FuNGI

A0A1G4JQQ9

Protein Details

Accession

A0A1G4JQQ9

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
102-123	DGVAPRAKMNQQRSRRFRSARD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 13.5, cyto_nucl 10.5, mito 7, cyto 6.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027073 5_3_exoribonuclease IPR041412 Xrn1_helical IPR004859 Xrn1_N IPR017151 Xrn2/3/4
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0004534 F:5'-3' RNA exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0006353 P:DNA-templated transcription termination GO:0006397 P:mRNA processing GO:0006364 P:rRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF17846 XRN_M PF03159 XRN_N
CDD	cd18673 PIN_XRN1-2-like

Amino Acid Sequences

MGVPSFFRWLSRKYPKIISPVIEDAPQVVDGVALPIDYSAPNPNGELDNLYLDMNGIVHPCSHPENRPPPETEDDMLLAVFEYTNRVLNMARPRKVLMIAVDGVAPRAKMNQQRSRRFRSARDAQIQNEERERVLQEKEDFGEVIDESVRNKRTWDSNAITPGTPFMVKLAAALRYWTSFKLATDPGWKNLQVIISDATVPGEGEHKIMNFIRSQRFDPQYNPNTSHCIYGLDADLIFLGLATHEPHFKILREDVFAQDNRRRQRVKDTFNVTDEEKQMLEQQDSEKPFLWLHISVLREYLSAELFIPRLSFEFDLERAIDDWVFMCFFCGNDFLPHLPSLDVRENSIDTLVEVWRIILPQLRTYMTCDGILNLECVELLMSNLASREPEIFKSRYNQELRKQEAAKRRKLLKNSNVTQGKTDRNFTAPLESFPLYDVSGNSAKNSLNLSNADFVKYRKEMNLANEGNKTSAEVLKMQSMLNENGVQSQESQISVVSAANEANFDAAAAMKQKLESQIIKTEATDDNNENAASKDNDELITPEAGNHEDVVERSLKRKLEDSADTPNSGLEGEDDTGSLAGVPLVHPSGVVSGVIDTDEAVKLYEPGFHDRYYRAKFGVFGNDADKLRKDLVRCYVEGISWVLLYYYQGCASWNWYYPYHYAPFASDFKDVKNLKIEFEEGEPFLPYEQLMSVLPAASAHNLPPLFKSLMSEPDSEIIEFYPEEFPIDMNGKKMSWQGIALLPFIDERKLLKVVRDQYQYLSADELARNVRKDEVLLISNKNANYAKFATNLYGDTPVEVVKFQHFASGLSGEAFRDVEGFVLNSKLSSPVSGGGLPDLSTNLFMKVGYRMPEITCRSKSVLLNGFIPSQPMLTPQDRDAVVHRYSQRWNAADMKYNVVPVGPCATTQYQPRLGGYKSFLYFQQVNMQPHNNMPSQYANRHGPPERMSRFNNHGSNNSRFSNARNYQTNRDQQGGRYSRYSGSSRPPPRNSGYN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.62
2	0.64
3	0.68
4	0.69
5	0.62
6	0.58
7	0.56
8	0.52
9	0.45
10	0.39
11	0.31
12	0.27
13	0.23
14	0.17
15	0.11
16	0.09
17	0.08
18	0.09
19	0.08
20	0.06
21	0.06
22	0.05
23	0.07
24	0.07
25	0.09
26	0.13
27	0.15
28	0.16
29	0.17
30	0.19
31	0.19
32	0.2
33	0.21
34	0.17
35	0.17
36	0.17
37	0.17
38	0.14
39	0.13
40	0.12
41	0.1
42	0.09
43	0.08
44	0.08
45	0.09
46	0.1
47	0.13
48	0.19
49	0.23
50	0.28
51	0.37
52	0.47
53	0.53
54	0.57
55	0.58
56	0.58
57	0.59
58	0.58
59	0.49
60	0.41
61	0.36
62	0.31
63	0.27
64	0.2
65	0.14
66	0.1
67	0.09
68	0.06
69	0.08
70	0.09
71	0.12
72	0.12
73	0.13
74	0.13
75	0.2
76	0.31
77	0.37
78	0.4
79	0.4
80	0.42
81	0.44
82	0.45
83	0.42
84	0.33
85	0.3
86	0.26
87	0.25
88	0.24
89	0.21
90	0.2
91	0.18
92	0.15
93	0.1
94	0.13
95	0.19
96	0.26
97	0.36
98	0.45
99	0.55
100	0.66
101	0.74
102	0.8
103	0.84
104	0.82
105	0.79
106	0.8
107	0.79
108	0.79
109	0.79
110	0.75
111	0.68
112	0.72
113	0.68
114	0.62
115	0.57
116	0.48
117	0.39
118	0.37
119	0.36
120	0.29
121	0.27
122	0.29
123	0.26
124	0.29
125	0.3
126	0.29
127	0.26
128	0.23
129	0.22
130	0.16
131	0.14
132	0.12
133	0.11
134	0.12
135	0.19
136	0.21
137	0.19
138	0.21
139	0.25
140	0.31
141	0.36
142	0.42
143	0.4
144	0.44
145	0.49
146	0.5
147	0.46
148	0.38
149	0.34
150	0.27
151	0.23
152	0.16
153	0.11
154	0.1
155	0.1
156	0.11
157	0.13
158	0.13
159	0.13
160	0.15
161	0.15
162	0.16
163	0.18
164	0.17
165	0.17
166	0.16
167	0.17
168	0.21
169	0.22
170	0.22
171	0.31
172	0.33
173	0.33
174	0.36
175	0.36
176	0.31
177	0.32
178	0.31
179	0.21
180	0.21
181	0.18
182	0.15
183	0.15
184	0.14
185	0.12
186	0.1
187	0.09
188	0.08
189	0.08
190	0.08
191	0.08
192	0.09
193	0.09
194	0.13
195	0.14
196	0.16
197	0.18
198	0.24
199	0.3
200	0.33
201	0.36
202	0.41
203	0.45
204	0.46
205	0.47
206	0.51
207	0.52
208	0.54
209	0.54
210	0.47
211	0.48
212	0.46
213	0.43
214	0.33
215	0.26
216	0.22
217	0.19
218	0.18
219	0.13
220	0.12
221	0.1
222	0.1
223	0.08
224	0.07
225	0.05
226	0.04
227	0.03
228	0.04
229	0.05
230	0.06
231	0.08
232	0.09
233	0.12
234	0.14
235	0.15
236	0.18
237	0.21
238	0.23
239	0.25
240	0.26
241	0.26
242	0.29
243	0.31
244	0.33
245	0.34
246	0.39
247	0.41
248	0.48
249	0.48
250	0.45
251	0.54
252	0.58
253	0.6
254	0.62
255	0.64
256	0.6
257	0.6
258	0.6
259	0.5
260	0.45
261	0.39
262	0.31
263	0.23
264	0.19
265	0.21
266	0.21
267	0.19
268	0.16
269	0.18
270	0.22
271	0.25
272	0.26
273	0.22
274	0.21
275	0.21
276	0.2
277	0.2
278	0.15
279	0.14
280	0.17
281	0.17
282	0.16
283	0.17
284	0.16
285	0.13
286	0.13
287	0.12
288	0.08
289	0.08
290	0.08
291	0.08
292	0.08
293	0.08
294	0.08
295	0.07
296	0.07
297	0.09
298	0.09
299	0.09
300	0.12
301	0.12
302	0.13
303	0.13
304	0.13
305	0.11
306	0.12
307	0.1
308	0.08
309	0.08
310	0.07
311	0.07
312	0.06
313	0.06
314	0.06
315	0.06
316	0.07
317	0.08
318	0.08
319	0.09
320	0.11
321	0.11
322	0.12
323	0.13
324	0.13
325	0.11
326	0.11
327	0.15
328	0.19
329	0.19
330	0.18
331	0.19
332	0.19
333	0.19
334	0.18
335	0.13
336	0.08
337	0.09
338	0.08
339	0.07
340	0.06
341	0.07
342	0.07
343	0.07
344	0.07
345	0.09
346	0.1
347	0.12
348	0.15
349	0.15
350	0.15
351	0.19
352	0.21
353	0.18
354	0.18
355	0.16
356	0.14
357	0.15
358	0.15
359	0.12
360	0.09
361	0.07
362	0.06
363	0.06
364	0.06
365	0.04
366	0.03
367	0.03
368	0.03
369	0.04
370	0.04
371	0.04
372	0.04
373	0.05
374	0.08
375	0.09
376	0.12
377	0.16
378	0.18
379	0.19
380	0.25
381	0.27
382	0.33
383	0.38
384	0.41
385	0.44
386	0.52
387	0.55
388	0.57
389	0.57
390	0.55
391	0.59
392	0.61
393	0.6
394	0.6
395	0.64
396	0.62
397	0.68
398	0.71
399	0.7
400	0.73
401	0.68
402	0.7
403	0.66
404	0.6
405	0.56
406	0.5
407	0.48
408	0.4
409	0.39
410	0.3
411	0.27
412	0.28
413	0.25
414	0.27
415	0.21
416	0.2
417	0.21
418	0.2
419	0.18
420	0.17
421	0.18
422	0.11
423	0.11
424	0.1
425	0.1
426	0.12
427	0.12
428	0.12
429	0.13
430	0.13
431	0.14
432	0.15
433	0.12
434	0.12
435	0.13
436	0.13
437	0.16
438	0.16
439	0.16
440	0.15
441	0.15
442	0.18
443	0.18
444	0.18
445	0.15
446	0.18
447	0.19
448	0.22
449	0.31
450	0.28
451	0.29
452	0.29
453	0.29
454	0.26
455	0.23
456	0.2
457	0.11
458	0.11
459	0.1
460	0.1
461	0.1
462	0.11
463	0.12
464	0.12
465	0.12
466	0.13
467	0.12
468	0.12
469	0.12
470	0.11
471	0.11
472	0.12
473	0.1
474	0.08
475	0.09
476	0.08
477	0.07
478	0.07
479	0.06
480	0.06
481	0.06
482	0.06
483	0.05
484	0.05
485	0.05
486	0.05
487	0.05
488	0.05
489	0.04
490	0.04
491	0.03
492	0.03
493	0.03
494	0.03
495	0.05
496	0.05
497	0.05
498	0.06
499	0.07
500	0.09
501	0.12
502	0.13
503	0.14
504	0.18
505	0.2
506	0.2
507	0.19
508	0.2
509	0.19
510	0.19
511	0.19
512	0.16
513	0.15
514	0.15
515	0.15
516	0.13
517	0.11
518	0.12
519	0.1
520	0.1
521	0.09
522	0.09
523	0.09
524	0.09
525	0.1
526	0.09
527	0.09
528	0.08
529	0.08
530	0.08
531	0.08
532	0.08
533	0.07
534	0.06
535	0.06
536	0.06
537	0.08
538	0.1
539	0.1
540	0.12
541	0.16
542	0.17
543	0.18
544	0.2
545	0.21
546	0.23
547	0.26
548	0.27
549	0.31
550	0.31
551	0.31
552	0.28
553	0.25
554	0.2
555	0.17
556	0.14
557	0.06
558	0.06
559	0.06
560	0.06
561	0.06
562	0.06
563	0.06
564	0.06
565	0.05
566	0.03
567	0.03
568	0.03
569	0.03
570	0.04
571	0.04
572	0.04
573	0.04
574	0.04
575	0.05
576	0.05
577	0.05
578	0.04
579	0.04
580	0.04
581	0.04
582	0.04
583	0.03
584	0.04
585	0.04
586	0.04
587	0.05
588	0.05
589	0.05
590	0.06
591	0.09
592	0.1
593	0.15
594	0.17
595	0.18
596	0.19
597	0.21
598	0.29
599	0.3
600	0.3
601	0.25
602	0.24
603	0.25
604	0.25
605	0.3
606	0.24
607	0.21
608	0.21
609	0.24
610	0.25
611	0.24
612	0.23
613	0.17
614	0.18
615	0.2
616	0.19
617	0.2
618	0.28
619	0.3
620	0.29
621	0.31
622	0.29
623	0.27
624	0.26
625	0.22
626	0.14
627	0.1
628	0.1
629	0.07
630	0.06
631	0.06
632	0.06
633	0.06
634	0.06
635	0.06
636	0.07
637	0.08
638	0.12
639	0.13
640	0.15
641	0.17
642	0.18
643	0.2
644	0.21
645	0.25
646	0.23
647	0.21
648	0.19
649	0.18
650	0.21
651	0.21
652	0.21
653	0.22
654	0.2
655	0.2
656	0.29
657	0.28
658	0.26
659	0.32
660	0.3
661	0.27
662	0.28
663	0.28
664	0.21
665	0.22
666	0.22
667	0.15
668	0.15
669	0.14
670	0.12
671	0.11
672	0.1
673	0.07
674	0.06
675	0.06
676	0.06
677	0.06
678	0.07
679	0.07
680	0.07
681	0.07
682	0.07
683	0.07
684	0.07
685	0.08
686	0.07
687	0.12
688	0.12
689	0.12
690	0.13
691	0.17
692	0.16
693	0.16
694	0.17
695	0.15
696	0.22
697	0.24
698	0.24
699	0.21
700	0.22
701	0.23
702	0.21
703	0.19
704	0.12
705	0.1
706	0.09
707	0.1
708	0.09
709	0.08
710	0.09
711	0.09
712	0.09
713	0.11
714	0.15
715	0.13
716	0.14
717	0.15
718	0.14
719	0.16
720	0.18
721	0.18
722	0.15
723	0.15
724	0.16
725	0.18
726	0.19
727	0.18
728	0.16
729	0.13
730	0.13
731	0.13
732	0.12
733	0.09
734	0.09
735	0.12
736	0.17
737	0.17
738	0.2
739	0.28
740	0.33
741	0.4
742	0.43
743	0.41
744	0.39
745	0.44
746	0.41
747	0.34
748	0.29
749	0.22
750	0.21
751	0.2
752	0.2
753	0.19
754	0.21
755	0.22
756	0.21
757	0.22
758	0.2
759	0.2
760	0.21
761	0.19
762	0.2
763	0.22
764	0.23
765	0.25
766	0.28
767	0.27
768	0.29
769	0.27
770	0.23
771	0.25
772	0.27
773	0.26
774	0.24
775	0.25
776	0.23
777	0.22
778	0.22
779	0.19
780	0.18
781	0.16
782	0.14
783	0.14
784	0.13
785	0.12
786	0.12
787	0.12
788	0.11
789	0.13
790	0.12
791	0.15
792	0.14
793	0.14
794	0.16
795	0.16
796	0.14
797	0.13
798	0.14
799	0.11
800	0.11
801	0.11
802	0.08
803	0.08
804	0.07
805	0.07
806	0.07
807	0.07
808	0.07
809	0.08
810	0.08
811	0.08
812	0.08
813	0.1
814	0.1
815	0.1
816	0.11
817	0.11
818	0.13
819	0.14
820	0.14
821	0.12
822	0.13
823	0.12
824	0.11
825	0.1
826	0.09
827	0.1
828	0.1
829	0.1
830	0.1
831	0.09
832	0.1
833	0.13
834	0.16
835	0.18
836	0.19
837	0.2
838	0.22
839	0.31
840	0.35
841	0.39
842	0.38
843	0.39
844	0.4
845	0.44
846	0.44
847	0.44
848	0.46
849	0.4
850	0.41
851	0.39
852	0.38
853	0.32
854	0.32
855	0.24
856	0.17
857	0.15
858	0.16
859	0.2
860	0.2
861	0.23
862	0.23
863	0.28
864	0.27
865	0.29
866	0.29
867	0.29
868	0.27
869	0.32
870	0.34
871	0.34
872	0.38
873	0.44
874	0.47
875	0.42
876	0.45
877	0.46
878	0.46
879	0.5
880	0.47
881	0.46
882	0.4
883	0.39
884	0.34
885	0.28
886	0.25
887	0.18
888	0.2
889	0.15
890	0.14
891	0.18
892	0.21
893	0.24
894	0.3
895	0.35
896	0.37
897	0.39
898	0.41
899	0.41
900	0.39
901	0.4
902	0.38
903	0.38
904	0.33
905	0.33
906	0.31
907	0.33
908	0.33
909	0.3
910	0.36
911	0.36
912	0.39
913	0.43
914	0.46
915	0.41
916	0.44
917	0.47
918	0.39
919	0.33
920	0.32
921	0.36
922	0.38
923	0.41
924	0.43
925	0.45
926	0.46
927	0.52
928	0.53
929	0.5
930	0.5
931	0.56
932	0.55
933	0.56
934	0.56
935	0.56
936	0.6
937	0.63
938	0.63
939	0.57
940	0.6
941	0.6
942	0.63
943	0.6
944	0.55
945	0.5
946	0.44
947	0.44
948	0.47
949	0.47
950	0.48
951	0.52
952	0.56
953	0.61
954	0.7
955	0.75
956	0.68
957	0.67
958	0.62
959	0.57
960	0.62
961	0.59
962	0.54
963	0.48
964	0.46
965	0.44
966	0.47
967	0.46
968	0.41
969	0.45
970	0.51
971	0.58
972	0.65
973	0.67
974	0.69

A0A1G4JQQ9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer