Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1G4IT08

Protein Details
Accession A0A1G4IT08    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
4-28NEYASKLKNLKRKRMNLVVKNSKETHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 25, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013260  mRNA_splic_SYF2  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF08231  SYF2  
Amino Acid Sequences MDLNEYASKLKNLKRKRMNLVVKNSKETKRERTLHQLNQKPAVYSMNAQSDEESDQASKGNDNVEKNKLFGYSIREYEQWKKREDRSKLDSAKYGDLAKSTYDKEVQRLSARRDNLEKTKLEEEGSRTVNNQGKIVIEDNPDLIDKLAESVRQTAKERYAKIQRKLQHRDVTAVPSTGFVNEKNKQFNAKLDRQAKKMEHSDSGND
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.66
2 0.73
3 0.78
4 0.82
5 0.86
6 0.86
7 0.87
8 0.87
9 0.81
10 0.8
11 0.77
12 0.73
13 0.69
14 0.67
15 0.66
16 0.65
17 0.66
18 0.65
19 0.68
20 0.72
21 0.74
22 0.77
23 0.75
24 0.7
25 0.72
26 0.67
27 0.57
28 0.48
29 0.41
30 0.33
31 0.27
32 0.27
33 0.26
34 0.25
35 0.24
36 0.23
37 0.22
38 0.22
39 0.2
40 0.16
41 0.1
42 0.1
43 0.11
44 0.11
45 0.1
46 0.09
47 0.13
48 0.16
49 0.2
50 0.24
51 0.28
52 0.29
53 0.29
54 0.29
55 0.25
56 0.22
57 0.2
58 0.23
59 0.21
60 0.22
61 0.24
62 0.24
63 0.27
64 0.36
65 0.42
66 0.38
67 0.39
68 0.43
69 0.48
70 0.57
71 0.59
72 0.58
73 0.57
74 0.63
75 0.63
76 0.6
77 0.56
78 0.49
79 0.44
80 0.37
81 0.31
82 0.22
83 0.18
84 0.16
85 0.13
86 0.13
87 0.12
88 0.12
89 0.15
90 0.15
91 0.17
92 0.19
93 0.2
94 0.23
95 0.27
96 0.31
97 0.32
98 0.33
99 0.33
100 0.35
101 0.38
102 0.38
103 0.39
104 0.34
105 0.32
106 0.33
107 0.31
108 0.28
109 0.26
110 0.23
111 0.24
112 0.25
113 0.21
114 0.2
115 0.25
116 0.28
117 0.27
118 0.24
119 0.19
120 0.18
121 0.19
122 0.19
123 0.16
124 0.14
125 0.14
126 0.14
127 0.14
128 0.13
129 0.12
130 0.11
131 0.08
132 0.06
133 0.07
134 0.08
135 0.08
136 0.09
137 0.15
138 0.17
139 0.21
140 0.25
141 0.27
142 0.35
143 0.4
144 0.41
145 0.45
146 0.53
147 0.58
148 0.62
149 0.66
150 0.64
151 0.68
152 0.75
153 0.75
154 0.73
155 0.66
156 0.63
157 0.58
158 0.57
159 0.49
160 0.41
161 0.32
162 0.24
163 0.23
164 0.2
165 0.18
166 0.15
167 0.21
168 0.26
169 0.32
170 0.36
171 0.38
172 0.43
173 0.44
174 0.51
175 0.52
176 0.55
177 0.59
178 0.63
179 0.68
180 0.65
181 0.71
182 0.66
183 0.65
184 0.64
185 0.59
186 0.55