Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1G4MIX6

Protein Details
Accession A0A1G4MIX6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
514-539LVEEEKGKAKKQRKPGKKNTPAAAAEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
517-550EEKGKAKKQRKPGKKNTPAAAAESVKKKRVAKKK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 11, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021950  Spt20  
IPR046468  Spt20-like_SEP  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF12090  Spt20  
Amino Acid Sequences MSDGGLGIPVNASKGIMQSTSASKLSQRPVGQVPPHVASSAGTQQQRLLLQQKLRQQQQQQQQAMQNYENQFYQFLMTINKKPKRLYNFAEDTDAILKKYEQFRPSFEFHIYENNYKICAPANTRLQQQQRTPQATSDGLILNKNNETLKEFLEYVARGRIPESIMEVLRDCNIQFYEGNLILQVYDHTNTVDIKQPQNKSTEQAAGAQIQNSNDTHVSSASGANTSANKGLDSSSQSSEPTKDGKEHVATFKRPRVYRTLLRPNDLTHYYDMLSYADHTRFSDNIYQQLEAEILTLTKRNLCLDVHLNPYEHQDKLDESLFLKPAYDYRTGKISSEHHPLPTKDGTKGKVGHIELHEELPQHSSSYEQMMLIMSERTTTTTMSTIAASLAKNAVDLTTSSLKNGGGKVSTSVSSTPGRASSNNPVAAAAVAAAAAVGSNNNENNQFSRLKFVEQWRVNKEKRKQQAMSTNIQPNAYNTRISMAAPLTAQQIKQQQLLQQHQNLDQQRIGSKRLVEEEKGKAKKQRKPGKKNTPAAAAESVKKKRVAKKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.13
3 0.12
4 0.13
5 0.15
6 0.19
7 0.24
8 0.24
9 0.23
10 0.25
11 0.32
12 0.36
13 0.41
14 0.39
15 0.39
16 0.45
17 0.52
18 0.52
19 0.5
20 0.49
21 0.45
22 0.44
23 0.38
24 0.32
25 0.24
26 0.25
27 0.27
28 0.29
29 0.27
30 0.27
31 0.28
32 0.32
33 0.32
34 0.33
35 0.31
36 0.31
37 0.37
38 0.42
39 0.49
40 0.54
41 0.6
42 0.63
43 0.66
44 0.68
45 0.71
46 0.76
47 0.72
48 0.69
49 0.68
50 0.65
51 0.61
52 0.53
53 0.5
54 0.43
55 0.4
56 0.35
57 0.29
58 0.25
59 0.21
60 0.21
61 0.15
62 0.14
63 0.18
64 0.22
65 0.29
66 0.39
67 0.45
68 0.48
69 0.51
70 0.58
71 0.6
72 0.64
73 0.62
74 0.62
75 0.63
76 0.6
77 0.6
78 0.52
79 0.45
80 0.41
81 0.36
82 0.26
83 0.2
84 0.19
85 0.21
86 0.28
87 0.33
88 0.33
89 0.35
90 0.4
91 0.45
92 0.48
93 0.45
94 0.4
95 0.35
96 0.3
97 0.37
98 0.36
99 0.34
100 0.34
101 0.31
102 0.3
103 0.28
104 0.28
105 0.22
106 0.22
107 0.23
108 0.27
109 0.35
110 0.38
111 0.42
112 0.49
113 0.53
114 0.56
115 0.57
116 0.59
117 0.59
118 0.6
119 0.57
120 0.51
121 0.48
122 0.42
123 0.36
124 0.3
125 0.23
126 0.19
127 0.2
128 0.19
129 0.18
130 0.17
131 0.19
132 0.17
133 0.15
134 0.17
135 0.17
136 0.18
137 0.18
138 0.17
139 0.16
140 0.18
141 0.17
142 0.16
143 0.19
144 0.18
145 0.15
146 0.15
147 0.17
148 0.15
149 0.15
150 0.17
151 0.15
152 0.15
153 0.16
154 0.16
155 0.14
156 0.14
157 0.14
158 0.11
159 0.11
160 0.1
161 0.11
162 0.11
163 0.11
164 0.14
165 0.14
166 0.14
167 0.12
168 0.11
169 0.09
170 0.09
171 0.09
172 0.06
173 0.07
174 0.07
175 0.07
176 0.08
177 0.09
178 0.1
179 0.16
180 0.18
181 0.23
182 0.3
183 0.33
184 0.35
185 0.38
186 0.38
187 0.35
188 0.35
189 0.32
190 0.26
191 0.26
192 0.25
193 0.24
194 0.23
195 0.21
196 0.19
197 0.16
198 0.16
199 0.14
200 0.14
201 0.11
202 0.11
203 0.1
204 0.09
205 0.1
206 0.09
207 0.1
208 0.08
209 0.08
210 0.08
211 0.09
212 0.09
213 0.09
214 0.1
215 0.1
216 0.09
217 0.09
218 0.1
219 0.11
220 0.14
221 0.15
222 0.15
223 0.16
224 0.16
225 0.17
226 0.18
227 0.17
228 0.17
229 0.15
230 0.15
231 0.16
232 0.19
233 0.21
234 0.22
235 0.28
236 0.3
237 0.33
238 0.37
239 0.4
240 0.43
241 0.41
242 0.41
243 0.41
244 0.43
245 0.45
246 0.5
247 0.55
248 0.51
249 0.53
250 0.51
251 0.45
252 0.43
253 0.38
254 0.3
255 0.2
256 0.18
257 0.16
258 0.15
259 0.14
260 0.1
261 0.08
262 0.08
263 0.09
264 0.09
265 0.09
266 0.09
267 0.1
268 0.1
269 0.13
270 0.17
271 0.16
272 0.2
273 0.21
274 0.2
275 0.19
276 0.19
277 0.17
278 0.11
279 0.1
280 0.05
281 0.04
282 0.05
283 0.06
284 0.06
285 0.07
286 0.08
287 0.08
288 0.1
289 0.1
290 0.13
291 0.16
292 0.19
293 0.22
294 0.23
295 0.23
296 0.22
297 0.26
298 0.25
299 0.21
300 0.18
301 0.14
302 0.14
303 0.16
304 0.16
305 0.12
306 0.11
307 0.14
308 0.15
309 0.14
310 0.13
311 0.11
312 0.12
313 0.16
314 0.21
315 0.19
316 0.19
317 0.25
318 0.25
319 0.25
320 0.27
321 0.26
322 0.25
323 0.31
324 0.31
325 0.3
326 0.33
327 0.33
328 0.34
329 0.36
330 0.34
331 0.32
332 0.35
333 0.34
334 0.35
335 0.37
336 0.34
337 0.35
338 0.34
339 0.34
340 0.3
341 0.33
342 0.28
343 0.27
344 0.26
345 0.2
346 0.19
347 0.16
348 0.15
349 0.12
350 0.11
351 0.1
352 0.1
353 0.12
354 0.12
355 0.1
356 0.1
357 0.1
358 0.1
359 0.1
360 0.09
361 0.06
362 0.06
363 0.07
364 0.08
365 0.09
366 0.09
367 0.09
368 0.1
369 0.11
370 0.11
371 0.11
372 0.09
373 0.09
374 0.11
375 0.1
376 0.09
377 0.1
378 0.09
379 0.09
380 0.08
381 0.08
382 0.06
383 0.07
384 0.11
385 0.15
386 0.16
387 0.16
388 0.17
389 0.18
390 0.19
391 0.2
392 0.17
393 0.12
394 0.13
395 0.15
396 0.15
397 0.16
398 0.15
399 0.14
400 0.16
401 0.17
402 0.17
403 0.17
404 0.17
405 0.19
406 0.19
407 0.23
408 0.28
409 0.33
410 0.34
411 0.32
412 0.3
413 0.28
414 0.27
415 0.22
416 0.13
417 0.06
418 0.04
419 0.04
420 0.03
421 0.03
422 0.02
423 0.02
424 0.03
425 0.04
426 0.06
427 0.07
428 0.09
429 0.11
430 0.13
431 0.15
432 0.19
433 0.21
434 0.2
435 0.27
436 0.26
437 0.29
438 0.34
439 0.39
440 0.45
441 0.49
442 0.56
443 0.57
444 0.65
445 0.68
446 0.71
447 0.73
448 0.72
449 0.75
450 0.78
451 0.74
452 0.74
453 0.77
454 0.73
455 0.71
456 0.7
457 0.67
458 0.59
459 0.56
460 0.48
461 0.41
462 0.42
463 0.37
464 0.3
465 0.22
466 0.23
467 0.22
468 0.22
469 0.22
470 0.16
471 0.16
472 0.15
473 0.16
474 0.18
475 0.2
476 0.2
477 0.22
478 0.28
479 0.29
480 0.33
481 0.34
482 0.34
483 0.41
484 0.49
485 0.52
486 0.5
487 0.51
488 0.52
489 0.57
490 0.56
491 0.51
492 0.45
493 0.4
494 0.4
495 0.39
496 0.39
497 0.35
498 0.34
499 0.34
500 0.4
501 0.42
502 0.41
503 0.44
504 0.5
505 0.56
506 0.59
507 0.6
508 0.62
509 0.66
510 0.7
511 0.74
512 0.76
513 0.77
514 0.83
515 0.88
516 0.91
517 0.92
518 0.93
519 0.89
520 0.88
521 0.78
522 0.72
523 0.68
524 0.61
525 0.57
526 0.57
527 0.56
528 0.52
529 0.56
530 0.59