Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1S8BPA9

Protein Details
Accession A0A1S8BPA9    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
25-47GYADRGNPHKRARDNNNNNHNSSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
9-19RGGRNAKRPRP
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 11, cyto 5.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR014720  dsRBD_dom  
IPR000999  RNase_III_dom  
IPR036389  RNase_III_sf  
Gene Ontology GO:0004525  F:ribonuclease III activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006396  P:RNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF00636  Ribonuclease_3  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50137  DS_RBD  
PS50142  RNASE_3_2  
CDD cd00593  RIBOc  
Amino Acid Sequences MNHNGGGHRGGRNAKRPRPDGSHHGYADRGNPHKRARDNNNNNHNSSNSKKNNNNSSNNNSQPPIPSAPNLNAITSLPTPLPPLPPINDPATARLAFTHTSVTNYQTETYDRLEWYGDSVIEMAATDLLWDTYPTLPGGRLSQMREALVNNTRLASFARGYGFDNIIAVDNHHNHNKDPNPNPAPPPPTYRLRIDPATWAASRNRPAEVKILGDVFEAYIGAIALEDRRDNQLRNPATTITFDRVKPLLRALWTPLLLPVPTFADEDERAQDAVKAAAARAFAPSGSGLKAWYEDVGDMGYENKAQQRFRVAYCVRGWWGENEDDKLKLGEGVGQSKKVARARAARDALGRRETVPEVRELAGRVEAYLAGKRAKREEAEAEKAAVAVAAKAGQVEAGEEGEDEAEGDGQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.64
2 0.69
3 0.71
4 0.73
5 0.73
6 0.72
7 0.71
8 0.69
9 0.7
10 0.62
11 0.6
12 0.54
13 0.48
14 0.48
15 0.46
16 0.46
17 0.43
18 0.49
19 0.54
20 0.61
21 0.66
22 0.69
23 0.72
24 0.75
25 0.8
26 0.84
27 0.87
28 0.84
29 0.79
30 0.72
31 0.64
32 0.59
33 0.54
34 0.54
35 0.51
36 0.54
37 0.59
38 0.65
39 0.74
40 0.76
41 0.79
42 0.76
43 0.76
44 0.76
45 0.74
46 0.69
47 0.59
48 0.52
49 0.46
50 0.43
51 0.4
52 0.33
53 0.3
54 0.3
55 0.31
56 0.37
57 0.34
58 0.3
59 0.26
60 0.24
61 0.26
62 0.22
63 0.21
64 0.14
65 0.13
66 0.16
67 0.17
68 0.19
69 0.18
70 0.21
71 0.22
72 0.24
73 0.28
74 0.27
75 0.3
76 0.28
77 0.28
78 0.29
79 0.27
80 0.24
81 0.21
82 0.21
83 0.18
84 0.18
85 0.19
86 0.14
87 0.18
88 0.19
89 0.21
90 0.2
91 0.21
92 0.21
93 0.18
94 0.2
95 0.19
96 0.21
97 0.2
98 0.18
99 0.18
100 0.17
101 0.16
102 0.16
103 0.15
104 0.12
105 0.09
106 0.09
107 0.08
108 0.07
109 0.07
110 0.05
111 0.04
112 0.04
113 0.03
114 0.03
115 0.04
116 0.04
117 0.04
118 0.06
119 0.06
120 0.07
121 0.07
122 0.08
123 0.08
124 0.09
125 0.11
126 0.13
127 0.16
128 0.17
129 0.21
130 0.22
131 0.22
132 0.22
133 0.21
134 0.22
135 0.23
136 0.23
137 0.19
138 0.18
139 0.18
140 0.17
141 0.17
142 0.15
143 0.11
144 0.12
145 0.12
146 0.13
147 0.14
148 0.16
149 0.15
150 0.13
151 0.12
152 0.1
153 0.1
154 0.09
155 0.09
156 0.1
157 0.12
158 0.14
159 0.18
160 0.18
161 0.18
162 0.25
163 0.29
164 0.34
165 0.36
166 0.43
167 0.44
168 0.46
169 0.49
170 0.47
171 0.46
172 0.39
173 0.42
174 0.37
175 0.37
176 0.38
177 0.37
178 0.36
179 0.36
180 0.36
181 0.31
182 0.3
183 0.27
184 0.27
185 0.24
186 0.22
187 0.2
188 0.22
189 0.26
190 0.24
191 0.24
192 0.21
193 0.22
194 0.24
195 0.22
196 0.19
197 0.15
198 0.14
199 0.13
200 0.12
201 0.11
202 0.07
203 0.06
204 0.05
205 0.04
206 0.03
207 0.03
208 0.02
209 0.02
210 0.03
211 0.03
212 0.04
213 0.04
214 0.05
215 0.09
216 0.11
217 0.12
218 0.16
219 0.25
220 0.26
221 0.27
222 0.28
223 0.25
224 0.24
225 0.26
226 0.25
227 0.2
228 0.21
229 0.19
230 0.21
231 0.21
232 0.22
233 0.2
234 0.21
235 0.2
236 0.18
237 0.19
238 0.19
239 0.22
240 0.2
241 0.2
242 0.19
243 0.17
244 0.15
245 0.14
246 0.11
247 0.09
248 0.1
249 0.1
250 0.09
251 0.11
252 0.12
253 0.14
254 0.14
255 0.14
256 0.13
257 0.13
258 0.13
259 0.1
260 0.1
261 0.1
262 0.08
263 0.08
264 0.09
265 0.09
266 0.09
267 0.09
268 0.09
269 0.07
270 0.08
271 0.09
272 0.08
273 0.09
274 0.09
275 0.08
276 0.08
277 0.09
278 0.09
279 0.09
280 0.08
281 0.07
282 0.07
283 0.07
284 0.07
285 0.06
286 0.06
287 0.06
288 0.06
289 0.08
290 0.12
291 0.16
292 0.17
293 0.19
294 0.26
295 0.29
296 0.3
297 0.39
298 0.35
299 0.38
300 0.39
301 0.41
302 0.34
303 0.33
304 0.32
305 0.25
306 0.28
307 0.26
308 0.26
309 0.26
310 0.27
311 0.25
312 0.25
313 0.23
314 0.19
315 0.15
316 0.13
317 0.14
318 0.15
319 0.22
320 0.24
321 0.24
322 0.25
323 0.27
324 0.34
325 0.33
326 0.35
327 0.34
328 0.41
329 0.46
330 0.55
331 0.56
332 0.52
333 0.55
334 0.57
335 0.56
336 0.5
337 0.45
338 0.36
339 0.37
340 0.38
341 0.35
342 0.31
343 0.28
344 0.27
345 0.27
346 0.28
347 0.25
348 0.24
349 0.22
350 0.2
351 0.17
352 0.15
353 0.15
354 0.15
355 0.17
356 0.18
357 0.21
358 0.24
359 0.28
360 0.32
361 0.37
362 0.37
363 0.4
364 0.47
365 0.49
366 0.53
367 0.51
368 0.48
369 0.42
370 0.39
371 0.33
372 0.24
373 0.16
374 0.09
375 0.08
376 0.07
377 0.07
378 0.08
379 0.08
380 0.07
381 0.07
382 0.08
383 0.08
384 0.07
385 0.08
386 0.07
387 0.08
388 0.08
389 0.07
390 0.07