Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1G4JC41

Protein Details
Accession A0A1G4JC41    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
10-38TYGSGKDGKAKKSKKSKKAEKDYQRLMLDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
15-29KDGKAKKSKKSKKAE
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 10, mito 7, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018609  Bud13  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
Pfam View protein in Pfam  
PF09736  Bud13  
Amino Acid Sequences MSLNDFLAQTYGSGKDGKAKKSKKSKKAEKDYQRLMLDVVDTSPKFEVDSSEDGVYRGQKSNKTAKTSKTGAWKNLTTNEIAFELPGYGAQDVLPASNSKFSGEVMSSGARAGLQTAEQVALQMREKEALDKLLAEQSQRNNEAVFRDHRGRKIENYAEMADLQENFTRRRQLDEEAQLKALNVGEIQKLGLTDVRLRNGTMSESSLKFEDPVNTFKPISNNAASSPVSLTGRKLYNKAFPENRFGITPGHRWDGVDRSTGFEKAWFAKQTEINDEKSMLHNLQET
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.22
3 0.28
4 0.36
5 0.44
6 0.5
7 0.59
8 0.69
9 0.79
10 0.8
11 0.85
12 0.88
13 0.89
14 0.93
15 0.94
16 0.93
17 0.93
18 0.91
19 0.88
20 0.78
21 0.67
22 0.56
23 0.46
24 0.36
25 0.26
26 0.2
27 0.17
28 0.16
29 0.17
30 0.17
31 0.15
32 0.15
33 0.15
34 0.16
35 0.15
36 0.19
37 0.2
38 0.21
39 0.21
40 0.21
41 0.22
42 0.23
43 0.21
44 0.23
45 0.25
46 0.28
47 0.34
48 0.44
49 0.48
50 0.53
51 0.55
52 0.55
53 0.58
54 0.57
55 0.56
56 0.56
57 0.56
58 0.54
59 0.55
60 0.52
61 0.48
62 0.49
63 0.46
64 0.37
65 0.31
66 0.26
67 0.21
68 0.18
69 0.14
70 0.1
71 0.09
72 0.07
73 0.07
74 0.07
75 0.05
76 0.05
77 0.05
78 0.06
79 0.06
80 0.06
81 0.07
82 0.06
83 0.07
84 0.1
85 0.1
86 0.1
87 0.1
88 0.1
89 0.11
90 0.11
91 0.11
92 0.1
93 0.1
94 0.1
95 0.09
96 0.09
97 0.07
98 0.06
99 0.06
100 0.05
101 0.04
102 0.04
103 0.05
104 0.05
105 0.05
106 0.06
107 0.06
108 0.07
109 0.08
110 0.08
111 0.08
112 0.09
113 0.1
114 0.11
115 0.11
116 0.11
117 0.1
118 0.1
119 0.1
120 0.12
121 0.12
122 0.11
123 0.14
124 0.15
125 0.19
126 0.2
127 0.2
128 0.17
129 0.17
130 0.18
131 0.18
132 0.17
133 0.17
134 0.23
135 0.26
136 0.29
137 0.33
138 0.33
139 0.34
140 0.39
141 0.38
142 0.33
143 0.33
144 0.3
145 0.26
146 0.24
147 0.21
148 0.14
149 0.12
150 0.1
151 0.09
152 0.1
153 0.12
154 0.14
155 0.19
156 0.18
157 0.23
158 0.24
159 0.27
160 0.33
161 0.39
162 0.4
163 0.36
164 0.36
165 0.31
166 0.29
167 0.26
168 0.18
169 0.1
170 0.07
171 0.08
172 0.07
173 0.07
174 0.07
175 0.07
176 0.07
177 0.07
178 0.08
179 0.08
180 0.14
181 0.16
182 0.19
183 0.19
184 0.2
185 0.2
186 0.19
187 0.2
188 0.15
189 0.15
190 0.16
191 0.16
192 0.18
193 0.18
194 0.17
195 0.16
196 0.17
197 0.19
198 0.18
199 0.22
200 0.23
201 0.26
202 0.26
203 0.27
204 0.29
205 0.28
206 0.3
207 0.28
208 0.27
209 0.24
210 0.28
211 0.26
212 0.24
213 0.21
214 0.19
215 0.19
216 0.18
217 0.19
218 0.2
219 0.25
220 0.27
221 0.3
222 0.31
223 0.37
224 0.42
225 0.49
226 0.52
227 0.49
228 0.54
229 0.53
230 0.51
231 0.44
232 0.4
233 0.37
234 0.33
235 0.36
236 0.33
237 0.34
238 0.33
239 0.33
240 0.35
241 0.35
242 0.33
243 0.33
244 0.29
245 0.3
246 0.32
247 0.32
248 0.29
249 0.24
250 0.26
251 0.24
252 0.31
253 0.29
254 0.28
255 0.34
256 0.38
257 0.4
258 0.46
259 0.45
260 0.42
261 0.41
262 0.41
263 0.36
264 0.35
265 0.35
266 0.27