Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1S8B4W3

Protein Details
Accession A0A1S8B4W3    Localization Confidence High Confidence Score 22.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
113-141AEEEPVKKGRKPKKEKKEKDPNEPKRPLTBasic
265-290PTPPVENKTPKPKRRKTGKENGVVAAHydrophilic
335-358KETVEEPAKRKRGRKSKGAEEVAABasic
361-383AAEPAPEPEKKNKRKRKSEVATAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
118-138VKKGRKPKKEKKEKDPNEPKR
271-283NKTPKPKRRKTGK
319-378KPANTRKAAAKKEEAPKETVEEPAKRKRGRKSKGAEEVAAAAAAEPAPEPEKKNKRKRKS
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 13.5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MGRPRKEDKQQKETAELMISVEDFARTRDSVVTGLTTLQTAVSDLLRSYLKHTNSVLGSTPYRLDTFGISNPLNNNEILAGALRDSPPAAAGPATTAAPQPIAAPVAAPAAPAEEEPVKKGRKPKKEKKEKDPNEPKRPLTMYFLYSAQARPIVKEDLGPTVTPGAVEEEIKKRWRELGDEEKKAWQEVYNKNRDEYLKKIAEYKANKGEAEAAKSLADAAEAAEAAEADVEMAEGAATAAGATAEESSASEDESSDKEASPKAPTPPVENKTPKPKRRKTGKENGVVAASSAAAPAHTASPIPLPSHPKNAVESTPAKPANTRKAAAKKEEAPKETVEEPAKRKRGRKSKGAEEVAAAAAAEPAPEPEKKNKRKRKSEVATA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.61
2 0.52
3 0.42
4 0.33
5 0.25
6 0.21
7 0.15
8 0.13
9 0.11
10 0.09
11 0.1
12 0.13
13 0.12
14 0.14
15 0.15
16 0.17
17 0.16
18 0.17
19 0.17
20 0.14
21 0.15
22 0.14
23 0.12
24 0.11
25 0.1
26 0.09
27 0.08
28 0.09
29 0.08
30 0.09
31 0.08
32 0.11
33 0.13
34 0.13
35 0.18
36 0.24
37 0.24
38 0.28
39 0.29
40 0.32
41 0.32
42 0.33
43 0.31
44 0.28
45 0.27
46 0.25
47 0.25
48 0.21
49 0.21
50 0.19
51 0.18
52 0.16
53 0.18
54 0.19
55 0.22
56 0.21
57 0.22
58 0.24
59 0.26
60 0.25
61 0.21
62 0.19
63 0.13
64 0.13
65 0.11
66 0.09
67 0.07
68 0.06
69 0.08
70 0.08
71 0.08
72 0.08
73 0.08
74 0.08
75 0.08
76 0.08
77 0.06
78 0.06
79 0.07
80 0.08
81 0.08
82 0.08
83 0.09
84 0.08
85 0.09
86 0.09
87 0.08
88 0.08
89 0.08
90 0.07
91 0.07
92 0.07
93 0.08
94 0.08
95 0.08
96 0.06
97 0.07
98 0.07
99 0.07
100 0.09
101 0.11
102 0.11
103 0.14
104 0.2
105 0.22
106 0.25
107 0.35
108 0.42
109 0.49
110 0.6
111 0.69
112 0.74
113 0.83
114 0.9
115 0.91
116 0.93
117 0.9
118 0.91
119 0.91
120 0.91
121 0.9
122 0.86
123 0.76
124 0.71
125 0.66
126 0.56
127 0.51
128 0.43
129 0.33
130 0.29
131 0.28
132 0.22
133 0.21
134 0.19
135 0.14
136 0.15
137 0.13
138 0.12
139 0.15
140 0.16
141 0.15
142 0.16
143 0.16
144 0.16
145 0.17
146 0.16
147 0.13
148 0.12
149 0.12
150 0.1
151 0.09
152 0.08
153 0.07
154 0.08
155 0.1
156 0.13
157 0.17
158 0.2
159 0.2
160 0.19
161 0.23
162 0.24
163 0.24
164 0.28
165 0.36
166 0.41
167 0.43
168 0.43
169 0.42
170 0.41
171 0.37
172 0.31
173 0.23
174 0.23
175 0.29
176 0.37
177 0.42
178 0.42
179 0.42
180 0.45
181 0.44
182 0.39
183 0.35
184 0.34
185 0.29
186 0.29
187 0.33
188 0.32
189 0.37
190 0.37
191 0.38
192 0.37
193 0.36
194 0.36
195 0.31
196 0.35
197 0.29
198 0.3
199 0.24
200 0.18
201 0.16
202 0.16
203 0.16
204 0.09
205 0.08
206 0.04
207 0.04
208 0.03
209 0.03
210 0.03
211 0.03
212 0.03
213 0.03
214 0.03
215 0.02
216 0.02
217 0.02
218 0.02
219 0.02
220 0.02
221 0.02
222 0.02
223 0.02
224 0.02
225 0.02
226 0.02
227 0.02
228 0.02
229 0.02
230 0.02
231 0.03
232 0.03
233 0.03
234 0.03
235 0.05
236 0.05
237 0.05
238 0.05
239 0.05
240 0.07
241 0.08
242 0.11
243 0.1
244 0.11
245 0.12
246 0.14
247 0.15
248 0.19
249 0.21
250 0.22
251 0.26
252 0.27
253 0.33
254 0.41
255 0.43
256 0.47
257 0.5
258 0.53
259 0.59
260 0.69
261 0.71
262 0.73
263 0.79
264 0.8
265 0.85
266 0.89
267 0.89
268 0.89
269 0.9
270 0.88
271 0.82
272 0.73
273 0.63
274 0.52
275 0.41
276 0.3
277 0.21
278 0.11
279 0.08
280 0.06
281 0.04
282 0.05
283 0.06
284 0.06
285 0.06
286 0.06
287 0.07
288 0.1
289 0.12
290 0.14
291 0.17
292 0.25
293 0.28
294 0.36
295 0.38
296 0.37
297 0.4
298 0.41
299 0.39
300 0.37
301 0.38
302 0.32
303 0.38
304 0.38
305 0.34
306 0.36
307 0.42
308 0.47
309 0.48
310 0.48
311 0.48
312 0.56
313 0.63
314 0.64
315 0.64
316 0.62
317 0.66
318 0.72
319 0.67
320 0.6
321 0.55
322 0.52
323 0.46
324 0.44
325 0.41
326 0.4
327 0.44
328 0.51
329 0.59
330 0.61
331 0.67
332 0.71
333 0.76
334 0.77
335 0.8
336 0.79
337 0.81
338 0.85
339 0.83
340 0.73
341 0.64
342 0.58
343 0.48
344 0.38
345 0.27
346 0.17
347 0.11
348 0.1
349 0.08
350 0.06
351 0.07
352 0.1
353 0.13
354 0.18
355 0.28
356 0.39
357 0.5
358 0.61
359 0.7
360 0.79
361 0.87
362 0.93
363 0.93