Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1G4IYI0

Protein Details
Accession A0A1G4IYI0    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
46-69EGDLKREIKKLQKHRDQIKTWLSKHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 14, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR038635  CCR4-NOT_su2/3/5_C_sf  
IPR012270  CCR4-NOT_su3/5  
IPR040168  Not2/3/5  
IPR007282  NOT2/3/5_C  
IPR007207  Not_N  
Gene Ontology GO:0030015  C:CCR4-NOT core complex  
GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000289  P:nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF04153  NOT2_3_5  
PF04065  Not3  
Amino Acid Sequences MSQRKLQQDIDKLLKKVKEGLQDFEDVYDKFQNTDASNTSYREKLEGDLKREIKKLQKHRDQIKTWLSKDDVKDKQQVLMENRRLIESGMERFKSVEKLMKTKQFSKEALINPDIIKDPRELKKRDQFLFIQDCLEELQKQLESFEAQENEHQCERHIFHISNLENILKQLQNNGLEPDTVEEYQEDIQYYVENNDDPDFIEYDTIYEDMGCEIQPGEVVKEVETPSKVVKSSRVEKSPKKRDSPMPITPLSASSASADKAKSVLASPSTNSTNVPFSSSKKDVSQKVADKTGTLNENLVLQKPDQNNSQGQNQNQSDESAVQPPKDLSKEIEELLAQDRAQYSAFQNPLFSPGLNYWLETKRTLIQPHDTMPSEMASQLESSLLNCPDSLDADTPSLHQDVLSMPHPTSIFFPNETIRLVSNDPIDISRNHPKHNDIYSGTSLARIMSKFDLDTLFFIFYHYQGSYEQFLSARELTIRGWQFNKVNRCWFYKEVEKLPPGMEQSEEISWRYFDYQKSWLARRCGAEFVYREEEFERI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.53
3 0.53
4 0.51
5 0.51
6 0.48
7 0.51
8 0.47
9 0.48
10 0.46
11 0.39
12 0.37
13 0.27
14 0.27
15 0.27
16 0.24
17 0.21
18 0.24
19 0.26
20 0.24
21 0.29
22 0.28
23 0.28
24 0.31
25 0.33
26 0.34
27 0.32
28 0.31
29 0.29
30 0.28
31 0.26
32 0.32
33 0.36
34 0.38
35 0.45
36 0.5
37 0.52
38 0.55
39 0.57
40 0.57
41 0.6
42 0.66
43 0.67
44 0.72
45 0.77
46 0.83
47 0.87
48 0.83
49 0.82
50 0.82
51 0.8
52 0.72
53 0.68
54 0.62
55 0.58
56 0.58
57 0.59
58 0.56
59 0.52
60 0.59
61 0.53
62 0.54
63 0.51
64 0.53
65 0.51
66 0.54
67 0.54
68 0.51
69 0.5
70 0.46
71 0.43
72 0.36
73 0.34
74 0.28
75 0.29
76 0.31
77 0.31
78 0.31
79 0.31
80 0.33
81 0.32
82 0.3
83 0.3
84 0.27
85 0.35
86 0.42
87 0.5
88 0.53
89 0.57
90 0.62
91 0.62
92 0.59
93 0.57
94 0.57
95 0.54
96 0.54
97 0.48
98 0.42
99 0.35
100 0.36
101 0.33
102 0.26
103 0.22
104 0.19
105 0.25
106 0.31
107 0.4
108 0.42
109 0.49
110 0.58
111 0.65
112 0.64
113 0.62
114 0.56
115 0.56
116 0.58
117 0.49
118 0.41
119 0.32
120 0.3
121 0.25
122 0.25
123 0.16
124 0.11
125 0.13
126 0.12
127 0.12
128 0.12
129 0.12
130 0.11
131 0.13
132 0.17
133 0.16
134 0.16
135 0.2
136 0.22
137 0.25
138 0.26
139 0.24
140 0.2
141 0.24
142 0.25
143 0.25
144 0.28
145 0.24
146 0.24
147 0.33
148 0.32
149 0.29
150 0.29
151 0.25
152 0.2
153 0.2
154 0.21
155 0.14
156 0.14
157 0.15
158 0.18
159 0.19
160 0.2
161 0.21
162 0.18
163 0.17
164 0.17
165 0.16
166 0.14
167 0.12
168 0.12
169 0.1
170 0.11
171 0.12
172 0.12
173 0.11
174 0.08
175 0.08
176 0.09
177 0.09
178 0.08
179 0.08
180 0.07
181 0.08
182 0.08
183 0.09
184 0.09
185 0.09
186 0.09
187 0.08
188 0.09
189 0.08
190 0.07
191 0.08
192 0.07
193 0.06
194 0.05
195 0.05
196 0.05
197 0.05
198 0.05
199 0.04
200 0.04
201 0.04
202 0.05
203 0.06
204 0.06
205 0.08
206 0.08
207 0.08
208 0.11
209 0.12
210 0.13
211 0.13
212 0.14
213 0.13
214 0.15
215 0.15
216 0.14
217 0.19
218 0.23
219 0.31
220 0.36
221 0.42
222 0.48
223 0.56
224 0.66
225 0.7
226 0.71
227 0.68
228 0.68
229 0.68
230 0.71
231 0.7
232 0.66
233 0.6
234 0.53
235 0.49
236 0.43
237 0.36
238 0.28
239 0.2
240 0.14
241 0.1
242 0.1
243 0.1
244 0.11
245 0.1
246 0.08
247 0.09
248 0.08
249 0.08
250 0.08
251 0.09
252 0.09
253 0.1
254 0.1
255 0.13
256 0.14
257 0.14
258 0.14
259 0.13
260 0.13
261 0.13
262 0.16
263 0.14
264 0.16
265 0.22
266 0.24
267 0.24
268 0.26
269 0.32
270 0.32
271 0.36
272 0.41
273 0.39
274 0.41
275 0.43
276 0.38
277 0.33
278 0.31
279 0.29
280 0.23
281 0.18
282 0.15
283 0.11
284 0.15
285 0.15
286 0.15
287 0.12
288 0.11
289 0.17
290 0.18
291 0.2
292 0.19
293 0.22
294 0.24
295 0.25
296 0.33
297 0.31
298 0.31
299 0.36
300 0.35
301 0.33
302 0.3
303 0.28
304 0.21
305 0.18
306 0.18
307 0.17
308 0.18
309 0.16
310 0.17
311 0.17
312 0.19
313 0.19
314 0.19
315 0.14
316 0.17
317 0.19
318 0.19
319 0.19
320 0.16
321 0.16
322 0.17
323 0.16
324 0.11
325 0.1
326 0.1
327 0.1
328 0.11
329 0.11
330 0.1
331 0.15
332 0.17
333 0.16
334 0.17
335 0.16
336 0.19
337 0.19
338 0.17
339 0.13
340 0.12
341 0.16
342 0.16
343 0.16
344 0.17
345 0.2
346 0.22
347 0.21
348 0.22
349 0.22
350 0.27
351 0.29
352 0.28
353 0.3
354 0.31
355 0.34
356 0.36
357 0.33
358 0.29
359 0.26
360 0.23
361 0.18
362 0.16
363 0.13
364 0.09
365 0.08
366 0.08
367 0.08
368 0.07
369 0.07
370 0.1
371 0.11
372 0.11
373 0.1
374 0.11
375 0.11
376 0.12
377 0.14
378 0.11
379 0.11
380 0.12
381 0.13
382 0.13
383 0.14
384 0.13
385 0.11
386 0.09
387 0.09
388 0.09
389 0.13
390 0.14
391 0.14
392 0.13
393 0.16
394 0.16
395 0.16
396 0.18
397 0.18
398 0.19
399 0.18
400 0.2
401 0.2
402 0.21
403 0.21
404 0.2
405 0.17
406 0.17
407 0.18
408 0.18
409 0.17
410 0.17
411 0.16
412 0.16
413 0.18
414 0.16
415 0.21
416 0.28
417 0.31
418 0.34
419 0.37
420 0.4
421 0.45
422 0.48
423 0.47
424 0.4
425 0.42
426 0.41
427 0.4
428 0.35
429 0.29
430 0.25
431 0.2
432 0.2
433 0.15
434 0.15
435 0.15
436 0.16
437 0.15
438 0.17
439 0.18
440 0.16
441 0.17
442 0.16
443 0.15
444 0.14
445 0.15
446 0.14
447 0.13
448 0.15
449 0.14
450 0.13
451 0.13
452 0.16
453 0.18
454 0.18
455 0.19
456 0.16
457 0.17
458 0.2
459 0.2
460 0.18
461 0.16
462 0.16
463 0.16
464 0.24
465 0.26
466 0.26
467 0.27
468 0.32
469 0.37
470 0.44
471 0.52
472 0.5
473 0.56
474 0.56
475 0.6
476 0.61
477 0.58
478 0.57
479 0.57
480 0.59
481 0.57
482 0.6
483 0.57
484 0.52
485 0.5
486 0.47
487 0.4
488 0.34
489 0.28
490 0.22
491 0.23
492 0.24
493 0.24
494 0.22
495 0.2
496 0.19
497 0.2
498 0.23
499 0.24
500 0.23
501 0.27
502 0.31
503 0.37
504 0.44
505 0.5
506 0.53
507 0.55
508 0.58
509 0.58
510 0.56
511 0.53
512 0.48
513 0.48
514 0.43
515 0.44
516 0.45
517 0.4
518 0.38