FuNGI

G3B6C5

Protein Details

Accession

G3B6C5

Localization Confidence

High

Confidence Score

25.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
76-96	LKDFTKPVRLHRKDPRNIQFH	Hydrophilic
98-124	SRQEIDQKKRREQQRAVEKAKRKQQRL	Hydrophilic
155-176	GGARNFRRNIFKRKTRQINLMA	Hydrophilic
489-512	IKLVSESPQKRQKPNEPREKSLSP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
105-120	KKRREQQRAVEKAKRK
385-392	DKEGKKLR
487-487	R

Subcellular Location(s)

nucl 22, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
KEGG	cten:CANTEDRAFT_106925 -
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MSTPQPRDQVTVKQESPASASVPVSLGSSSSSSSPNGKNPDQGWQDIPLKCYSEEDIKDKRHHIVRFTNKNNVDILKDFTKPVRLHRKDPRNIQFHLSRQEIDQKKRREQQRAVEKAKRKQQRLDGIPVDDTNSSSSGTPSNKNQMDLSQVAPEGGARNFRRNIFKRKTRQINLMADEKRKLRYEEYYPWVMEDYDGQNVYVGNYEAGASEASHVLFVFDKDGFKMIPAEKVYRFNPRNKYATLTLEEAEAKMEKKSAVPRWLMKHMSEKEEKDYRFRNNGNASANQVHIRGSNSNGAGNKLRTVSGASQFNDRDSDHDDIDFDEEFADDEEAPIMDADEEENKMAEQKMKKEMLKASHFDAGSDAEPDDDLDELFETEKSRKIDKEGKKLRKVLNKTEGGVYDSDDDDQLNPYLSKSDLESDDESDDGIEVKQEPDENNLFSQPGHPKARSFFAYNVGDGFVVIKAPPKFLEAFPRGEWLPEGRKRPIKLVSESPQKRQKPNEPREKSLSPTPSVPAVDLNDAGPTGSLVTIQEVLDIVKGNPLPPKELLIKLRGRINANEDNKQRIIMIVKMNLKLEKGMLVLKE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.48
2	0.45
3	0.45
4	0.37
5	0.31
6	0.24
7	0.24
8	0.2
9	0.19
10	0.18
11	0.15
12	0.13
13	0.11
14	0.1
15	0.11
16	0.11
17	0.12
18	0.14
19	0.15
20	0.22
21	0.26
22	0.31
23	0.38
24	0.39
25	0.44
26	0.44
27	0.51
28	0.49
29	0.48
30	0.43
31	0.42
32	0.47
33	0.43
34	0.44
35	0.38
36	0.36
37	0.33
38	0.33
39	0.3
40	0.31
41	0.33
42	0.37
43	0.43
44	0.47
45	0.52
46	0.53
47	0.58
48	0.57
49	0.57
50	0.57
51	0.6
52	0.64
53	0.69
54	0.71
55	0.74
56	0.68
57	0.66
58	0.62
59	0.53
60	0.46
61	0.37
62	0.37
63	0.31
64	0.3
65	0.3
66	0.29
67	0.35
68	0.33
69	0.41
70	0.47
71	0.48
72	0.56
73	0.65
74	0.74
75	0.74
76	0.83
77	0.83
78	0.78
79	0.75
80	0.72
81	0.69
82	0.64
83	0.63
84	0.55
85	0.46
86	0.42
87	0.5
88	0.51
89	0.54
90	0.56
91	0.57
92	0.64
93	0.71
94	0.78
95	0.78
96	0.78
97	0.78
98	0.81
99	0.83
100	0.82
101	0.82
102	0.82
103	0.8
104	0.82
105	0.81
106	0.76
107	0.74
108	0.75
109	0.76
110	0.74
111	0.74
112	0.69
113	0.62
114	0.57
115	0.49
116	0.42
117	0.31
118	0.26
119	0.18
120	0.14
121	0.13
122	0.11
123	0.12
124	0.15
125	0.18
126	0.21
127	0.24
128	0.33
129	0.34
130	0.35
131	0.35
132	0.31
133	0.33
134	0.31
135	0.28
136	0.21
137	0.19
138	0.17
139	0.16
140	0.15
141	0.12
142	0.12
143	0.18
144	0.18
145	0.25
146	0.28
147	0.33
148	0.42
149	0.47
150	0.57
151	0.59
152	0.67
153	0.71
154	0.78
155	0.84
156	0.79
157	0.81
158	0.79
159	0.77
160	0.71
161	0.69
162	0.63
163	0.56
164	0.54
165	0.48
166	0.43
167	0.38
168	0.36
169	0.31
170	0.33
171	0.37
172	0.41
173	0.44
174	0.44
175	0.41
176	0.39
177	0.36
178	0.3
179	0.23
180	0.18
181	0.14
182	0.13
183	0.13
184	0.12
185	0.12
186	0.12
187	0.12
188	0.1
189	0.08
190	0.06
191	0.06
192	0.06
193	0.05
194	0.06
195	0.06
196	0.05
197	0.05
198	0.06
199	0.06
200	0.06
201	0.06
202	0.06
203	0.06
204	0.06
205	0.07
206	0.07
207	0.08
208	0.08
209	0.09
210	0.08
211	0.08
212	0.12
213	0.11
214	0.15
215	0.17
216	0.2
217	0.21
218	0.26
219	0.28
220	0.34
221	0.37
222	0.41
223	0.47
224	0.49
225	0.52
226	0.48
227	0.5
228	0.43
229	0.43
230	0.38
231	0.31
232	0.25
233	0.22
234	0.22
235	0.17
236	0.15
237	0.12
238	0.1
239	0.08
240	0.09
241	0.08
242	0.11
243	0.17
244	0.22
245	0.27
246	0.3
247	0.35
248	0.39
249	0.45
250	0.43
251	0.38
252	0.42
253	0.39
254	0.41
255	0.41
256	0.38
257	0.38
258	0.42
259	0.41
260	0.38
261	0.4
262	0.39
263	0.41
264	0.41
265	0.42
266	0.39
267	0.42
268	0.4
269	0.36
270	0.34
271	0.28
272	0.28
273	0.22
274	0.19
275	0.15
276	0.13
277	0.14
278	0.11
279	0.12
280	0.14
281	0.13
282	0.15
283	0.15
284	0.16
285	0.17
286	0.17
287	0.16
288	0.14
289	0.13
290	0.11
291	0.13
292	0.14
293	0.16
294	0.2
295	0.2
296	0.23
297	0.23
298	0.23
299	0.23
300	0.2
301	0.18
302	0.17
303	0.18
304	0.15
305	0.14
306	0.14
307	0.12
308	0.14
309	0.12
310	0.08
311	0.06
312	0.06
313	0.06
314	0.06
315	0.06
316	0.04
317	0.04
318	0.05
319	0.04
320	0.04
321	0.04
322	0.04
323	0.03
324	0.03
325	0.04
326	0.05
327	0.05
328	0.05
329	0.06
330	0.05
331	0.07
332	0.08
333	0.13
334	0.14
335	0.18
336	0.25
337	0.31
338	0.32
339	0.35
340	0.39
341	0.41
342	0.43
343	0.41
344	0.37
345	0.37
346	0.35
347	0.31
348	0.27
349	0.21
350	0.16
351	0.15
352	0.12
353	0.08
354	0.08
355	0.08
356	0.07
357	0.05
358	0.05
359	0.04
360	0.04
361	0.04
362	0.05
363	0.06
364	0.07
365	0.08
366	0.13
367	0.15
368	0.18
369	0.19
370	0.25
371	0.35
372	0.42
373	0.52
374	0.58
375	0.66
376	0.71
377	0.77
378	0.78
379	0.78
380	0.76
381	0.74
382	0.73
383	0.67
384	0.6
385	0.56
386	0.49
387	0.41
388	0.35
389	0.26
390	0.18
391	0.15
392	0.14
393	0.11
394	0.1
395	0.09
396	0.1
397	0.09
398	0.09
399	0.09
400	0.08
401	0.1
402	0.1
403	0.1
404	0.1
405	0.13
406	0.13
407	0.17
408	0.18
409	0.18
410	0.19
411	0.18
412	0.17
413	0.13
414	0.11
415	0.08
416	0.07
417	0.06
418	0.06
419	0.07
420	0.08
421	0.1
422	0.11
423	0.15
424	0.18
425	0.18
426	0.19
427	0.19
428	0.18
429	0.16
430	0.22
431	0.22
432	0.27
433	0.31
434	0.31
435	0.33
436	0.36
437	0.41
438	0.39
439	0.37
440	0.32
441	0.34
442	0.35
443	0.32
444	0.3
445	0.25
446	0.21
447	0.18
448	0.16
449	0.08
450	0.07
451	0.07
452	0.12
453	0.12
454	0.14
455	0.14
456	0.16
457	0.19
458	0.2
459	0.3
460	0.28
461	0.31
462	0.31
463	0.34
464	0.31
465	0.3
466	0.3
467	0.25
468	0.31
469	0.33
470	0.38
471	0.42
472	0.49
473	0.5
474	0.56
475	0.59
476	0.56
477	0.55
478	0.59
479	0.6
480	0.64
481	0.66
482	0.69
483	0.7
484	0.71
485	0.72
486	0.73
487	0.74
488	0.74
489	0.81
490	0.83
491	0.81
492	0.81
493	0.81
494	0.76
495	0.7
496	0.68
497	0.63
498	0.54
499	0.5
500	0.45
501	0.41
502	0.38
503	0.33
504	0.28
505	0.24
506	0.23
507	0.21
508	0.19
509	0.16
510	0.15
511	0.14
512	0.1
513	0.08
514	0.07
515	0.06
516	0.06
517	0.06
518	0.08
519	0.1
520	0.09
521	0.1
522	0.09
523	0.1
524	0.1
525	0.11
526	0.1
527	0.13
528	0.14
529	0.15
530	0.2
531	0.22
532	0.25
533	0.24
534	0.3
535	0.3
536	0.36
537	0.39
538	0.42
539	0.47
540	0.48
541	0.53
542	0.53
543	0.52
544	0.5
545	0.53
546	0.54
547	0.54
548	0.59
549	0.56
550	0.58
551	0.54
552	0.5
553	0.43
554	0.36
555	0.34
556	0.31
557	0.33
558	0.34
559	0.39
560	0.41
561	0.44
562	0.43
563	0.4
564	0.36
565	0.3
566	0.25
567	0.21

G3B6C5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer