Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1G4M8Z3

Protein Details
Accession A0A1G4M8Z3    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
9-34TKPDSGRGSGRRQRDKKAEKPLDFEEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
19-25RRQRDKK
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 13, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039900  Pat1-like  
IPR019167  PAT1_dom  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000290  P:deadenylation-dependent decapping of nuclear-transcribed mRNA  
Pfam View protein in Pfam  
PF09770  PAT1  
Amino Acid Sequences MSFFGFDPTKPDSGRGSGRRQRDKKAEKPLDFEETYQGFGEHDQEEDDYLNDETFGNATELGTDFDFGYGKGSLESDVAPKSYADHGRSYASAAVAGPPSGQTGYGAAAVQGLDDGLDFKPMESLWTNQPMSMPMPQQFQQPQLPQHPQHPQQVLSMEQLERQQRQQQQQMGIPAQQQGFVGMPPQQDMKPMGYGYSPQGYMPQIHQMQGGGFPNQPQSFPPQAVPPQNMGTHQYQPMPLMFNRQMEPHQHPQQQVASPPSNQQQHLPVQQQLPQQSIPIGLSPQAQELGPQQQQQQSQQGSNFPVQMDSTRNSASPRSQALSPPHTPRDSNSRNGRRGSMRRQQEPLTEEEHKRLQIRQAKVDKILRHSGVMTPRDKDFITRYQLSQIVTDDPYNEDFYFQVYKIIQRGGVVGESNKGLIARAYLEHSGHRLGGRYKRADVALQRMQSQVEKAVTVAKERPQKNKENFDGAKEGVLGKISSTMNSKAPRRQLQIPTQKSEDDESNAAAIDEVVESLNGVELSSASKARRRSSYAFRTMDQSAVLCRSGGRKFVLSLIESVYSEVLELEAQLRSGKSIDNKALWDALHVADDSYEVSPFISILSFDKGVKIMPRILNFLDKAQKLRLLTLFFSELSHLNIIVTSSYKTNPHPTDVQLKKIELFQSVFLKIIVSFLSSSAEFLEVISLLLALIKDNNVSFISTSKIGLNLITVLISRAALIKQDINRGTVLSSSEISTWNEIYDKLFTALETRLALVFPPEEYTNRVVAISSSPSLLSANGEQTAKNHYYDHSYIWQFFASLALSGKLNHQRVIIDEIRDEIFGTISKAEELAKSTTVDEQVALYQRDKMYQDLNLFLNVMGLVARDGEITELK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.46
3 0.52
4 0.55
5 0.64
6 0.73
7 0.75
8 0.79
9 0.8
10 0.83
11 0.82
12 0.86
13 0.86
14 0.8
15 0.8
16 0.75
17 0.72
18 0.63
19 0.55
20 0.51
21 0.42
22 0.39
23 0.32
24 0.27
25 0.19
26 0.19
27 0.21
28 0.14
29 0.13
30 0.13
31 0.13
32 0.14
33 0.14
34 0.14
35 0.12
36 0.12
37 0.11
38 0.11
39 0.1
40 0.1
41 0.09
42 0.1
43 0.09
44 0.08
45 0.08
46 0.09
47 0.1
48 0.11
49 0.11
50 0.11
51 0.1
52 0.1
53 0.11
54 0.09
55 0.11
56 0.1
57 0.1
58 0.1
59 0.1
60 0.11
61 0.11
62 0.13
63 0.13
64 0.14
65 0.15
66 0.15
67 0.14
68 0.16
69 0.22
70 0.27
71 0.27
72 0.29
73 0.3
74 0.33
75 0.33
76 0.33
77 0.27
78 0.21
79 0.19
80 0.16
81 0.16
82 0.14
83 0.14
84 0.12
85 0.1
86 0.12
87 0.11
88 0.11
89 0.08
90 0.09
91 0.1
92 0.11
93 0.1
94 0.08
95 0.09
96 0.09
97 0.08
98 0.07
99 0.05
100 0.04
101 0.04
102 0.06
103 0.05
104 0.08
105 0.08
106 0.08
107 0.1
108 0.1
109 0.14
110 0.14
111 0.17
112 0.2
113 0.29
114 0.29
115 0.28
116 0.29
117 0.28
118 0.28
119 0.3
120 0.27
121 0.22
122 0.27
123 0.27
124 0.34
125 0.34
126 0.36
127 0.39
128 0.41
129 0.44
130 0.47
131 0.55
132 0.5
133 0.55
134 0.6
135 0.58
136 0.61
137 0.59
138 0.52
139 0.47
140 0.47
141 0.41
142 0.35
143 0.33
144 0.25
145 0.23
146 0.27
147 0.29
148 0.3
149 0.32
150 0.37
151 0.42
152 0.49
153 0.55
154 0.55
155 0.55
156 0.56
157 0.57
158 0.51
159 0.46
160 0.4
161 0.37
162 0.31
163 0.27
164 0.23
165 0.18
166 0.16
167 0.13
168 0.13
169 0.12
170 0.12
171 0.13
172 0.15
173 0.14
174 0.17
175 0.19
176 0.19
177 0.19
178 0.19
179 0.18
180 0.16
181 0.18
182 0.18
183 0.19
184 0.17
185 0.14
186 0.17
187 0.18
188 0.18
189 0.18
190 0.23
191 0.21
192 0.22
193 0.22
194 0.2
195 0.19
196 0.22
197 0.22
198 0.16
199 0.15
200 0.16
201 0.21
202 0.21
203 0.21
204 0.19
205 0.24
206 0.25
207 0.26
208 0.26
209 0.26
210 0.31
211 0.36
212 0.37
213 0.33
214 0.33
215 0.32
216 0.32
217 0.31
218 0.28
219 0.27
220 0.27
221 0.26
222 0.24
223 0.24
224 0.24
225 0.23
226 0.2
227 0.24
228 0.24
229 0.25
230 0.26
231 0.26
232 0.28
233 0.3
234 0.37
235 0.38
236 0.44
237 0.46
238 0.46
239 0.48
240 0.5
241 0.46
242 0.43
243 0.41
244 0.35
245 0.31
246 0.34
247 0.36
248 0.36
249 0.34
250 0.33
251 0.31
252 0.34
253 0.39
254 0.38
255 0.36
256 0.33
257 0.37
258 0.39
259 0.36
260 0.33
261 0.27
262 0.25
263 0.21
264 0.2
265 0.15
266 0.12
267 0.11
268 0.09
269 0.1
270 0.1
271 0.1
272 0.1
273 0.1
274 0.1
275 0.12
276 0.17
277 0.18
278 0.19
279 0.22
280 0.25
281 0.28
282 0.3
283 0.35
284 0.31
285 0.31
286 0.31
287 0.31
288 0.29
289 0.29
290 0.27
291 0.2
292 0.18
293 0.16
294 0.16
295 0.16
296 0.15
297 0.16
298 0.15
299 0.16
300 0.17
301 0.19
302 0.2
303 0.2
304 0.22
305 0.21
306 0.22
307 0.26
308 0.3
309 0.34
310 0.37
311 0.38
312 0.4
313 0.39
314 0.39
315 0.36
316 0.41
317 0.38
318 0.42
319 0.47
320 0.52
321 0.55
322 0.57
323 0.59
324 0.57
325 0.61
326 0.61
327 0.59
328 0.58
329 0.57
330 0.59
331 0.57
332 0.53
333 0.48
334 0.41
335 0.38
336 0.36
337 0.32
338 0.32
339 0.32
340 0.29
341 0.28
342 0.28
343 0.3
344 0.33
345 0.35
346 0.41
347 0.44
348 0.45
349 0.49
350 0.52
351 0.47
352 0.44
353 0.46
354 0.37
355 0.32
356 0.31
357 0.29
358 0.3
359 0.32
360 0.29
361 0.25
362 0.25
363 0.26
364 0.25
365 0.24
366 0.21
367 0.22
368 0.26
369 0.26
370 0.26
371 0.28
372 0.3
373 0.28
374 0.25
375 0.2
376 0.16
377 0.16
378 0.15
379 0.13
380 0.12
381 0.12
382 0.13
383 0.12
384 0.1
385 0.09
386 0.11
387 0.12
388 0.11
389 0.12
390 0.1
391 0.12
392 0.13
393 0.13
394 0.12
395 0.1
396 0.11
397 0.09
398 0.09
399 0.08
400 0.07
401 0.08
402 0.07
403 0.07
404 0.06
405 0.06
406 0.05
407 0.05
408 0.05
409 0.05
410 0.05
411 0.07
412 0.08
413 0.09
414 0.09
415 0.11
416 0.11
417 0.11
418 0.11
419 0.11
420 0.14
421 0.2
422 0.25
423 0.25
424 0.26
425 0.27
426 0.27
427 0.28
428 0.26
429 0.27
430 0.26
431 0.26
432 0.26
433 0.24
434 0.24
435 0.22
436 0.2
437 0.15
438 0.11
439 0.1
440 0.09
441 0.12
442 0.12
443 0.14
444 0.15
445 0.18
446 0.26
447 0.3
448 0.39
449 0.41
450 0.5
451 0.55
452 0.61
453 0.59
454 0.6
455 0.57
456 0.51
457 0.48
458 0.39
459 0.32
460 0.24
461 0.21
462 0.12
463 0.12
464 0.09
465 0.05
466 0.1
467 0.09
468 0.1
469 0.12
470 0.14
471 0.18
472 0.23
473 0.26
474 0.27
475 0.35
476 0.4
477 0.42
478 0.48
479 0.5
480 0.55
481 0.63
482 0.62
483 0.58
484 0.54
485 0.5
486 0.43
487 0.39
488 0.3
489 0.22
490 0.18
491 0.15
492 0.13
493 0.12
494 0.11
495 0.08
496 0.07
497 0.04
498 0.04
499 0.04
500 0.03
501 0.03
502 0.03
503 0.03
504 0.04
505 0.03
506 0.03
507 0.03
508 0.03
509 0.04
510 0.06
511 0.08
512 0.09
513 0.13
514 0.17
515 0.21
516 0.25
517 0.3
518 0.35
519 0.43
520 0.51
521 0.57
522 0.55
523 0.52
524 0.52
525 0.46
526 0.41
527 0.32
528 0.23
529 0.15
530 0.14
531 0.13
532 0.09
533 0.09
534 0.13
535 0.14
536 0.17
537 0.17
538 0.16
539 0.17
540 0.2
541 0.21
542 0.17
543 0.17
544 0.15
545 0.15
546 0.14
547 0.14
548 0.11
549 0.08
550 0.07
551 0.06
552 0.05
553 0.04
554 0.04
555 0.05
556 0.05
557 0.05
558 0.06
559 0.06
560 0.07
561 0.07
562 0.1
563 0.12
564 0.17
565 0.2
566 0.21
567 0.22
568 0.23
569 0.24
570 0.21
571 0.18
572 0.15
573 0.12
574 0.11
575 0.1
576 0.09
577 0.07
578 0.08
579 0.08
580 0.07
581 0.06
582 0.05
583 0.05
584 0.05
585 0.05
586 0.05
587 0.04
588 0.05
589 0.06
590 0.09
591 0.1
592 0.1
593 0.11
594 0.11
595 0.12
596 0.14
597 0.15
598 0.19
599 0.22
600 0.23
601 0.26
602 0.27
603 0.3
604 0.28
605 0.3
606 0.31
607 0.29
608 0.3
609 0.29
610 0.31
611 0.27
612 0.29
613 0.28
614 0.24
615 0.23
616 0.23
617 0.23
618 0.19
619 0.19
620 0.17
621 0.14
622 0.14
623 0.14
624 0.11
625 0.09
626 0.09
627 0.09
628 0.08
629 0.08
630 0.07
631 0.09
632 0.11
633 0.13
634 0.16
635 0.25
636 0.27
637 0.3
638 0.32
639 0.34
640 0.43
641 0.43
642 0.47
643 0.42
644 0.41
645 0.37
646 0.38
647 0.36
648 0.29
649 0.27
650 0.24
651 0.24
652 0.24
653 0.23
654 0.19
655 0.18
656 0.15
657 0.14
658 0.11
659 0.08
660 0.08
661 0.08
662 0.1
663 0.09
664 0.09
665 0.09
666 0.1
667 0.08
668 0.08
669 0.08
670 0.06
671 0.06
672 0.06
673 0.05
674 0.04
675 0.05
676 0.05
677 0.04
678 0.05
679 0.06
680 0.07
681 0.07
682 0.09
683 0.09
684 0.09
685 0.1
686 0.1
687 0.13
688 0.13
689 0.14
690 0.13
691 0.13
692 0.13
693 0.12
694 0.12
695 0.1
696 0.09
697 0.08
698 0.07
699 0.07
700 0.07
701 0.07
702 0.07
703 0.08
704 0.08
705 0.09
706 0.11
707 0.15
708 0.18
709 0.26
710 0.27
711 0.27
712 0.27
713 0.26
714 0.25
715 0.21
716 0.2
717 0.14
718 0.14
719 0.13
720 0.14
721 0.15
722 0.16
723 0.17
724 0.16
725 0.15
726 0.15
727 0.14
728 0.15
729 0.15
730 0.15
731 0.14
732 0.14
733 0.13
734 0.15
735 0.16
736 0.16
737 0.15
738 0.14
739 0.13
740 0.13
741 0.13
742 0.12
743 0.11
744 0.09
745 0.12
746 0.13
747 0.14
748 0.18
749 0.2
750 0.2
751 0.2
752 0.19
753 0.16
754 0.16
755 0.17
756 0.17
757 0.15
758 0.14
759 0.14
760 0.14
761 0.14
762 0.14
763 0.14
764 0.12
765 0.14
766 0.17
767 0.17
768 0.17
769 0.18
770 0.25
771 0.24
772 0.23
773 0.22
774 0.2
775 0.27
776 0.29
777 0.32
778 0.33
779 0.35
780 0.34
781 0.34
782 0.33
783 0.26
784 0.24
785 0.21
786 0.14
787 0.11
788 0.11
789 0.11
790 0.11
791 0.12
792 0.2
793 0.27
794 0.29
795 0.29
796 0.3
797 0.29
798 0.32
799 0.39
800 0.35
801 0.29
802 0.27
803 0.28
804 0.27
805 0.26
806 0.24
807 0.16
808 0.13
809 0.11
810 0.13
811 0.11
812 0.11
813 0.11
814 0.11
815 0.12
816 0.13
817 0.15
818 0.16
819 0.17
820 0.18
821 0.19
822 0.22
823 0.22
824 0.21
825 0.18
826 0.16
827 0.19
828 0.24
829 0.25
830 0.22
831 0.26
832 0.27
833 0.31
834 0.32
835 0.3
836 0.29
837 0.32
838 0.34
839 0.33
840 0.33
841 0.29
842 0.28
843 0.25
844 0.22
845 0.16
846 0.13
847 0.08
848 0.07
849 0.06
850 0.06
851 0.07
852 0.06
853 0.06