Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4R505

Protein Details
Accession C4R505    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
4-26SEDTERCTKKPRLDDKVVFRMANHydrophilic
37-58NTDPKADKKKLSSNTDKNNNVTHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto 4.5, cyto_pero 3.5, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036047  F-box-like_dom_sf  
IPR001810  F-box_dom  
IPR020472  G-protein_beta_WD-40_rep  
IPR011047  Quinoprotein_ADH-like_supfam  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
Gene Ontology GO:0043224  C:nuclear SCF ubiquitin ligase complex  
GO:0042802  F:identical protein binding  
GO:0043130  F:ubiquitin binding  
GO:1990756  F:ubiquitin ligase-substrate adaptor activity  
GO:0000209  P:protein polyubiquitination  
GO:0000083  P:regulation of transcription involved in G1/S transition of mitotic cell cycle  
GO:0046685  P:response to arsenic-containing substance  
GO:0046686  P:response to cadmium ion  
GO:0031146  P:SCF-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process  
KEGG ppa:PAS_chr3_0594  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF12937  F-box-like  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50181  FBOX  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
CDD cd22147  F-box_SpPof1-like  
cd00200  WD40  
Amino Acid Sequences MSVSEDTERCTKKPRLDDKVVFRMANQLEGKAGLEQNTDPKADKKKLSSNTDKNNNVTNFLTHHVVDQSMIPRDNFHKYCYRHNPDVTCNKNTDQCKMDEIQDAMEKIPPRDREAITHVWSIFSAAPYQHRSLILRGLLSQCCFPQLSMISEEVKSLIRLDFISTLPTELSLKILCYLDCASLCNAAQVSRKWKRLADDDRVWHYMCEQHIDRKCPQCGWGLPLLAMKRARHIPDEVSKEIPHTTAIDVKDNNTNKASKNTNTNTTVSKEVAPAARKTRPWKVVYSERYKVERNWRKGVYKVRTIEGHTDGVTCMQLGYKILMTGSYDSTIKIWNLETGALIRSLGGHTRGVRTLAFDDQKLITGGLDGTIKVFNYHTGECISTYHGHNNHVVSLDFIGKTIVSGSADQTVKVWHVETRTCYTLRGHTDWVNSVKIHPKSMTCFSASDDTTIRMWDLKTNSCIKVFGGEENKGHVGQVQCVIPLNIKYEIVEDLEKDNFADETREAQDSATPETEEEKNYPTHILTSSLDTTIKLWNVKTGKCVRTQFGHIEGVWSIAADTFRIVSGAHDRTIKVWDLQSGKCMHTFGSNDSSVSCVSLGDTRFASGLENGKIKVYYFD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.66
2 0.67
3 0.75
4 0.81
5 0.82
6 0.85
7 0.81
8 0.71
9 0.6
10 0.6
11 0.5
12 0.49
13 0.4
14 0.31
15 0.26
16 0.27
17 0.27
18 0.22
19 0.23
20 0.17
21 0.18
22 0.19
23 0.24
24 0.26
25 0.27
26 0.25
27 0.31
28 0.38
29 0.44
30 0.49
31 0.5
32 0.57
33 0.65
34 0.73
35 0.77
36 0.77
37 0.8
38 0.84
39 0.81
40 0.75
41 0.75
42 0.66
43 0.59
44 0.5
45 0.42
46 0.34
47 0.32
48 0.32
49 0.23
50 0.24
51 0.21
52 0.2
53 0.18
54 0.19
55 0.21
56 0.23
57 0.25
58 0.23
59 0.25
60 0.29
61 0.38
62 0.35
63 0.35
64 0.39
65 0.41
66 0.52
67 0.59
68 0.64
69 0.62
70 0.68
71 0.69
72 0.69
73 0.76
74 0.72
75 0.65
76 0.6
77 0.55
78 0.56
79 0.53
80 0.5
81 0.43
82 0.39
83 0.39
84 0.37
85 0.37
86 0.34
87 0.33
88 0.29
89 0.29
90 0.28
91 0.24
92 0.25
93 0.24
94 0.21
95 0.27
96 0.27
97 0.29
98 0.35
99 0.35
100 0.36
101 0.41
102 0.45
103 0.42
104 0.44
105 0.39
106 0.32
107 0.31
108 0.28
109 0.23
110 0.17
111 0.15
112 0.12
113 0.18
114 0.21
115 0.23
116 0.24
117 0.25
118 0.26
119 0.26
120 0.3
121 0.26
122 0.23
123 0.23
124 0.25
125 0.25
126 0.24
127 0.24
128 0.19
129 0.19
130 0.19
131 0.16
132 0.16
133 0.16
134 0.18
135 0.18
136 0.2
137 0.2
138 0.19
139 0.2
140 0.16
141 0.15
142 0.13
143 0.12
144 0.1
145 0.09
146 0.1
147 0.11
148 0.12
149 0.12
150 0.14
151 0.12
152 0.13
153 0.11
154 0.12
155 0.11
156 0.09
157 0.11
158 0.09
159 0.09
160 0.11
161 0.12
162 0.11
163 0.12
164 0.13
165 0.14
166 0.13
167 0.14
168 0.13
169 0.14
170 0.14
171 0.13
172 0.12
173 0.13
174 0.16
175 0.19
176 0.28
177 0.33
178 0.39
179 0.4
180 0.42
181 0.44
182 0.51
183 0.55
184 0.54
185 0.54
186 0.54
187 0.56
188 0.56
189 0.52
190 0.42
191 0.35
192 0.3
193 0.23
194 0.23
195 0.2
196 0.26
197 0.3
198 0.35
199 0.41
200 0.44
201 0.46
202 0.41
203 0.41
204 0.38
205 0.35
206 0.34
207 0.32
208 0.25
209 0.24
210 0.26
211 0.24
212 0.23
213 0.24
214 0.2
215 0.21
216 0.25
217 0.26
218 0.26
219 0.27
220 0.28
221 0.32
222 0.38
223 0.36
224 0.33
225 0.32
226 0.3
227 0.29
228 0.24
229 0.17
230 0.13
231 0.12
232 0.14
233 0.15
234 0.18
235 0.17
236 0.19
237 0.25
238 0.25
239 0.27
240 0.24
241 0.26
242 0.23
243 0.29
244 0.31
245 0.26
246 0.34
247 0.35
248 0.39
249 0.4
250 0.4
251 0.37
252 0.35
253 0.34
254 0.26
255 0.24
256 0.18
257 0.17
258 0.19
259 0.19
260 0.2
261 0.23
262 0.26
263 0.29
264 0.33
265 0.4
266 0.43
267 0.43
268 0.44
269 0.45
270 0.5
271 0.54
272 0.57
273 0.53
274 0.5
275 0.51
276 0.49
277 0.48
278 0.49
279 0.51
280 0.5
281 0.52
282 0.53
283 0.52
284 0.56
285 0.6
286 0.55
287 0.53
288 0.49
289 0.44
290 0.42
291 0.41
292 0.39
293 0.32
294 0.27
295 0.2
296 0.18
297 0.15
298 0.14
299 0.12
300 0.08
301 0.05
302 0.04
303 0.04
304 0.04
305 0.05
306 0.05
307 0.05
308 0.05
309 0.05
310 0.06
311 0.07
312 0.07
313 0.07
314 0.07
315 0.07
316 0.08
317 0.09
318 0.09
319 0.08
320 0.08
321 0.08
322 0.08
323 0.08
324 0.08
325 0.07
326 0.08
327 0.07
328 0.06
329 0.05
330 0.05
331 0.06
332 0.07
333 0.07
334 0.09
335 0.1
336 0.12
337 0.12
338 0.13
339 0.13
340 0.13
341 0.14
342 0.17
343 0.17
344 0.16
345 0.17
346 0.16
347 0.17
348 0.15
349 0.13
350 0.08
351 0.07
352 0.07
353 0.06
354 0.06
355 0.05
356 0.06
357 0.06
358 0.07
359 0.07
360 0.07
361 0.08
362 0.11
363 0.11
364 0.12
365 0.12
366 0.13
367 0.12
368 0.13
369 0.14
370 0.13
371 0.15
372 0.2
373 0.2
374 0.22
375 0.24
376 0.24
377 0.22
378 0.2
379 0.19
380 0.13
381 0.13
382 0.13
383 0.1
384 0.1
385 0.09
386 0.08
387 0.08
388 0.07
389 0.07
390 0.06
391 0.06
392 0.07
393 0.13
394 0.14
395 0.14
396 0.14
397 0.14
398 0.14
399 0.14
400 0.14
401 0.09
402 0.12
403 0.15
404 0.19
405 0.23
406 0.25
407 0.25
408 0.25
409 0.26
410 0.29
411 0.32
412 0.31
413 0.3
414 0.29
415 0.31
416 0.34
417 0.35
418 0.3
419 0.25
420 0.25
421 0.3
422 0.28
423 0.29
424 0.27
425 0.27
426 0.3
427 0.34
428 0.34
429 0.28
430 0.27
431 0.26
432 0.3
433 0.28
434 0.25
435 0.21
436 0.2
437 0.19
438 0.18
439 0.17
440 0.13
441 0.13
442 0.16
443 0.19
444 0.21
445 0.25
446 0.3
447 0.32
448 0.31
449 0.31
450 0.26
451 0.27
452 0.24
453 0.25
454 0.25
455 0.26
456 0.26
457 0.29
458 0.3
459 0.25
460 0.24
461 0.21
462 0.17
463 0.16
464 0.19
465 0.16
466 0.16
467 0.16
468 0.17
469 0.16
470 0.16
471 0.17
472 0.15
473 0.15
474 0.14
475 0.15
476 0.16
477 0.15
478 0.15
479 0.13
480 0.14
481 0.15
482 0.15
483 0.13
484 0.13
485 0.11
486 0.11
487 0.12
488 0.1
489 0.13
490 0.16
491 0.17
492 0.16
493 0.16
494 0.18
495 0.18
496 0.21
497 0.18
498 0.16
499 0.15
500 0.19
501 0.21
502 0.2
503 0.21
504 0.2
505 0.19
506 0.21
507 0.22
508 0.19
509 0.19
510 0.18
511 0.19
512 0.18
513 0.21
514 0.22
515 0.22
516 0.21
517 0.19
518 0.2
519 0.21
520 0.23
521 0.2
522 0.19
523 0.25
524 0.3
525 0.31
526 0.39
527 0.44
528 0.45
529 0.5
530 0.55
531 0.51
532 0.52
533 0.56
534 0.52
535 0.48
536 0.47
537 0.39
538 0.36
539 0.32
540 0.27
541 0.22
542 0.17
543 0.12
544 0.1
545 0.1
546 0.08
547 0.08
548 0.08
549 0.08
550 0.08
551 0.08
552 0.09
553 0.17
554 0.2
555 0.22
556 0.24
557 0.24
558 0.26
559 0.3
560 0.29
561 0.25
562 0.24
563 0.28
564 0.31
565 0.31
566 0.36
567 0.35
568 0.35
569 0.33
570 0.32
571 0.26
572 0.27
573 0.29
574 0.28
575 0.31
576 0.3
577 0.28
578 0.28
579 0.29
580 0.23
581 0.21
582 0.16
583 0.09
584 0.1
585 0.15
586 0.16
587 0.17
588 0.17
589 0.17
590 0.17
591 0.17
592 0.18
593 0.17
594 0.21
595 0.23
596 0.26
597 0.26
598 0.28
599 0.28