Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1G4JRM8

Protein Details
Accession A0A1G4JRM8    Localization Confidence Low Confidence Score 8.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
110-134ASTNLPTFRKPKHRNLKKTMSEFQNHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 12.5, cyto 10.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027267  AH/BAR_dom_sf  
IPR001683  PX_dom  
IPR036871  PX_dom_sf  
IPR014461  Retromer_complex_Vps17  
IPR037907  Vps17_PX  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:0030904  C:retromer complex  
GO:0032266  F:phosphatidylinositol-3-phosphate binding  
GO:0015031  P:protein transport  
GO:0042147  P:retrograde transport, endosome to Golgi  
Pfam View protein in Pfam  
PF00787  PX  
CDD cd07625  BAR_Vps17p  
cd06891  PX_Vps17p  
Amino Acid Sequences MTSAIPYDPFDDIDNNPFSEPAVESAPGTHDADEARDNEAENQPQLQKGDEERSVTAPGEDQDTTLQEQLENLVPERKNTKFTLVVKVTGLERVGSLANKKDNPAIIFDASTNLPTFRKPKHRNLKKTMSEFQNLFKYLNAALPETFVPSLPAPSTNYGIQNNEDYQKTQSAMQEWFDRICGDPLVLRCEELAFFIESDFNTYTPIGKVKSTVTGLRRKTLKQLAPPFDECLELAQFRPLVKSIHYNCHEIQLKLYRLSKLRKMLSQDENGVGQTFTEMLTDSSQIHTKLYKRFGKTLTAVGDIDSVVATLDMATLYDGLAWIVQDTYVVKEALTNRHFLMRELLQAQQNTKFRQDQARRLRVKRDVNPLKVDEAIRALKTATTAEHELTLKLQRTTANMLFEKQRWLEWYSHALTAAIREYTLRKIEYERKKLTLLERIKSDVRSADLKGGLSRLGRGASTSSTTGPSQTPQGDSWTGNSRYRHFQPGVLQTEFDNSLQEEQDSTHPTDPEEQRALDARNAAALLGTSTF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.25
3 0.24
4 0.23
5 0.21
6 0.2
7 0.19
8 0.15
9 0.15
10 0.15
11 0.14
12 0.16
13 0.18
14 0.19
15 0.19
16 0.17
17 0.15
18 0.15
19 0.18
20 0.21
21 0.19
22 0.19
23 0.19
24 0.19
25 0.23
26 0.27
27 0.28
28 0.26
29 0.29
30 0.28
31 0.31
32 0.31
33 0.27
34 0.26
35 0.28
36 0.33
37 0.31
38 0.33
39 0.31
40 0.33
41 0.33
42 0.29
43 0.25
44 0.2
45 0.18
46 0.19
47 0.17
48 0.15
49 0.15
50 0.17
51 0.18
52 0.18
53 0.17
54 0.14
55 0.14
56 0.15
57 0.18
58 0.17
59 0.16
60 0.22
61 0.22
62 0.26
63 0.31
64 0.31
65 0.32
66 0.33
67 0.37
68 0.38
69 0.41
70 0.48
71 0.45
72 0.45
73 0.41
74 0.41
75 0.36
76 0.3
77 0.26
78 0.16
79 0.13
80 0.13
81 0.14
82 0.14
83 0.16
84 0.2
85 0.25
86 0.27
87 0.29
88 0.31
89 0.33
90 0.32
91 0.32
92 0.31
93 0.25
94 0.24
95 0.23
96 0.22
97 0.18
98 0.18
99 0.15
100 0.13
101 0.12
102 0.15
103 0.21
104 0.27
105 0.38
106 0.45
107 0.55
108 0.65
109 0.76
110 0.82
111 0.86
112 0.89
113 0.87
114 0.86
115 0.84
116 0.78
117 0.73
118 0.64
119 0.59
120 0.55
121 0.47
122 0.4
123 0.32
124 0.27
125 0.22
126 0.24
127 0.2
128 0.14
129 0.13
130 0.14
131 0.14
132 0.15
133 0.14
134 0.11
135 0.12
136 0.11
137 0.12
138 0.11
139 0.13
140 0.13
141 0.15
142 0.18
143 0.18
144 0.21
145 0.21
146 0.22
147 0.22
148 0.23
149 0.23
150 0.23
151 0.22
152 0.2
153 0.2
154 0.2
155 0.2
156 0.2
157 0.2
158 0.2
159 0.21
160 0.21
161 0.23
162 0.22
163 0.22
164 0.19
165 0.18
166 0.15
167 0.15
168 0.13
169 0.09
170 0.11
171 0.12
172 0.16
173 0.15
174 0.14
175 0.13
176 0.13
177 0.13
178 0.11
179 0.11
180 0.08
181 0.07
182 0.08
183 0.09
184 0.08
185 0.11
186 0.11
187 0.09
188 0.1
189 0.1
190 0.11
191 0.11
192 0.14
193 0.11
194 0.11
195 0.13
196 0.13
197 0.16
198 0.17
199 0.21
200 0.25
201 0.32
202 0.34
203 0.38
204 0.4
205 0.38
206 0.44
207 0.47
208 0.46
209 0.46
210 0.54
211 0.54
212 0.55
213 0.55
214 0.49
215 0.41
216 0.37
217 0.28
218 0.2
219 0.16
220 0.11
221 0.1
222 0.1
223 0.1
224 0.1
225 0.11
226 0.1
227 0.1
228 0.11
229 0.19
230 0.2
231 0.28
232 0.3
233 0.33
234 0.32
235 0.39
236 0.4
237 0.32
238 0.32
239 0.3
240 0.3
241 0.3
242 0.32
243 0.28
244 0.3
245 0.34
246 0.36
247 0.37
248 0.38
249 0.37
250 0.4
251 0.44
252 0.44
253 0.42
254 0.38
255 0.32
256 0.3
257 0.27
258 0.22
259 0.15
260 0.09
261 0.07
262 0.05
263 0.04
264 0.04
265 0.04
266 0.04
267 0.05
268 0.06
269 0.07
270 0.08
271 0.09
272 0.1
273 0.1
274 0.13
275 0.16
276 0.21
277 0.29
278 0.35
279 0.36
280 0.41
281 0.42
282 0.44
283 0.41
284 0.4
285 0.34
286 0.29
287 0.27
288 0.22
289 0.2
290 0.15
291 0.13
292 0.08
293 0.06
294 0.04
295 0.03
296 0.03
297 0.02
298 0.03
299 0.02
300 0.03
301 0.03
302 0.03
303 0.03
304 0.03
305 0.03
306 0.03
307 0.03
308 0.03
309 0.03
310 0.03
311 0.03
312 0.04
313 0.04
314 0.05
315 0.07
316 0.07
317 0.07
318 0.1
319 0.13
320 0.21
321 0.21
322 0.22
323 0.21
324 0.26
325 0.27
326 0.24
327 0.26
328 0.19
329 0.21
330 0.21
331 0.24
332 0.22
333 0.23
334 0.25
335 0.27
336 0.3
337 0.29
338 0.32
339 0.31
340 0.31
341 0.41
342 0.46
343 0.5
344 0.56
345 0.64
346 0.68
347 0.69
348 0.74
349 0.72
350 0.74
351 0.71
352 0.72
353 0.71
354 0.68
355 0.69
356 0.63
357 0.56
358 0.5
359 0.42
360 0.32
361 0.27
362 0.25
363 0.19
364 0.18
365 0.16
366 0.14
367 0.14
368 0.14
369 0.11
370 0.12
371 0.14
372 0.14
373 0.17
374 0.17
375 0.16
376 0.18
377 0.22
378 0.21
379 0.19
380 0.21
381 0.19
382 0.22
383 0.28
384 0.29
385 0.3
386 0.28
387 0.3
388 0.33
389 0.33
390 0.35
391 0.29
392 0.28
393 0.24
394 0.26
395 0.26
396 0.25
397 0.31
398 0.28
399 0.28
400 0.27
401 0.24
402 0.21
403 0.2
404 0.19
405 0.12
406 0.1
407 0.1
408 0.12
409 0.17
410 0.2
411 0.19
412 0.19
413 0.26
414 0.36
415 0.45
416 0.53
417 0.54
418 0.53
419 0.55
420 0.58
421 0.56
422 0.56
423 0.53
424 0.48
425 0.46
426 0.48
427 0.49
428 0.45
429 0.42
430 0.35
431 0.31
432 0.29
433 0.28
434 0.29
435 0.27
436 0.27
437 0.25
438 0.24
439 0.23
440 0.2
441 0.2
442 0.17
443 0.16
444 0.15
445 0.15
446 0.16
447 0.15
448 0.18
449 0.18
450 0.17
451 0.19
452 0.2
453 0.21
454 0.2
455 0.2
456 0.22
457 0.23
458 0.25
459 0.23
460 0.28
461 0.29
462 0.28
463 0.3
464 0.34
465 0.36
466 0.38
467 0.41
468 0.4
469 0.46
470 0.5
471 0.55
472 0.47
473 0.48
474 0.5
475 0.55
476 0.58
477 0.5
478 0.46
479 0.38
480 0.4
481 0.37
482 0.29
483 0.22
484 0.16
485 0.18
486 0.18
487 0.18
488 0.15
489 0.15
490 0.2
491 0.23
492 0.25
493 0.27
494 0.27
495 0.28
496 0.37
497 0.38
498 0.4
499 0.4
500 0.36
501 0.36
502 0.4
503 0.41
504 0.35
505 0.34
506 0.27
507 0.25
508 0.24
509 0.21
510 0.16
511 0.13