Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1G4IY26

Protein Details
Accession A0A1G4IY26    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
332-359APAQRRLNHTTRRRRSSQKGRRPSLTDSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
343-353RRRRSSQKGRR
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019680  Mediator_Med1  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0045944  P:positive regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF10744  Med1  
Amino Acid Sequences MSDLYVETLSDMIALLQEYKPGLVTLENVTRLCKTLRLESFTDNIDSETIRLSAASNIIVIDMDFHKADERVKDVKLVLASNFDNFNYFNDEDNSNILYNSLSCYPDLHTFYFNLKFLSILDTYSNIETEPRISGQHDKLDLFKYFTELPDQLRTFFKDMSMVEEIRTNVDNKFGIYVMRAGTLVAKIDIEECDAHGERFHDYRYQNSSWTADASHKNAMGVMLVLKIFDTSLHFPQELISRDLVLDSDSHKPYSVANHQKSLHLFNDITSNLIPASKFKISNDNIELLGELLRWVSWWQHVLSPVLQTLKCPAPHPPNDPKRRTSSNSTSAPAQRRLNHTTRRRRSSQKGRRPSLTDSSMMKDGGLQQFTLTEVMSQPVVEEDEPSDIIDLVLNEEYLALGTHHRCHIEGGLQEWQAFVGSFKSIAL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.06
2 0.08
3 0.08
4 0.1
5 0.11
6 0.11
7 0.11
8 0.11
9 0.11
10 0.1
11 0.12
12 0.16
13 0.21
14 0.24
15 0.24
16 0.26
17 0.26
18 0.28
19 0.27
20 0.26
21 0.24
22 0.3
23 0.36
24 0.4
25 0.42
26 0.43
27 0.45
28 0.42
29 0.4
30 0.31
31 0.26
32 0.21
33 0.18
34 0.15
35 0.14
36 0.12
37 0.1
38 0.09
39 0.1
40 0.1
41 0.11
42 0.11
43 0.1
44 0.09
45 0.09
46 0.09
47 0.08
48 0.09
49 0.08
50 0.1
51 0.1
52 0.1
53 0.12
54 0.14
55 0.17
56 0.18
57 0.23
58 0.24
59 0.25
60 0.28
61 0.27
62 0.29
63 0.28
64 0.27
65 0.22
66 0.22
67 0.22
68 0.21
69 0.22
70 0.18
71 0.17
72 0.16
73 0.17
74 0.18
75 0.19
76 0.18
77 0.2
78 0.21
79 0.2
80 0.22
81 0.22
82 0.15
83 0.14
84 0.13
85 0.1
86 0.1
87 0.11
88 0.12
89 0.11
90 0.11
91 0.12
92 0.15
93 0.2
94 0.23
95 0.22
96 0.21
97 0.22
98 0.26
99 0.29
100 0.27
101 0.22
102 0.18
103 0.17
104 0.16
105 0.18
106 0.14
107 0.12
108 0.12
109 0.12
110 0.14
111 0.14
112 0.13
113 0.09
114 0.1
115 0.09
116 0.1
117 0.1
118 0.1
119 0.1
120 0.12
121 0.19
122 0.22
123 0.26
124 0.27
125 0.26
126 0.28
127 0.3
128 0.29
129 0.25
130 0.21
131 0.19
132 0.18
133 0.18
134 0.19
135 0.17
136 0.19
137 0.24
138 0.24
139 0.23
140 0.25
141 0.27
142 0.25
143 0.24
144 0.21
145 0.18
146 0.17
147 0.2
148 0.21
149 0.19
150 0.17
151 0.19
152 0.19
153 0.17
154 0.18
155 0.14
156 0.11
157 0.13
158 0.13
159 0.11
160 0.12
161 0.1
162 0.09
163 0.09
164 0.1
165 0.08
166 0.09
167 0.08
168 0.07
169 0.08
170 0.08
171 0.08
172 0.06
173 0.06
174 0.05
175 0.06
176 0.06
177 0.07
178 0.06
179 0.06
180 0.09
181 0.1
182 0.1
183 0.1
184 0.1
185 0.11
186 0.12
187 0.12
188 0.15
189 0.15
190 0.19
191 0.25
192 0.25
193 0.25
194 0.25
195 0.25
196 0.2
197 0.2
198 0.17
199 0.15
200 0.17
201 0.17
202 0.18
203 0.17
204 0.16
205 0.15
206 0.15
207 0.1
208 0.08
209 0.06
210 0.05
211 0.05
212 0.05
213 0.04
214 0.04
215 0.04
216 0.04
217 0.07
218 0.09
219 0.11
220 0.13
221 0.13
222 0.13
223 0.15
224 0.19
225 0.19
226 0.18
227 0.16
228 0.14
229 0.14
230 0.14
231 0.13
232 0.09
233 0.07
234 0.08
235 0.13
236 0.14
237 0.15
238 0.15
239 0.15
240 0.16
241 0.21
242 0.28
243 0.33
244 0.34
245 0.4
246 0.4
247 0.43
248 0.44
249 0.42
250 0.33
251 0.27
252 0.24
253 0.19
254 0.23
255 0.2
256 0.19
257 0.15
258 0.14
259 0.11
260 0.12
261 0.11
262 0.08
263 0.13
264 0.15
265 0.16
266 0.17
267 0.26
268 0.27
269 0.33
270 0.34
271 0.31
272 0.28
273 0.27
274 0.26
275 0.17
276 0.15
277 0.09
278 0.06
279 0.05
280 0.04
281 0.05
282 0.05
283 0.06
284 0.08
285 0.1
286 0.11
287 0.14
288 0.16
289 0.17
290 0.18
291 0.18
292 0.18
293 0.2
294 0.19
295 0.17
296 0.2
297 0.23
298 0.23
299 0.23
300 0.29
301 0.34
302 0.4
303 0.48
304 0.54
305 0.6
306 0.69
307 0.73
308 0.71
309 0.69
310 0.71
311 0.69
312 0.68
313 0.66
314 0.65
315 0.64
316 0.6
317 0.59
318 0.58
319 0.59
320 0.56
321 0.53
322 0.5
323 0.52
324 0.58
325 0.61
326 0.63
327 0.68
328 0.72
329 0.76
330 0.79
331 0.8
332 0.82
333 0.84
334 0.86
335 0.87
336 0.86
337 0.87
338 0.86
339 0.86
340 0.81
341 0.77
342 0.74
343 0.66
344 0.6
345 0.52
346 0.49
347 0.44
348 0.38
349 0.31
350 0.24
351 0.27
352 0.28
353 0.25
354 0.21
355 0.19
356 0.19
357 0.2
358 0.19
359 0.13
360 0.08
361 0.08
362 0.1
363 0.1
364 0.09
365 0.08
366 0.09
367 0.11
368 0.1
369 0.11
370 0.1
371 0.13
372 0.13
373 0.13
374 0.13
375 0.11
376 0.1
377 0.11
378 0.1
379 0.1
380 0.1
381 0.09
382 0.08
383 0.08
384 0.08
385 0.07
386 0.07
387 0.06
388 0.11
389 0.14
390 0.18
391 0.22
392 0.23
393 0.24
394 0.25
395 0.28
396 0.28
397 0.28
398 0.28
399 0.31
400 0.31
401 0.3
402 0.28
403 0.24
404 0.19
405 0.17
406 0.14
407 0.09
408 0.09