FuNGI

A0A1G4MJJ8

Protein Details

Accession

A0A1G4MJJ8

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-29	MAPKKRTKLSSFRTKGRAKRQDTENDRHD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
13-17	RTKGR

Subcellular Location(s)

nucl 18.5, mito_nucl 13.666, cyto_nucl 10.833, mito 7.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043954 Snu56_snRNP
Gene Ontology	GO:0003729 F:mRNA binding GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome
Pfam	View protein in Pfam PF19097 Snu56_snRNP

Amino Acid Sequences

MAPKKRTKLSSFRTKGRAKRQDTENDRHDDLMGSLQILKKKYPALEKTLANGHVFVPLLRGSDANSFDGLISAASGISGNYTVVSDEDGVSYFYCSNFNVLDCAFVLTLIFSKSDNRFSKTGSALSFERVPKGTAIRGSFFVYRSCDLSLLRYNSTAKRDVVQEKNLFNTHISVSRVVDIAEFREVSVMNYGFSRFLHSVVDALKGIKFRWAPVKINNIFAQNFKSYKCSSQMVLDEIPFASEGLLIDRQQILKQNLEAFEKTKSALEQFAKSVLEPDEGEENLEKEKARHFAAENSKLQPANPRQSSSRLNRGNQPFNKEPTGHTRYTGSSYLTHDEIKEYCVATIHATLEAVKRKSSYQILKTYIKCPRQYYIDIVYDNLNQLRSETNCNIVVLNLNNVHESTSWFDSLDLSKYTTVSTPHPSTVKVVSVGGIGEHNLKALQMLLDLIQNSQKS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.83
2	0.84
3	0.85
4	0.85
5	0.81
6	0.82
7	0.82
8	0.83
9	0.83
10	0.83
11	0.79
12	0.75
13	0.69
14	0.6
15	0.52
16	0.42
17	0.34
18	0.29
19	0.21
20	0.16
21	0.17
22	0.2
23	0.23
24	0.24
25	0.24
26	0.24
27	0.29
28	0.34
29	0.41
30	0.43
31	0.47
32	0.53
33	0.53
34	0.53
35	0.55
36	0.51
37	0.42
38	0.37
39	0.29
40	0.25
41	0.23
42	0.19
43	0.15
44	0.14
45	0.14
46	0.14
47	0.14
48	0.13
49	0.18
50	0.2
51	0.19
52	0.18
53	0.17
54	0.16
55	0.17
56	0.14
57	0.09
58	0.07
59	0.05
60	0.05
61	0.04
62	0.05
63	0.04
64	0.05
65	0.05
66	0.05
67	0.05
68	0.05
69	0.06
70	0.06
71	0.07
72	0.07
73	0.07
74	0.08
75	0.08
76	0.09
77	0.09
78	0.1
79	0.09
80	0.09
81	0.1
82	0.1
83	0.11
84	0.11
85	0.12
86	0.12
87	0.12
88	0.12
89	0.11
90	0.12
91	0.1
92	0.09
93	0.09
94	0.07
95	0.08
96	0.08
97	0.08
98	0.07
99	0.12
100	0.15
101	0.25
102	0.28
103	0.31
104	0.32
105	0.33
106	0.39
107	0.36
108	0.38
109	0.29
110	0.29
111	0.26
112	0.27
113	0.31
114	0.26
115	0.26
116	0.23
117	0.23
118	0.21
119	0.23
120	0.23
121	0.22
122	0.23
123	0.22
124	0.23
125	0.25
126	0.25
127	0.24
128	0.23
129	0.22
130	0.21
131	0.2
132	0.19
133	0.18
134	0.16
135	0.19
136	0.24
137	0.23
138	0.23
139	0.23
140	0.26
141	0.28
142	0.32
143	0.31
144	0.26
145	0.25
146	0.3
147	0.36
148	0.38
149	0.42
150	0.43
151	0.4
152	0.43
153	0.41
154	0.36
155	0.29
156	0.25
157	0.19
158	0.18
159	0.18
160	0.16
161	0.16
162	0.16
163	0.16
164	0.14
165	0.13
166	0.1
167	0.1
168	0.1
169	0.09
170	0.08
171	0.09
172	0.09
173	0.08
174	0.11
175	0.1
176	0.09
177	0.09
178	0.1
179	0.09
180	0.09
181	0.13
182	0.1
183	0.11
184	0.11
185	0.11
186	0.12
187	0.12
188	0.13
189	0.09
190	0.1
191	0.1
192	0.11
193	0.11
194	0.14
195	0.13
196	0.14
197	0.22
198	0.26
199	0.27
200	0.32
201	0.42
202	0.39
203	0.42
204	0.42
205	0.36
206	0.33
207	0.31
208	0.28
209	0.21
210	0.21
211	0.18
212	0.2
213	0.18
214	0.2
215	0.22
216	0.2
217	0.18
218	0.21
219	0.22
220	0.2
221	0.2
222	0.18
223	0.15
224	0.13
225	0.13
226	0.09
227	0.08
228	0.05
229	0.04
230	0.04
231	0.05
232	0.07
233	0.07
234	0.08
235	0.09
236	0.09
237	0.1
238	0.16
239	0.16
240	0.17
241	0.18
242	0.2
243	0.2
244	0.23
245	0.22
246	0.17
247	0.17
248	0.17
249	0.16
250	0.14
251	0.13
252	0.12
253	0.16
254	0.17
255	0.17
256	0.17
257	0.19
258	0.18
259	0.17
260	0.18
261	0.14
262	0.13
263	0.11
264	0.12
265	0.12
266	0.12
267	0.13
268	0.11
269	0.11
270	0.1
271	0.11
272	0.1
273	0.09
274	0.12
275	0.15
276	0.15
277	0.18
278	0.18
279	0.25
280	0.34
281	0.4
282	0.4
283	0.39
284	0.41
285	0.39
286	0.38
287	0.39
288	0.37
289	0.4
290	0.39
291	0.4
292	0.39
293	0.45
294	0.53
295	0.5
296	0.53
297	0.5
298	0.51
299	0.57
300	0.62
301	0.66
302	0.62
303	0.64
304	0.59
305	0.57
306	0.57
307	0.5
308	0.45
309	0.44
310	0.46
311	0.39
312	0.35
313	0.33
314	0.31
315	0.34
316	0.33
317	0.25
318	0.22
319	0.24
320	0.26
321	0.25
322	0.24
323	0.2
324	0.21
325	0.19
326	0.18
327	0.17
328	0.15
329	0.13
330	0.13
331	0.13
332	0.12
333	0.14
334	0.13
335	0.11
336	0.11
337	0.12
338	0.16
339	0.23
340	0.22
341	0.22
342	0.22
343	0.23
344	0.29
345	0.36
346	0.4
347	0.4
348	0.47
349	0.52
350	0.59
351	0.61
352	0.63
353	0.64
354	0.62
355	0.6
356	0.56
357	0.55
358	0.53
359	0.54
360	0.51
361	0.49
362	0.47
363	0.42
364	0.39
365	0.36
366	0.31
367	0.3
368	0.26
369	0.2
370	0.15
371	0.15
372	0.19
373	0.19
374	0.25
375	0.24
376	0.27
377	0.28
378	0.28
379	0.27
380	0.23
381	0.25
382	0.19
383	0.22
384	0.2
385	0.19
386	0.2
387	0.2
388	0.2
389	0.17
390	0.18
391	0.18
392	0.18
393	0.18
394	0.18
395	0.18
396	0.19
397	0.21
398	0.22
399	0.18
400	0.17
401	0.18
402	0.18
403	0.19
404	0.19
405	0.2
406	0.21
407	0.28
408	0.29
409	0.34
410	0.35
411	0.35
412	0.36
413	0.37
414	0.35
415	0.29
416	0.25
417	0.21
418	0.2
419	0.19
420	0.16
421	0.13
422	0.11
423	0.13
424	0.12
425	0.12
426	0.11
427	0.11
428	0.11
429	0.11
430	0.1
431	0.08
432	0.09
433	0.09
434	0.12
435	0.12
436	0.14

A0A1G4MJJ8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer