Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C4F8U6

Protein Details
Accession A0A0C4F8U6    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
288-312RSDSSRPRYSDRGKKRKSNLEVIDEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
299-303RGKKR
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto 5.5, cyto_mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR032567  LDOC1-rel  
IPR005162  Retrotrans_gag_dom  
Pfam View protein in Pfam  
PF03732  Retrotrans_gag  
Amino Acid Sequences MRDTFAQFHDHFSSERQKILWITSYFRAPSGNLGDDCPSYNWWRGLLKKNAEALGLPTIRASSLAEFVVKDLDSAESFLQFLESVFSNHREKEEAQEKLAALRQGSKSITDFNIEFNSYLHLVDYSDSTLVALYQSAVNPKIHECGVIRGGWSTIKTLEDKQERAVELAPDAGEVASLNHRRSAPAPRIEYRVAVPPASSAAVAPPPKSNQQVPMDIDVMSAEAGFTYPLWREEARRRGICIRCANTFDEEHYRKRGCPIQEDDWLKKDAILAVWKSWGGSLREDRNRSDSSRPRYSDRGKKRKSNLEVIDEPVLKKRNQSVPNESISAPSISLSQSPGAEYGGV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.38
3 0.32
4 0.33
5 0.34
6 0.36
7 0.39
8 0.31
9 0.34
10 0.35
11 0.4
12 0.36
13 0.35
14 0.32
15 0.25
16 0.28
17 0.29
18 0.3
19 0.26
20 0.27
21 0.28
22 0.28
23 0.29
24 0.25
25 0.23
26 0.22
27 0.26
28 0.25
29 0.26
30 0.31
31 0.36
32 0.44
33 0.5
34 0.52
35 0.53
36 0.56
37 0.54
38 0.49
39 0.42
40 0.35
41 0.34
42 0.28
43 0.22
44 0.18
45 0.17
46 0.16
47 0.16
48 0.15
49 0.08
50 0.1
51 0.11
52 0.11
53 0.11
54 0.12
55 0.13
56 0.12
57 0.1
58 0.09
59 0.1
60 0.09
61 0.11
62 0.11
63 0.09
64 0.09
65 0.09
66 0.09
67 0.07
68 0.07
69 0.07
70 0.07
71 0.09
72 0.11
73 0.15
74 0.17
75 0.18
76 0.2
77 0.21
78 0.21
79 0.29
80 0.35
81 0.33
82 0.31
83 0.34
84 0.32
85 0.32
86 0.34
87 0.26
88 0.19
89 0.22
90 0.22
91 0.22
92 0.23
93 0.22
94 0.2
95 0.22
96 0.22
97 0.19
98 0.18
99 0.17
100 0.18
101 0.17
102 0.16
103 0.13
104 0.14
105 0.12
106 0.12
107 0.1
108 0.08
109 0.08
110 0.08
111 0.08
112 0.07
113 0.06
114 0.06
115 0.06
116 0.06
117 0.05
118 0.05
119 0.04
120 0.04
121 0.05
122 0.05
123 0.07
124 0.1
125 0.1
126 0.11
127 0.12
128 0.13
129 0.12
130 0.14
131 0.13
132 0.14
133 0.15
134 0.15
135 0.14
136 0.12
137 0.13
138 0.12
139 0.12
140 0.09
141 0.08
142 0.09
143 0.11
144 0.12
145 0.19
146 0.22
147 0.23
148 0.24
149 0.26
150 0.25
151 0.25
152 0.24
153 0.16
154 0.13
155 0.12
156 0.1
157 0.07
158 0.06
159 0.05
160 0.04
161 0.04
162 0.04
163 0.09
164 0.11
165 0.12
166 0.14
167 0.14
168 0.16
169 0.18
170 0.25
171 0.27
172 0.31
173 0.35
174 0.35
175 0.4
176 0.39
177 0.38
178 0.32
179 0.32
180 0.26
181 0.22
182 0.19
183 0.15
184 0.15
185 0.15
186 0.13
187 0.06
188 0.06
189 0.11
190 0.12
191 0.12
192 0.14
193 0.16
194 0.19
195 0.23
196 0.23
197 0.26
198 0.29
199 0.32
200 0.32
201 0.32
202 0.3
203 0.26
204 0.25
205 0.17
206 0.14
207 0.09
208 0.07
209 0.04
210 0.03
211 0.03
212 0.03
213 0.03
214 0.04
215 0.05
216 0.07
217 0.1
218 0.11
219 0.16
220 0.25
221 0.33
222 0.4
223 0.41
224 0.44
225 0.5
226 0.54
227 0.57
228 0.57
229 0.52
230 0.47
231 0.48
232 0.47
233 0.41
234 0.37
235 0.32
236 0.34
237 0.34
238 0.34
239 0.38
240 0.38
241 0.36
242 0.41
243 0.44
244 0.38
245 0.42
246 0.45
247 0.44
248 0.5
249 0.55
250 0.53
251 0.5
252 0.48
253 0.4
254 0.33
255 0.29
256 0.22
257 0.2
258 0.22
259 0.2
260 0.19
261 0.21
262 0.2
263 0.19
264 0.19
265 0.21
266 0.17
267 0.22
268 0.28
269 0.36
270 0.45
271 0.48
272 0.49
273 0.5
274 0.52
275 0.5
276 0.53
277 0.52
278 0.53
279 0.59
280 0.6
281 0.6
282 0.66
283 0.72
284 0.73
285 0.75
286 0.77
287 0.77
288 0.83
289 0.87
290 0.88
291 0.85
292 0.85
293 0.81
294 0.78
295 0.72
296 0.67
297 0.64
298 0.55
299 0.49
300 0.45
301 0.43
302 0.34
303 0.36
304 0.41
305 0.44
306 0.49
307 0.56
308 0.59
309 0.61
310 0.65
311 0.63
312 0.54
313 0.47
314 0.42
315 0.34
316 0.25
317 0.19
318 0.16
319 0.14
320 0.15
321 0.15
322 0.15
323 0.14
324 0.15
325 0.16