Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1V6TR98

Protein Details
Accession A0A1V6TR98    Localization Confidence Low Confidence Score 9.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
105-141LRLRGGGKKRKKKVYTTPKKIKHKHKKTKLAVLKYYKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
107-133LRGGGKKRKKKVYTTPKKIKHKHKKTK
Subcellular Location(s) mito 12, mito_nucl 11.332, cyto_mito 9.332, nucl 9, cyto_nucl 8.666, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002906  Ribosomal_S27a  
IPR011332  Ribosomal_zn-bd  
IPR038582  S27a-like_sf  
IPR000626  Ubiquitin-like_dom  
IPR029071  Ubiquitin-like_domsf  
IPR019954  Ubiquitin_CS  
IPR019956  Ubiquitin_dom  
Gene Ontology GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0005840  C:ribosome  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0006412  P:translation  
Pfam View protein in Pfam  
PF01599  Ribosomal_S27  
PF00240  ubiquitin  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00299  UBIQUITIN_1  
PS50053  UBIQUITIN_2  
CDD cd01803  Ubl_ubiquitin  
Amino Acid Sequences MSRHSLWIAATCAIYEIDLLIPSSLASHCTAFIKMQIFVKTLTGKTITLEVESSDTIDNVKSKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGGKKRKKKVYTTPKKIKHKHKKTKLAVLKYYKVDGDGKIERLRRECPAPECGAGVFMAAMHNRQYCGKCHLTYVFDESK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.09
3 0.08
4 0.07
5 0.07
6 0.08
7 0.07
8 0.07
9 0.06
10 0.08
11 0.07
12 0.08
13 0.09
14 0.1
15 0.11
16 0.13
17 0.14
18 0.13
19 0.17
20 0.17
21 0.18
22 0.22
23 0.23
24 0.22
25 0.22
26 0.25
27 0.24
28 0.22
29 0.22
30 0.2
31 0.18
32 0.17
33 0.2
34 0.17
35 0.14
36 0.14
37 0.12
38 0.12
39 0.12
40 0.12
41 0.09
42 0.09
43 0.08
44 0.09
45 0.1
46 0.09
47 0.11
48 0.13
49 0.16
50 0.19
51 0.22
52 0.26
53 0.27
54 0.35
55 0.39
56 0.38
57 0.36
58 0.37
59 0.36
60 0.34
61 0.33
62 0.24
63 0.21
64 0.21
65 0.2
66 0.18
67 0.19
68 0.15
69 0.18
70 0.18
71 0.16
72 0.14
73 0.14
74 0.13
75 0.11
76 0.12
77 0.09
78 0.15
79 0.16
80 0.17
81 0.19
82 0.18
83 0.17
84 0.17
85 0.18
86 0.14
87 0.13
88 0.11
89 0.13
90 0.15
91 0.15
92 0.15
93 0.14
94 0.13
95 0.15
96 0.22
97 0.28
98 0.37
99 0.46
100 0.54
101 0.64
102 0.68
103 0.73
104 0.78
105 0.8
106 0.82
107 0.83
108 0.85
109 0.85
110 0.9
111 0.9
112 0.91
113 0.91
114 0.91
115 0.91
116 0.91
117 0.92
118 0.89
119 0.91
120 0.89
121 0.86
122 0.83
123 0.79
124 0.74
125 0.66
126 0.6
127 0.49
128 0.42
129 0.36
130 0.28
131 0.28
132 0.25
133 0.27
134 0.31
135 0.35
136 0.36
137 0.37
138 0.4
139 0.37
140 0.4
141 0.42
142 0.4
143 0.43
144 0.42
145 0.39
146 0.37
147 0.32
148 0.27
149 0.21
150 0.17
151 0.1
152 0.07
153 0.09
154 0.08
155 0.09
156 0.12
157 0.14
158 0.15
159 0.21
160 0.23
161 0.25
162 0.32
163 0.37
164 0.34
165 0.39
166 0.42
167 0.39
168 0.4