Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V6THJ9

Protein Details
Accession A0A1V6THJ9    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
39-70QQAVKRKRSELTKRENKTRFRQRESKETIRKAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
43-66KRKRSELTKRENKTRFRQRESKET
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12, cyto 3.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Amino Acid Sequences MSSATMAPEIPGFYYDPEKKKYFKIQANHAAPPNAQYSQQAVKRKRSELTKRENKTRFRQRESKETIRKAASLKHPLVNLQREIGVIVSSRARQEQQARIQASQLHRGELHRFEPWPNSYSIRHVLRNPRSGTLIAGSARGYESSVSVCFPDIDESQWSYDHTMERVLFREPYWLGSMSLSHSGYLLATMNEGPQGDCFLSAHLLPEPDEGGNYRWPTFSHPIRIRPHYPMSFWCSAAQPTGSTAHFAIGTSEGLHTLEGTNSHWCLSKKPFKGNTVSTGNRRRSQRTQSVHAVEWMSPDVIAAGQKNSKIFLHDLRSGGSATRLQHSDAVMEMKQMDEYRLVAAGPTSLRMYDLRFAPTALKYHDSSKPYLTFPDFSSLPFPTFDLSTELGLLASPSQDCKVQLFSLQTGLQVSSPLTGRQYSSPPSCVRFEYGNDTPEWRGPHGPSLLVGTDDVVEQWTW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.3
3 0.35
4 0.41
5 0.45
6 0.47
7 0.54
8 0.62
9 0.63
10 0.64
11 0.66
12 0.7
13 0.76
14 0.79
15 0.77
16 0.71
17 0.63
18 0.55
19 0.5
20 0.44
21 0.35
22 0.29
23 0.25
24 0.26
25 0.31
26 0.38
27 0.44
28 0.46
29 0.55
30 0.62
31 0.65
32 0.67
33 0.69
34 0.73
35 0.74
36 0.79
37 0.79
38 0.8
39 0.85
40 0.87
41 0.85
42 0.85
43 0.86
44 0.85
45 0.84
46 0.85
47 0.81
48 0.83
49 0.84
50 0.84
51 0.83
52 0.79
53 0.77
54 0.7
55 0.67
56 0.59
57 0.59
58 0.57
59 0.56
60 0.53
61 0.5
62 0.48
63 0.5
64 0.55
65 0.53
66 0.45
67 0.37
68 0.34
69 0.3
70 0.29
71 0.24
72 0.16
73 0.1
74 0.1
75 0.12
76 0.12
77 0.14
78 0.16
79 0.17
80 0.23
81 0.3
82 0.37
83 0.42
84 0.49
85 0.5
86 0.48
87 0.49
88 0.49
89 0.45
90 0.45
91 0.38
92 0.31
93 0.3
94 0.32
95 0.35
96 0.33
97 0.32
98 0.26
99 0.27
100 0.27
101 0.32
102 0.33
103 0.3
104 0.28
105 0.3
106 0.28
107 0.31
108 0.37
109 0.35
110 0.36
111 0.4
112 0.48
113 0.52
114 0.59
115 0.56
116 0.5
117 0.48
118 0.45
119 0.39
120 0.3
121 0.25
122 0.18
123 0.16
124 0.14
125 0.12
126 0.12
127 0.11
128 0.1
129 0.07
130 0.07
131 0.08
132 0.08
133 0.08
134 0.08
135 0.08
136 0.08
137 0.08
138 0.11
139 0.1
140 0.11
141 0.13
142 0.14
143 0.14
144 0.14
145 0.15
146 0.13
147 0.14
148 0.14
149 0.12
150 0.14
151 0.14
152 0.15
153 0.16
154 0.16
155 0.15
156 0.14
157 0.18
158 0.16
159 0.16
160 0.17
161 0.17
162 0.16
163 0.15
164 0.15
165 0.12
166 0.15
167 0.14
168 0.11
169 0.1
170 0.1
171 0.09
172 0.1
173 0.08
174 0.05
175 0.06
176 0.06
177 0.06
178 0.06
179 0.07
180 0.06
181 0.06
182 0.07
183 0.06
184 0.06
185 0.06
186 0.06
187 0.06
188 0.06
189 0.07
190 0.07
191 0.07
192 0.07
193 0.08
194 0.08
195 0.07
196 0.07
197 0.07
198 0.08
199 0.12
200 0.12
201 0.13
202 0.12
203 0.13
204 0.18
205 0.24
206 0.25
207 0.3
208 0.33
209 0.41
210 0.45
211 0.5
212 0.48
213 0.46
214 0.5
215 0.42
216 0.39
217 0.35
218 0.36
219 0.32
220 0.3
221 0.26
222 0.21
223 0.2
224 0.19
225 0.16
226 0.1
227 0.1
228 0.11
229 0.1
230 0.1
231 0.1
232 0.09
233 0.09
234 0.09
235 0.08
236 0.07
237 0.07
238 0.06
239 0.06
240 0.06
241 0.06
242 0.06
243 0.05
244 0.05
245 0.05
246 0.05
247 0.07
248 0.08
249 0.08
250 0.09
251 0.12
252 0.13
253 0.17
254 0.25
255 0.33
256 0.36
257 0.45
258 0.5
259 0.5
260 0.56
261 0.55
262 0.53
263 0.51
264 0.51
265 0.5
266 0.53
267 0.54
268 0.54
269 0.56
270 0.56
271 0.56
272 0.61
273 0.63
274 0.6
275 0.61
276 0.63
277 0.62
278 0.56
279 0.51
280 0.43
281 0.33
282 0.29
283 0.23
284 0.15
285 0.1
286 0.1
287 0.07
288 0.06
289 0.07
290 0.07
291 0.08
292 0.1
293 0.11
294 0.12
295 0.13
296 0.13
297 0.15
298 0.17
299 0.2
300 0.24
301 0.27
302 0.27
303 0.27
304 0.28
305 0.26
306 0.23
307 0.2
308 0.17
309 0.15
310 0.18
311 0.18
312 0.18
313 0.2
314 0.2
315 0.18
316 0.16
317 0.17
318 0.13
319 0.13
320 0.12
321 0.1
322 0.12
323 0.11
324 0.11
325 0.09
326 0.1
327 0.1
328 0.1
329 0.09
330 0.08
331 0.08
332 0.09
333 0.08
334 0.09
335 0.09
336 0.08
337 0.1
338 0.11
339 0.13
340 0.16
341 0.18
342 0.19
343 0.19
344 0.2
345 0.22
346 0.23
347 0.24
348 0.23
349 0.24
350 0.23
351 0.28
352 0.34
353 0.33
354 0.34
355 0.36
356 0.36
357 0.34
358 0.38
359 0.36
360 0.32
361 0.3
362 0.33
363 0.27
364 0.25
365 0.28
366 0.25
367 0.22
368 0.21
369 0.19
370 0.15
371 0.15
372 0.15
373 0.15
374 0.15
375 0.14
376 0.14
377 0.14
378 0.12
379 0.11
380 0.1
381 0.07
382 0.07
383 0.07
384 0.08
385 0.09
386 0.12
387 0.13
388 0.15
389 0.18
390 0.18
391 0.21
392 0.23
393 0.23
394 0.25
395 0.25
396 0.23
397 0.21
398 0.21
399 0.17
400 0.15
401 0.14
402 0.12
403 0.13
404 0.14
405 0.15
406 0.16
407 0.18
408 0.21
409 0.26
410 0.31
411 0.34
412 0.39
413 0.4
414 0.43
415 0.44
416 0.43
417 0.41
418 0.38
419 0.37
420 0.39
421 0.4
422 0.38
423 0.37
424 0.37
425 0.36
426 0.36
427 0.36
428 0.31
429 0.31
430 0.31
431 0.37
432 0.36
433 0.34
434 0.31
435 0.32
436 0.29
437 0.24
438 0.22
439 0.15
440 0.14
441 0.13
442 0.12