Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1S8BJB5

Protein Details
Accession A0A1S8BJB5    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
44-64RIPPSHSPQNRKEREENKENHBasic
73-128HTPPNTRGGERKSPNRRPPKAPPPTKPQPQPRTANPKKPPRARPPKTQLTKQTQFRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
75-118PPNTRGGERKSPNRRPPKAPPPTKPQPQPRTANPKKPPRARPPK
Subcellular Location(s) mito 22, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001597  ArAA_b-elim_lyase/Thr_aldolase  
IPR015424  PyrdxlP-dep_Trfase  
IPR015421  PyrdxlP-dep_Trfase_major  
IPR015422  PyrdxlP-dep_Trfase_small  
Gene Ontology GO:0016829  F:lyase activity  
GO:0006520  P:amino acid metabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF01212  Beta_elim_lyase  
CDD cd06502  TA_like  
Amino Acid Sequences MSPHNYYPVTAPSSSCPTPAGISPSQSPSINHWTTPGPASSDVRIPPSHSPQNRKEREENKENHHAHPHHHHHTPPNTRGGERKSPNRRPPKAPPPTKPQPQPRTANPKKPPRARPPKTQLTKQTQFRSDTITTPTASMLAAIASTTLGDDVFHEDATTNALQSWIASLLGKPAALLVMSGTMGNQVALRTHLGGPPHSVLCDHRAHILRAEAGGVAALCGAQIEGVFPSNGSYLTLEDVQANAVLGDDVHGCPTRVVELENTLGGAVMPLAEMQRIGAWARENGVITHLDGARLWEAVAAGHGTLAEYAACVDSVQLCFSKGLGAPMGSIIVGSEAFVKRARWIRKSIGGGIRMAGVVSAAARTAVEEQFVGGRLVRTHEQARRLAEKWEGLGGVLSVPTETNMVWLDVKKSGVEAADIMRLAAEKGIKTFGTRIVVHYQISELAMRGMEEVMEVVMGKKGAAAAAAAPETNGTEGA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.32
3 0.28
4 0.25
5 0.26
6 0.27
7 0.3
8 0.25
9 0.28
10 0.31
11 0.34
12 0.36
13 0.35
14 0.34
15 0.33
16 0.4
17 0.39
18 0.35
19 0.33
20 0.32
21 0.33
22 0.34
23 0.29
24 0.23
25 0.25
26 0.28
27 0.28
28 0.31
29 0.3
30 0.31
31 0.3
32 0.31
33 0.34
34 0.4
35 0.47
36 0.5
37 0.58
38 0.63
39 0.73
40 0.78
41 0.78
42 0.79
43 0.79
44 0.8
45 0.82
46 0.79
47 0.76
48 0.79
49 0.74
50 0.69
51 0.7
52 0.62
53 0.58
54 0.62
55 0.62
56 0.58
57 0.6
58 0.6
59 0.59
60 0.67
61 0.7
62 0.64
63 0.64
64 0.61
65 0.58
66 0.6
67 0.59
68 0.59
69 0.58
70 0.63
71 0.65
72 0.73
73 0.81
74 0.85
75 0.85
76 0.83
77 0.86
78 0.86
79 0.86
80 0.86
81 0.83
82 0.82
83 0.84
84 0.85
85 0.84
86 0.84
87 0.82
88 0.81
89 0.8
90 0.8
91 0.82
92 0.81
93 0.82
94 0.8
95 0.82
96 0.84
97 0.86
98 0.87
99 0.87
100 0.89
101 0.86
102 0.87
103 0.86
104 0.87
105 0.85
106 0.83
107 0.81
108 0.8
109 0.82
110 0.79
111 0.78
112 0.73
113 0.69
114 0.61
115 0.58
116 0.5
117 0.44
118 0.4
119 0.34
120 0.29
121 0.26
122 0.25
123 0.18
124 0.16
125 0.13
126 0.08
127 0.05
128 0.05
129 0.04
130 0.04
131 0.03
132 0.03
133 0.03
134 0.03
135 0.03
136 0.03
137 0.04
138 0.08
139 0.08
140 0.08
141 0.08
142 0.08
143 0.08
144 0.12
145 0.11
146 0.08
147 0.07
148 0.08
149 0.07
150 0.07
151 0.08
152 0.05
153 0.06
154 0.06
155 0.06
156 0.07
157 0.08
158 0.08
159 0.07
160 0.06
161 0.06
162 0.06
163 0.06
164 0.04
165 0.04
166 0.04
167 0.04
168 0.04
169 0.04
170 0.04
171 0.05
172 0.05
173 0.05
174 0.05
175 0.06
176 0.07
177 0.08
178 0.09
179 0.11
180 0.11
181 0.12
182 0.14
183 0.15
184 0.14
185 0.13
186 0.12
187 0.12
188 0.16
189 0.17
190 0.16
191 0.19
192 0.21
193 0.22
194 0.23
195 0.23
196 0.18
197 0.16
198 0.16
199 0.1
200 0.08
201 0.07
202 0.05
203 0.04
204 0.03
205 0.03
206 0.02
207 0.02
208 0.02
209 0.02
210 0.02
211 0.02
212 0.03
213 0.04
214 0.04
215 0.04
216 0.04
217 0.05
218 0.05
219 0.05
220 0.05
221 0.05
222 0.07
223 0.07
224 0.07
225 0.07
226 0.07
227 0.06
228 0.06
229 0.05
230 0.04
231 0.03
232 0.03
233 0.03
234 0.03
235 0.04
236 0.04
237 0.06
238 0.06
239 0.06
240 0.06
241 0.07
242 0.07
243 0.07
244 0.08
245 0.07
246 0.08
247 0.09
248 0.09
249 0.09
250 0.07
251 0.07
252 0.06
253 0.05
254 0.03
255 0.02
256 0.02
257 0.03
258 0.03
259 0.03
260 0.03
261 0.03
262 0.04
263 0.04
264 0.05
265 0.06
266 0.07
267 0.07
268 0.09
269 0.11
270 0.11
271 0.1
272 0.12
273 0.1
274 0.1
275 0.13
276 0.11
277 0.1
278 0.1
279 0.11
280 0.1
281 0.09
282 0.09
283 0.06
284 0.06
285 0.05
286 0.06
287 0.05
288 0.04
289 0.04
290 0.04
291 0.04
292 0.04
293 0.04
294 0.03
295 0.03
296 0.03
297 0.04
298 0.04
299 0.03
300 0.04
301 0.05
302 0.06
303 0.07
304 0.07
305 0.08
306 0.08
307 0.08
308 0.1
309 0.09
310 0.1
311 0.1
312 0.1
313 0.09
314 0.09
315 0.1
316 0.07
317 0.06
318 0.05
319 0.04
320 0.04
321 0.04
322 0.08
323 0.08
324 0.09
325 0.11
326 0.12
327 0.17
328 0.25
329 0.32
330 0.33
331 0.39
332 0.43
333 0.49
334 0.53
335 0.55
336 0.53
337 0.48
338 0.44
339 0.38
340 0.33
341 0.25
342 0.21
343 0.13
344 0.07
345 0.05
346 0.05
347 0.04
348 0.03
349 0.04
350 0.04
351 0.05
352 0.08
353 0.08
354 0.08
355 0.08
356 0.09
357 0.1
358 0.11
359 0.11
360 0.09
361 0.1
362 0.1
363 0.14
364 0.16
365 0.19
366 0.25
367 0.3
368 0.35
369 0.38
370 0.43
371 0.45
372 0.44
373 0.43
374 0.4
375 0.36
376 0.32
377 0.29
378 0.23
379 0.18
380 0.17
381 0.14
382 0.1
383 0.08
384 0.07
385 0.05
386 0.05
387 0.06
388 0.06
389 0.06
390 0.07
391 0.08
392 0.1
393 0.12
394 0.13
395 0.15
396 0.17
397 0.18
398 0.16
399 0.16
400 0.16
401 0.14
402 0.14
403 0.12
404 0.12
405 0.14
406 0.14
407 0.13
408 0.12
409 0.12
410 0.11
411 0.12
412 0.13
413 0.11
414 0.12
415 0.16
416 0.16
417 0.17
418 0.2
419 0.22
420 0.26
421 0.26
422 0.28
423 0.31
424 0.34
425 0.32
426 0.31
427 0.27
428 0.22
429 0.22
430 0.19
431 0.14
432 0.12
433 0.12
434 0.11
435 0.11
436 0.09
437 0.08
438 0.07
439 0.07
440 0.06
441 0.06
442 0.06
443 0.06
444 0.07
445 0.08
446 0.07
447 0.08
448 0.08
449 0.08
450 0.08
451 0.08
452 0.07
453 0.11
454 0.12
455 0.11
456 0.1
457 0.11
458 0.11