FuNGI

C4R3U9

Protein Details

Accession

C4R3U9

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
3-29	KDPFLSDGSRKRKRTNPPTSNVNRISK	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 22, cyto_nucl 14, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR001680 WD40_repeat IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
Gene Ontology	GO:0031428 C:box C/D RNP complex GO:0005730 C:nucleolus GO:0032040 C:small-subunit processome GO:0034511 F:U3 snoRNA binding GO:0000480 P:endonucleolytic cleavage in 5'-ETS of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0000447 P:endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0000472 P:endonucleolytic cleavage to generate mature 5'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)
KEGG	ppa:PAS_chr3_0207 -
Pfam	View protein in Pfam PF00400 WD40
PROSITE	View protein in PROSITE PS50082 WD_REPEATS_2 PS50294 WD_REPEATS_REGION

Amino Acid Sequences

MAKDPFLSDGSRKRKRTNPPTSNVNRISKTQNKNQTERADEDITSESETENLSSDGEVKEEQSSESEDEEDFAETAADKRRRLAKQYLENLQAEQESYEFDAQDLDNDILARRLQMDVNENKGTLYKFIADKLLVRDCKPTISRVGSKGMTCVSASYPFCYTTSKDMELSKWKIDDFNKKPQKVKYVKGGVKYRNLNKEQHLNGHCGEVLTCSASSNGKYVVTGGRDQRLIVWSTEALSPLRVWEIRNRNGVIFSTVFRKQSDQLYAACGDLKVRTYGVAQMSQLETLYGHQDFVADISALSQERCVTVGSRDRTAMLWKIPEESKLTFRGGDSEEKKNKFGNLNSKESDKLSFYAEGSLDCISMVDESHFVTGSDNGNVSFWAINKKKPIFVIRQAHGLEPRIPSGDASGEINEQAAEFQVPKRNPYWVTAIHSLPLSDVFFTGSWNGTIRVWKINSNLRSFELLGELPNANGVVTKIDSCEFDGKIRLFATLSKEHRLGRWIKTKGRNALYSAVLDLQNLKRPKNS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.69
2	0.77
3	0.82
4	0.83
5	0.83
6	0.81
7	0.86
8	0.84
9	0.86
10	0.83
11	0.8
12	0.71
13	0.65
14	0.67
15	0.66
16	0.67
17	0.67
18	0.69
19	0.69
20	0.73
21	0.77
22	0.75
23	0.71
24	0.67
25	0.63
26	0.56
27	0.48
28	0.44
29	0.38
30	0.31
31	0.26
32	0.23
33	0.16
34	0.14
35	0.14
36	0.12
37	0.11
38	0.1
39	0.09
40	0.09
41	0.12
42	0.11
43	0.12
44	0.12
45	0.12
46	0.14
47	0.14
48	0.15
49	0.13
50	0.16
51	0.16
52	0.17
53	0.17
54	0.14
55	0.15
56	0.15
57	0.14
58	0.11
59	0.09
60	0.08
61	0.08
62	0.11
63	0.19
64	0.23
65	0.23
66	0.29
67	0.38
68	0.43
69	0.49
70	0.56
71	0.56
72	0.62
73	0.7
74	0.71
75	0.68
76	0.64
77	0.57
78	0.49
79	0.4
80	0.3
81	0.22
82	0.15
83	0.1
84	0.12
85	0.12
86	0.1
87	0.1
88	0.11
89	0.11
90	0.12
91	0.13
92	0.11
93	0.1
94	0.11
95	0.11
96	0.11
97	0.11
98	0.1
99	0.09
100	0.1
101	0.11
102	0.13
103	0.21
104	0.23
105	0.29
106	0.3
107	0.29
108	0.28
109	0.29
110	0.27
111	0.2
112	0.18
113	0.15
114	0.15
115	0.17
116	0.19
117	0.17
118	0.2
119	0.23
120	0.3
121	0.28
122	0.29
123	0.32
124	0.3
125	0.35
126	0.34
127	0.32
128	0.3
129	0.35
130	0.38
131	0.37
132	0.42
133	0.38
134	0.37
135	0.36
136	0.3
137	0.25
138	0.2
139	0.18
140	0.14
141	0.18
142	0.18
143	0.18
144	0.19
145	0.19
146	0.19
147	0.2
148	0.2
149	0.2
150	0.24
151	0.24
152	0.25
153	0.25
154	0.28
155	0.34
156	0.36
157	0.32
158	0.29
159	0.28
160	0.31
161	0.35
162	0.42
163	0.39
164	0.47
165	0.54
166	0.57
167	0.63
168	0.62
169	0.67
170	0.63
171	0.63
172	0.61
173	0.62
174	0.62
175	0.64
176	0.68
177	0.62
178	0.64
179	0.66
180	0.63
181	0.62
182	0.62
183	0.58
184	0.53
185	0.57
186	0.51
187	0.52
188	0.47
189	0.4
190	0.37
191	0.34
192	0.3
193	0.22
194	0.19
195	0.12
196	0.1
197	0.08
198	0.07
199	0.07
200	0.08
201	0.08
202	0.09
203	0.09
204	0.1
205	0.09
206	0.09
207	0.09
208	0.11
209	0.12
210	0.15
211	0.17
212	0.18
213	0.18
214	0.18
215	0.19
216	0.18
217	0.17
218	0.14
219	0.13
220	0.1
221	0.11
222	0.12
223	0.12
224	0.09
225	0.09
226	0.08
227	0.08
228	0.09
229	0.09
230	0.09
231	0.17
232	0.24
233	0.29
234	0.33
235	0.33
236	0.32
237	0.32
238	0.31
239	0.26
240	0.19
241	0.15
242	0.15
243	0.16
244	0.17
245	0.17
246	0.18
247	0.18
248	0.21
249	0.23
250	0.2
251	0.18
252	0.19
253	0.19
254	0.18
255	0.16
256	0.12
257	0.09
258	0.08
259	0.09
260	0.07
261	0.06
262	0.07
263	0.07
264	0.11
265	0.11
266	0.12
267	0.11
268	0.12
269	0.12
270	0.12
271	0.11
272	0.08
273	0.07
274	0.06
275	0.08
276	0.07
277	0.07
278	0.06
279	0.07
280	0.07
281	0.07
282	0.07
283	0.04
284	0.04
285	0.04
286	0.06
287	0.06
288	0.06
289	0.06
290	0.06
291	0.06
292	0.07
293	0.07
294	0.07
295	0.1
296	0.18
297	0.2
298	0.21
299	0.21
300	0.21
301	0.21
302	0.24
303	0.22
304	0.17
305	0.17
306	0.16
307	0.19
308	0.19
309	0.2
310	0.2
311	0.2
312	0.21
313	0.21
314	0.22
315	0.19
316	0.19
317	0.2
318	0.2
319	0.26
320	0.27
321	0.34
322	0.4
323	0.42
324	0.44
325	0.42
326	0.43
327	0.4
328	0.42
329	0.44
330	0.42
331	0.47
332	0.46
333	0.47
334	0.44
335	0.4
336	0.36
337	0.27
338	0.22
339	0.18
340	0.18
341	0.16
342	0.17
343	0.16
344	0.14
345	0.13
346	0.13
347	0.1
348	0.08
349	0.08
350	0.06
351	0.06
352	0.06
353	0.05
354	0.06
355	0.06
356	0.07
357	0.07
358	0.07
359	0.07
360	0.1
361	0.1
362	0.11
363	0.11
364	0.11
365	0.11
366	0.1
367	0.11
368	0.09
369	0.09
370	0.18
371	0.19
372	0.23
373	0.31
374	0.33
375	0.35
376	0.39
377	0.45
378	0.43
379	0.51
380	0.56
381	0.49
382	0.54
383	0.53
384	0.5
385	0.47
386	0.42
387	0.36
388	0.29
389	0.28
390	0.23
391	0.22
392	0.19
393	0.18
394	0.16
395	0.13
396	0.13
397	0.12
398	0.11
399	0.11
400	0.11
401	0.09
402	0.08
403	0.07
404	0.06
405	0.06
406	0.07
407	0.11
408	0.18
409	0.2
410	0.23
411	0.24
412	0.3
413	0.31
414	0.33
415	0.35
416	0.32
417	0.38
418	0.39
419	0.38
420	0.34
421	0.33
422	0.29
423	0.23
424	0.21
425	0.15
426	0.1
427	0.1
428	0.1
429	0.1
430	0.11
431	0.12
432	0.11
433	0.11
434	0.12
435	0.13
436	0.13
437	0.17
438	0.19
439	0.25
440	0.26
441	0.29
442	0.34
443	0.41
444	0.46
445	0.47
446	0.47
447	0.42
448	0.44
449	0.41
450	0.35
451	0.29
452	0.24
453	0.2
454	0.2
455	0.18
456	0.14
457	0.14
458	0.13
459	0.1
460	0.1
461	0.09
462	0.09
463	0.1
464	0.11
465	0.12
466	0.13
467	0.14
468	0.17
469	0.22
470	0.2
471	0.22
472	0.28
473	0.27
474	0.29
475	0.28
476	0.26
477	0.22
478	0.24
479	0.28
480	0.31
481	0.34
482	0.36
483	0.4
484	0.41
485	0.43
486	0.47
487	0.47
488	0.48
489	0.54
490	0.56
491	0.62
492	0.69
493	0.76
494	0.78
495	0.79
496	0.74
497	0.68
498	0.65
499	0.58
500	0.49
501	0.42
502	0.36
503	0.29
504	0.25
505	0.27
506	0.26
507	0.31
508	0.34

C4R3U9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer