Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A1S8B4N2

Protein Details
Accession A0A1S8B4N2    Localization Confidence High Confidence Score 25.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
10-31AAKVTKSKSDSKSKNYPKAPPAHydrophilic
126-148SESKDEPPKKKAKKEAKKEADSDBasic
204-230SDSNSGAEKKKKKKKPTEGEKKAKGAKBasic
247-275SDSSTEKKSKKSMKKEKKDKEVKKESSATHydrophilic
370-392VTKGKGFTKEKNKGKKGSYRGGMBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
132-143PPKKKAKKEAKK
211-230EKKKKKKKPTEGEKKAKGAK
253-270KKSKKSMKKEKKDKEVKK
374-385KGFTKEKNKGKK
Subcellular Location(s) nucl 24, mito 1, cyto 1, cysk 1, cyto_mito 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006594  LisH  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50896  LISH  
Amino Acid Sequences MAKNKSAKPAAKVTKSKSDSKSKNYPKAPPAVLDLFHSFLVEYGYEKTAEQLRSETAQRDVEWKDAAKGMPTITEIVEEWEEDREIDNEIKAENGNDDSDSSDSSDSESSDDSASESSDDSASDSSESKDEPPKKKAKKEAKKEADSDDESSSSSDESSDAESDAESEASASSSSSSSSSSSSSSSSSSSSDASAKSSSSSSSSDSNSGAEKKKKKKKPTEGEKKAKGAKDESSATSSDSSSSSSDSDSSTEKKSKKSMKKEKKDKEVKKESSATSSDSSSGSDTMTSGSPALNATPGSKRKRNDSAADTPSNAVSGTSTPSGEDGNKRAKKSNVPFSRIPTDQYVDPRFQSNAFVPYDYAQRAHEKLIVTKGKGFTKEKNKGKKGSYRGGMIDTNAVNGIKFDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.73
2 0.73
3 0.76
4 0.74
5 0.75
6 0.74
7 0.74
8 0.78
9 0.78
10 0.83
11 0.82
12 0.83
13 0.79
14 0.79
15 0.73
16 0.64
17 0.6
18 0.54
19 0.47
20 0.42
21 0.37
22 0.3
23 0.27
24 0.25
25 0.18
26 0.14
27 0.15
28 0.11
29 0.1
30 0.11
31 0.12
32 0.13
33 0.13
34 0.16
35 0.21
36 0.22
37 0.22
38 0.21
39 0.23
40 0.26
41 0.29
42 0.28
43 0.26
44 0.28
45 0.27
46 0.31
47 0.3
48 0.29
49 0.29
50 0.28
51 0.25
52 0.26
53 0.26
54 0.22
55 0.22
56 0.19
57 0.17
58 0.18
59 0.17
60 0.13
61 0.14
62 0.12
63 0.13
64 0.13
65 0.12
66 0.11
67 0.11
68 0.12
69 0.11
70 0.12
71 0.09
72 0.11
73 0.12
74 0.12
75 0.11
76 0.11
77 0.12
78 0.11
79 0.11
80 0.1
81 0.1
82 0.1
83 0.1
84 0.11
85 0.11
86 0.11
87 0.11
88 0.11
89 0.1
90 0.1
91 0.11
92 0.11
93 0.1
94 0.1
95 0.1
96 0.1
97 0.1
98 0.1
99 0.09
100 0.08
101 0.08
102 0.08
103 0.08
104 0.07
105 0.07
106 0.07
107 0.08
108 0.07
109 0.08
110 0.08
111 0.09
112 0.09
113 0.1
114 0.1
115 0.12
116 0.21
117 0.29
118 0.34
119 0.42
120 0.52
121 0.59
122 0.67
123 0.74
124 0.77
125 0.79
126 0.84
127 0.86
128 0.86
129 0.84
130 0.79
131 0.72
132 0.67
133 0.59
134 0.51
135 0.41
136 0.31
137 0.25
138 0.22
139 0.18
140 0.12
141 0.09
142 0.07
143 0.06
144 0.06
145 0.07
146 0.07
147 0.07
148 0.07
149 0.07
150 0.07
151 0.07
152 0.06
153 0.05
154 0.04
155 0.04
156 0.04
157 0.05
158 0.04
159 0.05
160 0.05
161 0.05
162 0.06
163 0.07
164 0.07
165 0.08
166 0.09
167 0.09
168 0.1
169 0.1
170 0.11
171 0.11
172 0.11
173 0.11
174 0.11
175 0.11
176 0.11
177 0.11
178 0.12
179 0.11
180 0.12
181 0.12
182 0.11
183 0.11
184 0.1
185 0.1
186 0.1
187 0.11
188 0.11
189 0.13
190 0.14
191 0.14
192 0.14
193 0.15
194 0.14
195 0.17
196 0.21
197 0.26
198 0.34
199 0.43
200 0.53
201 0.61
202 0.7
203 0.77
204 0.82
205 0.86
206 0.89
207 0.9
208 0.91
209 0.92
210 0.88
211 0.83
212 0.77
213 0.68
214 0.59
215 0.51
216 0.43
217 0.37
218 0.34
219 0.29
220 0.26
221 0.24
222 0.22
223 0.2
224 0.17
225 0.14
226 0.12
227 0.11
228 0.1
229 0.1
230 0.1
231 0.09
232 0.1
233 0.1
234 0.11
235 0.12
236 0.14
237 0.17
238 0.23
239 0.26
240 0.29
241 0.37
242 0.46
243 0.53
244 0.62
245 0.69
246 0.74
247 0.82
248 0.89
249 0.91
250 0.92
251 0.93
252 0.91
253 0.9
254 0.9
255 0.84
256 0.8
257 0.77
258 0.67
259 0.61
260 0.54
261 0.46
262 0.36
263 0.32
264 0.26
265 0.2
266 0.19
267 0.15
268 0.14
269 0.11
270 0.09
271 0.08
272 0.09
273 0.09
274 0.08
275 0.07
276 0.07
277 0.07
278 0.08
279 0.08
280 0.08
281 0.08
282 0.1
283 0.17
284 0.25
285 0.32
286 0.38
287 0.4
288 0.47
289 0.56
290 0.6
291 0.6
292 0.6
293 0.62
294 0.63
295 0.63
296 0.56
297 0.47
298 0.41
299 0.34
300 0.26
301 0.16
302 0.1
303 0.09
304 0.11
305 0.11
306 0.11
307 0.11
308 0.12
309 0.13
310 0.16
311 0.19
312 0.21
313 0.31
314 0.36
315 0.39
316 0.44
317 0.48
318 0.55
319 0.6
320 0.65
321 0.64
322 0.65
323 0.67
324 0.67
325 0.69
326 0.6
327 0.54
328 0.48
329 0.42
330 0.4
331 0.44
332 0.42
333 0.38
334 0.38
335 0.37
336 0.34
337 0.31
338 0.31
339 0.26
340 0.28
341 0.26
342 0.25
343 0.24
344 0.24
345 0.29
346 0.26
347 0.24
348 0.21
349 0.26
350 0.27
351 0.28
352 0.3
353 0.27
354 0.29
355 0.38
356 0.41
357 0.38
358 0.42
359 0.46
360 0.48
361 0.53
362 0.54
363 0.54
364 0.58
365 0.67
366 0.71
367 0.76
368 0.79
369 0.8
370 0.84
371 0.84
372 0.82
373 0.82
374 0.78
375 0.73
376 0.67
377 0.63
378 0.56
379 0.48
380 0.44
381 0.34
382 0.29
383 0.25
384 0.22
385 0.17