Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1S8BJP4

Protein Details
Accession A0A1S8BJP4    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
105-124GVAPRAKMNQQRSRRFRAAQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
415-440KRRKETEDRREAAQKRRKLQEERRHG
1090-1114GGGGGGRGGGRRGGGRGGRGAYDRR
Subcellular Location(s) cyto_mito 10.333, cyto 10, mito 9.5, cyto_nucl 8.833, nucl 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027073  5_3_exoribonuclease  
IPR041412  Xrn1_helical  
IPR004859  Xrn1_N  
IPR017151  Xrn2/3/4  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004534  F:5'-3' RNA exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006353  P:DNA-templated transcription termination  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF17846  XRN_M  
PF03159  XRN_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
CDD cd18673  PIN_XRN1-2-like  
Amino Acid Sequences MGVPALFRWLSQKYPKIISPVVEAEPVEYPDGTVEPVDATKPNPNGEEMDNLYLDMNGIVHPCSHPEDKDPPENEEEMMIEIFKYTDRVVNMVRPRKLLMIAVDGVAPRAKMNQQRSRRFRAAQDAKQKDADAAEFAKMLASQNQKKGESENDDSAEAKIVKKTWDSNSITPGTPFMDILAQSLRYWCAYKLNTDPAWEKLKVIISDATVPGEGEHKIMEFVRSQRRSPYHDPNTRHVIYGLDADLIMLGLVTHEPHFRVLREDVFANDAKPRTCRRCGQVGHYADQCRGEIKKKEDDHDVKQNKVTKKPFIWLHVSILREYLAAELKVDSQGFPFDLERTLDDWVFMCFFVGNDFLPHLPSLEIREGGIDTLINIWRENLPIMGGYVTKDGHVDMSRAQVILQGLAKLEDGIFKRRKETEDRREAAQKRRKLQEERRHGGRFAQGGDGNQQNNSPTARKGSKKGETAENFANLPMFSPGELQSKEARALTHENFVNRKAIFQGSANVANANKSAAAALKEGLLGKKPETVSVAAGQDGSAEDVPVPDAPAEDATATPPSALGKRKAELLEDDSSTPGRNTPDAGPPAVKSDEPPEDTVKMWEDGYMDRYYEQKFHVDPADIEFRHQVARDYAEGLAWVLLYYLQGCASWTWYYPHHYAPFAQDFVDLDKMELKFEKGRPFRPYEQLMGVLPAASNHAIPSVFRPLMEEADSEIIDFYPEDFRVDLNGKKMAWQGVAILPFIDEKRLLDAMATKYPLLSPDEAARNEFGKEVLLFSTRHPLYEEVAQQWYSKKQGEPQHKLNPEVSDGLAGTVTKNDDYLPQSSLVFPLETKGMPDLEEDQSISVHYEMPKSKNVHKSQLLRGVEFPPPALTQDEIHGVRNRARHGGGGGGGRDRGFHSHNENRWQGGPPRHRGGGGGGGGGYNNGGGHHNNNHHHHNQNNNSNPNPNNPIAGFLNPNFDPQAFMQRGPGAGGGPPGGPAGVPPPPHLAAQMNGWQPPPPPQFGGAFPPMPAGYGGYGGPPQNGGGGGGGGGGYGYGGRRDDNYRPGGGGGGGGGGGGYGGRQDDSYRPDHGYGGGGGGGRGGDGYGGGGGGGGGRGGGRRGGGRGGRGAYDRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.53
3 0.55
4 0.54
5 0.5
6 0.47
7 0.44
8 0.4
9 0.37
10 0.33
11 0.28
12 0.27
13 0.26
14 0.21
15 0.17
16 0.15
17 0.14
18 0.14
19 0.13
20 0.1
21 0.09
22 0.09
23 0.1
24 0.12
25 0.13
26 0.15
27 0.21
28 0.25
29 0.28
30 0.28
31 0.29
32 0.31
33 0.32
34 0.35
35 0.31
36 0.3
37 0.27
38 0.26
39 0.24
40 0.2
41 0.18
42 0.12
43 0.09
44 0.07
45 0.08
46 0.08
47 0.09
48 0.1
49 0.12
50 0.18
51 0.22
52 0.22
53 0.28
54 0.36
55 0.42
56 0.51
57 0.5
58 0.49
59 0.5
60 0.49
61 0.43
62 0.35
63 0.29
64 0.22
65 0.2
66 0.15
67 0.1
68 0.09
69 0.09
70 0.08
71 0.1
72 0.09
73 0.13
74 0.13
75 0.17
76 0.2
77 0.28
78 0.37
79 0.44
80 0.47
81 0.45
82 0.46
83 0.45
84 0.44
85 0.39
86 0.32
87 0.29
88 0.27
89 0.25
90 0.24
91 0.21
92 0.21
93 0.18
94 0.15
95 0.1
96 0.13
97 0.19
98 0.26
99 0.37
100 0.46
101 0.55
102 0.66
103 0.74
104 0.8
105 0.81
106 0.78
107 0.74
108 0.76
109 0.75
110 0.74
111 0.77
112 0.73
113 0.68
114 0.66
115 0.6
116 0.5
117 0.42
118 0.34
119 0.26
120 0.22
121 0.19
122 0.17
123 0.16
124 0.15
125 0.13
126 0.14
127 0.17
128 0.24
129 0.3
130 0.37
131 0.43
132 0.44
133 0.45
134 0.47
135 0.48
136 0.46
137 0.46
138 0.44
139 0.4
140 0.39
141 0.39
142 0.36
143 0.33
144 0.26
145 0.22
146 0.2
147 0.2
148 0.22
149 0.25
150 0.31
151 0.31
152 0.4
153 0.44
154 0.44
155 0.49
156 0.49
157 0.46
158 0.4
159 0.36
160 0.28
161 0.23
162 0.19
163 0.13
164 0.13
165 0.12
166 0.13
167 0.14
168 0.14
169 0.13
170 0.15
171 0.15
172 0.14
173 0.16
174 0.15
175 0.21
176 0.21
177 0.26
178 0.3
179 0.37
180 0.37
181 0.39
182 0.41
183 0.38
184 0.42
185 0.38
186 0.33
187 0.28
188 0.33
189 0.29
190 0.29
191 0.26
192 0.21
193 0.24
194 0.24
195 0.21
196 0.16
197 0.15
198 0.13
199 0.13
200 0.12
201 0.09
202 0.09
203 0.08
204 0.1
205 0.1
206 0.12
207 0.13
208 0.2
209 0.3
210 0.33
211 0.35
212 0.42
213 0.47
214 0.53
215 0.58
216 0.62
217 0.62
218 0.67
219 0.71
220 0.68
221 0.72
222 0.64
223 0.57
224 0.46
225 0.37
226 0.3
227 0.27
228 0.21
229 0.13
230 0.11
231 0.1
232 0.09
233 0.08
234 0.06
235 0.03
236 0.03
237 0.03
238 0.03
239 0.04
240 0.06
241 0.07
242 0.08
243 0.11
244 0.14
245 0.14
246 0.18
247 0.2
248 0.22
249 0.23
250 0.23
251 0.21
252 0.23
253 0.23
254 0.19
255 0.21
256 0.21
257 0.2
258 0.24
259 0.32
260 0.35
261 0.41
262 0.47
263 0.48
264 0.55
265 0.58
266 0.59
267 0.6
268 0.57
269 0.55
270 0.54
271 0.5
272 0.41
273 0.39
274 0.32
275 0.26
276 0.25
277 0.28
278 0.3
279 0.34
280 0.41
281 0.44
282 0.47
283 0.54
284 0.57
285 0.57
286 0.6
287 0.6
288 0.53
289 0.55
290 0.59
291 0.55
292 0.57
293 0.56
294 0.53
295 0.51
296 0.56
297 0.55
298 0.52
299 0.53
300 0.46
301 0.46
302 0.43
303 0.41
304 0.34
305 0.3
306 0.25
307 0.18
308 0.16
309 0.12
310 0.11
311 0.09
312 0.1
313 0.1
314 0.1
315 0.12
316 0.12
317 0.1
318 0.09
319 0.1
320 0.09
321 0.1
322 0.1
323 0.09
324 0.11
325 0.11
326 0.12
327 0.12
328 0.14
329 0.12
330 0.12
331 0.11
332 0.11
333 0.1
334 0.09
335 0.08
336 0.06
337 0.06
338 0.07
339 0.07
340 0.07
341 0.06
342 0.08
343 0.08
344 0.08
345 0.09
346 0.08
347 0.08
348 0.08
349 0.11
350 0.12
351 0.12
352 0.11
353 0.12
354 0.11
355 0.11
356 0.1
357 0.07
358 0.05
359 0.07
360 0.09
361 0.09
362 0.09
363 0.1
364 0.1
365 0.11
366 0.11
367 0.09
368 0.07
369 0.07
370 0.07
371 0.07
372 0.07
373 0.07
374 0.08
375 0.08
376 0.08
377 0.08
378 0.08
379 0.1
380 0.1
381 0.1
382 0.1
383 0.13
384 0.13
385 0.13
386 0.13
387 0.12
388 0.12
389 0.13
390 0.12
391 0.09
392 0.09
393 0.09
394 0.09
395 0.07
396 0.07
397 0.09
398 0.11
399 0.18
400 0.24
401 0.24
402 0.28
403 0.31
404 0.35
405 0.41
406 0.5
407 0.53
408 0.58
409 0.6
410 0.59
411 0.65
412 0.67
413 0.68
414 0.66
415 0.61
416 0.58
417 0.64
418 0.68
419 0.69
420 0.74
421 0.74
422 0.76
423 0.76
424 0.76
425 0.71
426 0.64
427 0.57
428 0.5
429 0.41
430 0.32
431 0.29
432 0.22
433 0.2
434 0.23
435 0.23
436 0.19
437 0.18
438 0.17
439 0.14
440 0.15
441 0.16
442 0.14
443 0.12
444 0.18
445 0.23
446 0.26
447 0.32
448 0.38
449 0.43
450 0.46
451 0.49
452 0.52
453 0.48
454 0.49
455 0.45
456 0.38
457 0.32
458 0.27
459 0.24
460 0.15
461 0.13
462 0.09
463 0.07
464 0.06
465 0.07
466 0.09
467 0.13
468 0.13
469 0.15
470 0.16
471 0.17
472 0.18
473 0.18
474 0.16
475 0.14
476 0.19
477 0.19
478 0.22
479 0.22
480 0.24
481 0.24
482 0.25
483 0.26
484 0.21
485 0.2
486 0.16
487 0.16
488 0.14
489 0.13
490 0.15
491 0.14
492 0.15
493 0.15
494 0.14
495 0.13
496 0.13
497 0.12
498 0.1
499 0.07
500 0.05
501 0.06
502 0.06
503 0.07
504 0.07
505 0.07
506 0.07
507 0.08
508 0.08
509 0.08
510 0.09
511 0.09
512 0.09
513 0.13
514 0.13
515 0.13
516 0.14
517 0.14
518 0.14
519 0.15
520 0.15
521 0.11
522 0.11
523 0.1
524 0.08
525 0.07
526 0.07
527 0.04
528 0.04
529 0.04
530 0.04
531 0.05
532 0.04
533 0.05
534 0.04
535 0.04
536 0.04
537 0.04
538 0.05
539 0.04
540 0.04
541 0.05
542 0.06
543 0.06
544 0.05
545 0.05
546 0.06
547 0.09
548 0.12
549 0.15
550 0.17
551 0.18
552 0.21
553 0.22
554 0.22
555 0.2
556 0.22
557 0.2
558 0.19
559 0.18
560 0.16
561 0.15
562 0.15
563 0.13
564 0.1
565 0.09
566 0.08
567 0.1
568 0.12
569 0.17
570 0.18
571 0.19
572 0.18
573 0.17
574 0.2
575 0.19
576 0.16
577 0.12
578 0.14
579 0.17
580 0.18
581 0.19
582 0.18
583 0.19
584 0.19
585 0.19
586 0.17
587 0.14
588 0.12
589 0.11
590 0.1
591 0.1
592 0.12
593 0.12
594 0.1
595 0.1
596 0.13
597 0.13
598 0.14
599 0.14
600 0.14
601 0.14
602 0.16
603 0.17
604 0.16
605 0.15
606 0.17
607 0.23
608 0.2
609 0.2
610 0.19
611 0.18
612 0.18
613 0.18
614 0.16
615 0.1
616 0.12
617 0.12
618 0.13
619 0.12
620 0.11
621 0.1
622 0.09
623 0.07
624 0.05
625 0.05
626 0.03
627 0.03
628 0.03
629 0.03
630 0.04
631 0.04
632 0.04
633 0.04
634 0.05
635 0.07
636 0.07
637 0.08
638 0.1
639 0.12
640 0.16
641 0.18
642 0.22
643 0.21
644 0.22
645 0.22
646 0.25
647 0.26
648 0.22
649 0.2
650 0.16
651 0.15
652 0.16
653 0.17
654 0.12
655 0.1
656 0.13
657 0.13
658 0.14
659 0.14
660 0.14
661 0.17
662 0.21
663 0.3
664 0.3
665 0.36
666 0.4
667 0.47
668 0.49
669 0.5
670 0.5
671 0.43
672 0.4
673 0.36
674 0.31
675 0.25
676 0.21
677 0.14
678 0.11
679 0.08
680 0.08
681 0.06
682 0.06
683 0.05
684 0.06
685 0.06
686 0.07
687 0.09
688 0.14
689 0.14
690 0.14
691 0.16
692 0.16
693 0.18
694 0.18
695 0.16
696 0.11
697 0.13
698 0.13
699 0.1
700 0.09
701 0.07
702 0.07
703 0.07
704 0.06
705 0.07
706 0.07
707 0.08
708 0.08
709 0.08
710 0.11
711 0.14
712 0.15
713 0.16
714 0.18
715 0.17
716 0.2
717 0.22
718 0.2
719 0.18
720 0.16
721 0.15
722 0.15
723 0.16
724 0.14
725 0.12
726 0.1
727 0.11
728 0.11
729 0.1
730 0.08
731 0.07
732 0.1
733 0.11
734 0.1
735 0.09
736 0.14
737 0.16
738 0.19
739 0.19
740 0.16
741 0.16
742 0.16
743 0.18
744 0.16
745 0.13
746 0.12
747 0.16
748 0.21
749 0.22
750 0.23
751 0.22
752 0.21
753 0.2
754 0.19
755 0.14
756 0.1
757 0.1
758 0.1
759 0.1
760 0.11
761 0.11
762 0.12
763 0.21
764 0.19
765 0.2
766 0.21
767 0.21
768 0.21
769 0.25
770 0.27
771 0.2
772 0.22
773 0.22
774 0.22
775 0.23
776 0.24
777 0.23
778 0.23
779 0.22
780 0.27
781 0.35
782 0.45
783 0.51
784 0.56
785 0.62
786 0.63
787 0.64
788 0.59
789 0.52
790 0.44
791 0.37
792 0.29
793 0.2
794 0.17
795 0.14
796 0.11
797 0.1
798 0.08
799 0.07
800 0.08
801 0.07
802 0.08
803 0.08
804 0.11
805 0.14
806 0.15
807 0.15
808 0.16
809 0.16
810 0.16
811 0.17
812 0.14
813 0.12
814 0.1
815 0.1
816 0.11
817 0.1
818 0.11
819 0.11
820 0.1
821 0.1
822 0.12
823 0.15
824 0.14
825 0.15
826 0.14
827 0.13
828 0.13
829 0.13
830 0.12
831 0.09
832 0.1
833 0.1
834 0.16
835 0.2
836 0.23
837 0.29
838 0.33
839 0.4
840 0.47
841 0.51
842 0.55
843 0.58
844 0.62
845 0.63
846 0.68
847 0.63
848 0.54
849 0.52
850 0.47
851 0.42
852 0.36
853 0.28
854 0.21
855 0.2
856 0.19
857 0.18
858 0.16
859 0.13
860 0.15
861 0.2
862 0.19
863 0.22
864 0.26
865 0.26
866 0.29
867 0.33
868 0.33
869 0.31
870 0.31
871 0.28
872 0.25
873 0.25
874 0.24
875 0.23
876 0.22
877 0.19
878 0.2
879 0.18
880 0.18
881 0.17
882 0.17
883 0.16
884 0.19
885 0.26
886 0.34
887 0.4
888 0.47
889 0.48
890 0.47
891 0.47
892 0.48
893 0.47
894 0.48
895 0.51
896 0.51
897 0.54
898 0.53
899 0.51
900 0.47
901 0.42
902 0.39
903 0.31
904 0.24
905 0.18
906 0.17
907 0.16
908 0.15
909 0.12
910 0.05
911 0.05
912 0.05
913 0.07
914 0.08
915 0.12
916 0.19
917 0.26
918 0.33
919 0.38
920 0.44
921 0.49
922 0.54
923 0.55
924 0.59
925 0.62
926 0.64
927 0.68
928 0.67
929 0.64
930 0.64
931 0.61
932 0.57
933 0.54
934 0.45
935 0.4
936 0.34
937 0.35
938 0.3
939 0.31
940 0.28
941 0.23
942 0.28
943 0.25
944 0.26
945 0.23
946 0.21
947 0.22
948 0.19
949 0.28
950 0.24
951 0.24
952 0.26
953 0.26
954 0.26
955 0.24
956 0.24
957 0.14
958 0.13
959 0.14
960 0.12
961 0.1
962 0.11
963 0.1
964 0.09
965 0.08
966 0.07
967 0.1
968 0.13
969 0.14
970 0.16
971 0.21
972 0.23
973 0.23
974 0.25
975 0.24
976 0.21
977 0.24
978 0.29
979 0.27
980 0.27
981 0.28
982 0.27
983 0.26
984 0.34
985 0.34
986 0.31
987 0.3
988 0.31
989 0.33
990 0.34
991 0.39
992 0.34
993 0.3
994 0.27
995 0.27
996 0.25
997 0.23
998 0.21
999 0.15
1000 0.11
1001 0.11
1002 0.11
1003 0.1
1004 0.13
1005 0.13
1006 0.13
1007 0.13
1008 0.12
1009 0.12
1010 0.12
1011 0.11
1012 0.08
1013 0.08
1014 0.07
1015 0.06
1016 0.06
1017 0.05
1018 0.04
1019 0.03
1020 0.03
1021 0.04
1022 0.05
1023 0.07
1024 0.08
1025 0.09
1026 0.13
1027 0.19
1028 0.25
1029 0.32
1030 0.36
1031 0.35
1032 0.35
1033 0.35
1034 0.32
1035 0.27
1036 0.21
1037 0.13
1038 0.09
1039 0.07
1040 0.06
1041 0.05
1042 0.04
1043 0.03
1044 0.03
1045 0.03
1046 0.03
1047 0.04
1048 0.05
1049 0.06
1050 0.09
1051 0.14
1052 0.19
1053 0.23
1054 0.25
1055 0.28
1056 0.29
1057 0.29
1058 0.28
1059 0.25
1060 0.21
1061 0.19
1062 0.17
1063 0.14
1064 0.12
1065 0.12
1066 0.1
1067 0.08
1068 0.07
1069 0.06
1070 0.04
1071 0.04
1072 0.05
1073 0.04
1074 0.04
1075 0.04
1076 0.04
1077 0.04
1078 0.04
1079 0.04
1080 0.03
1081 0.03
1082 0.04
1083 0.05
1084 0.07
1085 0.09
1086 0.1
1087 0.13
1088 0.15
1089 0.23
1090 0.26
1091 0.28
1092 0.33
1093 0.34
1094 0.35