965	0.15
966	0.16
967	0.15
968	0.11
969	0.11
970	0.11
971	0.11
972	0.12
973	0.14
974	0.12
975	0.14
976	0.14
977	0.13
978	0.13
979	0.14
980	0.16
981	0.15
982	0.16
983	0.16
984	0.17
985	0.17
986	0.18
987	0.15
988	0.12
989	0.1
990	0.09
991	0.09
992	0.08
993	0.08
994	0.07
995	0.07
996	0.07
997	0.07
998	0.06
999	0.05
1000	0.06
1001	0.06
1002	0.08
1003	0.08
1004	0.09
1005	0.1
1006	0.1
1007	0.14
1008	0.14
1009	0.15
1010	0.14
1011	0.14
1012	0.13
1013	0.14
1014	0.18
1015	0.15
1016	0.18
1017	0.21
1018	0.21
1019	0.21
1020	0.22
1021	0.22
1022	0.19
1023	0.2
1024	0.17
1025	0.15
1026	0.14
1027	0.15
1028	0.17
1029	0.2
1030	0.24
1031	0.25
1032	0.25
1033	0.23
1034	0.24
1035	0.26
1036	0.28
1037	0.26
1038	0.21
1039	0.19
1040	0.18
1041	0.19
1042	0.18
1043	0.14
1044	0.1
1045	0.11
1046	0.12
1047	0.12
1048	0.16
1049	0.18
1050	0.19
1051	0.25
1052	0.33
1053	0.41
1054	0.47
1055	0.51
1056	0.53
1057	0.54
1058	0.56
1059	0.51
1060	0.43
1061	0.39
1062	0.34
1063	0.33
1064	0.31
1065	0.28
1066	0.24
1067	0.24
1068	0.23
1069	0.18
1070	0.17
1071	0.13
1072	0.11
1073	0.1
1074	0.12
1075	0.13
1076	0.13
1077	0.12
1078	0.11
1079	0.11
1080	0.11
1081	0.12
1082	0.11
1083	0.1
1084	0.1
1085	0.09
1086	0.09
1087	0.08
1088	0.08
1089	0.07
1090	0.07
1091	0.07
1092	0.06
1093	0.07
1094	0.07
1095	0.07
1096	0.08
1097	0.09
1098	0.12
1099	0.13
1100	0.18
1101	0.23
1102	0.24
1103	0.27
1104	0.28
1105	0.29
1106	0.3
1107	0.29
1108	0.24
1109	0.2
1110	0.18
1111	0.15
1112	0.17
1113	0.16
1114	0.13
1115	0.15
1116	0.18
1117	0.18
1118	0.21
1119	0.24
1120	0.22
1121	0.24
1122	0.29
1123	0.32
1124	0.34
1125	0.35
1126	0.34
1127	0.34
1128	0.32
1129	0.3
1130	0.26
1131	0.21
1132	0.17
1133	0.16
1134	0.15
1135	0.12
1136	0.16
1137	0.2
1138	0.18
1139	0.2
1140	0.22
1141	0.27
1142	0.35
1143	0.41
1144	0.48
1145	0.52
1146	0.59
1147	0.66
1148	0.73
1149	0.77
1150	0.78
1151	0.82
1152	0.83
1153	0.83
1154	0.86
1155	0.78
1156	0.75
1157	0.7
1158	0.64
1159	0.56
1160	0.5
1161	0.47
1162	0.4
1163	0.43
1164	0.39
1165	0.37
1166	0.35
1167	0.33
1168	0.34
1169	0.27
1170	0.27
1171	0.23
1172	0.24
1173	0.22
1174	0.21
1175	0.2
1176	0.15
1177	0.17
1178	0.16
1179	0.16
1180	0.13
1181	0.12
1182	0.16
1183	0.2
1184	0.2
1185	0.18
1186	0.17
1187	0.19
1188	0.22
1189	0.23
1190	0.2
1191	0.16
1192	0.16
1193	0.16
1194	0.17
1195	0.14
1196	0.11
1197	0.14
1198	0.13
1199	0.16
1200	0.2
1201	0.19
1202	0.21
1203	0.27
1204	0.29
1205	0.35
1206	0.46
1207	0.52
1208	0.57
1209	0.66
1210	0.73
1211	0.78
1212	0.86
1213	0.88
1214	0.89
1215	0.9
1216	0.91
1217	0.89
1218	0.86
1219	0.8
1220	0.75
1221	0.75
1222	0.73

A0A1V6SNH0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer