Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1S8BIR1

Protein Details
Accession A0A1S8BIR1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
373-395REEEALKRKKLERKQMLERMNSQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
198-267KPPVGAIKHKPLEKLTKKEKLALHEKNKQAAAAAKDPKLALKQGLKPGLKGPAKGVDAKAGEPAKEKKKA
379-402KRKKLERKQMLERMNSQAKKKRPF
Subcellular Location(s) mito 21, mito_nucl 13.833, cyto_mito 11.333, nucl 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013256  Chromatin_SPT2  
Pfam View protein in Pfam  
PF08243  SPT2  
Amino Acid Sequences MSVSQSATVCRHRCSPGPQFLNSVLSSIGGGAGQSQAQSGRAAPSQAPAPNPTQTPRVGGPSNGVSSTTTPKRKAEGEPAPVPAKAPRRDLDPSRSNPVSRTGTASPVVKPAAPAPSSSMPYRGTAQPSGSTITRKPSTYASVAKSGPSATTIAKPAPKPVTKPSPAVTTVQAAAGPAPKKGSYQEILARAKAAQQEKPPVGAIKHKPLEKLTKKEKLALHEKNKQAAAAAKDPKLALKQGLKPGLKGPAKGVDAKAGEPAKEKKKAPDLGYQGTMRGAMRPAAKEPTYQGTMHKGAAAVRRPGLDRGDRSRSGSLGPRPPAEKRYRYVEDDEEEEDYESEGSSDMEAGIFDVDQEEQMSLRVARKEDEEALREEEALKRKKLERKQMLERMNSQAKKKRPF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.53
2 0.58
3 0.59
4 0.62
5 0.6
6 0.58
7 0.56
8 0.54
9 0.45
10 0.36
11 0.26
12 0.2
13 0.18
14 0.13
15 0.11
16 0.06
17 0.06
18 0.06
19 0.07
20 0.07
21 0.07
22 0.08
23 0.08
24 0.09
25 0.1
26 0.11
27 0.14
28 0.15
29 0.17
30 0.17
31 0.19
32 0.23
33 0.25
34 0.26
35 0.26
36 0.28
37 0.3
38 0.33
39 0.33
40 0.32
41 0.3
42 0.32
43 0.31
44 0.34
45 0.32
46 0.29
47 0.3
48 0.3
49 0.31
50 0.27
51 0.25
52 0.2
53 0.21
54 0.28
55 0.33
56 0.35
57 0.37
58 0.4
59 0.43
60 0.46
61 0.49
62 0.51
63 0.51
64 0.53
65 0.52
66 0.54
67 0.52
68 0.47
69 0.43
70 0.39
71 0.39
72 0.36
73 0.38
74 0.35
75 0.39
76 0.46
77 0.51
78 0.54
79 0.54
80 0.54
81 0.56
82 0.58
83 0.53
84 0.47
85 0.48
86 0.44
87 0.36
88 0.37
89 0.31
90 0.31
91 0.33
92 0.34
93 0.27
94 0.26
95 0.25
96 0.2
97 0.19
98 0.18
99 0.22
100 0.2
101 0.19
102 0.21
103 0.24
104 0.27
105 0.26
106 0.27
107 0.22
108 0.24
109 0.27
110 0.25
111 0.25
112 0.24
113 0.25
114 0.23
115 0.23
116 0.24
117 0.22
118 0.22
119 0.2
120 0.25
121 0.26
122 0.25
123 0.26
124 0.26
125 0.28
126 0.3
127 0.34
128 0.29
129 0.31
130 0.31
131 0.3
132 0.28
133 0.24
134 0.19
135 0.15
136 0.14
137 0.1
138 0.12
139 0.13
140 0.15
141 0.19
142 0.19
143 0.24
144 0.29
145 0.3
146 0.32
147 0.37
148 0.44
149 0.43
150 0.46
151 0.42
152 0.4
153 0.39
154 0.37
155 0.31
156 0.23
157 0.21
158 0.18
159 0.16
160 0.11
161 0.1
162 0.12
163 0.11
164 0.1
165 0.11
166 0.11
167 0.12
168 0.13
169 0.17
170 0.14
171 0.17
172 0.21
173 0.27
174 0.28
175 0.27
176 0.26
177 0.22
178 0.24
179 0.25
180 0.23
181 0.19
182 0.21
183 0.27
184 0.27
185 0.28
186 0.26
187 0.22
188 0.21
189 0.25
190 0.25
191 0.28
192 0.32
193 0.32
194 0.33
195 0.35
196 0.45
197 0.44
198 0.5
199 0.5
200 0.54
201 0.53
202 0.58
203 0.57
204 0.53
205 0.56
206 0.57
207 0.57
208 0.57
209 0.58
210 0.56
211 0.53
212 0.46
213 0.37
214 0.32
215 0.28
216 0.27
217 0.29
218 0.26
219 0.27
220 0.27
221 0.27
222 0.25
223 0.22
224 0.19
225 0.21
226 0.25
227 0.3
228 0.38
229 0.37
230 0.36
231 0.38
232 0.42
233 0.38
234 0.33
235 0.29
236 0.28
237 0.29
238 0.31
239 0.29
240 0.25
241 0.24
242 0.24
243 0.27
244 0.22
245 0.21
246 0.23
247 0.3
248 0.31
249 0.37
250 0.39
251 0.39
252 0.47
253 0.53
254 0.53
255 0.54
256 0.53
257 0.5
258 0.53
259 0.47
260 0.38
261 0.32
262 0.29
263 0.21
264 0.16
265 0.13
266 0.13
267 0.16
268 0.17
269 0.19
270 0.23
271 0.23
272 0.23
273 0.25
274 0.27
275 0.27
276 0.26
277 0.26
278 0.26
279 0.28
280 0.27
281 0.25
282 0.2
283 0.21
284 0.27
285 0.3
286 0.26
287 0.26
288 0.28
289 0.29
290 0.31
291 0.32
292 0.33
293 0.34
294 0.38
295 0.44
296 0.44
297 0.46
298 0.45
299 0.41
300 0.38
301 0.39
302 0.39
303 0.4
304 0.42
305 0.41
306 0.43
307 0.47
308 0.52
309 0.54
310 0.53
311 0.49
312 0.55
313 0.56
314 0.57
315 0.58
316 0.54
317 0.48
318 0.45
319 0.42
320 0.35
321 0.3
322 0.26
323 0.21
324 0.16
325 0.13
326 0.1
327 0.08
328 0.07
329 0.06
330 0.06
331 0.06
332 0.05
333 0.05
334 0.05
335 0.05
336 0.05
337 0.05
338 0.05
339 0.05
340 0.06
341 0.06
342 0.07
343 0.07
344 0.06
345 0.07
346 0.1
347 0.11
348 0.15
349 0.19
350 0.2
351 0.22
352 0.25
353 0.29
354 0.34
355 0.38
356 0.36
357 0.35
358 0.38
359 0.36
360 0.33
361 0.31
362 0.3
363 0.34
364 0.37
365 0.37
366 0.4
367 0.48
368 0.57
369 0.66
370 0.71
371 0.72
372 0.76
373 0.83
374 0.86
375 0.86
376 0.84
377 0.79
378 0.77
379 0.76
380 0.72
381 0.7
382 0.69