Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1S8BJ06

Protein Details
Accession A0A1S8BJ06    Localization Confidence High Confidence Score 20.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
18-43HESLAAEKSQRKRKRKGDVDELEDVYHydrophilic
53-75REEAKRKAERGSKRQKKEDGEAABasic
447-472GLKLGGKKGKGKKGGKPTSRSSKRGABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
27-33QRKRKRK
50-69EEAREEAKRKAERGSKRQKK
274-281GKEVRKKK
345-358RKLRVVRAKGIKRN
390-417AAKLLGKAGAAKIKSAGRPEGKRDFKTR
442-482KQGKTGLKLGGKKGKGKKGGKPTSRSSKRGAAWKAAGGKKD
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 14.333, mito_nucl 10.666, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MPPAEDASSDEDAAIPVHESLAAEKSQRKRKRKGDVDELEDVYMRKLEKEEAREEAKRKAERGSKRQKKEDGEAAEVSGASEEDGEGASSDEDVRSDGGGDEDAESDSEIPQHETQTSRPKDETELEKASRTVFLGNVSIDAISEKSAKKTLIKHMSSFLSELPENKPPHKFDSIRFRSTPFSTFIPKKAAYATKEVMDETAHSTNAYVVYTTNQAAREAARRLNGTVVLNRHLRVDEVAHPAKTDHRRCVFVGNLSFVDDESMIQEAEAKRLGKEVRKKKEPGDVEEGLWRTFGKVGTVESVRVIRDPKTRVGKGFAYVQFTDENAVEAALLYNDKRFPPMLPRKLRVVRAKGIKRNKTNSATSTRPVSTKGVYNPKVSAEERSMQGRAAKLLGKAGAAKIKSAGRPEGKRDFKTREDKPANGMFKTPEQFVFEGHRATEKQGKTGLKLGGKKGKGKKGGKPTSRSSKRGAAWKAAGGKKD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.09
3 0.07
4 0.07
5 0.08
6 0.08
7 0.1
8 0.13
9 0.14
10 0.17
11 0.24
12 0.34
13 0.44
14 0.53
15 0.61
16 0.69
17 0.77
18 0.85
19 0.88
20 0.88
21 0.89
22 0.87
23 0.84
24 0.8
25 0.72
26 0.61
27 0.52
28 0.42
29 0.32
30 0.26
31 0.19
32 0.15
33 0.15
34 0.21
35 0.27
36 0.32
37 0.36
38 0.39
39 0.46
40 0.51
41 0.52
42 0.53
43 0.55
44 0.54
45 0.51
46 0.54
47 0.56
48 0.6
49 0.68
50 0.72
51 0.73
52 0.78
53 0.86
54 0.85
55 0.83
56 0.81
57 0.79
58 0.73
59 0.67
60 0.58
61 0.5
62 0.42
63 0.34
64 0.26
65 0.17
66 0.12
67 0.06
68 0.06
69 0.05
70 0.04
71 0.05
72 0.05
73 0.04
74 0.05
75 0.05
76 0.06
77 0.06
78 0.06
79 0.06
80 0.07
81 0.07
82 0.06
83 0.07
84 0.07
85 0.07
86 0.07
87 0.08
88 0.08
89 0.08
90 0.08
91 0.08
92 0.08
93 0.07
94 0.07
95 0.08
96 0.08
97 0.11
98 0.12
99 0.13
100 0.15
101 0.16
102 0.21
103 0.31
104 0.33
105 0.34
106 0.34
107 0.34
108 0.36
109 0.41
110 0.42
111 0.38
112 0.41
113 0.38
114 0.39
115 0.38
116 0.34
117 0.29
118 0.24
119 0.18
120 0.12
121 0.13
122 0.13
123 0.12
124 0.12
125 0.11
126 0.1
127 0.09
128 0.08
129 0.07
130 0.07
131 0.1
132 0.1
133 0.12
134 0.15
135 0.16
136 0.21
137 0.26
138 0.35
139 0.42
140 0.44
141 0.43
142 0.45
143 0.46
144 0.42
145 0.37
146 0.28
147 0.21
148 0.19
149 0.19
150 0.18
151 0.24
152 0.25
153 0.27
154 0.31
155 0.31
156 0.36
157 0.41
158 0.41
159 0.4
160 0.49
161 0.53
162 0.53
163 0.51
164 0.48
165 0.45
166 0.44
167 0.4
168 0.32
169 0.27
170 0.29
171 0.31
172 0.31
173 0.33
174 0.31
175 0.29
176 0.31
177 0.33
178 0.29
179 0.32
180 0.31
181 0.27
182 0.27
183 0.26
184 0.22
185 0.17
186 0.15
187 0.14
188 0.13
189 0.11
190 0.11
191 0.11
192 0.11
193 0.11
194 0.1
195 0.06
196 0.05
197 0.07
198 0.08
199 0.09
200 0.1
201 0.1
202 0.1
203 0.11
204 0.12
205 0.15
206 0.16
207 0.17
208 0.18
209 0.18
210 0.18
211 0.18
212 0.19
213 0.16
214 0.17
215 0.17
216 0.18
217 0.19
218 0.19
219 0.18
220 0.16
221 0.15
222 0.13
223 0.13
224 0.14
225 0.2
226 0.21
227 0.2
228 0.2
229 0.2
230 0.26
231 0.32
232 0.32
233 0.32
234 0.33
235 0.36
236 0.37
237 0.4
238 0.35
239 0.31
240 0.29
241 0.23
242 0.21
243 0.19
244 0.18
245 0.14
246 0.13
247 0.08
248 0.07
249 0.05
250 0.06
251 0.05
252 0.05
253 0.08
254 0.08
255 0.09
256 0.12
257 0.12
258 0.11
259 0.15
260 0.18
261 0.21
262 0.31
263 0.4
264 0.47
265 0.54
266 0.57
267 0.57
268 0.64
269 0.61
270 0.57
271 0.55
272 0.47
273 0.4
274 0.41
275 0.38
276 0.3
277 0.26
278 0.19
279 0.12
280 0.13
281 0.12
282 0.09
283 0.08
284 0.09
285 0.12
286 0.13
287 0.13
288 0.12
289 0.14
290 0.13
291 0.14
292 0.15
293 0.16
294 0.21
295 0.24
296 0.3
297 0.38
298 0.4
299 0.4
300 0.43
301 0.4
302 0.36
303 0.41
304 0.36
305 0.32
306 0.3
307 0.3
308 0.25
309 0.24
310 0.23
311 0.15
312 0.13
313 0.08
314 0.08
315 0.06
316 0.06
317 0.06
318 0.05
319 0.05
320 0.05
321 0.07
322 0.09
323 0.09
324 0.11
325 0.12
326 0.13
327 0.24
328 0.34
329 0.42
330 0.48
331 0.51
332 0.59
333 0.64
334 0.71
335 0.69
336 0.65
337 0.63
338 0.66
339 0.72
340 0.72
341 0.76
342 0.77
343 0.77
344 0.77
345 0.78
346 0.74
347 0.71
348 0.67
349 0.64
350 0.59
351 0.53
352 0.51
353 0.44
354 0.39
355 0.37
356 0.34
357 0.29
358 0.31
359 0.36
360 0.41
361 0.42
362 0.44
363 0.42
364 0.42
365 0.45
366 0.4
367 0.36
368 0.3
369 0.31
370 0.31
371 0.33
372 0.31
373 0.27
374 0.29
375 0.26
376 0.23
377 0.22
378 0.22
379 0.19
380 0.22
381 0.2
382 0.19
383 0.19
384 0.2
385 0.23
386 0.2
387 0.2
388 0.22
389 0.25
390 0.28
391 0.3
392 0.35
393 0.38
394 0.44
395 0.51
396 0.57
397 0.61
398 0.63
399 0.67
400 0.66
401 0.66
402 0.7
403 0.69
404 0.7
405 0.68
406 0.65
407 0.64
408 0.67
409 0.62
410 0.53
411 0.5
412 0.42
413 0.42
414 0.43
415 0.38
416 0.31
417 0.31
418 0.3
419 0.3
420 0.34
421 0.29
422 0.28
423 0.27
424 0.29
425 0.26
426 0.31
427 0.37
428 0.31
429 0.33
430 0.38
431 0.4
432 0.38
433 0.44
434 0.46
435 0.45
436 0.49
437 0.54
438 0.56
439 0.59
440 0.65
441 0.68
442 0.71
443 0.73
444 0.75
445 0.76
446 0.78
447 0.84
448 0.84
449 0.82
450 0.82
451 0.83
452 0.85
453 0.8
454 0.75
455 0.73
456 0.7
457 0.73
458 0.68
459 0.66
460 0.6
461 0.62
462 0.65