Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1S8B6A3

Protein Details
Accession A0A1S8B6A3    Localization Confidence Medium Confidence Score 11
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
259-287EPPAQARPKSPERRERSKSPVKTVREAKEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
264-278ARPKSPERRERSKSP
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto_nucl 10.833, mito_nucl 8.833, cyto 7.5, mito 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020103  PsdUridine_synth_cat_dom_sf  
IPR014780  tRNA_psdUridine_synth_TruB  
Gene Ontology GO:0009982  F:pseudouridine synthase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0001522  P:pseudouridine synthesis  
Amino Acid Sequences MEERPVSVYKLELVDWFAPGTHGWRYPKEEMEGTKEEKEVALKASSSGAPKNATVVEGEGKGEGEDSAAAAAAAAAAGEKRKRDEGDATEEIPEKKTKMESGAEQPADATTTTTTTAETDDTPAKTSPAEKEEEEEEEEEKPTATPAEKSGSDDDDDGANAPAALIRMTVSSGFYVRTLCHDLGAAVDSLACMTSLVRTEQGDFELGKNVLEYEDLRAGEDVWGPKVKTLLEEWTARQQQQDEQQQQQQPSEQQRKSEEPPAQARPKSPERRERSKSPVKTVREAKEDDVPELD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.19
3 0.18
4 0.15
5 0.14
6 0.14
7 0.16
8 0.15
9 0.21
10 0.24
11 0.29
12 0.36
13 0.4
14 0.44
15 0.46
16 0.47
17 0.44
18 0.47
19 0.47
20 0.44
21 0.42
22 0.38
23 0.34
24 0.3
25 0.29
26 0.23
27 0.2
28 0.17
29 0.15
30 0.15
31 0.18
32 0.19
33 0.2
34 0.2
35 0.21
36 0.21
37 0.2
38 0.22
39 0.2
40 0.18
41 0.16
42 0.16
43 0.15
44 0.14
45 0.14
46 0.12
47 0.12
48 0.11
49 0.11
50 0.08
51 0.06
52 0.05
53 0.05
54 0.05
55 0.04
56 0.04
57 0.03
58 0.03
59 0.03
60 0.02
61 0.02
62 0.02
63 0.03
64 0.06
65 0.08
66 0.1
67 0.13
68 0.17
69 0.19
70 0.22
71 0.28
72 0.29
73 0.36
74 0.37
75 0.35
76 0.34
77 0.35
78 0.32
79 0.28
80 0.25
81 0.17
82 0.16
83 0.17
84 0.16
85 0.18
86 0.2
87 0.22
88 0.27
89 0.34
90 0.32
91 0.3
92 0.29
93 0.24
94 0.22
95 0.19
96 0.13
97 0.06
98 0.07
99 0.08
100 0.08
101 0.08
102 0.07
103 0.08
104 0.08
105 0.08
106 0.1
107 0.12
108 0.12
109 0.14
110 0.14
111 0.13
112 0.13
113 0.14
114 0.15
115 0.15
116 0.17
117 0.15
118 0.17
119 0.18
120 0.19
121 0.18
122 0.16
123 0.14
124 0.12
125 0.13
126 0.11
127 0.1
128 0.08
129 0.07
130 0.07
131 0.07
132 0.07
133 0.08
134 0.11
135 0.11
136 0.13
137 0.14
138 0.15
139 0.15
140 0.14
141 0.13
142 0.1
143 0.1
144 0.08
145 0.07
146 0.06
147 0.05
148 0.04
149 0.04
150 0.04
151 0.04
152 0.04
153 0.04
154 0.04
155 0.05
156 0.05
157 0.05
158 0.05
159 0.06
160 0.06
161 0.07
162 0.07
163 0.07
164 0.1
165 0.14
166 0.13
167 0.13
168 0.13
169 0.12
170 0.12
171 0.13
172 0.09
173 0.05
174 0.05
175 0.05
176 0.04
177 0.04
178 0.04
179 0.03
180 0.03
181 0.04
182 0.06
183 0.07
184 0.08
185 0.09
186 0.1
187 0.11
188 0.12
189 0.12
190 0.12
191 0.12
192 0.14
193 0.14
194 0.13
195 0.12
196 0.11
197 0.1
198 0.1
199 0.1
200 0.09
201 0.13
202 0.13
203 0.13
204 0.13
205 0.13
206 0.13
207 0.16
208 0.14
209 0.13
210 0.16
211 0.16
212 0.17
213 0.18
214 0.17
215 0.16
216 0.17
217 0.2
218 0.21
219 0.23
220 0.25
221 0.33
222 0.36
223 0.35
224 0.35
225 0.32
226 0.33
227 0.4
228 0.48
229 0.44
230 0.46
231 0.53
232 0.56
233 0.56
234 0.53
235 0.48
236 0.45
237 0.5
238 0.55
239 0.49
240 0.5
241 0.54
242 0.58
243 0.59
244 0.6
245 0.55
246 0.53
247 0.58
248 0.62
249 0.65
250 0.61
251 0.61
252 0.6
253 0.65
254 0.68
255 0.7
256 0.71
257 0.71
258 0.79
259 0.83
260 0.83
261 0.83
262 0.83
263 0.81
264 0.81
265 0.82
266 0.78
267 0.8
268 0.8
269 0.78
270 0.74
271 0.7
272 0.63
273 0.62
274 0.57