FuNGI

A0A0C4EHG5

Protein Details

Accession

A0A0C4EHG5

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
384-403	APGPRMVKKKKKPGLDDWLG	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
7-13	RGRGRGR
61-73	PAASKFKPRMVKR
91-112	GGAGGRGRGRGRGGGDRGGRGR
383-396	AAPGPRMVKKKKKP

Subcellular Location(s)

mito 14, nucl 8, cyto 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MPPRGSRGRGRGRAREPVEEKEAVLDPILNQLTDISVNESQPGTATSANRAAGPSGEGAKPAASKFKPRMVKRVAKVEPDAEEEDSGRTAGGAGGRGRGRGRGGGDRGGRGRAEIVMTASGAFAMGPAEASTRRTVQGPSRSGMRRIDNSIMPTDERSRTATSGTTTPWEGRPGEALELYSDIDEGGSDGPDDNFVDDDGRSKVADLNDITLEHSMAPLSLPWDPKRVAERERLVQARNEKLLKLAQTKLKKENTDLPNDSKPSSLPIRESTTTTTVSDSSVPLKDEHLNDQDENQKRDVKLKKEQLEEISNVGKQFTQRQPAIKKAPNPEPTSTSRAEAASSNGEAAATYYVFQFPRHFPQFRDPSNDVIGEEPPAEPQKAAAPGPRMVKKKKKPGLDDWLGWGKGGKRTEIMGVPPSETGDDSVQGQIGELVIRRSGRVQMIIANVAYDVLPGAKPTFHQEIAVIDPKPDSQLRAMFVLGSTQDKFIVVPDVSTLLKREQALAPTS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.78
2	0.78
3	0.71
4	0.69
5	0.66
6	0.57
7	0.5
8	0.43
9	0.4
10	0.31
11	0.26
12	0.2
13	0.14
14	0.2
15	0.21
16	0.16
17	0.15
18	0.14
19	0.15
20	0.15
21	0.15
22	0.14
23	0.16
24	0.16
25	0.18
26	0.18
27	0.17
28	0.16
29	0.17
30	0.14
31	0.15
32	0.17
33	0.19
34	0.23
35	0.24
36	0.24
37	0.23
38	0.21
39	0.18
40	0.19
41	0.17
42	0.16
43	0.16
44	0.15
45	0.15
46	0.16
47	0.18
48	0.18
49	0.24
50	0.23
51	0.31
52	0.36
53	0.45
54	0.53
55	0.55
56	0.64
57	0.65
58	0.72
59	0.7
60	0.75
61	0.72
62	0.68
63	0.67
64	0.61
65	0.53
66	0.48
67	0.45
68	0.35
69	0.3
70	0.25
71	0.23
72	0.19
73	0.16
74	0.11
75	0.08
76	0.07
77	0.08
78	0.08
79	0.11
80	0.11
81	0.17
82	0.17
83	0.2
84	0.21
85	0.22
86	0.23
87	0.23
88	0.26
89	0.29
90	0.31
91	0.36
92	0.38
93	0.4
94	0.4
95	0.39
96	0.35
97	0.28
98	0.26
99	0.2
100	0.18
101	0.14
102	0.13
103	0.11
104	0.11
105	0.1
106	0.09
107	0.07
108	0.06
109	0.05
110	0.04
111	0.04
112	0.03
113	0.03
114	0.04
115	0.06
116	0.06
117	0.09
118	0.11
119	0.12
120	0.14
121	0.15
122	0.18
123	0.25
124	0.33
125	0.34
126	0.34
127	0.4
128	0.42
129	0.44
130	0.46
131	0.44
132	0.39
133	0.4
134	0.43
135	0.37
136	0.37
137	0.35
138	0.31
139	0.26
140	0.25
141	0.25
142	0.23
143	0.22
144	0.23
145	0.23
146	0.22
147	0.22
148	0.21
149	0.19
150	0.19
151	0.19
152	0.17
153	0.17
154	0.18
155	0.18
156	0.19
157	0.18
158	0.16
159	0.17
160	0.17
161	0.17
162	0.15
163	0.14
164	0.11
165	0.11
166	0.11
167	0.08
168	0.07
169	0.05
170	0.05
171	0.04
172	0.04
173	0.04
174	0.04
175	0.04
176	0.04
177	0.05
178	0.06
179	0.06
180	0.05
181	0.05
182	0.05
183	0.06
184	0.06
185	0.08
186	0.08
187	0.09
188	0.08
189	0.09
190	0.12
191	0.11
192	0.15
193	0.13
194	0.14
195	0.14
196	0.14
197	0.14
198	0.11
199	0.11
200	0.08
201	0.07
202	0.05
203	0.05
204	0.04
205	0.04
206	0.05
207	0.08
208	0.11
209	0.12
210	0.16
211	0.16
212	0.19
213	0.24
214	0.26
215	0.28
216	0.32
217	0.35
218	0.35
219	0.41
220	0.41
221	0.37
222	0.36
223	0.38
224	0.34
225	0.34
226	0.31
227	0.25
228	0.25
229	0.26
230	0.25
231	0.24
232	0.25
233	0.27
234	0.33
235	0.37
236	0.43
237	0.45
238	0.43
239	0.42
240	0.47
241	0.44
242	0.45
243	0.44
244	0.41
245	0.4
246	0.41
247	0.38
248	0.29
249	0.25
250	0.22
251	0.22
252	0.19
253	0.17
254	0.19
255	0.23
256	0.24
257	0.25
258	0.24
259	0.23
260	0.23
261	0.22
262	0.19
263	0.15
264	0.14
265	0.14
266	0.12
267	0.11
268	0.11
269	0.12
270	0.11
271	0.13
272	0.16
273	0.16
274	0.2
275	0.21
276	0.22
277	0.21
278	0.23
279	0.29
280	0.3
281	0.31
282	0.29
283	0.3
284	0.29
285	0.37
286	0.41
287	0.4
288	0.44
289	0.51
290	0.55
291	0.55
292	0.57
293	0.54
294	0.51
295	0.45
296	0.38
297	0.31
298	0.26
299	0.22
300	0.19
301	0.16
302	0.13
303	0.2
304	0.22
305	0.27
306	0.29
307	0.36
308	0.4
309	0.47
310	0.54
311	0.51
312	0.53
313	0.53
314	0.6
315	0.6
316	0.6
317	0.55
318	0.52
319	0.52
320	0.5
321	0.45
322	0.36
323	0.31
324	0.26
325	0.25
326	0.2
327	0.18
328	0.15
329	0.14
330	0.13
331	0.11
332	0.1
333	0.09
334	0.09
335	0.07
336	0.05
337	0.05
338	0.06
339	0.08
340	0.09
341	0.1
342	0.14
343	0.16
344	0.25
345	0.32
346	0.33
347	0.34
348	0.43
349	0.51
350	0.51
351	0.56
352	0.49
353	0.45
354	0.46
355	0.44
356	0.34
357	0.27
358	0.24
359	0.16
360	0.15
361	0.12
362	0.12
363	0.13
364	0.13
365	0.12
366	0.12
367	0.15
368	0.18
369	0.19
370	0.2
371	0.22
372	0.26
373	0.33
374	0.4
375	0.43
376	0.5
377	0.59
378	0.65
379	0.72
380	0.75
381	0.77
382	0.78
383	0.8
384	0.81
385	0.77
386	0.69
387	0.64
388	0.64
389	0.54
390	0.46
391	0.39
392	0.32
393	0.31
394	0.31
395	0.26
396	0.21
397	0.22
398	0.26
399	0.26
400	0.26
401	0.25
402	0.25
403	0.24
404	0.23
405	0.22
406	0.19
407	0.17
408	0.16
409	0.12
410	0.12
411	0.12
412	0.13
413	0.13
414	0.11
415	0.11
416	0.09
417	0.08
418	0.09
419	0.08
420	0.09
421	0.11
422	0.11
423	0.12
424	0.14
425	0.18
426	0.2
427	0.21
428	0.21
429	0.23
430	0.25
431	0.26
432	0.24
433	0.2
434	0.17
435	0.15
436	0.14
437	0.09
438	0.07
439	0.06
440	0.06
441	0.07
442	0.09
443	0.09
444	0.1
445	0.17
446	0.22
447	0.21
448	0.22
449	0.22
450	0.24
451	0.29
452	0.34
453	0.28
454	0.23
455	0.23
456	0.23
457	0.27
458	0.25
459	0.22
460	0.21
461	0.26
462	0.27
463	0.28
464	0.28
465	0.24
466	0.22
467	0.22
468	0.19
469	0.18
470	0.17
471	0.16
472	0.16
473	0.16
474	0.16
475	0.15
476	0.19
477	0.15
478	0.14
479	0.15
480	0.17
481	0.18
482	0.19
483	0.2
484	0.17
485	0.21
486	0.22
487	0.25
488	0.26

A0A0C4EHG5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer