FuNGI

A0A1S8B5M0

Protein Details

Accession

A0A1S8B5M0

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
139-162	LRDPGKRLAPKRKKQTDAEKNEPI	Basic
410-435	YYPIVQRTFIRPKRKAQRTPGMQLDD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
142-152	PGKRLAPKRKK

Subcellular Location(s)

nucl 11, cyto_nucl 10, mito 9, cyto 7

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007133 RNA_pol_II-assoc_Paf1
Gene Ontology	GO:0016593 C:Cdc73/Paf1 complex GO:0016570 P:histone modification GO:0006368 P:transcription elongation by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF03985 Paf1

Amino Acid Sequences

MSGGRVYHQDYIARIRYSNVLPPPPNPPKLLEIPNTGLASGQYTSAGFASRLAREQPLNVEADAELGMPIDLVGLPGVFEGDDSVLLASDEPVSLHPHDRALLRPLSTLGKPSSLAGGVSFLRRTEYMTAAGGGGHSGLRDPGKRLAPKRKKQTDAEKNEPINILRSILKGFDIAYPQDAYKGPDTVQNLRGEEITAEERRAWDHPRHPAKPNLKLVDSYPVLPDLEAVTETGGYIVAKFQTNPIANQGPAYDERVDAGLLRVLEPTAEQDEAYRVRLAEHEAAMAAEGNNDGGASRTAAAAAAKGPSPPQPHYDYEFFLPASHEAVRGLKRKFSTTDPGREDEALYDAEKTEATGRRCFRFDRIRCYETYQQTGNPHDPYDETVALALHDGGNSPAAGEEGRLQKGAYYYPIVQRTFIRPKRKAQRTPGMQLDDEQENRVDVLEIEVREPDEREVADRQGFREKLEGEGELAEA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.35
2	0.33
3	0.36
4	0.36
5	0.41
6	0.4
7	0.42
8	0.42
9	0.45
10	0.53
11	0.56
12	0.57
13	0.52
14	0.48
15	0.46
16	0.51
17	0.56
18	0.5
19	0.47
20	0.47
21	0.5
22	0.47
23	0.4
24	0.33
25	0.26
26	0.24
27	0.18
28	0.14
29	0.1
30	0.09
31	0.1
32	0.11
33	0.12
34	0.09
35	0.12
36	0.16
37	0.17
38	0.2
39	0.21
40	0.24
41	0.25
42	0.27
43	0.28
44	0.27
45	0.27
46	0.24
47	0.23
48	0.18
49	0.18
50	0.16
51	0.11
52	0.08
53	0.06
54	0.06
55	0.05
56	0.05
57	0.04
58	0.04
59	0.04
60	0.04
61	0.04
62	0.04
63	0.04
64	0.04
65	0.04
66	0.04
67	0.04
68	0.05
69	0.05
70	0.05
71	0.05
72	0.05
73	0.05
74	0.05
75	0.05
76	0.05
77	0.05
78	0.06
79	0.07
80	0.1
81	0.12
82	0.15
83	0.15
84	0.16
85	0.19
86	0.2
87	0.22
88	0.24
89	0.26
90	0.24
91	0.24
92	0.24
93	0.26
94	0.25
95	0.26
96	0.22
97	0.2
98	0.2
99	0.19
100	0.19
101	0.15
102	0.15
103	0.11
104	0.12
105	0.11
106	0.13
107	0.13
108	0.11
109	0.13
110	0.13
111	0.15
112	0.15
113	0.16
114	0.16
115	0.16
116	0.16
117	0.14
118	0.14
119	0.11
120	0.08
121	0.07
122	0.05
123	0.05
124	0.04
125	0.06
126	0.09
127	0.11
128	0.14
129	0.19
130	0.26
131	0.33
132	0.42
133	0.51
134	0.59
135	0.67
136	0.76
137	0.79
138	0.79
139	0.81
140	0.84
141	0.83
142	0.82
143	0.81
144	0.78
145	0.69
146	0.64
147	0.57
148	0.46
149	0.39
150	0.29
151	0.23
152	0.16
153	0.16
154	0.15
155	0.14
156	0.13
157	0.1
158	0.11
159	0.11
160	0.12
161	0.11
162	0.12
163	0.12
164	0.12
165	0.14
166	0.14
167	0.14
168	0.13
169	0.14
170	0.13
171	0.16
172	0.19
173	0.21
174	0.26
175	0.26
176	0.25
177	0.25
178	0.24
179	0.21
180	0.18
181	0.15
182	0.14
183	0.12
184	0.12
185	0.12
186	0.12
187	0.13
188	0.16
189	0.18
190	0.2
191	0.25
192	0.34
193	0.43
194	0.47
195	0.5
196	0.56
197	0.59
198	0.62
199	0.64
200	0.57
201	0.49
202	0.45
203	0.42
204	0.4
205	0.33
206	0.25
207	0.18
208	0.16
209	0.15
210	0.14
211	0.13
212	0.07
213	0.06
214	0.06
215	0.05
216	0.04
217	0.04
218	0.04
219	0.04
220	0.04
221	0.03
222	0.03
223	0.04
224	0.05
225	0.05
226	0.05
227	0.06
228	0.12
229	0.13
230	0.13
231	0.17
232	0.17
233	0.17
234	0.17
235	0.17
236	0.13
237	0.13
238	0.15
239	0.12
240	0.1
241	0.1
242	0.1
243	0.1
244	0.08
245	0.08
246	0.07
247	0.06
248	0.07
249	0.06
250	0.06
251	0.06
252	0.06
253	0.07
254	0.07
255	0.07
256	0.06
257	0.07
258	0.1
259	0.11
260	0.12
261	0.11
262	0.1
263	0.1
264	0.11
265	0.14
266	0.13
267	0.13
268	0.11
269	0.11
270	0.1
271	0.1
272	0.09
273	0.06
274	0.04
275	0.04
276	0.04
277	0.03
278	0.03
279	0.03
280	0.04
281	0.04
282	0.04
283	0.05
284	0.05
285	0.05
286	0.06
287	0.06
288	0.05
289	0.06
290	0.06
291	0.06
292	0.07
293	0.08
294	0.13
295	0.17
296	0.19
297	0.22
298	0.26
299	0.29
300	0.33
301	0.34
302	0.31
303	0.29
304	0.28
305	0.24
306	0.2
307	0.18
308	0.14
309	0.14
310	0.12
311	0.11
312	0.1
313	0.15
314	0.2
315	0.25
316	0.26
317	0.29
318	0.3
319	0.33
320	0.35
321	0.36
322	0.41
323	0.41
324	0.49
325	0.49
326	0.5
327	0.48
328	0.46
329	0.41
330	0.31
331	0.26
332	0.18
333	0.14
334	0.12
335	0.1
336	0.1
337	0.09
338	0.09
339	0.13
340	0.18
341	0.21
342	0.28
343	0.32
344	0.35
345	0.38
346	0.4
347	0.42
348	0.48
349	0.51
350	0.54
351	0.58
352	0.57
353	0.56
354	0.62
355	0.62
356	0.56
357	0.55
358	0.47
359	0.42
360	0.44
361	0.48
362	0.45
363	0.38
364	0.34
365	0.29
366	0.28
367	0.27
368	0.28
369	0.22
370	0.18
371	0.16
372	0.16
373	0.14
374	0.14
375	0.11
376	0.06
377	0.06
378	0.06
379	0.06
380	0.07
381	0.07
382	0.06
383	0.06
384	0.06
385	0.06
386	0.07
387	0.12
388	0.16
389	0.17
390	0.18
391	0.18
392	0.19
393	0.21
394	0.22
395	0.19
396	0.19
397	0.21
398	0.28
399	0.35
400	0.34
401	0.34
402	0.36
403	0.42
404	0.49
405	0.53
406	0.57
407	0.56
408	0.66
409	0.75
410	0.83
411	0.83
412	0.83
413	0.86
414	0.84
415	0.86
416	0.84
417	0.78
418	0.68
419	0.6
420	0.55
421	0.5
422	0.43
423	0.36
424	0.28
425	0.23
426	0.22
427	0.21
428	0.16
429	0.1
430	0.13
431	0.16
432	0.16
433	0.16
434	0.18
435	0.18
436	0.19
437	0.21
438	0.18
439	0.17
440	0.17
441	0.2
442	0.22
443	0.26
444	0.31
445	0.31
446	0.33
447	0.39
448	0.39
449	0.37
450	0.41
451	0.36
452	0.34
453	0.35
454	0.32
455	0.24

A0A1S8B5M0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer