FuNGI

A0A1S8BIV5

Protein Details

Accession

A0A1S8BIV5

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
158-184	LSYKDIMKKREREREEREKQEKKARGE	Basic
216-235	AAAGRKRKKRWDVSSEDTAT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
165-182	KKREREREEREKQEKKAR
219-225	GRKRKKR

Subcellular Location(s)

plas 14, nucl 5.5, cyto_nucl 5.5, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011989 ARM-like IPR016024 ARM-type_fold IPR015016 SF3b_su1 IPR038737 SF3b_su1-like
Gene Ontology	GO:0005681 C:spliceosomal complex GO:0003729 F:mRNA binding GO:0000245 P:spliceosomal complex assembly
Pfam	View protein in Pfam PF08920 SF3b1

Amino Acid Sequences

MSDGKLDALNVTTSKANARTADFETIKRLQQERNAAASGKKGSKTFDPANQRTDNSTKASLTESFDTDLYERNGGNRYDGYLTSIPANDDEDMDDADDGRRLVGQYTATRAQMDEFATGDGMEEDLLMDREKQAQIQSRETDYQRRRFERGTGDDEGLSYKDIMKKREREREEREKQEKKARGEDVDEHQATLKDGGDKTPTGGDKTPTENGANGAAAGRKRKKRWDVSSEDTATNGTNGAVESEPKKRSRWDQTPSVPVPGDSDAASKRRSRWDQAPALGATPAPGAAGLATPVHPSQSGQVLSFGTDISGRNAPISDEELDELLPGEAQGYRILTPPPGYEPVRAPAKKVAATPTPNTASLAGGFMMQEPENARALGKQLPNEIPGVGELQFFKTEDMQYFGKLMDGQNEEELSVDEMKERKIMRLLLKVKNGTPPMRKTALRQLTDNARNFGAGPLFNQILPLLMERTLEDQERHLLVKVIDRVLYKLDDMVRPYVHKILVVIEPLLIDQDYYARVEGREIISNLAKAAGLAHMISTMRPDIDHPDEYVRNTTARAFAVVASALGIPALLPFLRAVCRSKKSWQARHTGVKIVQQIPILMGCAILPHLKGLVDCIGDNLNDEQTKVRTVTALAIAALAEAANPYGIESFDDILNPLWTGARKQRGKGLAGFLKAVGYIIPLMDEEYANYYTSQIMEILLREFSSPDEEMKKVVLKVISQCASTEGVTAGYLKENVLDDFFKSFWVRRMALDKRNYRQVVETTVDLGQKVGVSEIVERIVVNLKDESEPYRKMTVETLEKVIAGLGAADIGERLEERLVDGILHAFQEQSIEDIVMLNGFGTVVNALGTRCKPYLPQIVSTILWRLNNKSATVRQQAADLVSRIALVMKQCGEDALMGKLGTVLYEYLGEEYPEVLGSILGALRSIVTVVGINQMQPPIKDLLPRLTPILRNRHEKVQENTIDLVGRIADRGPESVNAREWMRICFELLDMLKAHKKGIRRAANNTFGFIAKAIGPQDVLATLLNNLRVQERQSRVCTAVAIGIVAETCAPFTVLPALMNEYRVPELNVQNGVLKSLSFLFEYIGEMAKDYVYAVTPLLEDALIDRDQVHRQTAASVVKHVALGVVGLGCEDAMVHLLNLLYPNIFETSPHVIDRIIEAIEAVRVAVGTGVVMNYVWAGLFHPARKVRQPYWRLYNDAYVHSADAMVPYYPDMGDANTVRHELNIIL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.2
2	0.22
3	0.25
4	0.26
5	0.29
6	0.31
7	0.34
8	0.42
9	0.4
10	0.38
11	0.41
12	0.42
13	0.43
14	0.45
15	0.45
16	0.42
17	0.47
18	0.56
19	0.54
20	0.55
21	0.53
22	0.48
23	0.46
24	0.46
25	0.45
26	0.42
27	0.4
28	0.37
29	0.38
30	0.43
31	0.49
32	0.5
33	0.51
34	0.56
35	0.57
36	0.63
37	0.64
38	0.59
39	0.57
40	0.55
41	0.51
42	0.46
43	0.44
44	0.37
45	0.34
46	0.35
47	0.32
48	0.32
49	0.31
50	0.28
51	0.26
52	0.25
53	0.26
54	0.23
55	0.25
56	0.22
57	0.22
58	0.2
59	0.21
60	0.26
61	0.25
62	0.28
63	0.24
64	0.24
65	0.25
66	0.25
67	0.28
68	0.24
69	0.25
70	0.24
71	0.24
72	0.22
73	0.2
74	0.22
75	0.16
76	0.15
77	0.15
78	0.14
79	0.13
80	0.13
81	0.12
82	0.1
83	0.1
84	0.11
85	0.1
86	0.09
87	0.1
88	0.1
89	0.11
90	0.13
91	0.17
92	0.18
93	0.25
94	0.28
95	0.27
96	0.27
97	0.27
98	0.25
99	0.25
100	0.23
101	0.18
102	0.15
103	0.15
104	0.14
105	0.14
106	0.12
107	0.09
108	0.07
109	0.06
110	0.05
111	0.05
112	0.06
113	0.07
114	0.07
115	0.08
116	0.09
117	0.14
118	0.15
119	0.17
120	0.22
121	0.3
122	0.35
123	0.41
124	0.44
125	0.44
126	0.5
127	0.51
128	0.55
129	0.56
130	0.6
131	0.63
132	0.64
133	0.65
134	0.62
135	0.64
136	0.64
137	0.62
138	0.59
139	0.53
140	0.5
141	0.44
142	0.41
143	0.36
144	0.27
145	0.21
146	0.15
147	0.15
148	0.19
149	0.23
150	0.3
151	0.37
152	0.46
153	0.55
154	0.66
155	0.7
156	0.73
157	0.79
158	0.83
159	0.84
160	0.86
161	0.86
162	0.83
163	0.84
164	0.84
165	0.82
166	0.77
167	0.76
168	0.7
169	0.64
170	0.61
171	0.59
172	0.55
173	0.57
174	0.51
175	0.42
176	0.39
177	0.35
178	0.31
179	0.26
180	0.21
181	0.17
182	0.17
183	0.19
184	0.21
185	0.2
186	0.21
187	0.25
188	0.25
189	0.24
190	0.26
191	0.27
192	0.28
193	0.32
194	0.33
195	0.31
196	0.3
197	0.27
198	0.25
199	0.24
200	0.2
201	0.15
202	0.14
203	0.14
204	0.16
205	0.24
206	0.32
207	0.39
208	0.45
209	0.55
210	0.64
211	0.72
212	0.79
213	0.8
214	0.8
215	0.79
216	0.82
217	0.75
218	0.65
219	0.55
220	0.45
221	0.36
222	0.27
223	0.2
224	0.1
225	0.07
226	0.07
227	0.08
228	0.08
229	0.1
230	0.14
231	0.2
232	0.26
233	0.28
234	0.31
235	0.35
236	0.44
237	0.52
238	0.58
239	0.58
240	0.63
241	0.68
242	0.74
243	0.7
244	0.65
245	0.54
246	0.45
247	0.4
248	0.31
249	0.26
250	0.17
251	0.18
252	0.17
253	0.2
254	0.23
255	0.24
256	0.27
257	0.36
258	0.41
259	0.45
260	0.5
261	0.57
262	0.61
263	0.61
264	0.61
265	0.51
266	0.46
267	0.39
268	0.31
269	0.22
270	0.14
271	0.11
272	0.06
273	0.05
274	0.04
275	0.04
276	0.04
277	0.04
278	0.05
279	0.06
280	0.07
281	0.08
282	0.09
283	0.09
284	0.09
285	0.1
286	0.15
287	0.16
288	0.15
289	0.17
290	0.16
291	0.16
292	0.16
293	0.14
294	0.09
295	0.09
296	0.09
297	0.11
298	0.13
299	0.12
300	0.12
301	0.13
302	0.13
303	0.13
304	0.15
305	0.13
306	0.12
307	0.12
308	0.12
309	0.12
310	0.11
311	0.1
312	0.07
313	0.06
314	0.05
315	0.05
316	0.05
317	0.06
318	0.07
319	0.07
320	0.08
321	0.1
322	0.11
323	0.11
324	0.12
325	0.13
326	0.16
327	0.2
328	0.21
329	0.22
330	0.23
331	0.28
332	0.36
333	0.35
334	0.34
335	0.35
336	0.37
337	0.37
338	0.37
339	0.36
340	0.34
341	0.38
342	0.37
343	0.38
344	0.36
345	0.34
346	0.33
347	0.28
348	0.22
349	0.18
350	0.16
351	0.1
352	0.08
353	0.08
354	0.07
355	0.08
356	0.07
357	0.08
358	0.09
359	0.11
360	0.12
361	0.12
362	0.11
363	0.1
364	0.13
365	0.18
366	0.19
367	0.18
368	0.22
369	0.23
370	0.24
371	0.24
372	0.22
373	0.16
374	0.14
375	0.14
376	0.1
377	0.09
378	0.09
379	0.1
380	0.1
381	0.11
382	0.11
383	0.11
384	0.12
385	0.12
386	0.15
387	0.14
388	0.14
389	0.15
390	0.14
391	0.12
392	0.12
393	0.12
394	0.14
395	0.15
396	0.16
397	0.16
398	0.16
399	0.15
400	0.14
401	0.14
402	0.1
403	0.08
404	0.07
405	0.09
406	0.1
407	0.11
408	0.15
409	0.15
410	0.15
411	0.18
412	0.23
413	0.26
414	0.34
415	0.41
416	0.43
417	0.48
418	0.49
419	0.47
420	0.48
421	0.48
422	0.45
423	0.44
424	0.42
425	0.42
426	0.44
427	0.44
428	0.42
429	0.47
430	0.5
431	0.45
432	0.42
433	0.41
434	0.46
435	0.52
436	0.5
437	0.41
438	0.32
439	0.31
440	0.3
441	0.27
442	0.19
443	0.12
444	0.1
445	0.11
446	0.12
447	0.11
448	0.11
449	0.09
450	0.08
451	0.09
452	0.09
453	0.07
454	0.07
455	0.07
456	0.07
457	0.1
458	0.11
459	0.12
460	0.12
461	0.12
462	0.14
463	0.15
464	0.15
465	0.13
466	0.13
467	0.13
468	0.17
469	0.18
470	0.17
471	0.18
472	0.17
473	0.18
474	0.17
475	0.17
476	0.13
477	0.13
478	0.14
479	0.14
480	0.15
481	0.17
482	0.16
483	0.16
484	0.18
485	0.18
486	0.16
487	0.14
488	0.13
489	0.13
490	0.14
491	0.13
492	0.12
493	0.09
494	0.09
495	0.09
496	0.08
497	0.06
498	0.04
499	0.03
500	0.04
501	0.05
502	0.05
503	0.06
504	0.06
505	0.06
506	0.07
507	0.09
508	0.1
509	0.12
510	0.12
511	0.13
512	0.14
513	0.14
514	0.13
515	0.11
516	0.09
517	0.07
518	0.07
519	0.05
520	0.05
521	0.04
522	0.04
523	0.05
524	0.05
525	0.05
526	0.06
527	0.06
528	0.05
529	0.06
530	0.06
531	0.1
532	0.14
533	0.15
534	0.15
535	0.18
536	0.19
537	0.2
538	0.22
539	0.18
540	0.14
541	0.14
542	0.14
543	0.12
544	0.12
545	0.11
546	0.1
547	0.09
548	0.09
549	0.08
550	0.07
551	0.06
552	0.05
553	0.04
554	0.04
555	0.03
556	0.03
557	0.03
558	0.03
559	0.02
560	0.03
561	0.03
562	0.04
563	0.06
564	0.07
565	0.11
566	0.16
567	0.2
568	0.22
569	0.27
570	0.37
571	0.45
572	0.52
573	0.55
574	0.57
575	0.6
576	0.65
577	0.62
578	0.57
579	0.49
580	0.45
581	0.44
582	0.37
583	0.33
584	0.25
585	0.23
586	0.19
587	0.17
588	0.13
589	0.08
590	0.06
591	0.04
592	0.04
593	0.04
594	0.05
595	0.04
596	0.04
597	0.05
598	0.05
599	0.05
600	0.06
601	0.07
602	0.07
603	0.07
604	0.07
605	0.08
606	0.07
607	0.08
608	0.08
609	0.08
610	0.07
611	0.08
612	0.08
613	0.08
614	0.1
615	0.09
616	0.09
617	0.08
618	0.08
619	0.09
620	0.09
621	0.09
622	0.07
623	0.07
624	0.06
625	0.06
626	0.05
627	0.04
628	0.02
629	0.02
630	0.02
631	0.02
632	0.02
633	0.02
634	0.03
635	0.03
636	0.04
637	0.04
638	0.05
639	0.05
640	0.06
641	0.06
642	0.06
643	0.06
644	0.06
645	0.05
646	0.05
647	0.06
648	0.08
649	0.13
650	0.22
651	0.24
652	0.25
653	0.31
654	0.34
655	0.36
656	0.36
657	0.37
658	0.32
659	0.31
660	0.3
661	0.24
662	0.2
663	0.18
664	0.15
665	0.08
666	0.05
667	0.04
668	0.03
669	0.04
670	0.03
671	0.04
672	0.05
673	0.05
674	0.04
675	0.07
676	0.08
677	0.08
678	0.08
679	0.08
680	0.08
681	0.08
682	0.08
683	0.06
684	0.06
685	0.06
686	0.06
687	0.06
688	0.06
689	0.06
690	0.06
691	0.06
692	0.06
693	0.09
694	0.09
695	0.1
696	0.13
697	0.13
698	0.13
699	0.14
700	0.16
701	0.13
702	0.15
703	0.14
704	0.13
705	0.16
706	0.21
707	0.21
708	0.19
709	0.19
710	0.18
711	0.19
712	0.17
713	0.14
714	0.09
715	0.08
716	0.08
717	0.08
718	0.07
719	0.06
720	0.06
721	0.06
722	0.06
723	0.07
724	0.07
725	0.08
726	0.08
727	0.08
728	0.1
729	0.1
730	0.1
731	0.11
732	0.12
733	0.15
734	0.2
735	0.2
736	0.21
737	0.29
738	0.34
739	0.41
740	0.48
741	0.51
742	0.5
743	0.58
744	0.57
745	0.5
746	0.47
747	0.41
748	0.36
749	0.31
750	0.27
751	0.2
752	0.21
753	0.2
754	0.17
755	0.15
756	0.1
757	0.09
758	0.08
759	0.07
760	0.05
761	0.05
762	0.06
763	0.07
764	0.07
765	0.07
766	0.07
767	0.07
768	0.12
769	0.11
770	0.12
771	0.12
772	0.12
773	0.13
774	0.14
775	0.18
776	0.18
777	0.2
778	0.21
779	0.24
780	0.23
781	0.23
782	0.25
783	0.26
784	0.27
785	0.27
786	0.26
787	0.23
788	0.23
789	0.22
790	0.19
791	0.14
792	0.07
793	0.05
794	0.03
795	0.03
796	0.03
797	0.03
798	0.03
799	0.02
800	0.03
801	0.03
802	0.04
803	0.04
804	0.04
805	0.05
806	0.06
807	0.06
808	0.06
809	0.06
810	0.06
811	0.06
812	0.07
813	0.06
814	0.05
815	0.05
816	0.06
817	0.06
818	0.06
819	0.06
820	0.05
821	0.05
822	0.06
823	0.06
824	0.05
825	0.05
826	0.04
827	0.03
828	0.03
829	0.03
830	0.03
831	0.03
832	0.03
833	0.04
834	0.04
835	0.04
836	0.08
837	0.09
838	0.12
839	0.12
840	0.13
841	0.14
842	0.2
843	0.3
844	0.29
845	0.31
846	0.3
847	0.33
848	0.33
849	0.32
850	0.29
851	0.22
852	0.22
853	0.21
854	0.22
855	0.25
856	0.26
857	0.27
858	0.3
859	0.32
860	0.37
861	0.41
862	0.39
863	0.34
864	0.33
865	0.33
866	0.29
867	0.26
868	0.2
869	0.15
870	0.12
871	0.12
872	0.1
873	0.1
874	0.09
875	0.08
876	0.1
877	0.1
878	0.11
879	0.11
880	0.11
881	0.11
882	0.1
883	0.11
884	0.09
885	0.1
886	0.09
887	0.09
888	0.09
889	0.09
890	0.07
891	0.07
892	0.06
893	0.05
894	0.06
895	0.06
896	0.07
897	0.07
898	0.08
899	0.07
900	0.07
901	0.07
902	0.06
903	0.06
904	0.05
905	0.04
906	0.04
907	0.04
908	0.05
909	0.04
910	0.04
911	0.04
912	0.04
913	0.04
914	0.04
915	0.04
916	0.04
917	0.04
918	0.05
919	0.08
920	0.08
921	0.09
922	0.1
923	0.13
924	0.14
925	0.14
926	0.16
927	0.16
928	0.16
929	0.19
930	0.2
931	0.24
932	0.26
933	0.27
934	0.28
935	0.29
936	0.34
937	0.37
938	0.46
939	0.45
940	0.51
941	0.53
942	0.59
943	0.62
944	0.64
945	0.61
946	0.61
947	0.58
948	0.53
949	0.5
950	0.42
951	0.35
952	0.28
953	0.23
954	0.14
955	0.11
956	0.08
957	0.08
958	0.08
959	0.09
960	0.1
961	0.11
962	0.14
963	0.18
964	0.2
965	0.22
966	0.23
967	0.23
968	0.26
969	0.25
970	0.24
971	0.24
972	0.22
973	0.21
974	0.19
975	0.18
976	0.19
977	0.19
978	0.19
979	0.15
980	0.18
981	0.22
982	0.22
983	0.24
984	0.22
985	0.27
986	0.33
987	0.43
988	0.5
989	0.51
990	0.59
991	0.65
992	0.72
993	0.67
994	0.6
995	0.51
996	0.41
997	0.36
998	0.28
999	0.2
1000	0.11
1001	0.13
1002	0.13
1003	0.12
1004	0.11
1005	0.11
1006	0.11
1007	0.1
1008	0.1
1009	0.07
1010	0.07
1011	0.08
1012	0.1
1013	0.12
1014	0.12
1015	0.13
1016	0.14
1017	0.16
1018	0.19
1019	0.26
1020	0.31
1021	0.35
1022	0.38
1023	0.42
1024	0.42
1025	0.41
1026	0.38
1027	0.29
1028	0.25
1029	0.19
1030	0.15
1031	0.11
1032	0.09
1033	0.08
1034	0.07
1035	0.06
1036	0.04
1037	0.04
1038	0.04
1039	0.05
1040	0.05
1041	0.06
1042	0.09
1043	0.1
1044	0.1
1045	0.11
1046	0.16
1047	0.16
1048	0.18
1049	0.18
1050	0.17
1051	0.18
1052	0.18
1053	0.19
1054	0.2
1055	0.23
1056	0.25
1057	0.26
1058	0.25
1059	0.28
1060	0.27
1061	0.26
1062	0.2
1063	0.17
1064	0.14
1065	0.14
1066	0.15
1067	0.11
1068	0.11
1069	0.11
1070	0.11
1071	0.13
1072	0.12
1073	0.13
1074	0.11
1075	0.11
1076	0.11
1077	0.1
1078	0.1
1079	0.09
1080	0.08
1081	0.07
1082	0.08
1083	0.08
1084	0.08
1085	0.08
1086	0.08
1087	0.08
1088	0.07
1089	0.06
1090	0.07
1091	0.1
1092	0.1
1093	0.1
1094	0.11
1095	0.14
1096	0.19
1097	0.21
1098	0.23
1099	0.2
1100	0.2
1101	0.22
1102	0.27
1103	0.3
1104	0.27
1105	0.27
1106	0.26
1107	0.26
1108	0.25
1109	0.23
1110	0.18
1111	0.11
1112	0.1
1113	0.08
1114	0.06
1115	0.05
1116	0.05
1117	0.05
1118	0.04
1119	0.04
1120	0.04
1121	0.03
1122	0.05
1123	0.05
1124	0.05
1125	0.06
1126	0.06
1127	0.07
1128	0.09
1129	0.09
1130	0.08
1131	0.08
1132	0.1
1133	0.11
1134	0.11
1135	0.1
1136	0.14
1137	0.21
1138	0.23
1139	0.24
1140	0.23
1141	0.21
1142	0.22
1143	0.24
1144	0.21
1145	0.14
1146	0.11
1147	0.11
1148	0.11
1149	0.11
1150	0.1
1151	0.08
1152	0.06
1153	0.05
1154	0.05
1155	0.05
1156	0.05
1157	0.04
1158	0.05
1159	0.05
1160	0.05
1161	0.05
1162	0.05
1163	0.05
1164	0.05
1165	0.05
1166	0.04
1167	0.06
1168	0.11
1169	0.15
1170	0.17
1171	0.25
1172	0.31
1173	0.37
1174	0.45
1175	0.53
1176	0.55
1177	0.62
1178	0.67
1179	0.69
1180	0.74
1181	0.74
1182	0.71
1183	0.66
1184	0.67
1185	0.6
1186	0.55
1187	0.49
1188	0.39
1189	0.34
1190	0.29
1191	0.26
1192	0.17
1193	0.15
1194	0.13
1195	0.1
1196	0.09
1197	0.09
1198	0.1
1199	0.1
1200	0.11
1201	0.1
1202	0.1
1203	0.15
1204	0.16
1205	0.18
1206	0.19
1207	0.21
1208	0.2
1209	0.19

A0A1S8BIV5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer