FuNGI

A0A0C4EM20

Protein Details

Accession

A0A0C4EM20

Localization Confidence

Low

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1000-1019	VSVLRKHKPDKIAQQQRRTP	Hydrophilic
1079-1106	SKFPEAAARHWRTRRKKLHVHVTHHTQE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

plas 18, nucl 3, mito 2, cyto 2, E.R. 2, cyto_mito 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR016197 Chromo-like_dom_sf IPR000953 Chromo/chromo_shadow_dom IPR023780 Chromo_domain IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR001584 Integrase_cat-core IPR041588 Integrase_H2C2 IPR043128 Rev_trsase/Diguanyl_cyclase IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR000477 RT_dom IPR041577 RT_RNaseH_2
Gene Ontology	GO:0016020 C:membrane GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0015074 P:DNA integration
Pfam	View protein in Pfam PF00385 Chromo PF17921 Integrase_H2C2 PF17919 RT_RNaseH_2 PF00078 RVT_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50013 CHROMO_2 PS50994 INTEGRASE PS50878 RT_POL
CDD	cd00024 CD_CSD cd09274 RNase_HI_RT_Ty3 cd01647 RT_LTR

Amino Acid Sequences

MTGQSNPKTSSTEGQGPMMGKARICDKDSTPHPNWNPAPPQPKWNPANDFDTALVVLSTQQTSSTEGQRPMMGKVRICDKGVCVLPPPQCESNKGFPQSFSKAAGKPLSFLEHYPTEISAAKTLWLTSTRLVAVGKAAIAAQTAKELVPQCYHQFIDMFRKSSAKSLPPRGKYDFCVDLVPGATLQASRIIPLSPAENQALETLIEEGLASRKMRRTTSPWAAPVLFTGKKDGNLRPCFDYQKLNVLTVKNRYPLPLTMDLVDSLLNANTFTKLDLHNAYRNLRVVEGDEDKLAYICKPGQFALLTIPFGPTRAPGYFQYFMQDILLGQIGKDTATYLDDIMVYTQKGSNHTAAVNGILETLSKHQLWLKLEKCEFSKPEVEYLGLLIACNRIRMDPAKVKAVTEWPTPRNITELQWFIGLSKFYCQFIDHFSGKTRPLHDLTKAKTPFVWDNKCNSAFECLKTAFTSAPILKIVNPYKLFILECDCSNFALGAVLSQAEENYKIFDKELLAIVTAFKEWRQYLEGNPHRLTAIVYTDHWNLESFMTTKELTQRQVRRPDLAPAPGKKLNFGQLLKPKNILERTFAEILEFKSWFEDKSVDLENAEHWFEVDVLGMDAEQGAENELVMLDAEIIARIRELTPLNAQLTRWIESLKTPAGNWNRYAETKGIFKAAGHPGQSCTLALVRRSFVWNGQKKSINQYVDGCDSCQRVKALTQQPFGALEPLPIPEGPWMDISYDLITELPESRSYNSILSVVEHLTKMVHFIPYKKSTNAEQLGDLMAEHVWKLHGTPKTIFSNQESIFVSQITRELDNQLGIRLQPPTAYHPRTDRQLEIANKAVEKYLCHFVSYPQDNWAPLMATAEFAYNNNNHTSIGVSLFKENYRFNPSYSGILLAEHCVPAVAERLCQLAEVQQELKHFLEAAQEALKSQLNSGVRKTPEWNSGDKVWLDGCNILTTHPSPKLEHRWLGPFPIAIRISKSAYKMTLPLSMQGVHPVFHVSVLRKHKPDKIAQQQRRTPEPVTVNGGDESEVNRILDSRRRGWTAQYLVSWRGFGPAENSWEPEANLKNSGDLLAEFNSKFPEAAARHWRTRRKKLHVHVTHHTQEPQTPDSIFLSLEQTITVTEFCWESVLPILGFNWCLELRVVFCICASLPRSNPSWKTGSHCTTTVTPPLEESDQTTPPQDYPLEIWVICEKISDNLKGLFLNFVLYLVIFCELIPLMRLMLFGLFYVLIISNLGSE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.4
2	0.41
3	0.38
4	0.38
5	0.37
6	0.32
7	0.24
8	0.24
9	0.31
10	0.32
11	0.34
12	0.36
13	0.34
14	0.42
15	0.49
16	0.56
17	0.53
18	0.58
19	0.58
20	0.63
21	0.63
22	0.62
23	0.63
24	0.62
25	0.66
26	0.58
27	0.65
28	0.62
29	0.68
30	0.65
31	0.66
32	0.64
33	0.6
34	0.63
35	0.55
36	0.5
37	0.41
38	0.37
39	0.28
40	0.22
41	0.17
42	0.11
43	0.11
44	0.1
45	0.1
46	0.09
47	0.1
48	0.11
49	0.16
50	0.2
51	0.26
52	0.3
53	0.32
54	0.34
55	0.37
56	0.37
57	0.37
58	0.42
59	0.39
60	0.36
61	0.38
62	0.44
63	0.44
64	0.45
65	0.42
66	0.36
67	0.39
68	0.39
69	0.36
70	0.32
71	0.35
72	0.38
73	0.39
74	0.43
75	0.42
76	0.41
77	0.45
78	0.48
79	0.51
80	0.54
81	0.55
82	0.51
83	0.48
84	0.53
85	0.53
86	0.49
87	0.45
88	0.43
89	0.4
90	0.44
91	0.48
92	0.42
93	0.38
94	0.37
95	0.37
96	0.32
97	0.31
98	0.31
99	0.26
100	0.27
101	0.26
102	0.24
103	0.21
104	0.22
105	0.23
106	0.19
107	0.17
108	0.17
109	0.16
110	0.16
111	0.17
112	0.16
113	0.17
114	0.16
115	0.19
116	0.18
117	0.19
118	0.19
119	0.17
120	0.16
121	0.15
122	0.14
123	0.1
124	0.1
125	0.08
126	0.09
127	0.09
128	0.08
129	0.08
130	0.09
131	0.09
132	0.13
133	0.16
134	0.18
135	0.2
136	0.24
137	0.25
138	0.29
139	0.29
140	0.26
141	0.26
142	0.27
143	0.34
144	0.35
145	0.35
146	0.32
147	0.35
148	0.34
149	0.38
150	0.41
151	0.39
152	0.43
153	0.52
154	0.6
155	0.62
156	0.68
157	0.69
158	0.66
159	0.61
160	0.59
161	0.53
162	0.44
163	0.4
164	0.34
165	0.29
166	0.25
167	0.22
168	0.15
169	0.11
170	0.1
171	0.08
172	0.08
173	0.12
174	0.11
175	0.11
176	0.12
177	0.12
178	0.13
179	0.14
180	0.17
181	0.14
182	0.17
183	0.18
184	0.17
185	0.17
186	0.17
187	0.17
188	0.14
189	0.12
190	0.09
191	0.08
192	0.08
193	0.07
194	0.07
195	0.08
196	0.11
197	0.11
198	0.15
199	0.21
200	0.25
201	0.29
202	0.34
203	0.39
204	0.46
205	0.55
206	0.58
207	0.54
208	0.55
209	0.52
210	0.46
211	0.41
212	0.38
213	0.3
214	0.24
215	0.26
216	0.24
217	0.28
218	0.33
219	0.37
220	0.41
221	0.44
222	0.47
223	0.47
224	0.49
225	0.5
226	0.47
227	0.48
228	0.4
229	0.44
230	0.42
231	0.39
232	0.39
233	0.37
234	0.4
235	0.4
236	0.42
237	0.36
238	0.35
239	0.34
240	0.34
241	0.33
242	0.35
243	0.34
244	0.3
245	0.28
246	0.28
247	0.26
248	0.23
249	0.2
250	0.13
251	0.09
252	0.08
253	0.07
254	0.06
255	0.07
256	0.08
257	0.08
258	0.09
259	0.1
260	0.11
261	0.15
262	0.2
263	0.24
264	0.28
265	0.32
266	0.34
267	0.35
268	0.36
269	0.33
270	0.29
271	0.25
272	0.22
273	0.22
274	0.23
275	0.21
276	0.18
277	0.18
278	0.17
279	0.17
280	0.15
281	0.1
282	0.1
283	0.12
284	0.13
285	0.14
286	0.15
287	0.17
288	0.17
289	0.17
290	0.2
291	0.19
292	0.18
293	0.17
294	0.18
295	0.15
296	0.15
297	0.15
298	0.11
299	0.13
300	0.13
301	0.16
302	0.17
303	0.24
304	0.25
305	0.25
306	0.26
307	0.23
308	0.22
309	0.2
310	0.17
311	0.1
312	0.1
313	0.11
314	0.08
315	0.07
316	0.08
317	0.07
318	0.07
319	0.07
320	0.06
321	0.05
322	0.06
323	0.07
324	0.06
325	0.07
326	0.07
327	0.07
328	0.08
329	0.09
330	0.08
331	0.08
332	0.1
333	0.11
334	0.14
335	0.17
336	0.18
337	0.18
338	0.18
339	0.18
340	0.16
341	0.16
342	0.13
343	0.1
344	0.09
345	0.07
346	0.07
347	0.07
348	0.09
349	0.11
350	0.1
351	0.12
352	0.14
353	0.19
354	0.23
355	0.3
356	0.31
357	0.36
358	0.38
359	0.4
360	0.39
361	0.41
362	0.4
363	0.35
364	0.38
365	0.31
366	0.33
367	0.3
368	0.28
369	0.22
370	0.2
371	0.17
372	0.11
373	0.1
374	0.07
375	0.1
376	0.1
377	0.11
378	0.11
379	0.09
380	0.12
381	0.15
382	0.22
383	0.26
384	0.28
385	0.34
386	0.34
387	0.34
388	0.33
389	0.37
390	0.33
391	0.32
392	0.36
393	0.3
394	0.34
395	0.35
396	0.33
397	0.31
398	0.29
399	0.25
400	0.24
401	0.24
402	0.21
403	0.2
404	0.2
405	0.17
406	0.17
407	0.16
408	0.11
409	0.12
410	0.13
411	0.13
412	0.14
413	0.14
414	0.13
415	0.17
416	0.23
417	0.2
418	0.2
419	0.22
420	0.25
421	0.27
422	0.3
423	0.27
424	0.25
425	0.28
426	0.3
427	0.34
428	0.38
429	0.38
430	0.44
431	0.43
432	0.39
433	0.36
434	0.37
435	0.38
436	0.4
437	0.44
438	0.38
439	0.42
440	0.47
441	0.48
442	0.44
443	0.37
444	0.35
445	0.3
446	0.28
447	0.27
448	0.22
449	0.21
450	0.21
451	0.21
452	0.15
453	0.14
454	0.17
455	0.13
456	0.14
457	0.13
458	0.13
459	0.13
460	0.2
461	0.22
462	0.24
463	0.24
464	0.23
465	0.23
466	0.24
467	0.23
468	0.17
469	0.19
470	0.14
471	0.14
472	0.15
473	0.15
474	0.14
475	0.14
476	0.13
477	0.08
478	0.08
479	0.07
480	0.05
481	0.04
482	0.04
483	0.04
484	0.04
485	0.04
486	0.04
487	0.05
488	0.05
489	0.07
490	0.08
491	0.08
492	0.08
493	0.09
494	0.1
495	0.1
496	0.12
497	0.1
498	0.09
499	0.09
500	0.09
501	0.08
502	0.08
503	0.07
504	0.05
505	0.08
506	0.08
507	0.1
508	0.13
509	0.13
510	0.16
511	0.27
512	0.32
513	0.35
514	0.35
515	0.34
516	0.31
517	0.3
518	0.27
519	0.18
520	0.15
521	0.1
522	0.11
523	0.13
524	0.14
525	0.14
526	0.14
527	0.13
528	0.11
529	0.1
530	0.11
531	0.09
532	0.08
533	0.1
534	0.1
535	0.11
536	0.16
537	0.18
538	0.2
539	0.27
540	0.34
541	0.39
542	0.48
543	0.49
544	0.47
545	0.46
546	0.48
547	0.44
548	0.43
549	0.41
550	0.34
551	0.38
552	0.37
553	0.36
554	0.31
555	0.29
556	0.29
557	0.28
558	0.27
559	0.28
560	0.33
561	0.37
562	0.36
563	0.37
564	0.32
565	0.32
566	0.35
567	0.29
568	0.26
569	0.25
570	0.28
571	0.26
572	0.26
573	0.21
574	0.18
575	0.19
576	0.17
577	0.14
578	0.1
579	0.11
580	0.11
581	0.11
582	0.1
583	0.1
584	0.09
585	0.12
586	0.13
587	0.11
588	0.11
589	0.11
590	0.11
591	0.12
592	0.11
593	0.08
594	0.07
595	0.07
596	0.06
597	0.06
598	0.05
599	0.04
600	0.03
601	0.03
602	0.03
603	0.03
604	0.03
605	0.03
606	0.03
607	0.02
608	0.03
609	0.03
610	0.03
611	0.03
612	0.03
613	0.03
614	0.03
615	0.03
616	0.02
617	0.02
618	0.02
619	0.03
620	0.03
621	0.03
622	0.03
623	0.03
624	0.04
625	0.06
626	0.07
627	0.08
628	0.1
629	0.13
630	0.14
631	0.15
632	0.14
633	0.16
634	0.18
635	0.18
636	0.16
637	0.14
638	0.13
639	0.14
640	0.17
641	0.14
642	0.13
643	0.11
644	0.18
645	0.23
646	0.25
647	0.25
648	0.26
649	0.26
650	0.26
651	0.28
652	0.22
653	0.18
654	0.18
655	0.17
656	0.15
657	0.13
658	0.13
659	0.17
660	0.2
661	0.21
662	0.2
663	0.2
664	0.2
665	0.21
666	0.21
667	0.15
668	0.11
669	0.11
670	0.12
671	0.13
672	0.13
673	0.12
674	0.13
675	0.15
676	0.15
677	0.18
678	0.26
679	0.32
680	0.34
681	0.38
682	0.42
683	0.41
684	0.48
685	0.49
686	0.4
687	0.35
688	0.34
689	0.32
690	0.3
691	0.29
692	0.23
693	0.2
694	0.2
695	0.18
696	0.18
697	0.16
698	0.13
699	0.15
700	0.23
701	0.29
702	0.34
703	0.35
704	0.33
705	0.33
706	0.33
707	0.32
708	0.24
709	0.16
710	0.1
711	0.09
712	0.09
713	0.09
714	0.08
715	0.08
716	0.08
717	0.09
718	0.09
719	0.09
720	0.09
721	0.09
722	0.09
723	0.09
724	0.08
725	0.07
726	0.07
727	0.06
728	0.05
729	0.05
730	0.07
731	0.07
732	0.08
733	0.09
734	0.1
735	0.12
736	0.13
737	0.13
738	0.12
739	0.12
740	0.11
741	0.11
742	0.11
743	0.1
744	0.1
745	0.1
746	0.09
747	0.08
748	0.08
749	0.09
750	0.09
751	0.12
752	0.12
753	0.15
754	0.22
755	0.29
756	0.32
757	0.31
758	0.33
759	0.32
760	0.39
761	0.4
762	0.34
763	0.27
764	0.25
765	0.24
766	0.22
767	0.18
768	0.1
769	0.07
770	0.06
771	0.05
772	0.04
773	0.04
774	0.04
775	0.05
776	0.11
777	0.14
778	0.17
779	0.19
780	0.24
781	0.29
782	0.31
783	0.33
784	0.29
785	0.34
786	0.32
787	0.34
788	0.3
789	0.26
790	0.24
791	0.23
792	0.2
793	0.12
794	0.14
795	0.11
796	0.11
797	0.11
798	0.12
799	0.13
800	0.14
801	0.14
802	0.13
803	0.12
804	0.11
805	0.12
806	0.11
807	0.1
808	0.1
809	0.11
810	0.18
811	0.25
812	0.27
813	0.28
814	0.33
815	0.36
816	0.41
817	0.43
818	0.37
819	0.32
820	0.38
821	0.38
822	0.36
823	0.37
824	0.33
825	0.3
826	0.29
827	0.27
828	0.2
829	0.18
830	0.19
831	0.22
832	0.2
833	0.21
834	0.21
835	0.22
836	0.31
837	0.33
838	0.3
839	0.27
840	0.28
841	0.27
842	0.27
843	0.25
844	0.16
845	0.12
846	0.13
847	0.09
848	0.08
849	0.09
850	0.09
851	0.08
852	0.08
853	0.11
854	0.1
855	0.12
856	0.12
857	0.13
858	0.12
859	0.12
860	0.13
861	0.11
862	0.13
863	0.13
864	0.13
865	0.14
866	0.16
867	0.17
868	0.19
869	0.19
870	0.21
871	0.26
872	0.26
873	0.26
874	0.3
875	0.31
876	0.3
877	0.29
878	0.27
879	0.19
880	0.18
881	0.18
882	0.14
883	0.13
884	0.1
885	0.1
886	0.08
887	0.07
888	0.07
889	0.12
890	0.1
891	0.1
892	0.11
893	0.12
894	0.12
895	0.12
896	0.12
897	0.1
898	0.11
899	0.13
900	0.14
901	0.15
902	0.16
903	0.19
904	0.19
905	0.16
906	0.14
907	0.12
908	0.15
909	0.13
910	0.14
911	0.13
912	0.13
913	0.13
914	0.15
915	0.16
916	0.12
917	0.12
918	0.15
919	0.18
920	0.2
921	0.23
922	0.28
923	0.27
924	0.3
925	0.33
926	0.33
927	0.37
928	0.39
929	0.39
930	0.36
931	0.36
932	0.38
933	0.34
934	0.3
935	0.24
936	0.22
937	0.19
938	0.17
939	0.16
940	0.13
941	0.13
942	0.13
943	0.14
944	0.15
945	0.18
946	0.21
947	0.22
948	0.23
949	0.31
950	0.4
951	0.44
952	0.46
953	0.45
954	0.47
955	0.46
956	0.47
957	0.41
958	0.33
959	0.27
960	0.3
961	0.28
962	0.22
963	0.24
964	0.24
965	0.26
966	0.28
967	0.29
968	0.25
969	0.26
970	0.26
971	0.26
972	0.25
973	0.28
974	0.25
975	0.25
976	0.24
977	0.23
978	0.22
979	0.26
980	0.24
981	0.18
982	0.18
983	0.17
984	0.15
985	0.16
986	0.19
987	0.15
988	0.23
989	0.32
990	0.38
991	0.42
992	0.47
993	0.52
994	0.55
995	0.61
996	0.64
997	0.67
998	0.71
999	0.75
1000	0.81
1001	0.8
1002	0.79
1003	0.77
1004	0.71
1005	0.61
1006	0.57
1007	0.53
1008	0.46
1009	0.47
1010	0.42
1011	0.37
1012	0.33
1013	0.31
1014	0.24
1015	0.2
1016	0.18
1017	0.13
1018	0.13
1019	0.11
1020	0.11
1021	0.12
1022	0.15
1023	0.21
1024	0.26
1025	0.29
1026	0.34
1027	0.38
1028	0.39
1029	0.42
1030	0.48
1031	0.46
1032	0.44
1033	0.42
1034	0.4
1035	0.4
1036	0.4
1037	0.35
1038	0.26
1039	0.24
1040	0.2
1041	0.17
1042	0.18
1043	0.18
1044	0.24
1045	0.24
1046	0.27
1047	0.25
1048	0.26
1049	0.26
1050	0.27
1051	0.28
1052	0.24
1053	0.27
1054	0.24
1055	0.23
1056	0.23
1057	0.23
1058	0.18
1059	0.14
1060	0.14
1061	0.13
1062	0.16
1063	0.15
1064	0.16
1065	0.17
1066	0.17
1067	0.16
1068	0.14
1069	0.2
1070	0.18
1071	0.26
1072	0.36
1073	0.41
1074	0.49
1075	0.58
1076	0.68
1077	0.7
1078	0.79
1079	0.82
1080	0.81
1081	0.85
1082	0.87
1083	0.9
1084	0.89
1085	0.87
1086	0.85
1087	0.83
1088	0.78
1089	0.72
1090	0.66
1091	0.56
1092	0.5
1093	0.48
1094	0.41
1095	0.35
1096	0.29
1097	0.27
1098	0.25
1099	0.24
1100	0.21
1101	0.16
1102	0.17
1103	0.15
1104	0.14
1105	0.12
1106	0.11
1107	0.1
1108	0.11
1109	0.1
1110	0.07
1111	0.08
1112	0.08
1113	0.08
1114	0.09
1115	0.09
1116	0.09
1117	0.12
1118	0.14
1119	0.12
1120	0.13
1121	0.13
1122	0.13
1123	0.14
1124	0.13
1125	0.14
1126	0.12
1127	0.13
1128	0.13
1129	0.14
1130	0.14
1131	0.18
1132	0.19
1133	0.15
1134	0.15
1135	0.16
1136	0.15
1137	0.2
1138	0.22
1139	0.23
1140	0.25
1141	0.29
1142	0.34
1143	0.4
1144	0.44
1145	0.43
1146	0.43
1147	0.4
1148	0.44
1149	0.5
1150	0.52
1151	0.48
1152	0.46
1153	0.44
1154	0.45
1155	0.46
1156	0.46
1157	0.39
1158	0.34
1159	0.31
1160	0.34
1161	0.32
1162	0.28
1163	0.28
1164	0.27
1165	0.27
1166	0.28
1167	0.29
1168	0.27
1169	0.25
1170	0.28
1171	0.24
1172	0.21
1173	0.2
1174	0.23
1175	0.23
1176	0.21
1177	0.23
1178	0.23
1179	0.23
1180	0.21
1181	0.19
1182	0.16
1183	0.19
1184	0.24
1185	0.24
1186	0.24
1187	0.25
1188	0.27
1189	0.27
1190	0.27
1191	0.23
1192	0.18
1193	0.18
1194	0.14
1195	0.12
1196	0.11
1197	0.1
1198	0.1
1199	0.08
1200	0.09
1201	0.07
1202	0.07
1203	0.08
1204	0.08
1205	0.09
1206	0.1
1207	0.09
1208	0.09
1209	0.1
1210	0.1
1211	0.09
1212	0.09
1213	0.09
1214	0.08
1215	0.09
1216	0.08
1217	0.07
1218	0.09
1219	0.09
1220	0.08
1221	0.08

A0A0C4EM20

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer