FuNGI

A0A1G4M706

Protein Details

Accession

A0A1G4M706

Localization Confidence

High

Confidence Score

23.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
10-46	NSASPFIKREQHRREFLRSRSKKNATPKPFVKKEDPD	Hydrophilic
236-257	DGGGRYRRGNSKRKTRQLKLLD	Basic
493-517	QENGKSSRKGSPKKKSSRGSPTAPQ	Hydrophilic
597-617	IRELREKVSKHPSNKERMKLL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
26-34	LRSRSKKNA
245-249	NSKRK
498-510	SSRKGSPKKKSSR

Subcellular Location(s)

nucl 23.5, cyto_nucl 13

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MSNPLRSSGNSASPFIKREQHRREFLRSRSKKNATPKPFVKKEDPDAYDERTSQILQGSGSSSKKVKQENGAEYNEFPLRAVSSEKLENIRTHILKFQSKKKIDPTKDFHLPIRLHRKDTRNLQFQLTRAEIVQRQKEIAEFKNRADEEEKGDENSSKTNTPSVIDVEEAPSTSSVKEEPKSPETPAQPTPPVTVLEEAGPAEDPTKVGMVKYDGQEQPAIDEDESADPFADVAPDGGGRYRRGNSKRKTRQLKLLDENAKRLRFEEFYPWVMEDFDGLNTWVGSYEAGNSDSYVLLSVENDGSFTMVPADKVYKFTARNKYATLTIEEAEKRMEKNGKGVPRWLMKHLDDIGTTTTRYDRTRRRLKAVDAREGDDEDRGDNSEVELDFDEEFADDEEAPIIDGNEQENKESEDRIKKEMLQANAMGLRDDEEIDDDLFGEKKIDDEGERVKKALQKSDAAALYESDDDELNPYLSESDLEDQDANTVKQEDQENGKSSRKGSPKKKSSRGSPTAPQIYVKSIKDCMIVLKAGKSVLNNFPSGEWNPQAKKRSSEQPADLGSAKGGAESDENAENLLTEDDIINAVSGKRMTLKQLIRELREKVSKHPSNKERMKLLVKRLVKLNDGYLELNK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.43
2	0.4
3	0.44
4	0.43
5	0.52
6	0.6
7	0.65
8	0.71
9	0.75
10	0.81
11	0.82
12	0.83
13	0.84
14	0.82
15	0.81
16	0.83
17	0.84
18	0.81
19	0.83
20	0.84
21	0.81
22	0.82
23	0.83
24	0.83
25	0.83
26	0.82
27	0.8
28	0.77
29	0.78
30	0.77
31	0.71
32	0.66
33	0.62
34	0.6
35	0.55
36	0.48
37	0.4
38	0.32
39	0.3
40	0.25
41	0.24
42	0.19
43	0.16
44	0.16
45	0.17
46	0.2
47	0.21
48	0.24
49	0.24
50	0.28
51	0.34
52	0.4
53	0.43
54	0.47
55	0.55
56	0.61
57	0.65
58	0.65
59	0.6
60	0.54
61	0.52
62	0.44
63	0.35
64	0.25
65	0.19
66	0.16
67	0.15
68	0.17
69	0.15
70	0.18
71	0.21
72	0.24
73	0.26
74	0.29
75	0.29
76	0.3
77	0.37
78	0.34
79	0.33
80	0.36
81	0.38
82	0.44
83	0.49
84	0.54
85	0.56
86	0.58
87	0.63
88	0.68
89	0.72
90	0.72
91	0.75
92	0.73
93	0.71
94	0.75
95	0.72
96	0.65
97	0.63
98	0.57
99	0.56
100	0.6
101	0.56
102	0.54
103	0.59
104	0.63
105	0.63
106	0.71
107	0.71
108	0.69
109	0.67
110	0.67
111	0.63
112	0.58
113	0.56
114	0.47
115	0.38
116	0.29
117	0.31
118	0.3
119	0.34
120	0.37
121	0.32
122	0.31
123	0.31
124	0.34
125	0.34
126	0.36
127	0.38
128	0.35
129	0.35
130	0.43
131	0.42
132	0.42
133	0.39
134	0.35
135	0.32
136	0.35
137	0.34
138	0.27
139	0.28
140	0.27
141	0.25
142	0.27
143	0.23
144	0.19
145	0.19
146	0.2
147	0.19
148	0.19
149	0.19
150	0.18
151	0.16
152	0.15
153	0.15
154	0.14
155	0.14
156	0.13
157	0.11
158	0.1
159	0.1
160	0.09
161	0.09
162	0.1
163	0.14
164	0.15
165	0.2
166	0.26
167	0.31
168	0.33
169	0.35
170	0.39
171	0.38
172	0.42
173	0.41
174	0.4
175	0.37
176	0.36
177	0.35
178	0.3
179	0.28
180	0.24
181	0.21
182	0.16
183	0.14
184	0.13
185	0.11
186	0.1
187	0.09
188	0.08
189	0.07
190	0.07
191	0.06
192	0.06
193	0.08
194	0.07
195	0.07
196	0.08
197	0.11
198	0.14
199	0.16
200	0.22
201	0.21
202	0.23
203	0.24
204	0.22
205	0.2
206	0.19
207	0.18
208	0.11
209	0.11
210	0.11
211	0.11
212	0.12
213	0.11
214	0.08
215	0.07
216	0.07
217	0.07
218	0.06
219	0.04
220	0.04
221	0.04
222	0.04
223	0.04
224	0.07
225	0.09
226	0.1
227	0.14
228	0.17
229	0.25
230	0.33
231	0.43
232	0.5
233	0.59
234	0.68
235	0.75
236	0.82
237	0.78
238	0.8
239	0.79
240	0.79
241	0.74
242	0.73
243	0.72
244	0.63
245	0.65
246	0.61
247	0.54
248	0.45
249	0.39
250	0.33
251	0.26
252	0.26
253	0.27
254	0.24
255	0.24
256	0.25
257	0.24
258	0.22
259	0.2
260	0.18
261	0.11
262	0.08
263	0.07
264	0.06
265	0.06
266	0.06
267	0.05
268	0.05
269	0.05
270	0.04
271	0.04
272	0.04
273	0.05
274	0.06
275	0.07
276	0.07
277	0.07
278	0.07
279	0.07
280	0.07
281	0.06
282	0.05
283	0.04
284	0.05
285	0.05
286	0.05
287	0.05
288	0.05
289	0.04
290	0.05
291	0.05
292	0.04
293	0.05
294	0.05
295	0.05
296	0.06
297	0.08
298	0.08
299	0.11
300	0.12
301	0.15
302	0.19
303	0.26
304	0.35
305	0.37
306	0.38
307	0.37
308	0.37
309	0.36
310	0.33
311	0.28
312	0.2
313	0.16
314	0.18
315	0.17
316	0.15
317	0.14
318	0.14
319	0.12
320	0.15
321	0.19
322	0.16
323	0.22
324	0.27
325	0.31
326	0.31
327	0.34
328	0.35
329	0.36
330	0.38
331	0.35
332	0.35
333	0.29
334	0.33
335	0.31
336	0.27
337	0.21
338	0.2
339	0.19
340	0.15
341	0.14
342	0.11
343	0.11
344	0.13
345	0.15
346	0.22
347	0.28
348	0.38
349	0.48
350	0.52
351	0.58
352	0.61
353	0.66
354	0.68
355	0.65
356	0.64
357	0.56
358	0.54
359	0.47
360	0.43
361	0.35
362	0.27
363	0.21
364	0.12
365	0.11
366	0.1
367	0.1
368	0.08
369	0.08
370	0.09
371	0.09
372	0.09
373	0.09
374	0.09
375	0.08
376	0.08
377	0.08
378	0.06
379	0.06
380	0.06
381	0.06
382	0.05
383	0.05
384	0.05
385	0.05
386	0.05
387	0.05
388	0.04
389	0.04
390	0.05
391	0.06
392	0.1
393	0.11
394	0.11
395	0.12
396	0.15
397	0.15
398	0.16
399	0.21
400	0.25
401	0.28
402	0.3
403	0.31
404	0.31
405	0.38
406	0.41
407	0.37
408	0.31
409	0.29
410	0.28
411	0.28
412	0.27
413	0.19
414	0.13
415	0.13
416	0.11
417	0.11
418	0.09
419	0.08
420	0.09
421	0.09
422	0.09
423	0.07
424	0.08
425	0.08
426	0.08
427	0.07
428	0.06
429	0.06
430	0.07
431	0.08
432	0.08
433	0.11
434	0.2
435	0.27
436	0.27
437	0.27
438	0.29
439	0.32
440	0.35
441	0.39
442	0.35
443	0.31
444	0.32
445	0.38
446	0.36
447	0.33
448	0.3
449	0.22
450	0.2
451	0.17
452	0.15
453	0.1
454	0.08
455	0.07
456	0.09
457	0.09
458	0.08
459	0.07
460	0.08
461	0.07
462	0.07
463	0.08
464	0.08
465	0.09
466	0.1
467	0.11
468	0.11
469	0.11
470	0.13
471	0.15
472	0.13
473	0.12
474	0.13
475	0.12
476	0.16
477	0.18
478	0.19
479	0.23
480	0.29
481	0.32
482	0.35
483	0.39
484	0.37
485	0.38
486	0.43
487	0.47
488	0.52
489	0.58
490	0.65
491	0.71
492	0.79
493	0.87
494	0.87
495	0.87
496	0.88
497	0.85
498	0.81
499	0.77
500	0.76
501	0.72
502	0.65
503	0.57
504	0.48
505	0.46
506	0.46
507	0.4
508	0.34
509	0.3
510	0.31
511	0.3
512	0.28
513	0.25
514	0.22
515	0.23
516	0.21
517	0.21
518	0.2
519	0.2
520	0.21
521	0.2
522	0.22
523	0.27
524	0.28
525	0.27
526	0.26
527	0.26
528	0.29
529	0.3
530	0.3
531	0.27
532	0.32
533	0.37
534	0.43
535	0.5
536	0.49
537	0.52
538	0.54
539	0.59
540	0.6
541	0.62
542	0.59
543	0.58
544	0.57
545	0.55
546	0.49
547	0.4
548	0.32
549	0.25
550	0.2
551	0.14
552	0.12
553	0.09
554	0.09
555	0.1
556	0.12
557	0.13
558	0.13
559	0.13
560	0.13
561	0.12
562	0.11
563	0.11
564	0.08
565	0.07
566	0.07
567	0.07
568	0.08
569	0.08
570	0.07
571	0.07
572	0.08
573	0.1
574	0.1
575	0.1
576	0.15
577	0.17
578	0.22
579	0.3
580	0.35
581	0.4
582	0.5
583	0.56
584	0.57
585	0.62
586	0.61
587	0.6
588	0.63
589	0.57
590	0.56
591	0.6
592	0.62
593	0.64
594	0.71
595	0.71
596	0.74
597	0.81
598	0.81
599	0.76
600	0.76
601	0.78
602	0.75
603	0.76
604	0.75
605	0.71
606	0.68
607	0.7
608	0.66
609	0.6
610	0.55
611	0.51
612	0.46
613	0.43

A0A1G4M706

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer